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Day6 呦呦鹿鸣—学习R包

x + y)2.select(),按列筛选,按名称选择变量(1)按列号筛选select(test,1)# 筛选test数据集的第一列iris %>% select(1:3)# 筛选iris数据集的第一到第三列...2)按列名筛选select(test, Petal.Length, Petal.Width)iris %>% select(Species, Sepal.Length)3.filter()筛选行/返回具有匹配条件的行可以按照某分类变量的值进行数据筛选...inner_join,取交集inner_join(test1, test2, by = "x")满足两个条件：有相同变量名，相同变量名的列里有相同元素；2.左连left_join列表书写顺序决定了最终合成列表中列的顺序...test2, by = 'x')left_join(test2, test1, by = 'x')3.全连full_joinfull_join( test1, test2, by = 'x')列表书写顺序决定了最终合成列表中列的顺序...,每列数值的类型必须相同；以"by"的列为标准，补齐列表，空值为"NA"4.半连接：返回能够与y表匹配的x表所有记录semi_join交集表中test1部分的列semi_join(x = test1,

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R︱高效数据操作——data.table包（实战心得、dplyr对比、key灵活用法、数据合并）

DT数据集按照x分组，然后计算v变量的和、最小值、最大值。 （2）dplyr函数利用%>%（链式操作）来改进： 链式操作是啥意思呢？...3、第三种方式：key-merge setkey(DT,x) setkey(X,V1) merge(DT, X) 预先设置两个数据集的key后，也可以用比较常见的merge函数来进行数据合并。...返回匹配到键值所在列(V2列)所有行中的第一行 > DT["A", mult ="first"] V1 V2 V3 V4 1: 1 A -1.1727 1 2、nomatch参数——未匹配样本处理...nomatch参数用于控制，当在i中没有到匹配数据的返回结果，默认为NA，也能设定为0。...2016-11-28补充： 留言区大神给了一个比较好的选中列的方式，其中主要就是对with的使用： data.table取列时，可以用data[,1,with=FALSE]取data的第一列

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数据处理|R-dplyr

%in% c("setosa","virginica")) 3）变量筛选（列） select函数:可以通过指定列名选择指定的变量进行分析，得到的为选择的列。...select(iris,Sepal.Width,Petal.Length,Species) 其他特殊选择，可匹配： select(iris,contains("." )) #选取名称中含有字符的列 区别...Min ；Max Mean ；Median ；Var ；Sd等 summarise(iris, max(Petal.Width), first(Sepal.Width)) #返回数据框中变量的最大值及第一四分位值...(x,y,by = NULL) #内连接，合并数据仅保留匹配的记录 by设置两个数据集用于匹配的字段名，默认使用全部同名字段进行匹配，如果两个数据集需要匹配的字段名不同，可以直接用等号指定匹配的字段名...注意：bind_rows()函数需要两个合并对象有相同的列数，而bind_cols()函数则需要两个合并对象有相同的行数。

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R语言入门（一）之数据处理

str(a1) #以简洁的方式显示对象的数据结构及内容 summary(a1) #可以提供最小值、最大值、四分位数和数值型变量的均值，以及因子向量和逻辑型向量的频数统计 ?...a1[,3] #显示a1第三列数据（横着显示） ? a1[3] #显示a1第三列数据（竖着显示） ? a1[2,3] #显示a1第二行第三列的数据 ?...#数据特定列的选择 a2.2[, c("Species", "Sepal.Length", "Sepal.Width")] a2.2[,c(5,1,2)] dplyr::select(a2.2, 5,...#数据列的选择 dplyr::select(a2.2, Species, contains("Sepal")) #筛选a2.2数据中标题包括"Sepal"、标题为"Species"的列 ?..." = "Journal")) #merge 函数类似于 Excel 中的 Vlookup，可以实现对两个数据表进行匹配和拼接的功能；by.x，by.y：指定依据哪些行合并数据框，默认值为相同列名的列

