Cox PH模型中协变量的系数值过大

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r、survival-analysis、cox-regression

我正在尝试建立R中具有时变协变量的Cox PH模型。我使用的是survival软件包中的coxph函数。虽然其中一个协变量的系数值太大，特别是2.5e+32，但在估计过程中没有任何问题。我猜不出这个问题的原因是什么，也不知道如何解决它。这个变量是非平稳的，并且违反了比例假

浏览 46提问于2021-10-26得票数 0

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R中带coxph (生存包)分层变量模型诊断的误差

r、survival-analysis、survival、cox

我有一个数据集，其中有3个组接受不同媒体的曝光。一组被暴露在三种媒体中的一种。因此，我的coxph模型是分层的：fullModel <- coxph(Surv(time, status) ~ strata(treatment), data = d) test.assump <- cox.zph(full

浏览 5提问于2022-06-24得票数 1

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R中具有时变协变量的全参数比例风险模型的拟合

r、survival-analysis

我需要拟合一个具有时变协变量的参数PH模型(所以，不是Cox模型)。我们可以在R中这样做吗？我听说survreg函数不能处理时变协变量。我一直在徒劳地寻找可以处理这一问题的软件包。

浏览 3提问于2013-03-06得票数 3

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Cox模型，coxph()，无事件对照处理，种子萌发

r、survival-analysis、cox-regression

我的数据集是种子萌发实验的结果。感兴趣的主要变量是“对待”变量(具有3个级别的分类变量)。在我的脚本中，我试图通过比较PH系数百分比来找出不同处理之间是否存在差异，哪一个是最好的，以及在多大程度上。2)如果违反了危险假设(PH)的相称性，我应该如何处理我的数据才能继续构建cox模型？我进行了深入的研究，但还不能

浏览 2提问于2019-02-04得票数 1

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如何在R中预测Cox回归模型中的生存时间？

r、survival-analysis、cox-regression

我使用考克斯回归对一个问题进行了建模，现在我想要预测一个人的估计生存时间。该模型有一个协变量列表，生存时间取决于这些协变量。告诉我们如何计算P(T>t)，它基本上是给定个体的生存函数(1-CDF)。我想预测一些稍微不同的东西。给定已经使用的协变量的值，我想预测这个人将活的估计天数。根据我的说法，这类似于从pdf中采样。我如

浏览 0提问于2015-02-13得票数 4

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cox.zph如何处理随时间变化的协变量？

r、cox-regression

我有一个有5个时间相关变量和2个时间自变量的coxph模型.我想检验比例风险假设，除了鞅和偏差残差，使用cox.zph。我的问题是，这个函数如何处理随时间变化的协变量？在阅读之后，我不确定这是否是建议的适合度测试来评估时变协变量的PH假设。+CODE_06+factor(clima)+TP_media7 +ndvi+pe

浏览 5提问于2014-06-30得票数 6

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在具有13个独立协变量的Cox模型上的偏差残差诊断--我能得到每个协变量的图吗？

r、cox-regression

我是新的生存统计和这些论坛，所以请原谅我不知道行话或适当的调查方式。WIll给我最好的机会。我的目标是做一些考克斯回归，并想做一些基本的诊断，它的适用性。我有大约13个协变量，当我执行get诊断时，我可以得到一个偏差残差图。然而，这个阴谋代表了整个考克斯模型，我发现它是扭曲的。因此，我希望对Cox模型中的每一个协变量<

浏览 0提问于2019-01-11得票数 0

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H2O: Cox* PH模型中的时变协变量？*

h2o

但第一个链接上的符号并不清楚它是否支持。是吗？

浏览 2提问于2015-03-20得票数 1

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如何绘制survreg (R的包生存)生成的生存曲线？

r、plot、survival-analysis、weibull

我试着用一个威布尔模型来拟合和绘制一个生存数据。这些数据只有一个协变量，队列，从2006年到2010年。那么，有什么想法可以添加到下面的两行代码中，以绘制2010年队列的生存曲线？s <- Surv(subSetCdm$dur,subSetCdm$event)用CoxPH模型实现同样的效

浏览 4提问于2012-02-06得票数 34

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我尝试过用许多不同的方式表示数据，但是我找不到任何与survreg一起工作的数据，但是这种格式在ggsurvplot中很好，但是对于这两个函数来说，格式可能需要不同吗？如果能帮忙我会很感激的，谢谢。orangered","deepskyblue"),xlim=c(0,838), ylim=c(0,1), xlab="Days Since Planting")现在我最大的问题是决定使用哪一种模型最合适：survd

