首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

R ggplot2:如何在子组箱形图中绘制2组的平均值?

在R中使用ggplot2绘制子组箱形图并同时显示两组的平均值,可以按照以下步骤进行操作:

  1. 首先,确保已经安装了ggplot2包,如果没有安装可以使用以下命令进行安装:
代码语言:txt
复制
install.packages("ggplot2")
  1. 导入ggplot2包:
代码语言:txt
复制
library(ggplot2)
  1. 创建一个数据框,包含两组数据和对应的分组变量:
代码语言:txt
复制
data <- data.frame(Group = c(rep("Group 1", 100), rep("Group 2", 100)),
                   Value = c(rnorm(100, mean = 0, sd = 1), rnorm(100, mean = 2, sd = 1)))
  1. 使用ggplot函数创建一个基础图层,并设置x轴为分组变量,y轴为数据值:
代码语言:txt
复制
p <- ggplot(data, aes(x = Group, y = Value))
  1. 添加箱形图图层,并设置颜色和填充样式:
代码语言:txt
复制
p <- p + geom_boxplot(fill = "lightblue", color = "black")
  1. 添加平均值点图层,并设置颜色和形状:
代码语言:txt
复制
p <- p + stat_summary(fun = mean, geom = "point", shape = 23, size = 3, fill = "red", color = "black")
  1. 设置图表标题和坐标轴标签:
代码语言:txt
复制
p <- p + labs(title = "Boxplot with Mean", x = "Group", y = "Value")
  1. 显示图表:
代码语言:txt
复制
print(p)

这样就可以在子组箱形图中绘制两组数据的平均值。根据具体的需求,可以进一步调整图表的样式和布局。

页面内容是否对你有帮助?
有帮助
没帮助

相关·内容

R for data science (第一章) ②

例如,条形图使用条形图,折线图使用线条图,箱形图使用箱形图格栅等。 散点图打破了这一趋势; 他们使用点geom。 如上所述,您可以使用不同的geom来绘制相同的数据。...我们将很快学会如何在同一个地块中放置多个geoms。ggplot2提供超过30个geoms,扩展包提供更多(请参阅https://www.ggplot2-exts.org)。...许多geom,如geom_smooth(),使用单个几何对象来显示多行数据。对于这些geoms,您可以将组审美设置为分类变量以绘制多个对象。 ggplot2将为分组变量的每个唯一值绘制一个单独的对象。...实际上,每当您将美学映射到离散变量时,ggplot2都会自动将这些geoms的数据分组(如线型示例中所示)。依靠这个特征很方便,因为群体aesthetic本身并没有增加传说或区别特征与geoms。...您可以通过将一组映射传递给ggplot()来避免这种类型的重复。 ggplot2会将这些映射视为适用于图中每个geom的全局映射。

4.4K30

箱线图的生物学含义

数据分布动态变换图 三、如何绘制箱线图 1.一些描述统计学概念 平均值,方差,最大值,最小值这些应该很熟悉,主要介绍一下中位数和四分位数的概念。 中位数:就是样本排序后,最中间的那个数了。...用四分位数绘制箱形图的是一个公认的惯例:永远不应使用箱子或线来显示平均值、标准差或标准误。中位数不一定在箱子中心,两边延伸的线也不一定是对称的。...1.5×IQR1.5乘数对应±2.7σ(其中σ是标准差),覆盖了99.3%的正态分布数据。 延伸线之外的异常值可以单独绘制。 箱形图构造需要至少n = 5(越多越好)的样本,尽管某些软件不检查这一点。...其次,一些软件如R使用铰链hinges而非四分位数来作为箱边界,下铰链和上铰链分别是数据下半部分和上半部分的中位值,这种箱线图与基于四分位数的箱线图略有不同。...四、箱线图的优点与不足 1.箱线图能直观展现样本的分布 从下图中可以看出箱线图的统计描述比均值和标准差更直观的展现了数据集的统计分布。 ?

4.1K60
  • 可视化之为什么要使用箱线图?

    统计图就是用把数据映射到几何形状如点、线、柱的美学属性如颜色、大小、形状上。这是理解图的关键,也是画图的关键。 对于箱线图也是如此 。 箱线图,顾明思义,是形状像箱子并展示一组或多组数据分布的统计图。...第一印象柱子的高度一样,反应出四套数据集的平均值是一样的。 看起来只是误差线高低不同,反应出数据存在一些波动。 从这个柱状图很难想到背后的数据分布会如子图a中所示,差别那么大。...转录组中我们有一个前提假设,相互比较的样本之间总的基因表达量是一致的,绘制箱线图时其整体数据分布也是一致的 (如下右图)。...箱线图绘制方法 R语言学习 - 箱线图(小提琴图、抖动图、区域散点图) R语言 - 箱线图一步法 ggplot2高效实用指南 (可视化脚本、工具、套路、配色) 推荐使用功能强大的在线绘图网站-ImageGP...- 富集分析和表达数据可视化 一个震撼的交互型3D可视化R包 - 可直接转ggplot2图为3D 学习津贴 单篇留言点赞数的第一位(点赞数至少为8)可获得我们赠送的在线基础课的9折优惠券。