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生信星球 学习小组Day6笔记--学习R包 高小能

认识 R 包R包是多个函数的集合，具有详细的说明和示例。学生信，R语言必学的原因是丰富的图表和Biocductor上面的各种生信分析R包。　包的使用是一通百通的，我们以dplyr为例，讲一下R包。...安装和加载R包1.镜像设置为了保证我们可以自定义CRAN和Bioconductor的下载镜像，其实是可以在Rstudio中进行设置的，只需要运行这两行代码即可：# options函数就是设置R运行过程中的一些选项设置...图片加载library(dplyr)示例数据直接使用内置数据集iris的简化版:test % (cmd/ctr + shift + M)count统计某列的unique值dplyr...处理关系数据图片1.內连inner_join,取交集2.左连left_join3.全连full_join4.半连接：返回能够与y表匹配的x表所有记录semi_join5.反连接：返回无法与y表匹配的x表的所记录

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2023.4生信马拉松day7-R语言综合应用

以上操作根据此前学过的知识新增列的话这么写： 图片 4.简单了解：select() 、filter()筛选列、行 5.补充知识：管道符%>% -（1）当遇到连续的步骤时：多次赋值，会产生多个中间的变量；...； -（2）当逻辑值为TRUE时执行大括号内的代码，如果为FALSE就不执行； -（3）如果要执行的代码只有一行可以不加大于号； -（4）实例：安装R包的满分操作——根据一个包是否已安装来决定要不要安装这个包...转换数据：把表格转换成两列数据 -（1） 第一步：转置 -（2） 第二步：把行名作为一列添加到数据中（因为ggplot2容易把行名丢掉，所以倾向于把行名作为一列） -（3） 第三步：新增一列“group...加载test1.Rdata，将两个数据框按照probe_id列连接在一起，按共同列取交集 #2....，但顺序不同；对比之后发现我的是按排序前原本的先后顺序列出的（因为要一个一个检查是否是最大/最小的前十个）；如果先arrange一下再%in%就可以跟老师的顺序一样了。

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【实用派】R语言中的便捷小操作

管道处理 管道处理避免了中间变量的生成，从而节省了内存，并且使代码直观易读，很大程度的简化代码。 R语言中，管道运算符为“dplyr”包中的“%>%”，指左边的结果作为参数，传入右边的函数。...默认左边的结果作为右面函数中的第一个传入参数，或者唯一缺失的参数。 运用iris数据集，介绍管道运算符的使用。 首先导入数据并加载dplyr包。 ?...当右侧函数只有一个参数时，以计算iris数据集第一列均值为例： ? 第二种方式中，“.”代表了输入参数的位置。第三种方式中，虽然去掉了括号，但是函数功能没有改变。...当右侧函数有两个输入参数时，以用iris数据集前两列生成新数据框，并查看前六行为例： ? 注意通过上述三种表示，得到结果中第一列和第二列数据的顺序。...attach()与detach()函数 当我们选取列表或数据框中对象时，需要用到“$”符号，但是当数据文件中有很多变量时，多次使用“$”会很麻烦，这时可以用attach()函数，连接数据，使得可以直接通过变量名来获取变量中的信息

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R（二）近期记录

按道理前两列都是数值型，那么apply后每一行的前两个元素也应该是数值型呀，那是不是呢，我们看看： > apply(df, 1, function(v) mode(v[1:2])) [1] "character...其实apply是将每一行当作一个向量来处理的。因为第三列是字符型，所以当一行中只要有一个值是字符型，其他数值型的值都会被自动转换为字符型。...我们经常要对一个数据集做多步处理，如果用基础包里的功能也能实现，但是一旦需要调整处理的先后顺序，那就很麻烦，通常需要进行很大的改动。但是如果用dplyr包就可以轻松很多。...按行合并list中的向量 用dplyr包中的bind_rows函数实现 > lis <- list( + a=1:5, + b=2:6, + d=3:7 + ) > library(dplyr...<=pattern) 表示前面匹配，比如 (?<=a )\d+ 表示前面匹配了a和空格的数字。 最后 近期使用R语言的一些收获罗列于此，希望能对大家有所助益。

