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R︱高效数据操作——data.table包(实战心得、dplyr对比、key灵活用法、数据合并

data.table可是比dplyr以及Python中的pandas还好用的数据处理方式。...(参考来源:R高效数据处理包dplyr和data.table,你选哪个?) ?...最常见的合并函数就是merge,还有sql的方式(常见的合并方式可见: R语言数据合并数据增减、不等长合并 )。...在data.table中有三类数据合并的方式: 1、直接用[] data_one[data_two,nomatch=NA,mult="all"] 以第一个数据为基准,依据key进行合并,只出现重复部分...参考文献: 些许案例,代码参考自以下博客,感谢你们的辛勤: 1、R语言data.table简介 2、超高性能数据处理包data.table 3、R语言data.table速查手册 4、R高效数据处理包

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左手用R右手Python系列——数据合并与追加

今天这篇跟大家介绍R语言与Python数据处理中的第二个小知识点——数据合并与追加。...针对数据合并与追加,RPython中都有对应的函数可以快速完成需求,根据合并与追加的使用场景,这里我将本文内容分成三部分: 数据合并(简单合并,无需匹配) 数据合并(匹配合并数据追加 数据合并(简单合并...merge plyr::join dplyr::left/right/inter/full_join 这里为了节省时间,只介绍第一种基础函数,欲了解详情,可以查看这篇历史文章: (R语言数据处理——数据合并与追加...数据追加: 数据追加通常只需保证数据及的宽度一致且列字段名称一致,相对来说比较简单。在R语言和Python中,也很好实现。...本文汇总: 数据合并(简单合并R: cbind() dplyr::bind_cols() Python: Pandas-cancat() 数据合并(匹配和并) R: merge plyr::join

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将基因组数据分类并写出文件,python,awk,R data.table速度PK

由于基因组数据过大,想进一步用R语言处理担心系统内存不够,因此想着将文件染色体拆分,发现python,awk,R 语言都能够非常简单快捷的实现,那么速度是否有差距呢,因此在跑几个50G的大文件之前...,先用了244MB的数据对各个脚本进行测试,并且将其速度进行对比。...最后用R语言data.table包进行处理,data.table是data.frame的高级版,在速度上作了很大的改进,但是和awk和python相比,具有优势吗? 1 #!...用时10.6秒,发现刚刚读完数据,立刻就处理和写出完毕,处理和写出时间非常短,因此总体用时较短。...总结 虽然都是逐行处理,但由上述结果猜测awk内部运行并没有python快,但awk书写一行代码搞定,书写速度快,至于pythondata.table慢,猜测原因是R data.table用C语言写

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数据流编程教程:R语言与DataFrame

DBI DBI是一个为R数据库通讯的数据库接口。相当于Java里面的DAO,Python里的Torndb和Tornlite,方便多种关系型数据库的SQL请求。...此外,separate和union方法提供了数据分组拆分、合并的功能,应用在nominal数据的转化上。...2. jsonlite 类似于Python中的json库,参考前文 [[原]数据流编程教程:R语言与非结构化数据共舞](https://segmentfault.com/a/11......(x, y): x 和 y 的并集(行) setdiff(x, y): x 和 y 的补集 (在x中不在y中) 更多详细操作可以参考由SupStats翻译的 数据再加工速查表,比Python的老鼠书直观很多...3.R Tutorial: Data Frame 4.Python Pandas 官方文档 5.知乎:R语言读大数据? 6.知乎的高分问答:如何使用 ggplot2?

