Cytoscape中的多个根节点

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javascript、cytoscape.js、cytoscape

我在Cytoscape中创建了一个具有Breadthfirst布局的树。var options = { roots: undefined, // the rootsof the trees

浏览 27提问于2017-02-07得票数 3

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如何在呈现前处理cytoscape.js图形数据

javascript、graph、cytoscape.js

我有相对大量的图形数据(超过1000个节点，超过2000条边)。Cytoscape.js无法呈现这么多的数据，所以我决定做一些交互式的图表探索。我想从图根开始(它是DAG)，用户将能够在点击节点之后探索它们。我知道我可以在cytoscape.js之外这样做，但是我想知道我是否可以创建一个节点/边缘集合来操作(删除除了根和它们的邻居之外的所有节点)，然后作

浏览 1提问于2015-02-04得票数 0

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基于内容的Cytoscape.js样式节点

css、cytoscape.js、cytoscape-web

我想给我的根节点涂上与屏幕上其他节点不同的颜色，我已经做了一些预先的工作来识别根节点的值，并让它在一个变量中随时可用。但是，在试图对图形进行样式化时，什么都不会发生，而且很难通过这种方式进行调试。示例： $('#cy').cytoscape</em

浏览 2提问于2014-09-26得票数 9

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Cytoscape.js为选定的所有节点获取ID

cytoscape.js

我使用Cytoscape.js来表示网络图。我可以一次高亮显示多个节点，方法是选择第一个节点，然后选择第二个节点，同时保持shift键。我查看了cytoscape.js文档，但找不到所描述的位置。

浏览 1提问于2018-02-19得票数 1

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疾病网络

networking、cytoscape

我有一个包含两列的表:一列包含Disease names，另一列包含Genes。我想创建一个只有Disease nodes的图，连接两个节点，如果它们有共同的基因影响它们。我如何在Cytoscape中做到这一点？

浏览 3提问于2020-10-26得票数 1

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在cytoscape网络中映射节点大小并添加图例

python、networkx、cytoscape

我使用python中的networkx包构建了多个网络，每个网络代表一个生物实验。然后我将这些网络导出为gml文件，以便在cytoscape中可视化并进行比较。在每个文件中，我都有两个节点属性--即count和color。在cytoscape中，我将节点大小分配给它的计数。然而，节点计数之间存在巨大的差异，例如，一些节点的计数为

浏览 4提问于2018-04-13得票数 1

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如何处理在Cytoscape.js中使用dagre布局时的多树情况

javascript、tree、cytoscape.js、dagre

我是Cytoscape.js的新手，正在尝试根据用户的搜索输入，借助Dagre布局来绘制图表。节点数量通常为50-100。虽然Dagre适用于单个树，但当图形包含多个树(有时包括独立的节点)时，这些树的根部会自动水平排列(如图所示)，这使得节点和标签变得非常小。如果我们可以利用水平空间，图形肯定会更清晰。我的问题是，我们如何处理多树的情况，垂直排列这些树(例如，4个根在一

浏览 4提问于2015-08-17得票数 2

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如何使用Cytoscape分析“一对多”数据值

cytoscape、network-analysis

我对使用Cytoscape分析基因之间的分子关系很感兴趣，我一直在阅读Cytoscape网站上的教程，但我不确定如何使用Cytoscape进行“一对多”比较。例如，每个基因通常被指定为“节点”，其“边”对应于与其他基因的交互作用。Cytoscape使用“属性”将节点或边名称映射到特定的数据值。在一个简单的“一对一”比较中，您可能有一个包含10个基因及其表达值的列表

浏览 1提问于2020-06-02得票数 1

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Cytoscape:使用多个属性？

node.js、networking、attributes、cytoscape

我正在使用Cytoscape，并且我需要为每个节点使用多个属性，可能会复制这些节点。如果我上传具有多个属性的“属性文件”，则每个节点只能使用一个属性。

浏览 0提问于2018-10-05得票数 0

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cytoscape.js查找具有数据字段值的已连接节点

javascript、cytoscape.js

我在cytoscape.js中设置了一个图表。其中的一些节点有一个数据字段"feature = true“。对于我选择的节点，我希望找到连接最近的具有"feature = true“的节点。我研究了不同的算法，但如果它们接受对多个节点进行验证的选择器，它们似乎不会以预期的方式将最短路径返回到与选择器匹配的<e