    2.7K31

    R语言绘图之ggplot2

    那么今天我们就为大家介绍一下目前在R语言中流行的绘图包ggplot2。 1. ggplot2的安装:install.packages("ggplot2")。...3. ggplot2的函数介绍: ggplot2里的所有函数可以分为以下几类: 用于运算(我们在此不讲,如fortify_,mean_等) 初始化、展示绘图等命令(ggplot,plot,print等)...,用竖直线来表示 geom_path 几何路径,由一组点按顺序连接 geom_point 点 geom_pointrange 一条垂直线,线的中间有一个点(与Crossbar图和箱线图相关,可以用来表示线的范围...) geom_polygon 多边形 geom_quantile 一组分位数线(来自分位数回归) geom_rect 二维的长方形 geom_ribbon 彩虹图(在连续的x值上表示y的范围,例如Tufte...二维密度图,用六边形表示 stat_boxplot 绘制带触须的箱线图 stat_contour 绘制三维数据的等高线图 stat_density 绘制密度图 stat_density2d 绘制二维密度图

    4.3K10

    Day7:R语言课程 (R语言进行数据可视化)

    学习目标 使用扩展包“ggplot2”绘制图表。 使用“map”函数进行数据结构迭代。 导出在R环境之外使用的图片。...使用R base包提供的函数'mean()': mean(rpkm_ordered[,"sample1"]) 只想要其中一个样本(数据框中的1列)的平均值,可以这样实现,但要从所有12个样本中获取此信息该如何实现...ggscatter1 有了必须的映射,再为图片添加一些可选的映射,比如颜色。通过指定列标题来,按照基因型给点上色。自动使用一组默认颜色,不必指定。此外,ggplot2还自动绘制了图例!...已经有了用ggplot2进行绘图所需的所有信息,可以尝试绘制一个箱线图。...箱形图提供了基于五分位数的数据分布图。框的顶部和底部代表第一和第三个四分位数(分别为25%和75%)。框内的线代表中位数(50%)。在框的上方和下方延伸到的点代表数据集的最大值和最小值。

    6K10

    「R」ggplot2数据可视化

    分组指的是在一个图形中显示两组或多组观察结果。小面化指的是在单独、并排的图形上显示观察组。需要注意,ggplot2包在定义组或面时使用因子。 这里我们使用mtcars数据集查看分组和面,并进行绘图。...用几何函数指定图的类型 ggplot()函数指定要绘制的数据源和变量,几何函数则指定这些变量如何在视觉上进行表示。目前,有37个几何函数可供使用。以下列出常用的函数。...分组 在R中,组通常用分类变量的水平(因子)来定义。 分组是通过ggplot2图将一个或多个带有诸如颜色、形状、填充、尺寸和线条类型的视觉特征的分组变量来完成的。...分面 如果组在图中并排出现而不是重叠为单一的图形,关系就是清晰的。我们可以使用facet_wrap()函数和facet_grid()函数创建网格图形(在ggplot2中也称为刻面图)。...不过指导它们的存在是有用的。 修改ggplot2图形的外观 R的基础绘图中,使用par()函数或特定的画图函数的图形参数来自定义基本函数。

    7.4K10

    R语言从入门到精通:Day17 (ggplot2绘图)

    函数ggplot()虽然设置图形,但没有自己的视觉输出,而是使用一个或多个几何函数向图中添加了几何对象(简写为geom),包括点、线、条、箱线图和阴影区域。...函数ggplot()指定要绘制的数据源和变量,几何函数则指定这些变量如何在视觉上进行表示(使用点、条、线和阴影区)。表1列出了几种常见的几何函数(目前有37个几何函数可供使用)。 表1,几何函数 ?...举个最简单的例子,函数geom_boxplot()可以绘制箱线图,如图4。 图4,箱线图示例 ? 每个几何函数都有一组自己的选项,可以通过帮助文档来了解,我们也给大家列出了一些常见选项。...图6,小提琴图和箱线图的组合 ? 讲到这里,必须要强调使用ggplot2的最终目的还是为了更好的理解数据。而为了理解数据,在一个图中画出两个或更多组的观察值通常是很有帮助的。...在R中,组通常用分类变量的水平(因子)来定义。分组是通过ggplot2图将一个或多个带有诸如形状、颜色、填充、尺寸和线类型的视觉特征的分组变量来完成的。

    5.2K31

    数据处理基础—ggplot2了解一下

    5.8 ggplot2简介 5.8.1 什么是ggplot2 ggplot2是由Hadley Wickham设计的R软件包,它有助于数据绘图。在本实验中,我们将简要介绍该软件包的一些功能。...5.8.2 ggplot2的原理 如果要使用ggplot2绘制数据,则数据必须是数据框。 使用aes映射函数来指定数据框中的变量如何映射到图上的要素 使用geoms来指定数据在图表中的表示方式,例如。...散点图,条形图,箱形图等。 5.8.3 使用aes映射功能 该aes函数指定数据框中的变量如何映射到绘图上的要素。...例如,我们选择的geom可以指定我们的数据显示为散点图,条形图或箱形图。 让我们看看我们的图形怎样看起来像散点图。...每个细胞中每个基因的表达的程度由相应框的颜色表示。例如,我们可以从该图中看出,基因18在细胞10中高度表达,但在细胞1中低表达。 该图还为我们提供了有关聚类算法结果的信息。

