我想在~6500个目录中运行一个简单的python脚本。最简单、最不有效的方法是:
for d in *_directorynumber; do (cd "$d" && cp ../script.py . && python ./script.py );done
这显然要花很长时间。相反,我尝试并行运行:
task(){
cd "$d" && python ./script.py .
}
然后按如下方式运行此任务:
for d in *_directorynumber; do
task "$d
我在RMarkdown中使用reticulate,并试图通过并行处理来运行本地定义的Python函数。我环顾四周,我发现是最接近于解决我的问题的,除了我使用的函数不是在单独的Python脚本中定义的,而是在Rmarkdown中定义的。下面是一个使用llply的简化示例,它给出了错误Error in unserialize(socklist[[n]]) : error reading from connection。
我还尝试过foreach(),它即使使用reticulate::py$function也不能识别py$对象。
我还尝试了mclapply和pbmcapply,它们似乎运行并占用所有
我对python非常陌生,我不确定在分布式集群上实现多线程/多进程代码的最佳方法是什么。
我试图使用Python编写一个包装器脚本,该脚本使用PBS队列系统调用运行在大型集群上的外部MPI程序。下面给出了一个(非常)简化的脚本类型版本,代码移到特定目录中,运行外部MPI程序并检查结果,以查看是否有任何重大更改。
#!/local/python-2.7.1/bin/python2.7
import os
import subprocess as sp
import coordinate_functions as coord_funcs
os.chdir('/usr/work/cmur
祝您今天愉快!
我有两个功能。第一,没有平行:
def non_parallel():
for a in range(500):
for b in range(500):
for c in range(500):
try:
if (1+1/a)*(1+1/b)*(1+1/c)==3:
print("a=",a,", b=",b,", c=", c, sep='')
except ZeroD
我在运行一个耗时的程序很多次。我有机会访问一个需要504个处理器的集群,但是客户服务很慢,所以我求助于您。我正在使用一个非常简单的应用程序,如下所示:
import multiprocessing
def function(data):
data = complicated_function_I_was_given(data)
with open('unique_id', 'w') as f:
f.write(data)
pool = multiprocessing.Pool(504)
pool.map(function, d
我想使用不同的超参数多次运行Python3进程。为了充分利用可用的CPU,我需要多次生成该进程。然而,在实践中,我几乎没有看到任何提速.下面我将复制一个小测试,说明效果。
首先是Python测试脚本:
(speed_test.py)
import numpy as np
import time
now = time.time()
for i in range(50):
np.matmul(np.random.rand(1000,1000),np.random.rand(1000,1000))
print(round(time.time()-now,1))
10.0 a A :pyth
我有一个PyQt5应用程序,它在我的开发机器(核心i7 Windows 7)上运行得很好,但是在我的目标平台()上存在性能问题。在对当前代码进行“优化”之前,我一直在进一步详细研究Python并发性(即确保所有UI代码都在MainThread中,所有逻辑代码都在单独的线程中)。我了解到GIL很大程度上阻止了CPython解释器实现真正的并发性。
我的问题是:使用IronPython或Cython作为解释器更好,还是将所有逻辑发送到可以使用多核的外部非Python函数,并让PyQt应用程序简单地更新UI?如果采用后一种语言,哪种语言最适合高速并行计算?
我有一个关于shell脚本中的并行处理的问题。我有一个程序my Program,我希望在循环内的循环中多次运行它。这个程序基本上是这样的:
MYPATHDIR=`ls $MYPATH`
for SUBDIRS in $MYPATHDIR; do
SUBDIR_FILES=`ls $MYPATH/$SUBDIRS`
for SUBSUBDIRS in $SUBDIR_FILES; do
find $MYPATH/$SUBDIRS/$SUBSUBDIRS | ./myProgram $MYPATH/$SUBDIRS/outputfile.dat
done
done
我希望做的是