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(3489)
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沙龙
1
回答
R
cells
-
package
ComplexHeatmap
中
的
热
图
数值
r
、
heatmap
我有一个包含数字
的
小矩阵,我想将其转换到
热
图中,并将数字保存在其中。0.4078177 0.2416839stock.PLX 0.2416839 0.1485917 1.0000000 这就是我制作
热
图
的
方法library(
ComplexHeatmap
) cluster_columns=FALSE, cluster_rows=FAL
浏览 16
提问于2020-04-24
得票数 0
1
回答
如何使
热
图
可点击?
heatmap
、
clickable
我已经在下面附上了我
的
代码,我一直在用它来尝试生成一个可点击
的
热
图
。实际
的
热
图
已生成,但我无法生成单击事件。下面是我
的
代码: Number(28.555040),); const
浏览 0
提问于2019-02-21
得票数 0
2
回答
如何使用
ComplexHeatmap
更改单元格
的
尺寸?
r
、
heatmap
我正在尝试使用
ComplexHeatmap
在
R
中
创建一个
热
图
。我使用以下代码部分创建了一个
热
图
: cluster_rows = FALSE, cluster_columns =labels = c("1", "0.9", "0.8", "0.7", "0.6", "0.5&qu
浏览 203
提问于2018-03-18
得票数 2
1
回答
如何将未知变量传递给
R
中
的
另一个函数
r
、
function
、
arguments
我正在编写一个函数,它使用一些输入数据生成一个
热
图
,但在此之前执行一些转换。为了生成实际
的
热
图
,我使用
ComplexHeatmap
::Heatmap,它提供了各种各样
的
选项来修改
热
图
。我想让用户有机会通过我
的
函数直接指定
ComplexHeatmap
::Heatmap
的
参数。现在我用
的
是这样
的
东西: library(
ComplexHeatm
浏览 4
提问于2022-04-17
得票数 1
回答已采纳
1
回答
如何将行名分配给数字矩阵,以便它们可以显示在
热
图上?
r
、
heatmap
、
rowname
、
complexheatmap
所以我正在尝试使用
ComplexHeatmap
package
创建一个
热
图
,我
的
数据
的
第一列是物种名称,例如“志贺氏菌”和接下来
的
8列以其样本id为标题,表示每个物种在样本中被观察到
的
次数(以
数值
表示要创建一个
热
图
,我需要一个数字矩阵,所以我像这样获取my_matrix <- as.matrix(my_data[,c(2:9)]),获取除第一个包含字符值
的
列之外
的</
浏览 15
提问于2021-08-08
得票数 0
1
回答
安装
ComplexHeatmap
时出现问题。错误:程序包“群集”编译失败
r
、
r-package
我正在安装一个名为复杂
热
图
()
的
R
包。我知道这个错误。到目前为止,我刚刚确定了对这个包可能要做
的
事情:,但我不知道该做什么。这就是为什么我要给你写信。非常感谢你
的
帮助collect2: error: ld returned 1 exit status /usr/share/
R
/recipe for target 'cl
浏览 6
提问于2019-11-14
得票数 0
回答已采纳
1
回答
外部树状
图
在复杂
热
图中用于cluster_rows时不保持相同
的
形状。
r
、
dataframe
、
dendrogram
、
hclust
、
complexheatmap
我正在尝试使用
ComplexHeatmap
库创建一个带有外部树状
图
的
热
图
。"G900GG","I332LP","I332LO", "M332LP","A322TR","C14SA","B467ET","Z653","
R
124T","F334A",
浏览 7
提问于2022-02-02
得票数 1
回答已采纳
1
回答
是否有任何方式访问移动矩阵
的
ComplexHeatmap
?
r
我想通过伟大
的
ComplexHeatmap
库绘制一个非常巨大
的
热
图
.我遇到了错误:C堆栈
的
使用太接近极限问题了--这可能是底层递归(?)
的
限制。算法。所以现在一切都好了: jitter参数按每次执行按行对集群进行随机化。因此,在我
的
管道
中
很难检查结果
的<
浏览 1
提问于2020-08-07
得票数 0
回答已采纳
1
回答
如何在
ComplexHeatmap
软件包
中
制作彩色边框
r
、
heatmap
在
ComplexHeatmap
包
中
,我找不到在
热
图
周围绘制边框
的
方法。我已经在附图中说明了这个问题。有没有人可以帮我呢?提前感谢!示例代码:library(circlize) mat = matrix(rnorm(80, 2), 8, 10)rownames(mat) = paste0("
R</em
浏览 11
提问于2017-01-17
得票数 1
回答已采纳
1
回答
使用"
ComplexHeatmap
“软件包
的
热
图
树状
图
cluster-analysis
、
heatmap
、
dendrogram
我正在使用"
ComplexHeatmap
“包在一个矩阵
中
创建一个相关性
的
热
图
。我想对
热
图
的
树状
图
使用我自己
的
聚类,所以我运行以下代码:mat = matrix(rnorm(800),80,10);Heatmap(cor.mat ,cluster_rows=rowclus
浏览 10
提问于2017-07-04
得票数 0
1
回答
如何调整复杂
热
图中轴标签
的
字体大小?