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R语言学习笔记之——数据处理神器data.table

合理选择一套自己的数据处理工具组合算是挺艰难的选择,因为这个涉及到使用习惯和迁移成本的问题,比如你先熟知了R语言的基础绘图系统,在没有强大的驱动力的情况下,你可能不太愿意画大把时间去研究ggplot2,...data.table 1、I/O性能: data.table的被推崇的重要原因就是他的IO吞吐性能在R语言诸多包中首屈一指,这里以一个1.6G多的2015年纽约自行车出行数据集为例来检验其性能到底如何,...数据合并data.table数据合并方式非常简洁; DT <- data.table(x=rep(letters[1:5],each=3), y=runif(15)) DX <- data.table...左手用R右手Python系列——数据合并与追加 长宽转换: 长宽转换仍然支持plyr中的melt/dcast函数以及tidyr中的gather/spread函数。...本篇仅对data.table的基础常用函数做一个整理,如果想要学习期更为灵活高阶的用法,还请异步官方文档。 左手用R右手Python系列——数据塑型与长宽转换

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一句Python,一句R数据合并、分组、排序、翻转、集合

https://blog.csdn.net/sinat_26917383/article/details/52293091 先学了R,最近刚刚上手python,所以想着将pythonR...最好就是一句python,对应写一句Rpython中的numpy模块相当于R中的matirx矩阵格式,化为矩阵,很多内容就有矩阵的属性,可以方便计算。...— 二、数据合并——pandas 1、横向合并,跟R一样,用merge就可以。...如果是 元组+list,都可以通过append/insert合并起来。 如果数据格式是array的话,如何对array进行合并?...利用切片的方法进行序列翻转:data[::-1] —————————————————————————— 六、数据交集、并集 来源于: python 集合比较(交集、并集,差集) 1、交、并、差集

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r」dplyr 里的 join 与 base 里的 merge 存在差异

今天在使用连接操作时发现:虽然都是合并操作函数,dplyr 包里的 *_join() 和基础包里面的 merge() 存在差异,不同的数据结构,结果也会存在偏差。...构造数据集 下面是一个可重复的例子,构造两个数据集,一个是基于 data.frame 的列表,另一个是就要 data.table 的列表: x <- list( a = data.frame(r1...本质上是 data.table 体格的泛型函数不支持类似基础包中的操作。 如何编写代码支持对上述数据集的连接操作?...但特殊情况下,即类似我上述构造的数据集:数据子集不是所有但两两之间都存在共有的列,但按照一定的顺序确实能够将其合并。...如果 be_join 不为空,进行如下的循环: 如果存在,则将这个子集和 to_join 共同列合并 如果不存在,使用循环位移一位,将当前 be_join 的第 2 个子集移动为 第 1 个。

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5个例子比较Python Pandas 和R data.table

PythonR数据科学生态系统中的两种主要语言。它们都提供了丰富的功能选择并且能够加速和改进数据科学工作流程。...在这篇文章中,我们将比较Pandas 和data.table,这两个库是PythonR最长用的数据分析包。我们不会说那个一个更好,我们这里的重点是演示这两个库如何为数据处理提供高效和灵活的方法。...我们还可以升序或降序对结果进行排序。...N”可作为data.table中的count函数。 默认情况下,这两个库都升序对结果排序。排序规则在pandas中的ascending参数控制。data.table中使用减号获得降序结果。...作者:Soner Yıldırım 原文地址:https://towardsdatascience.com/5-examples-to-compare-python-pandas-and-r-data-table

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【工具】深入对比数据科学工具箱:PythonR之争

从工具上来看,由业务到工程的顺序,这个两条是:EXCEL >> R >> Python >> Scala 在实际工作中,对于小数据集的简单分析来说,使用EXCEL绝对是最佳选择。...Scala 和 Excel 是两个极端,对于大多数创业公司而言,我们没有足够多的人手来实现专业化的分工,更多情况下,我们会在 PythonR 上花费更多的时间同时完成数据分析(A型)和数据构建(B...数据传输与解析 Python R CSV(原生) csv read.csv CSV(优化) pandas.read_csv("nba_2013.csv") data.table::fread("nba_...事实上,现在 RPython数据操作的速度已经被优化得旗鼓相当了。下面是R中的 data.table、dplyr 与 Python 中的 pandas 的数据操作性能对比: ?...我曾经用data.table和pandas分别读取过一个600万行的IOT数据,反复10次,data.table以平均10s的成绩胜过了pandas平均15s的成绩,所以在IO上我倾向于选择使用data.table