浏览 2提问于2016-09-01得票数 0

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用于大型节点图可视化的CPU-GPU硬件加速

cytoscape

我希望可视化一个大型的节点网络(远远超过一百万个节点和边)，并且正在寻找合适的工具来实现这一点。Cytoscape有许多我们正在寻找的功能，但目前还不清楚它是否能支持这种规模的网络，特别是交互式使用。最有可能的可行方式是使用多个cpus或gpus并行可视化。这可以在Cytoscape中完成吗？

浏览 16提问于2021-11-08得票数 0

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如何让Cytoscape.js自动创建类似于Cytoscape创建的布局？

cytoscape.js、cytoscape

在使用Cytoscape.js之前，我使用了Cytoscape进行生物网络可视化。 Cytoscape能够使用其内部布局算法从我们的网络文件中创建一个自动布局。布局布局是非常合理的--相互连接的节点被放置在附近，节点与每组节点中心的中心节点很好地分布在一起，这对生物网络来说是很好的，因为节点太多，节点之间的连接

浏览 2提问于2017-03-04得票数 3

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Cytoscape样式的多个变量

cytoscape

我正在使用Cytoscape来生成一个监管网络。是否有使用多个变量来设置节点大小的选项？我有两个组A和B。组be的节点大小应该由列'expression‘和edgecount的节点大小来定义。我尝试只选择A节点，并通过样式中的表达式设置节点大小，但它改变了所有数据集。

浏览 0提问于2018-08-02得票数 0

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如何在多节点动态cytoscape.js上添加类

vue.js、web、graph、cytoscape.js、cytoscape

cytoscape.js .我有一个选择性的输入。我想在多个节点上添加一个类，选择input .

浏览 9提问于2022-03-15得票数 0

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使用cytoscape从节点和边缘csv文件创建网络

graph、cytoscape

然而，在Cytoscape上，我创建了一个空的网络，并尝试通过拖放或导入底部导入边缘和节点文件，但没有添加任何内容！以前有人试过这个吗？

浏览 8提问于2021-04-17得票数 0

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如何创建层次结构

cytoscape.js

刚刚开始使用cytoscape.js和breathfirst布局。看起来它将是一个很棒的库。我希望能够创建分层或树状布局，理想情况下能够将节点固定到某个级别。对于要使用的正确布局或如何实现它，有什么建议吗？有谁知道如何使用词根：？我尝试了这样的“root：' xyz '”，其中xyz是我的图表中根节点的id。另外，我试图像下面这样使用position和locked属性来锁定我的

浏览 1提问于2014-04-15得票数 1

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Cytoscape默认情况下折叠所有父节点

reactjs、cytoscape.js

我正在使用带有react-cytoscape和cytoscape-undo-redo和cytoscape-expand-collapse的cytoscape.js。我还为我的图形使用了COSEBilkent布局(因为我需要有复合节点的选项)。首先，我接收所有节点和扩展的组。我希望首先将这些复合节点折叠起来，但我找不到解决方案。有人能帮帮忙吗？ ?

浏览 32提问于2020-08-28得票数 0

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使用collapseAll预设Cytoscape布局，并在展开节点组上更改布局

reactjs、cytoscape.js

我使用的是cytoscape js与react cytoscape和cytoscape undoRedo，以及cytoscape expand collapse。在第一次渲染时，我想要按预设布局(我有所有节点的位置)。它工作得很好，但是当我执行api.collapseAll()时，它看起来节点没有这些位置。即使分组的节点具有与父节点相同的位置。import React, { use

浏览 13提问于2020-08-31得票数 0

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如何在图形中显示多个节点内容(Cytoscape样式表)

javascript、css、cytoscape.js

我想要显示与node.The相关的两个节点内容(节点id和节点名称)，在代码覆盖第一个style.How之后，我们可以在图形中显示多个内容。style: cytoscape.stylesheet() .css({ 'text-valign

浏览 1提问于2014-12-30得票数 1

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cytoscape.js中具有多个父节点的复合节点

javascript、d3.js、cytoscape.js、bayesian-networks

我正在为cytoscape.js中的贝叶斯网络(模板符号)创建一个编辑器。在模板表示法中，有时我需要有一个包含两个父节点的节点。就像图中的图表一样。我找不到这样的插件，如果有人有建议，我很感激。

浏览 2提问于2018-11-18得票数 1

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