您将4个不同“数字”的字符串解释为数字,因此以4为基数.如果您有一串实际数字,范围为0-3,则可以让int()真正快速地生成一个整数.
def seq_to_int(seq, _m=str.maketrans...请注意,这将生成一个整数对象,而不是零和一个字符的二进制字符串:
>>> seq_to_int(‘TGTGAGAAGCACCATAAAAGGCGTTGTG’)
67026852874722286
>>>...8字节整数表示形式.在上面的输出示例中,我使用format()字符串分别将该整数值格式化为十六进制和二进制字符串,然后将这些表示形式零填充到64位数字的正确位数....([choice(‘ATCG’) for _ in range(28)]) for _ in range(10 ** 6)]
在使用2.9 GHz Intel Core i7的Macbook Pro和Python...要将其与到目前为止发布的其他方法进行比较,还需要调整一些方法以产生整数,并将其包装到函数中:
def seq_to_int_alexhall_a(seq, mapping={‘A’: b’00’, ‘C