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JAGS递归模型
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我是使用JAGS/WinBUGS/STAN语言进行贝叶斯统计分析的新手。我正在尝试拟合扩展的SIR模型，错误似乎位于第2行，因为我总是收到警告："Error parsing model file: error on line 2 near "for"“ 但是我无法理解这个错误beta ~ dbeta(0.1, 0.3)"T <- nrow(y)
jag
浏览 47提问于2020-12-21得票数 0
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是否有可能误用JAGS作为从具有已知参数的模型生成数据的工具？我需要从预定义的模型中采样数据点，以便进行模拟研究，并测试我在R中开发的模型的威力。不幸的是，该模型有些棘手(带有AR和VAR组件的层次结构)，而且我无法在R中直接模拟数据，而在互联网上搜索时，我发现了一个，其中数据是在JAGS中使用data{}块生成的。在这篇文章中，作者直接估算了JAGS模型。因为我在R中有我的模型，所以我想不使用model{}块将数据传输回R。这个是可
浏览 5提问于2016-07-10得票数 1
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在运行jags模型时，我得到了以下错误消息:jags.model中的模块glm加载错误(model.file，data = data，inits = init.values，n.chains = n.chains，：这是我的密码：install.packages('rjags')
library(rjags)library('R2jag
浏览 5提问于2022-03-27得票数 0
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我正在尝试使用在R中实现的JAGS将多变量模型拟合到物种组成数据。我有3个物种相对丰度的数据(介于0，1之间)，其中两个是相关的。下面是生成类似数据的代码。我想对这些数据拟合一个仅截距模型，使用dirlichet分布来解释因变量之间的协方差，这是beta分布的多变量扩展。library(runjags)
jags.modeldat
浏览 21提问于2018-03-02得票数 3
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)The following object is masked from ‘package:coda’:Warningmessage:我正在运行一个jags模型，其中包含作为'dgenpareto‘的广义Pareto我使用以下命令行来运行我的jags模型：
> jags</em
浏览 10提问于2022-08-01得票数 0
我试图按照"Lahoz-Monfort JJ，Guillera-Arroita G，Tingley R (2015)统计方法“中提供的指令在R2jags中运行这个脚本。<-list(Y=hh,S=S,K=K,p10_max=p10_max) Thoropa_model<-jags(data = jags.data, inits = jags</e
浏览 5提问于2021-10-02得票数 0
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我已经使用rjags实现了LDA模型。我用以下命令成功地获得了最终样本： data = data, n.adapt = 100)
浏览 4提问于2016-04-25得票数 0
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我使用包rjags在R中执行MCMC，并且我希望保存函数jags.model的输出，以便以后在另一个R会话中使用。<- jags.model(textConnection(model.str), data = list(x = x, N = N))我可以生成这样的mu示例：Thinning interval = 1 # [1,] 0.2312028# attr(,"class")
# [1] "mcmc.list"
浏览 1提问于2014-08-21得票数 5
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我使用R中的runjags包在一个单独的处理节点上运行每个链的贝叶斯统计模型，我希望通过使用run.jags包在并行循环中嵌套run.jags调用来一次适应多个模型。下面是一个错误消息示例：
socketConnection中的错误(“localhost”、port = port、server= TRUE、blocking = TRUE )：无法打开连接
下面是一些生成数据并适合两个模型
浏览 2提问于2018-12-03得票数 3
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我正在使用RJAGS修改现有的模型。我想并行运行链，偶尔检查Gelman收敛诊断，看看是否需要继续运行。如果我不重新编译模型，RJAGS会抱怨。当链停止时，是否有一种方法来存储链的位置，这样我就可以从我停止的地方重新初始化？这里我将给出一个非常简单的例子。[[i]]$recompile()
jags.samples <- coda.samples(jags[[i]],c('mu','tau'),100)
浏览 0提问于2015-04-06得票数 6
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最近，我开始使用JAGS，并在R中调用它，最后我得到了用代码链接到R的jags。格式将JAGS模型数据保存在一个单独的文件中(就像我学到的那样)。, 1000) : object 'jags' not found n.chains = 4,
jags
浏览 0提问于2014-02-20得票数 3
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我正在使用R中的JAGS将威布尔模型拟合到离散值。我可以将威布尔模型拟合到连续数据，但当我切换到离散值时，我会遇到麻烦。以下是一些数据，以及在JAGS中拟合威布尔模型的代码：y <- rweibull(200, shape = 1, scale= 0.9)library(runj
浏览 5提问于2017-08-25得票数 1
我用R2jags做了一个模型。我喜欢jags语法，但是我发现R2jags产生的输出并不容易使用。我最近读到了关于rstanarm包的内容。它有许多有用的功能，并且得到了tidybayes和bayesplot包的良好支持，以便轻松地进行模型诊断和可视化。但是，我不喜欢用rstanarm编写模型的语法。理想情况下，我希望在这两个领域中取得最佳效果，即用R2jags编写模型，并将输出转换为Stanreg对象以使用rstanarm函数。
这有可能吗？如果是这样
浏览 4提问于2020-09-09得票数 0
您将如何使用rjags将现有值(矩阵、向量)传递到JAGS模型？下面是一个示例代码： A = inverse(B)不知怎么的，我想把B = diag(100)传递到上面的模型中，我应该怎么做呢？
浏览 8提问于2015-08-03得票数 1
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jags.model需要一个包含BUGS模型的文件名作为它的第一个参数。为了将所有内容包含在一个脚本中，我有时使用writeLines命令将BUGS模型写入文件。Y1[i] ~ dnorm(Beta0, Beta1) Beta0 ~ dunif(1, 5)}, "m1.jags")
mod1 <- jags.model("m1.jags", dat
浏览 2提问于2012-05-20得票数 4
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我正在使用r2openbugs来拟合一组模型。这要求我为我尝试的每个模型创建一个新的模型文件。我有一套组合，我想测试(不同的协变量集，是否包括随机效应，是否计算预测等)。我想要创建一个脚本，它接受一组参数(包含的协变量列表，随机效应和预测的T/F )并输出一个有效的openbug模型文件。当前针对问题的尝试:我目前正在编写我希望使用的每个模型，并使用R闭包在它们之间进行选择。然而，这显然是重复了大量的代码，而且需要很长时间。我确信可以根据某些参数为基本模型添加/修改文
浏览 2提问于2017-06-15得票数 2
我把R中runjags模型的输出作为mcmc.list。下面是生成3条1,000个样本链的代码。我想把所有的12条链都剪到最后的400个样品上。下面是运行runjags模型并将输出转换为mcmc.list的一些数据model {for (i in 1:N){y.hat[i] <- m0m0 ~ dnorm(0, .0001)sigma ~ dunif(0, 100)
浏览 1提问于2018-04-25得票数 1
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我的模型失败了，错误如下： Error in rjags::jags.model在这种情况下，有没有办法告诉run.jags或JAGS自己重试并重新运行模型？例如，要告诉他再进行N次尝试，以正确初始化模型。这将是非常合乎逻辑的事情，而不只是失败。附言:请注意，我目前正在
浏览 8提问于2015-02-26得票数 0
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我正在使用jags来模拟贝叶斯框架中的工程反问题。我想知道我是否可以在jags模型中包含一个函数来定义µ参数。mu[i]=function(c,fi){...} c ~ dnorm( 9 , 1/9 )}谢谢
浏览 0提问于2018-09-03得票数 1
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