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生信学习-Day6-学习R包

在 iris 数据集中，Petal.Length 和 Petal.Width 分别代表花瓣的长度和宽度。 因此，当你使用 vars 变量时，你实际上是在引用那些具有这些名称的列。...这样做的目的通常是为了在后续的函数调用中简化代码，特别是在你想要操作数据框中特定的列时。 这会从 your_data_frame 数据框中选择列名与 vars 向量中的字符串相匹配的列。...这个函数执行的是一个内连接（inner join），它会将两个数据框中具有相同键值的行组合在一起。这里的 "键值" 是用于连接两个数据框的列。...这意味着函数将查找 test1 和 test2 中列名为 "x" 的列，并基于这两列中的匹配值来合并行。只有当两个数据框中都存在列 "x" 且某些行在这一列的值相等时，这些行才会出现在最终的结果中。...内连接的特点是只包含两个数据框中键值匹配的行。如果 test1 中的某行在其 "x" 列中的值在 test2 的 "x" 列中没有对应值，则这行不会出现在结果中，反之亦然。

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VLOOKUP很难理解？或许你就差这一个神器

range_lookup （可选）一个逻辑值，该值指定希望 VLOOKUP查找近似匹配还是精确匹配：近似匹配 - 1/TRUE假定表中的第一列按数字或字母顺序排序，然后搜索最接近的值。...这是未指定值时的默认方法。例如，=VLOOKUP (90，A1：B100，2，TRUE)。完全匹配 - 0/FALSE 搜索第一列中的确切值。...数组形式 INDEX(array, row_num, [column_num]) 返回由行号和列号索引选中的表或数组中元素的值。 当函数 INDEX 的第一个参数为数组常量时，使用数组形式。...如果数组具有多行和多列，并且row_num 或 column_num ，INDEX 返回数组中整个行或列的数组。 row_num 必需，除非column_num 存在。...的第二参数中它的单元格个数是6个，所以，当IF的条件为1时候，他就会得到6个结果，第三个参数也是这个道理以此类推，它的运算结果可以显示为下图。

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R&Python Data Science 系列：数据处理（3）

x、y、z的最大值、最小值 diamonds %>% select(x, y, z) %>% summarise_all(list(min, max)) ?...3.2 偏移函数 两个偏移函数lead()和lag()： lead(column,n)：按照某种分组排序规则之后,向下取某列数据的第n行记录 lag(column,n)：按照某种分组排序规则之后...，结果记录在第二行，函数作用于前三行记录，结果记录在第三行......注意：Python中n()函数需要传入参数，R中不需要传入参数；Python中输出列按照字段名称升序排列，R中输出的列按照书写顺序输出。...5 总结 数据处理1-3，主要介绍了Python中dfply和R中dplyr包中的数据处理函数，几乎满足数据预处理中筛选变量、衍生变量以及计算一些统计量的需求。

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R语言列筛选的方法--select

我们知道，R语言学习，80%的时间都是在清洗数据，而选择合适的数据进行分析和处理也至关重要，如何选择合适的列进行分析，你知道几种方法？ 如何优雅高效的选择合适的列，让我们一起来看一下吧。 1....使用R语言默认的方法：列选择 这一种，当然是简单粗暴的方法，想要哪一列，就把相关的列号提取出来，形成一个向量，进行操作即可。...像这种情况，解决办法有两种： 5.1 绝对引用函数 即使用select时，要用dplyr::select a3 = a2 %>% dplyr::select(ID,F1,y1,y2,y3) 这样也比较麻烦...5.2 放到环境变量中 「推荐的方法：」 r$> select = dplyr::select r$> a3 = a2 %>% select(ID,F1,y1,y2,y3) 推荐在载入包时，将下面代码放在开头...library(tidyverse) select = dplyr::select 6. 提取h开头的列 这里，用starts_with，会匹配开头为h的列。

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干货 | 男朋友老是说自己R语言很6，快来用这40道题目检测他

我们想计算数据表中第二列和第三列之间的相关性，下面代码中的哪个能实现这个目的？...20 R运行中的大部分工作都使用系统内存，如果同时采用大的数据集，当R的工作空间不能保证所有的R对象都保持在内存中时问题就出现了。在这样的情况下，移除无用的对象是一种解决方法。...22 在特征选择过程（feature selection）中使用下面的数据表（名称为table），列1和列2已经证明影响不显著。因此我们不会把这两个特性加入到我们的预测模型中。...（个）能选择“table”中列3到列6中的所有行？...25 处理字符串数据（string）是文本分析的一个重要组成部分，当创建参数符号或其它符号时，分割字符串经常是一项常用任务。下面命令行的输出是什么？

