首页
学习
活动
专区
圈层
工具
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往
  • 您找到你想要的搜索结果了吗?
    是的
    没有找到

    R语言绘制曲线图

    由于ggplot2中的geom_line()函数只能绘制折线图,需要用到ggalt提供的geom_xspline()函数绘制光滑的曲线图 geom_line 将所有点连接起来,是折线图但不平滑 geom_smooth.../stat_smooth一条平滑的线,但他是拟合曲线,不会遍历所有数据点 实现遍历所有点的光滑曲线需要用到插值原理 一个更好的选择是使用插值splines.这也是一个使用多项式的插值,但不是只使用一个(...",color="black"), axis.text = element_text(size=10,face="plain",color="black") ) image.png 通过R自带的...spline函数获得一系列插值点后用geom_line()绘制的曲线明显光滑了 spline_int <- as.data.frame(spline(mydata$x, mydata$y)) ggplot...axis.text = element_text(size=10,face="plain",color="black") ) image.png也可以直接用geom_xspline()函数 绘制填充面积的曲线图

    4.7K10

    R可视乎|等高线图

    简介 等高线图(contour map) 是可视化二维空间标量场的基本方法[1],可以将三维数据使用二维的方法可视化,同时用颜色视觉特征表示第三维数据,如地图上的等高线、天气预报中的等压线和等温线等。...含义:转换前第一行在转换后第一列为1,对应位置在第二列,第三列是对应值。 ? ? >> 设置颜色调色盘,以后详细讲解。...本篇视为《R语言数据可视化之美》学习笔记,并进行函数详细介绍与解释,其他可视化图可参考在菜单命令中搜索得到。对应代码与相关数据,请在我的github中获取(文末原文)。...参考资料 [1] R语言数据可视化之美: https://github.com/EasyChart/Beautiful-Visualization-with-R [2] Using 2D Contour...https://plotly.com/r/contour-plots/

    4.5K20

    R语言绘制火山图_r语言画曲线图

    常规的火山图中主要包含了两个重要信息,差异表达倍数(Fold Change值,简称FC,作图时会对FC进行log转化,根据logFC值的正负判断这些基因的表达量是上调了还是下调了)以及统计学显著性p值(...p-value,通常是FDR校正后的p值,根据校正后p值判断基因表达量上调或下调是否具有显著性)。...因此在判断差异基因时,与常规的统计学方法相比,除了p值,通常还会考虑差异倍数,即结合这两个统计结果筛选表达量显著上调或下调的基因(一般而言,差异倍数不能太小)。...红色点代表了癌组织中表达量显著上调的基因,蓝色的点代表了表达量显著下调的基因,灰色的点或者p值未达到显著性水平,或者差异倍数太低不具生物学代表性。...我们只要准备已经计算好的带有Fold Change值以及显著性p值等信息的做图文件,作图就可以了。如上提到,limma、edgeR、DESeq2、EBSeq等方法可计算这些数值。

    79750

    R语言绘图 | 给箱线图加个点

    箱线图是我们展示数据时常用的一种统计图形。但是箱线图有时候并不能很好的展示数据的离差,目前已经不被许多高水平的杂志接受了。在这里,小编教大家在箱线图上加点,更好的展示数据分布。...ggpubr是一个广泛应用于学术绘图的R包,可以让我们轻松绘制出用于发表的高质量图形。...## 安装R包 install.packages("ggpubr") ## 加载R包 library("ggpubr") ## 导入数据 traits <- read.table("input.txt"...","#E7B800","#FC4E07"),add="jitter",shape="Type") p 简单输入几行代码,带点的箱线图就绘制好啦!...图中的ns表示P值>0.05,*表示0.01<P值≤0.05,**表示0.001<P值≤0.01,***表示0.0001<P值≤0.001,****表示P值≤0.0001。

