使用mpicc ,[[INVALID],INVALID] ORTE_ERROR_LOG: A system-required executable either could not be found or was not executable by this user in file ess_singleton_module.c at line 231
从 https://github.com/ParRes/Kernels 下载最新版本 Kernels-default.zip。
由于CASCI/CASSCF计算量随活性空间呈指数增长,超过(16,16)的计算在高配机器上几乎不可能。近似求解大活性空间的方法通常有DMRG, selected CI等等。Block-1.5是做DMRG计算的经典程序,由Sandeep Sharma和Garnet Chan开发,虽然早在5年前就不更新了,但其计算速度仍高于很多同类程序。Block-1.5一般结合PySCF使用,可以进行DMRG-CASCI,DMRG-CASSCF和DMRG-SC-NEVPT2等计算。笔者之前在公众号上将该程序的安装拆分为几篇短文
CESM是一个完全耦合的地球系统的数值模拟,由大气、海洋、冰、陆地表面、碳循环和其他组成部分组成。CESM包括一个气候模型,提供地球过去、现在和未来的模拟。CESM是CCSM的升级版,2010年,国家科学基金会(NSF)和美国能源部(DoE)的重要资金(NSF)和重要资金的全球动力学部门(CGD)在2010年发布了CESM1。
针对目前国内Rosetta中文资源甚少、零散、求助难的问题,我搭建了一个Rosetta中文社区论坛(beta)。
ORCA官方于2021年7月1日发布了5.0版本,前期从ORCA论坛上来看,有不少同行都非常期待。除了昨天的线上发布会,今天还会有一个线上的论坛,感兴趣的朋友可以去官方论坛查看相关帖子:
IB(InfiniBand)和 RDMA(Remote Direct Memory Access)是一种高性能网络技术,通常用于加速数据传输。它们不是基于传统的 TCP/IP 协议栈,而是使用自己的协议栈,以实现低延迟、高带宽的数据传输。
虽然笔者写过 ARM 比 Intel CPU 要有低功耗、高性能等优势,但是目前来说 Intel 芯片仍然是主流,毕竟大部分实验室所使用的服务器、工作站以及个人普通 PC 基本上都是 Intel 芯片。在 Intel 平台我们可能对于软件和依赖库的支持不需要太担心,正常来说不管 Linux 或者 Unix 系统都会有。这里笔者采用 Ubuntu Server 20.04 来举例介绍 Intel 平台下 CONQUEST 的编译安装。
安装ompi 准备ompi安装包 下载ompi:https://github.com/open-mpi/ompi/releases 版本建议大于4.0.0。 因为发现openmpi-4.0.0里面没有configure,只找到config,因此我自己用的是openmpi-4.0.1.tar.gz。 把ompi压缩包上传到要安装horovod的服务器。 安装ompi 我没有完全按照horovod指向的教程来,而是根据ompi的README.md做了些许修改: # 解压安装包 gunzip -c ope
近期由于一些原因接触到了并行计算,对于这个陌生的领域我最先接触到的是MPI框架。MPI(Message Passing Interface),可以理解为是一种独立于语言的信息传递标准。目前它有两种具体的实现OpenMPI和MPICH,也就是说如果我们要使用MPI标准进行并行计算,就需要安装OpenMPI或MPICH库。本文以MPICH为例,在ubantu中安装MPI的环境,并对vscode进行配置。
Dalton是一款开源免费的量子化学程序,主要特色是支持一大堆性质的计算,例如DFT下的二次响应计算(常规TDDFT计算仅是线性相应),MCSCF波函数下的核磁NMR计算等等,以及各类激发态方法。当然,也有一些高精度单参考方法(如MP2-R12和CCSD-R12等),但较少用到。其PDF手册在
MPI是一个跨语言的通讯协议,用于并发编程。MPI标准定义了一组具有可移植性的编程接口。
C++11, C++14, 以及 C++17. 我猜你已经看出了其中的命名模式: 今年(2017)的晚些时候,我们便会迎来新的C++标准(C++17). 今年的3月份, C++17已经达到了标准草案阶段. 在我深入新标准的细节之前, 让我们先来总体浏览一下C++17.(译注:作者的文章写于2017年初,当时C++17标准仍未正式发布)
工友在机器上面编译了好几天也失败了,后面又换了MAC(笑死M1的片子,开虚拟机编译)又是报错的一天。
随着近年来 AMD、Apple 等科技公司对于 ARM 芯片的研发技术的成熟,以 MacbookPro M1 为代表的 ARM 架构的普通 PC 开始进入市场。其实由于 ARM 的低功耗、高性能的优势,以 AWS、Azure 为首的云服务产商早已经推出了 ARM 服务器。当然,操作系统提供商们也对 ARM 架构的 CPU 进行了支持,比如 Ubuntu Server 就有 ARM 版本。还有像树莓派、路由器等这样的基于 ARM 芯片运行的小平台,都是 ARM 操作系统。截止现在为止,各种常用的软件、依赖库都相继支持 ARM 芯片,使得 ARM 版本的普通 PC、服务器也有了很大的发展势头。