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玩转数据处理120题｜R语言版本

) df %>% summarise(avg_3 = roll_mean(col2, n=3)) 98 数据修改 题目：将数据按照第三列值的大小升序排列 难度：⭐⭐ R语言解法 df <- df...计算第一列与第二列之间的欧式距离 难度：⭐⭐⭐ 备注 不可以使用自定义函数 R语言解法 # 可以利用概念计算 res <- (df$col1 - df$col2) ^ 2 sqrt(sum(res))...：从CSV文件中读取指定数据 难度：⭐⭐ 备注 从数据1中的前10行中读取positionName, salary两列 R语言解法 #一步读取文件的指定列用readr包或者原生函数都没办法 #如果文件特别大又不想全部再选指定列可以用如下办法...#基本思想先读取较少的数据获取列名 #给目标列以外的列打上NULL导致第二次读取文件时NULL列丢失即可 res <- read.csv('数据1.csv',encoding = 'GBK',nrows...难度：⭐⭐ 备注 从数据2中读取数据并在读取数据时将薪资大于10000的为改为高 R语言解法 library(readr) df2 % mutate

8.7K10

学习小组Day6-bubble

学习R包R包是多个函数的集合，具有详细的说明和示例。学生信，R语言必学的原因是丰富的图表和Biocductor上面的各种生信分析R包。　包的使用是一通百通的。...1.安装并加载R包1.1 镜像设置也和Linux一样，官方源因受到网速影响比较慢，添加国内镜像源会方便很多这里需要用到两行代码# options函数就是设置R运行过程中的一些选项设置options("repos...bashrc/环境文件一样的R的环境文件.Rprofile即可首先用file.edit()来编辑文件：file.edit('~/.Rprofile')然后在文件中添加上述两行代码即可保存重新加载一下R（...具体讲解dplyr包的五个基础函数2.1 mutate(),新增列mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width)2.2 select(),按列筛选① 按列号筛选...select(test,1) # 选择第一列select(test,c(1,5)) # 选择第一和五列 select(test,Sepal.Length) # 直接选择列名② 按列名筛选select(test

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R语言第二章数据处理(9)数据合并

和dplyr包中的join函数进行数据框的合并，它们数据框合并的原理同样是数据框的合并原理是这样的：首先在A数据框某一指定列的每一行内容在B数据框表的指定列进逐行匹配，直到A中所有行匹配完为止。...这里的数据仍使用merge函数中的两个数据(略有修改)：作者信息数据和书籍信息数据。依照下面介绍的合并条件，这两个数据既有相同的内容，又有彼此中不存在的内容。...要求必须有相同列名的列 type为合并方式 inner，行：显示x，y中共有的行; 列：显示x，y中的所有列 left，行：显示x中所有的行; 列：显示x，y中的所有列，未匹配到的值，不论字符数字，全显示为...NA right，行：显示y中所有的行; 列：显示x，y中的所有列，未匹配到的值，不论字符数字，全显示为NA full，先显示x中所有的行在y中的匹配结果，接着显示y中未匹配上的内容 match匹配的规则...all匹配 inner_join函数 函数结果, 行：显示x中所有能在y中匹配到行; 列：显示x，y中的所有列 library(dplyr) # 单指标匹配 inner_join(data1,data2

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DAY06-R包学习

")library(dplyr)dplyr五个基础函数1.mutate()，新增列test <- iris[c(1:2,51:52,101:102),] #如果你的目的是选择 iris 数据集的第 1-...2 行，第 51-52 行和第 101-102 行的所有列，你需要使用逗号 , 在子集选择中明确区分行和列。...iris[c(1:2, 51:52, 101:102)]逗号尝试选择特定的行，但是语法实际指向了列，因为没有指定列的选择mutate(test,new = Sepal.Length*Sepal.Width...x表所有记录semi_joinsemi_join(x = test1, y = test2, by = 'x') #半连接, 返回能够与y表匹配的x表所有记录，不合并两表格，只针对x操作5.反连接：返回无法与...y表匹配的x表的所记录anti_joinanti_join(x = test2, y = test1, by = 'x') # 反向半连接，返回不能够与y表匹配的x表所有记录，不合并两表格，只针对x操作

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