    2.9K40

    R语言之列线图的绘制应用

    它在医学领域中的应用由来已久,常见的有百分位列线图和概率列线图等。...因此在列线图的制作上,不能盲目地建立某个指标的列线图,只有当模型的预测效果得到了明确验证之后,方可对模型制作列线图,此时该列线图也会有很好的应用价值。...(摘自临床研究方法学园地) 接下来我们介绍在R语言中如何绘制以及分析列线图结果,前期的验证我们就不再赘述了,方法有很多。 首先我们导入需要的R包rms。我们以逻辑回归为例绘制列线图。...对于上图的结果分析:比如我们想看男性70岁的一个风险情况,首先我们在points坐标轴找到对应的男性,70岁的值,分别是65,70。...至此列线图除了前期的验证过程,后期的分析全部结束。

    4.5K40

    R-ggplot2 学术箱线图制作

    引言 之前有和群里的小伙伴讨论说"将之前Python-matplotlib 绘制的图用R-ggplot2重新绘制",也得到很多小伙伴的响应 ? ? 。...本期推文就推出箱线图(boxplot)的R-ggplot2 绘制方法,大家可以和 Python-matplotlib 箱线图绘制 这篇文章对比下。 02....(2)数据可视化 R-ggplot2 绘制箱线图很简单,主要为 geom_boxplot() ,先采用默认的参数绘制 ,代码如下: plot_pir 线图的宽、颜色、字体以及一些主题 颜色等,下面我们进行修改。...总结 R-ggplot2 绘制箱线图还是十分简单的,不仅拥有丰富 的图表元素设置函数、主题以及额外的第三方绘图包。当然,对绘图数据的要求也比较严格。大家觉得和Python 绘制 有什么不同呢?

    1.3K10

    R语言学习由浅入深路线图

    有这种疑问的人有福了,因为笔者将根据自己的经历总结一下R语言书籍的学习路线图以使Ruser少走些弯路。 本文分为6个部分,分别介绍初级入门,高级入门,绘图与可视化,计量经济学,时间序列分析,金融等。...1.初级入门 《An Introduction to R》,这是官方的入门小册子。其有中文版,由丁国徽翻译,译名为《R导论》。《R4Beginners》,这本小册子有中文版应该叫《R入门》。...有了这些基础之后,要去读一些经典书籍比较全面的入门书籍,比如《统计建模与R软件》,国外还有《R Cookbook》和《R in action》,本人没有看过,因此不便评论。...《Statistics with R》和《The R book》。...with R》。

    98050

    R中重复值、缺失值及空格值的处理

    1、R中重复值的处理 unique函数作用:把数据结构中,行相同的数据去除。...2、R中缺失值的处理 缺失值的产生 ①有些信息暂时无法获取 ②有些信息被遗漏或者错误处理了 缺失值的处理方式 ①数据补齐(例如用平均值填充) ②删除对应缺失值(如果数据量少的时候慎用) ③不处理 na.omit...缺失数据清洗 #读取数据 data <- read.csv('1.csv', fileEncoding = "UTF-8"); #清洗空数据 new_data <- na.omit(data) 3、R中空格值的处理...'); library(raster); #空格值处理 new_data <- trim(data) 注意install.packages('raster', repos='http://cran.r-project.org...') 使用R.studio的小伙伴,在下载包很慢的的时候,可以使用R的官网站点,在中国地区会快很多,以解决此问题。

    8.2K100

    R语言-缺失值(二)

    运行结果可知,0表示变量列中有缺失值,1表示变量列中缺失值,第一行表示无缺失值,第二行表示除了span之外无缺失值,第一列表示各个缺失值模式实例个数,最后一列表示各模式中有缺失值的变量个数。...可看到,sleep数据集有42例没有缺失值,仅2个实例缺失span,9个实例同时缺失NanD和Dream,数据集总共包含42x0+2x1+.....1x3=38个缺失值 aggr()函数不仅仅绘制每个变量的缺失值数...左边的图可知缺失值数量,NonD有最大的缺失值数14个,右边的图显示有2个哺乳动物缺失NonD、Dream、Sleep评分。42个动物没有缺失值。...左边的箱线图展示的是 (深灰色 )与不包括 ( 红色 )Gest 的Dream变量分布。注意,在灰度图上红色是更深的阴影。 四个红点代表缺失了Gest得分的Dream值。...两个变量均有缺失值的观测个数在两边界交叉处 (左下角 )蓝色标出。

    68630
    领券