//站点:www.cndev-lab.com //所有稿件均有版权,如要转载,请务必著名出处和作者 #include <iostream> using namespace std; class Vehicle { public: Vehicle(int weight = 0) { Vehicle::weight = weight; } void SetWeight(int weight) { cout<<"重新设置重量"<<endl; Vehicle::weight = weight; } virtual void ShowMe() = 0; protected: int weight; }; class Car:public Vehicle//汽车 { public: Car(int weight=0,int aird=0):Vehicle(weight) { Car::aird = aird; } void ShowMe() { cout<<"我是汽车!"<<endl; } protected: int aird; }; class Boat:public Vehicle//船 { public: Boat(int weight=0,float tonnage=0):Vehicle(weight) { Boat::tonnage = tonnage; } void ShowMe() { cout<<"我是船!"<<endl; } protected: float tonnage; }; class AmphibianCar:public Car,public Boat//水陆两用汽车,多重继承的体现 { public: AmphibianCar(int weight,int aird,float tonnage) :Vehicle(weight),Car(weight,aird),Boat(weight,tonnage) //多重继承要注意调用基类构造函数 { } void ShowMe() { cout<<"我是水陆两用汽车!"<<endl; } }; int main() { AmphibianCar a(4,200,1.35f);//错误 a.SetWeight(3);//错误 system("pause"); } 上面的代码从表面看,看不出有明显的语发错误,但是它是不能够通过编译的。这有是为什么呢? 这是由于多重继承带来的继承的模糊性带来的问题。 先看如下的图示:
CP2K安装的方法有很多(我们曾分享过CP2K 5.1版本的安装及简单介绍),笔者最近尝试在课题组新买的服务器上从源码编译安装CP2K,过程中遇到了各种问题。根据这次安装的经验,在此笔者想和大家分享如何从零开始安装CP2K(支持PLUMED)。
安装mpi4py所需要的依赖包(python2.7版本/Cpython/Openmpi) 1.源码包安装Python2.7版本
具体来讲,本文首先介绍了分布式计算的基本概念,以及分布式计算如何用于深度学习。然后,列举了配置处理分布式应用的环境的标准需求(硬件和软件)。最后,为了提供亲身实践的经验,本文从理论角度和实现的角度演示了一个用于训练深度学习模型的分布式算法(同步随机梯度下降,synchronous SGD)。
AI 研习社消息,日前, Facebook 人工智能研究院发布 wav2letter 工具包,它是一个简单高效的端到端自动语音识别(ASR)系统,实现了 Wav2Letter: an End-to-End ConvNet-based Speech Recognition System 和 Letter-Based Speech Recognition with Gated ConvNets 这两篇论文中提出的架构。如果大家想现在就开始使用这个工具进行语音识别,Facebook 提供 Librispeech
CFOUR程序的全称为Coupled-Cluster techniques for Computational Chemistry,是一款专注于高精度量子化学计算的程序。从名字可以看出,其专长为耦合簇方法,支持在CC级别下做单点、几何结构优化(如CCSD(T)级别)、激发态计算(如EOM-CCSDT)、性质计算(如CCSD(T)级别的NMR计算)。其官方网站为
业界AI应用中,GPU的使用逐渐增加,腾讯云TACO是一种异构计算加速软件服务,搭配腾讯自研的软硬件协同优化组件和硬件厂商特有优化方案,支持物理机、云服务器、容器等产品的计算加速、图形渲染、视频转码各个应用场景,帮助用户实现全方位全场景的降本增效。
PGL图学习之图游走类metapath2vec模型[系列五] 本项目链接:https://aistudio.baidu.com/aistudio/projectdetail/5009827?contr
导致CPU100%的原因很多,而程序中出现死循环就是原因之一。然而,并不是每个人在工作中都有机会踩中这个坑。我就是其中一个没踩过的。人生似乎有些不完整。
大家对转录本测序已经耳濡目染,但是我们由于当时组织的选择并不能做到100% 的肿瘤,因为比例很小也就直接忽略了。为此,很多学者就在研究相关的算法旨在解决这个问题。我们今天就为大家介绍一个在R语言中实现的对样本测序的反卷积算法。我们引用作者文章(Wang Z, Cao S, Morris J S, et al. Transcriptome Deconvolutionof Heterogeneous Tumor Samples with Immune Infiltration[J]. iScience, 2018, 9:451-460.)中的图形摘要做个简单的描述:
