首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往
您找到你想要的搜索结果了吗?
是的
没有找到

1代码计算肿瘤突变负荷TMB

我们只要1代码即可,即使是初学者也可以轻松搞定! 下载和整理MAF数据的教程请参考:TCGA的maf突变文件不能下载了?直接用TCGAbiolinks包搞定!...就一个TMB计算还要写几十代码,真没必要!...2.0 2.5 plot of chunk unnamed-chunk-2 上面的1代码中的captureSize默认是50,有用30的,38的,35的,五花八门,我就用38了。...加载临床数据,临床数据的下载可以参考推文: 新版TCGA数据库学习:批量下载数据 1代码提取6种TCGA表达矩阵2.0版 1代码提取TCGA的6种表达矩阵是有视频教程的 我更推荐1代码系列获取的临床信息...可能是最适合初学者的TCGA官网下载和表达矩阵整理教程 新版TCGAbiolinks包学习:可视化 1代码提取6种TCGA表达矩阵和临床信息 1代码提取6种TCGA表达矩阵2.0版 1代码提取TCGA

1.6K40

1Python代码实现:PDF转Word。

之前给大家介绍了:1Python代码,实现Word批量转换PDF。 今天,给大家介绍python-office近期更新的功能之一:1代码,实现PDF转Word。 真的很实用! 1....安装python-office 安装很简单,在有python环境的电脑上,只需要执行下面这一命令。...代码 # 导入这个库:python-office,简写为office import office # 1代码,实现 PDF 转 Word office.pdf.pdf2docx(file_path=...'程序员晚枫.pdf') # 参数说明: # file_path:存放PDF的位置 + PDF的文件名,例如:c://test//程序员晚枫.pdf 3.提交需求 1代码实现复杂功能,是不是很简单.../CoderWanFeng/python-office 4. python-office库,近期添加的功能 生成二维码、翻译、提取音频、重命名文件/文件夹、图片加水印 实现Word批量转换PDF 一Python

59310

R语言亚组分析1代码实现!

使用survival包中的colon数据集用于演示,这是一份关于结肠癌患者的生存数据,共有1858,16列,共分为3个组,1个观察组+2个治疗组,观察他们发生终点事件的差异。...:年龄 obstruct:肠梗阻,1是有 perfor:肠穿孔,1是有 adhere:和附近器官粘连,1是有 nodes:转移的淋巴结数量 status:生存状态,0代表删失,1代表发生终点事件 differ...:肿瘤分化程度,1-well,2-moderate,3-poor extent:局部扩散情况,1-submucosa,2-muscle,3-serosa,4-contiguous structures...surg:手术后多久了,1-long,2-short node4:是否有超过4个阳性淋巴结,1代表是 time:生存时间 etype:终点事件类型,1-复发,2-死亡 rm(list = ls()) library...(rx==3,0,1), rx=factor(rx,levels=c(0,1)) ) str(df) 亚组分析 使用jstable,只要1代码即可!!!

1K20

1代码完成8种免疫浸润分析

这个包整合了常见的10种免疫浸润方法,只需要1代码即可实现,而且输出的格式统一,方便进行可视化和数据整合操作! 完全不需要你自己分别进行操作,极大地简化了进行免疫浸润分析的步骤。...下面就给大家演示如何使用1代码实现8种免疫浸润方法! 首先是安装R包。...13.60652 14.53353 dim(expr_coad) ## [1] 17170 524 这样我们的表达矩阵就整理好了,下面就开始演示1代码实现...1代码实现8种免疫浸润分析 所有方法只要通过deconvo_tme()函数即可完成,只要在method中选择不同的方法即可!也不需要自己再去寻找各种方法对应的免疫细胞集,都是内置好的!...所有的结果都是:是样本,列是细胞,名是样本名,列名是细胞名,并且每种细胞名后面都有相应的方法名字的后缀,方便标识!

95330
领券