首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往
您找到你想要的搜索结果了吗?
是的
没有找到

RNAvelocity1:RNA速率简介及scVelo安装

测量单个细胞中的基因活性需要破坏这些细胞以读取其内容,这使得研究动态过程和了解细胞命运决定具有挑战性。La Manno et al. (Nature, 2018)[1]引入了 RNA 速率的概念,利用新转录的未剪接的前体 mRNA 和成熟的剪接 mRNA 可以在常见的单细胞 RNA-seq 流程中区分的事实,可以恢复定向动态信息,前者可通过内含子的存在检测。这种不仅测量基因活性,而且测量它们在单个细胞中的变化(RNA 速率)的概念,开辟了研究细胞分化的新方法。最初提出的框架将速率作为观察到的剪接和未剪接 mRNA 的比率与推断的稳态的偏差。如果违反了共同剪接速率的中心假设和对具有稳态 mRNA 水平的完整剪接动力学的观察,则会出现速率估计错误。

01
领券