尝试使用nibabel从dicom转到nifti。为了寻找单独保存标题和图像的方法，我完成了其余的工作。nibabel.Nifti1Header有一个write_to函数，但只接受一个fileobj。如何将带有保存文件路径名的Nifti1Header实例传递给该方法？nibabel.save方法采用img矩阵，但是仿射和头部只能以组合的.nii格式保存，这种格式将头部字典中的“魔术”元素更改为n+1，而不是分离.hdr</em
浏览 3提问于2017-02-01得票数 0
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第17行文件“d：\卷转换为img.affine”
文件"C:\Python39\lib\site-packages\nibabel\nifti1.py"，第1756行，在init超级(Nifti1Pairinit(文件"C:\Python39\lib\site-packages\nibabel\spatialimages.py"，行469，在init self.update_
浏览 20提问于2022-01-12得票数 1
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我正在尝试读取Nifti图像并将头信息写入csv文件。import nibabel as nibhdr = img.header
<class 'nibabel.nifti1.Nifti1PairHeader'> object, endian='>&
浏览 10提问于2020-03-24得票数 0
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我用nibabel写出3D灰度.nii文件并在NIfTI查看器(芒果，MCIcron)中打开它们都没有问题。然而，我还无法写出3D颜色，因为每个RGB平面都被解释为不同的体积。* np.random.rand(20, 201, 202, 3)).astype(np.uint8)nib.save(ni_img, nifti_path)
被视为3个独立的20x201x202卷。
浏览 1提问于2016-11-11得票数 4
这是我用来在Python中加载特定nifti图像的代码： import nibabel as nibimport os
img= nib.load(path)
print(
浏览 10提问于2019-01-04得票数 0
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这是我使用的代码：import nibabel as nib
fileNPY1 ="teste01.npy"print(img_array1.shape)
print(img_array1.dtype= nib.Nifti1Im
浏览 30提问于2021-12-10得票数 1
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我正在尝试使用Nibabel将numpy数组转换为Nifti文件格式。我的一些Numpy数组有dtype('<i8')，当Nibabel调用数据类型时，它应该是dtype('uint8')。
浏览 8提问于2017-06-06得票数 4
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我有一个.hdr文件，其中包含从核磁共振扫描中获取的图像的数据。
现在我需要知道如何操作这些类型的文件，以便使用python对它们进行图像处理(比如3d中值滤波，将一个图像除以另一个图像)。
浏览 0提问于2013-06-10得票数 1
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数据集由nii.gz文件组成，我可以使用Python中的nibabel库打开这些文件。我使用了以下代码：import numpy as npimport matplotlib.pyplot as platimg</
浏览 39提问于2020-05-30得票数 0
我有很多二维的nibabel (.nii)切片，我需要从这些切片创建一个3D nibabel (.nii)图像，有什么方法吗？
浏览 14提问于2022-03-17得票数 0
当我尝试将我的.NII文件加载为4D Niimg类对象时(我已经尝试过nil量和nibabel)，"/Users/audreyphan/Documents/Spring2020/DESPO/res4d/1/res4d_anat.nii“错误: ImageFileError:无法计算出ImageFileError的文件类型
ds_name = '/Users/audreyphan/
浏览 1提问于2020-03-03得票数 2
问题是当我需要保存文件时，我必须计算仿射来将ijk空间中现在更密集的体素映射到引用xyz空间。我该怎么做？ 首先，我的想法是使用旧的仿射并计算新的仿射。在python-nibabel、matlab-nifti-toolbox等工具中似乎没有set_voxel_size函数。这怎么能成为一个案例？ 如何显式更改体素大小？
浏览 26提问于2019-04-20得票数 1
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图像由nibabel加载。体素大小为1.5×1.5×1.5毫米。我对MRI图像处理知之甚少。我找不到清晰的教程。如果您知道任何其他Python库可以这样做，它也会工作。
浏览 2提问于2018-12-06得票数 7
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我已经收到了一个fMRI会话的多个Nifti图像，其中每个卷扫描都被保存到一个3D-Nifti文件中。它们的名字是'foobar_001.nii'，…，'foobar_187.nii‘。我想合并这些，并编写了下面的for-循环这样做。import numpy as np # This will load the first,n] = np.array(
浏览 1提问于2015-11-16得票数 1
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迭代多维数组
、、
如果很重要，这是一个.nii文件类型(用于存储核磁共振脑部数据的文件)，我使用nipy模块加载这些图像，然后可以将其作为numpy数组处理以进行图像处理。import nipy
result= numpy.zeros(shape = img_manip.shape, dtype =
浏览 0提问于2013-06-21得票数 3
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我是NiBabel的新手。我想知道如何使用这个库从Nifti图像中获得强度矩阵。我使用以下脚本来获取体素：example_img = ni.load('myImage.nii')
data = example_img.get_data(我需要在nifti图像中获得体素的强度，是否可以使用nibabel？如果没有，你能给我一个其他的解决方案吗？谢谢。
浏览 3提问于2017-07-14得票数 3
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我目前正在使用以下代码将DCM片转换为NIfti映像：import os
此代码将生成一个3D NIfti卷。如何从这个3D NIfti卷中获取所有的切片？
浏览 15提问于2022-02-09得票数 1
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我正在寻找一个函数，传递一个4D-Nifti文件作为一个arg或文件名，将产生一个4D张量。
你能给我指个好方向还是好图书馆？将脑片nifti文件转换为4D衰减张量。
浏览 2提问于2016-07-05得票数 2
我有一个文件夹，里面有DICOM文件(例如CT扫描)，我需要提取体积的仿射信息，因为我将产生一个掩模，稍后需要它来对齐体积和掩模。
然而，我现在的解决方案根本不是最优的。我首先使用dicom2nifti包从包含DICOM文件的文件夹创建一个nifti文件，然后使用nibabel打开创建的nifti文件。然后我用nii.affine得到仿射信息(其中nii是加载的nifti<
浏览 8提问于2020-08-17得票数 1
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我有一个nifti文件1.nii.gz现在，我从来没有处理过nifti文件。img = nib.load(1.nii.gz)img.shape
结果是(448,448,25)，所
浏览 2提问于2020-05-16得票数 3
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