如何在Atmail上构建XSS蠕虫 这篇博客文章由高级安全分析师Zach Julian撰写; 你可以在Twitter上与他联系。 Atmail是云端和本地电子邮件托管的受欢迎的提供商。 作为DreamHost的atmail用户,在我工作期间,我看到了几个令人印象深刻的电子邮件跨站点脚本(XSS)攻击,我试图在他们的webmail前端找到一个xss漏洞。 几个小时后我发现了一个有效载荷,但是想更进一步的利用他。 最着名的XSS蠕虫病例在2005年影响了MySpace ,2014年的TweetDeck更
PGL图学习之图游走类metapath2vec模型系列五 本项目链接:https://aistudio.baidu.com/aistudio/projectdetail/5009827?contrib
本文主要介绍了分布式深度学习的各框架以及一些分布式深度学习训练中的常见问题,如:docker及ssh环境问题、nccl多机通信问题等。
面向对象的基本概念,面向对象编程,oop,面向对象,面向对象的分析,面向对象的设计,面向对象的编程,什么是类。
接下来我们检测GPU是否安装成功,如果没有安装GPU,会显示warning说是CPU only,最后test pass。这样说明安装成功
Horovod 是一款基于 AllReduce 的分布式训练框架。凭借其对 TensorFlow、PyTorch 等主流深度学习框架的支持,以及通信优化等特点,Horovod 被广泛应用于数据并行的训练中。
使用HTTP Request插件,我们能在Jenkins pipeline中发送HTTP请求给第三方系统。这是最通用的Jenkins与第三方系统集成的方式之一。
f:\goproject\src\go_code\data_structure>go run main.go ==========员工菜单========== insert 表示添加员工 show 表示显示员工 find 表示查询员工 exit 表示退出员工 请输入你的选择: insert 请输入员工id: 1 请输入员工名字: bob ==========员工菜单========== insert 表示添加员工 show 表示显示员工 find 表示查询员工 exit 表示退出员工 请输入你的选择: insert 请输入员工id: 8 请输入员工名字: mike ==========员工菜单========== insert 表示添加员工 show 表示显示员工 find 表示查询员工 exit 表示退出员工 请输入你的选择: insert 请输入员工id: 15 请输入员工名字: tom ==========员工菜单========== insert 表示添加员工 show 表示显示员工 find 表示查询员工 exit 表示退出员工 请输入你的选择: insert 请输入员工id: 57 请输入员工名字: pop ==========员工菜单========== insert 表示添加员工 show 表示显示员工 find 表示查询员工 exit 表示退出员工 请输入你的选择: show 当前0链表为空 链表:1,员工id:1,员工名字:bob-->链表:1,员工id:8,员工名字:mike-->链表:1,员工id:15,员工名字:tom-->链表:1,员工id:57,员工名字:pop--> 当前2链表为空 当前3链表为空 当前4链表为空 当前5链表为空 当前6链表为空 ==========员工菜单========== insert 表示添加员工 show 表示显示员工 find 表示查询员工 exit 表示退出员工 请输入你的选择: insert 请输入员工id: 36 请输入员工名字: bib ==========员工菜单========== insert 表示添加员工 show 表示显示员工 find 表示查询员工 exit 表示退出员工 请输入你的选择: show 当前0链表为空 链表:1,员工id:1,员工名字:bob-->链表:1,员工id:8,员工名字:mike-->链表:1,员工id:15,员工名字:tom-->链表:1,员工id:36,员工名字:bib-->链表:1,员工id:57,员工名字:pop--> 当前2链表为空 当前3链表为空 当前4链表为空 当前5链表为空 当前6链表为空 ==========员工菜单========== insert 表示添加员工 show 表示显示员工 find 表示查询员工 exit 表示退出员工 请输入你的选择: insert 请输入员工id: 12 请输入员工名字: viv ==========员工菜单========== insert 表示添加员工 show 表示显示员工 find 表示查询员工 exit 表示退出员工 请输入你的选择: show 当前0链表为空 链表:1,员工id:1,员工名字:bob-->链表:1,员工id:8,员工名字:mike-->链表:1,员工id:15,员工名字:tom-->链表:1,员工id:36,员工名字:bib-->链表:1,员工id:57,员工名字:pop--> 当前2链表为空 当前3链表为空 当前4链表为空 链表:5,员工id:12,员工名字:viv--> 当前6链表为空 ==========员工菜单========== insert 表示添加员工 show 表示显示员工 find 表示查询员工 exit 表示退出员工 请输入你的选择: find 请输入你要查找的id: 12 链表5找到该员工 12 ==========员工菜单========== insert 表示添加员工 show 表示显示员工 find 表示查询员工 exit 表示退出员工 请输入你的选择: find 请输入你要查找的id: 7 id=7的员工不存在 ==========员工菜单========== insert 表示添加员工 show 表示显示员工 find 表示查询员工 exit 表示退出员工 请输入你的选择: exit