r
、
plot
、
heatmap
、
bioconductor
我正在使用在
R
中
创建一个
热
图
。我在这里重新创建了一个小
热
图
。我无法从文档中了解如何调整x轴上文本
的
字体大小。3)colnames(a) = c("c1","c2","c3") my_heatmap =
ComplexHeatmap
c
浏览 80
提问于2020-03-12
得票数 3
回答已采纳
1
回答
使用
ComplexHeatmap
包创建多个
热
图
时出错
r
、
heatmap
我在使用
ComplexHeatmap
包创建多个
热
图
时遇到了困难。当我运行一个脚本,其中包含
的
代码完全取自文档()...mat1 = rbind(mat1, matrix(rnorm(40, -2), 4, 10))colnames(mat1) = paste0("C&
浏览 7
提问于2017-01-19
得票数 0
回答已采纳
1
回答
ComplexHeatmap
包中切片
的
顺序
r
、
bioconductor
我在
R
中使用
ComplexHeatmap
包,并按k均值聚类(行和列)拆分我
的
热
图
。行
的
聚类效果很好。对于列,我得到了一个4列集群(对照)和一个8列集群(处理),这是很好
的
。但是,对于某些
热
图
,控件幻灯片位于右侧,而对于某些
热
图
,控件幻灯片位于左侧。我想统一排序(控制向左,处理向右)。当我使用column_split函数重新排列切片时,我得到了3个簇,而不是2个簇。
浏览 29
提问于2020-03-10
得票数 0
2
回答
如何将使用
ComplexHeatmap
包创建
的
热
图
保存为png格式?
r
、
save
我已经使用
R
中
的
ComplexHeatmap
包制作了一个
热
图
。我想将该
图
保存到我
的
pc上,然后运行以下代码:View(df) View (df1) librar
浏览 2
提问于2021-02-04
得票数 3
6
回答
用簇绘制热
图
,但隐藏树状
图
。
r
、
plot
、
visualization
、
heatmap
默认情况下,
R
的
heatmap将对行和列进行集群:heatmap(mtscaled, scale='none')我可以禁用群集:然后树状
图
就消失了: 但是现在数据不再是聚集
的
了。我不希望显示树状
图
,但我仍然希望将行和/或列聚集在一起。我该怎么做? 我想要
的<
浏览 1
提问于2015-04-27
得票数 10
回答已采纳
2
回答
如何在
ComplexHeatmap
中
增加细胞高度?
r
、
rstudio
、
heatmap
我使用下面的代码为我
的
DEG基因创建了一个使用(library("
ComplexHeatmap
")).
的
热
图
。这是我
的
守则:library("
ComplexHeatmap
")library("RColorBrewer"
浏览 0
提问于2016-12-23
得票数 0
回答已采纳
1
回答
如何在
ComplexHeatmap
的
连续色标
中
创建颜色中断?
r
、
heatmap
我想用
ComplexHeatmap
包创建一个
热
图
,其中我有一个连续
的
颜色标度,直到某个阈值,并且对于高于阈值
的
值,我有一个区分颜色。我已经尝试将阈值以上
的
值替换为最大值。这为
热
图
提供了所需
的
结果。然而,在这种情况下,我
的
色标图例不再准确。有没有一种方法可以为复杂
的
热
图
创建颜色中断,就像“break ()”对
热
图
所做
的</
浏览 13
提问于2020-10-29
得票数 0
1
回答
R
ComplexHeatMap
在框
中
添加价值并删除树状结构
r
我如何在
R
中
结合这两件事呢?我想隐藏树状
图
并显示其值?library(
ComplexHeatmap
)Heatmap(mat, {}这隐藏了树状
图
- heatmapc
浏览 30
提问于2018-09-08
得票数 1
1
回答
如何在
ComplexHeatmap
中
更改边框大小?
r
、
size
、
border
、
heatmap
如何在
ComplexHeatmap
中
更改边框大小?我使用
的
是
R
包
ComplexHeatmap
。
浏览 92
提问于2021-03-03
得票数 0
1
回答
如何在Heatmap
中
添加行标签(注释)
r
、
heatmap
我有下面的脚本,用于使用Rstudio
中
的
heatmap创建Heatmap。一切看起来都很好,颜色,树状
图
大小和位置,字体大小,列注释(标签),但我似乎不能添加行标签。我
的
数据文件是选项卡分隔
的
文本文件,带有标题行(Heatmap
中
的
列名),和第一列有示例名称(我希望这些名称在Heatmap
中
显示为行标签)。这是我
的
剧本: source("https://bioconductor.org/bio
浏览 1
提问于2017-09-19
得票数 2
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