浏览 0提问于2018-09-03得票数 1

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用校正群预测法预测生存曲线

r、data-visualization、survival-analysis、cox-regression

如何用在R中实现的校正组预测方法绘制连续协变量(假设数值的第20和第80百分位数)的预测生存曲线？因为我得到了两条生存曲线，它们是由rx (0或1)分层的，条件方法是对膀胱数据集的作用。然而，假设我想使用边际方法，而不是分层，而是在第20和第80值处绘制我的连续协变量，但同时也重新平衡了子种群。希望朝正确的方向迈出任何一步。对于再状态，我有一个具有连续预测因子<

浏览 0提问于2019-09-02得票数 2

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如何用R来滞后二分变量和连续变量？

我使用的是带有时变协变量的Cox回归模型。我需要将我所有的协变量都滞后一个周期(年)，以避免因果关系同时出现的问题。所以我想知道我怎样才能在R中做到这一点？我有二分的和连续的时变协变量。我的数据示例： A 1990 380,4009552 0

浏览 1提问于2015-11-09得票数 0

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cox模型的年生存率[R]

r、mean、rate、survival-analysis、cox-regression

我首先必须估计3个虚拟解释变量对生存的影响，所以我使用了Anderson-Gill模型(从Cox模型的扩展)。主要的“问题”是年龄类变量是一个时间相关的协变量。有些人在一些年内被跟踪，因此在学习期间改变了年龄等级。该模型的输出提供了我正在测试的每一个变量对生存的影响(性别、地区和年龄)。我可以很容易地预测生存(

浏览 6提问于2016-04-08得票数 1

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Cox回归的Kaplan-Meier图

r、plot、survival-analysis、cox-regression

我有一个Cox比例风险模型，它使用以下R中的代码建立，用于预测死亡率。添加协变量A、B和C只是为了避免混淆(即年龄、性别、种族)，但我们真正感兴趣的是预测变量X。X是一个连续变量。cox.model <- coxph(Surv(time, dead) ~ A + B + C + X, data = df) 现在，我在绘制Kaplan-Meier曲线时遇到了麻烦。我一直在寻找如何创建这个形象，但我没有太多

浏览 2提问于2015-08-18得票数 8

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绘制估计的存活率如何依赖于感兴趣的协变量的值。relevel的问题

r、survival-analysis

我想要画出Cox模型的估计存活率如何取决于感兴趣的协变量的值，而其余变量则固定为其平均值(如果它们是连续变量)或虚拟变量的最低值。在这个示例之后，我构造了一个包含三行的新数据帧，每行对应我感兴趣的变量的每个值；其他协变量是固定的。在这些协变量</em

浏览 5提问于2019-03-26得票数 0

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如何在R中调整生存分析

r、survival-analysis

我试图在调整性别、年龄和体重指数的情况下，通过多变量Cox比例风险模型估计HbA1c变异性与全因死亡率之间的关系。我看不到任何关于它的信息。我可以像下面这样创建模型吗？感谢您的回答。library(survival) res.cox <- coxph(Surv(time, status) ~ HbA1c + sex + age+BMI, data = dataSurv)

浏览 0提问于2021-05-29得票数 0

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如何在多变量Coxph中得到特定变量的wald检验？

r、survival-analysis、cox-regression、multivariate-testing

我使用R生存包拟合了一个多变量Cox模型，如下所示：data(lung)res.cox1coxph(formula = Surv(time, status) ~ sex + ph.karnoCox模型(**sex + <

浏览 4提问于2020-06-02得票数 2

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从glmnet获得变量选择顺序

r、glmnet、variable-selection

我一直在使用glmnet软件包为一个目标变量Y(数值)和762个协变量建立一个LASSO回归模型。我使用glmnet()函数，然后使用coef(fit, s = 0.056360)获得该特定值lambda的系数值。我现在需要的是变量选择顺序，即所选协变量中的哪一个首先被选择(首先输入模型)、第二个、第三个等等。在使用plot(fit, label

浏览 18提问于2021-12-09得票数 4

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将多个cox模型组合到R中的森林地块中

r、cox-regression、forestplot

我有6个不同的多变量cox模型，它们运行一个数据集的不同子组，具有相同的其他协变量，我正在调整模型中的。我想从6个不同的模型中绘制一块林地中各亚组的危险比。我正在使用R 我在任何地方都找不到合适的解决方案。请帮帮忙。我已经查看了metafor包，但这似乎没有帮助。ggplot包似乎不能组合不同的</em

浏览 23提问于2020-02-24得票数 0

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在R？

r、curve-fitting、cox-regression

我用权重和时间自变量的时间依赖变量拟合了coxph模型，如下所示：1 0 1 0 60 60start, stop, death) ~ weight + age + factor(smoke) + cluster(id), 我想绘制体重对生存曲线的影响，该图可能有两条生存曲线，一条是体重60，另一条是体重80，这表明了体重增加对曲线的</e

浏览 0提问于2018-09-19得票数 0

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