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R语言处理一个巨大的数据集,而且超出了计算机的内存限制

使用R编程处理一个超出计算机内存限制的巨大数据集时,可以采用以下策略(其他编程语言同理):使用数据压缩技术:将数据进行压缩,减小占用的内存空间。...可以使用R数据压缩包(如bigmemory、ff、data.table)来存储和处理数据。逐块处理数据:将数据集拆分成较小的块进行处理,而不是一次性将整个数据集加载到内存中。...可以使用data.table包或readr包的分块读取数据的功能。使用索引:为了加快数据检索速度,可以在处理大型数据集时使用索引。...数据预处理:在加载数据之前,对数据进行预处理,删除或合并冗余的列,减少数据集的大小。...使用其他编程语言:如果R无法处理巨大数据集,可以考虑使用其他编程语言(如Python、Scala)或将数据导入到数据库中来进行处理。

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深入对比数据科学工具箱:PythonR之争

从工具上来看,由业务到工程的顺序,这个两条是:EXCEL >> R >> Python >> Scala 在实际工作中,对于小数据集的简单分析来说,使用EXCEL绝对是最佳选择。...Scala和Excel是两个极端,对于大多数创业公司而言,我们没有足够多的人手来实现专业化的分工,更多情况下,我们会在PythonR上花费更多的时间同时完成数据分析(A型)和数据构建(B型)的工作。...数据传输与解析 Python R CSV(原生) csv read.csv CSV(优化) pandas.read_csv("nba_2013.csv") data.table::fread("nba_...数据框操作 Python R Factor的Select操作 df[['a', 'c']] dt[,....下面是R中的 data.table、dplyr 与 Python 中的 pandas 的数据操作性能对比: image.png 我曾经用data.table和pandas分别读取过一个600万行的IOT

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如何在CDSW中使用R绘制直方图

1.文档编写目的 ---- Cloudera的新产品CDSW(Cloudera Data Science Workbench)集成了R、Scala、Python2、Python3等语言进行统计和数据分析...本文档主要讲述如何在CDSW中使用R语言绘制直方图和饼图,并使用Hive数仓作为数据源。...数据集 VDT <- data.table(tabledata) ## 设置直方图的横坐标和纵坐标及类型 p <- ggplot(VDT, aes(x=scope, y=count)) + geom_bar...数据集 VDT <- data.table(tabledata) ## 用order()让数据框的数据 scope 列数据从大到小排序 VDT = VDT[order(VDT$scope, decreasing...挚友不肯放,数据玩的花! 温馨提示:要看高清无码套图,请使用手机打开并单击图片放大查看。 ---- 推荐关注Hadoop实操,第一时间,分享更多Hadoop干货,欢迎转发和分享。

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CSV数据读取,性能最高多出RPython 22倍

一项便捷且高效的语言对于数据工作者来说是至关重要的。 目前,数据科学绝大多数使用的是RPython、Java、MatLab和SAS。 其中,尤为PythonR的使用最为广泛。 ?...性能指标是随着线程数从1增加到20而加载数据集所花费的时间。 由于Pandas不支持多线程,因此报告中的所有数据均为单线程的速度。 浮点型数据集 第一个数据集包含以1000k行和20列排列的浮点值。...使用R,添加线程似乎不会导致任何性能提升。 单线程CSV.jl比data.table快2.5倍,而在10个线程中,CSV.jl则大约比data.table快14倍。...Pandas需要119秒才能读取此数据集。 单线程data.table读取大约比CSV.jl快两倍。 但是,使用更多线程,Julia的速度与R一样快或稍快。...可以看出,在所有八个数据集中,Julia的CSV.jl总是比Pandas快,并且在多线程的情况下,它与Rdata.table互有竞争。