上一篇说的是表单布局上的变化,也就是通过TR、TD的设置,实现了多行多列的效果。那么格子画好了,我们 可以往里面放控件了。上次都是用的文本框,这个显然是不行的,还要扩大这个范围。 这个控件的范围就比较大了,不光是TextBox、DropDownList,还有HTM编辑器这类的,都是可能会往里面放的,当然象GridView这样的就先不考虑了。另外还要可以扩展,可以随时增加新的子控件。 那么控件得类型这么多,要如何控制呢?第一用基类,第二用接口。 基类是.net Fram
HCA方案将所有的信道分为两部分:一部分信道固定配置给某些小区,即部分信道隔离;另一部分信道则保留在中心存储区中,为系统中的所有用户所共享,即部分信道共享。HCA是FCA和DCA的折中,故成为混合分配。(关于FCA和DCA参见相应词条)
本文介绍了如何在 Houdini 中创建一个简单的程序化生成工具,该工具可以根据输入的参数自动生成相应的模型和材质。通过使用 Houdini 的节点和 Python 脚本,可以创建一个自定义的参数驱动的生成工具,从而大大提高生产效率。
CSG 构造实体几何这个概念在工业水利水电施工上、游戏上已经有很多人使用了,最简单的实体表示叫作体元,通常是形状简单的物体,如立方体、圆柱体、棱柱、棱锥、球体、圆锥等。根据每个软件包的不同这些体元也有所不同,在一些软件包中可以使用弯曲的物体进行 CSG 处理,在另外一些软件包中则不支持这些功能。构造物体就是将体元根据集合论的布尔逻辑组合在一起,这些运算包括:并集、交集以及补集。我们一般可以用 CSG 来将简单的模型合在一起生成复杂的模型,这样在构造模型的时候会省很多力。 HT 中的 ht.CSGNode 图
本公众号之前发过《离线编译OpenMolcas+QCMaquis》一文,成功安装后可进行DMRG-NEVPT2和DMRG-PDFT计算。但其中需要编译QCMaquis、 HDF5、GSL和Boost库,过程颇为繁琐。笔者发现有的小伙伴不需要做DMRG计算,只想用OpenMolcas中最核心、最特色的功能——CASSCF、CASPT2、ic-MRCISD和MC-PDFT方法,则安装过程可以大大简化。
This parallel program performs writes and reads to/from files under several sets of conditions and reports the resulting throughput rates.
编写|PaddlePaddle 排版|wangp 本文将介绍如何使用PaddlePaddle在不同的集群框架下完成分布式训练。分布式训练架构如下图所示: B.计算节点(Trainer): 每个trai
原文:http://showme.codes/2019-02-23/jenkins-script-console-in-practice/
Atmail是一个热门的云服务以及电子邮件托管提供商,目前有很多公司、主机服务商和ISP都在使用Atmail,比如说DreamHost、LegalShield (美国)、m:tel(波斯尼亚)、iiNet和Optus (澳大利亚)。
Ubuntu18.04安装ROS的版本为ros-melodic Ubuntu16.04安装ROS的版本为ros-kinetic
建设性的立体几何具有许多实际用途,它用于需要简单几何对象的情况下,或者数学精度很重要的地方,几乎所有的工程 CAD 软件包都使用 CSG(可以用于表示刀具切削,以及零件必须配合在一起的特征)。CSG 是 Constructive Solid Geometry 建模技术的简称,通过裁剪 subtract、融合 union 和相交 intersect 的运算,组合出复杂模型效果,HT 封装了 ht.CSGNode 和 ht.CSGShape 等图元类型来支持 CSG 的组合功能,常用于墙面的门窗挖空凿洞的应用场
Step2:sudo apt-get install openmpi-bin
本文介绍如何使用 Jenkins + Ansible 实现对 Nginx 的自动化部署。最终达到的效果有如下几点:
构造实体几何CSG全称Constructive solid geometry,是3D计算机图形学中构建模型的常用技术,可通过合并Union、相减Subtraction和相交Intersction的三种
Amber是一套分子动力学模拟程序,我们今天来说下如何使用云服务器安装部署这套程序。
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