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经验总结 | 最有效的R学习路径(一)

那么,大猫建议的R学习路径是什么呢? “在所有数据挖掘工作中,70%~80%的时间都用在了枯燥无谓的前期数据清洗与处理中,而只有剩下的20%~30%的时间是用在建模和计算上。”...——Hadley Wickham ” 小伙伴们肯定有这样的经历:在写论文的过程中,绝大部分的时间都用来清理数据,例如剔除异常值、表与表之间的匹配与连接、数据分类汇总等,而最后用来跑回归的时间可能就只有十几秒左右...因此,大猫给出的第一个建议是: 一:将自己的绝大多数时间花在学习数据处理的方法上! 那么R中有哪些适合数据处理的工具呢?...如果对R已经有一定了解,就可以跳过前戏,直接进入正题,学习其中的data.table的教程,如下: ? datacamp上面还有一系列关于数据挖掘以及Python的教程,大猫看了以后也收益匪浅。...假设你已经掌握了R的基本操作,且有一定编程基础,那么大猫预计你需要3个月左右的时间充分掌握data.table这个包。

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新书《R语言编程—基于tidyverse》信息汇总

R语言这些优质的特性,使得它始终在数据统计分析领域的 SAS、Stata、SPSS、Python、Matlab 等同类软件中占据领先地位。...不夸张地说,tidyverse 操作数据比 pandas 更加好用、易用!再加上可视化本来就是 R 所擅长,可以说 R数据科学领域好于 Python 。...、R连接数据库、中文编码问题及解决办法),数据连接(数据行/列拼接、SQL数据库连接),数据重塑 (“脏”数据变“整洁”数据,长宽表转换、拆分与合并列),数据操作 (选择列、筛选行、对行排序、修改列、...分组汇总)、其它数据操作 (行汇总、窗口函数、滑窗迭代、整洁计算),以及data.table基本使用 (常用数据操作的dplyr语法与data.table语法对照)。...tidyverse最大的优势就是以“管道流”、“整洁语法”操作数据,这些语法真正让数据操作从R base的晦涩难记难用,到tidyverse的“一致”、“整洁”好记好用,比Python的 pandas还好用

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能不能让R行处理数据

从今天开始大猫会选择一些Stackoverflow.com上有关R数据处理的问答摘录给大家。...这些问题大多数涉及到用data.table包处理数据data.table是目前R中人气最高的数据处理包。 2....如果要自己寻找Stackoverflow上与R或是data.table相关的问题,可以在搜索栏输入[R] [data.table] Your question。 提 出问题 好啦,开始上课!...看,胜利就在前方,最后,我们只要把mean.scale合并到原来的数据集就行,代码如下(t1是原始数据集): ▶ t4 <- t3[t1, on = "fund_name", nomatch = 0]...事实上,大猫把整个过程分解成了好几步,如果对于data.table包比较熟悉,完全可以在一行之内搞定所有事情,根本不需要把进行数据集的拆分、合并: ▶ t.final <- t1[, ":="(mean.scale

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R语言数据分析利器data.table包 —— 数据框结构处理精讲

版权声明:本文为博主原创文章,转载请注明出处     R语言data.table包是自带包data.frame的升级版,用于数据框格式数据的处理,最大的特点快。...因此,在对大数据处理上,使用data.table无疑具有极高的效率。这里我们主要讲的是它对数据框结构的快捷处理。...将一个R对象转化为data.tableR可以时矢量,列表,data.frame等,keep.rownames决定是否保留行名或者列表名,默认FALSE,如果TRUE,将行名存在"rn"行中,keep.rownames...,仅仅对POSIXct有影响,as.character将digits.secs转化字符并通过R内部UTC转回本地时间。...showProgress,在工作台显示进程,当用file==""时,自动忽略此参数 verbose,是否交互和报告时间 data.table数据框结构处理语法 data.table[ i , j ,

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