    1.5K30

    ggplot2

    同时也是一个 R 包 ggplot2 的简介 pip 安装 ggplot2 是数据可视化的重要程序包,用于绘制各种高级统计图形。...ggplot2 命令的基本组成 具体来讲,在 ggplot2 程序包中,每一副图都是由若干组件组成的,这些组件包括: data: 数据,必须为 data.frame。...geoms: 包括 geoms_开头的各种对象,用来绘制各种基本组件,包括点、线、面、多边形、柱状图、箱线图等。 aesthetics: 图形的美学特征,如颜色、形状、透明度、大小、分组等。...scales: 坐标轴的属性 stats: 统计变换。用于设定数据要进行的统计转换,例如平均值、中位数、记录数等。...完整的 ggplot2 绘图命令, 总是以 ggplot() 开始。 ggplot() 及其参数奠定整个 ggplot2 图形的基础,最重要的两个参数为 data 和 mapping。

    69640

    从零开始的异世界生信学习 GEO数据库数据挖掘--GEO背景知识简介

    箱线图的绘制方法是:先找出一组数据的上边缘、下边缘、中位数和两个四分位数;然后, 连接两个四分位数画出箱体;再将上边缘和下边缘与箱体相连接,中位数在箱体中间。...箱形图很形象的分为中心、延伸以及分布状态的全部范围。 箱形图中最重要的是对相关统计点的计算,相关统计点都可以通过百分位计算方法进行实现。...箱形图的绘制步骤: 1、画数轴,度量单位大小和数据批的单位一致,起点比最小值稍小,长度比该数据批的全距稍长。 2、画一个矩形盒,两端边的位置分别对应数据批的上下四分位数(Q3和Q1)。...相同值的数据点并列标出在同一数据线位置上,不同值的数据点标在不同数据线位置上。至此一批数据的箱形图便绘出了。统计软件绘制的箱形图一般没有标出内限和外限。...图片 Foldchange(FC):处理组表达量的平均值/对照组表达量的平均值 logFoldchange(logFC):Foldchange取log2 !!!

    1.7K10

    「R」数据可视化2 : 箱形图

    本系列文章将介绍多种基于不同R包的作图方法,希望能够帮助到各位读者。 什么是箱形图 箱形图(Box-plot)是一种用作显示一组数据分散情况的统计图,因形状如箱子而得名。...箱形图能显示出一组数据的最大值(Maximum)、最小值(Minimum)、中位数(Median)及上下四分位数(1st/3rd Quartile),同时还可以显示逸出值(Outlier)。 ?...箱形图怎么画 (1) 需要什么格式的数据 我们需要的数据只要两列,一列为x,一列为y。本次我们使用R中提供的iris数据。 ?...比如我们想要探究不同物种的花萼长度差异。 (2) 如何使用ggplot2做箱形图 利用ggplot2画图的核心命令是geom_boxplot。我们先来尝试做一个最最基础也是最丑的boxplot图。...可以看到不同的物种之间Sepal.Length有所不同,那么这种差异显著吗? 这个时候我们就需要做检验,那么如何可以直接把检验结果展示在图中呢。这个时候我们可以使用另一个R包ggpubr。

    2.1K10

    统计02:怎样描绘数据

    如果群体总数为偶数,那么中位数就是中间两个成员取值的平均值。按照大于还是小于中位数的标准,成员可以划分为数目相同的两组。...每个成员根据自己取值的大小,拿相应大小的那块儿披萨。把上面的数据绘制成饼图: ? 从图中可以看到,在这场“分大饼”的游戏中,美国和中国占了大的份额。...还有一些绘图是为了呈现群体参数,比如箱形图(box plot)。比如湘北高中身高数据绘制成箱形图: ? 如图中标注的,箱形图体现的主要是中位数和四分位数。...比如,我们可以在直方图中标出平均值和标准差: ?...例如在泡泡图中用图例说明泡泡大小所代表的读数。 在图中标注附加的图像元素,如代表平均值的标示线、代表拟合的虚线曲线等。 备份数据、图像文件和相关代码。

    1.6K70

    统计02:怎样描绘数据

    如果群体总数为偶数,那么中位数就是中间两个成员取值的平均值。按照大于还是小于中位数的标准,成员可以划分为数目相同的两组。...每个成员根据自己取值的大小,拿相应大小的那块儿披萨。把上面的数据绘制成饼图: ? 从图中可以看到,在这场“分大饼”的游戏中,美国和中国占了大的份额。...还有一些绘图是为了呈现群体参数,比如箱形图(box plot)。比如湘北高中身高数据绘制成箱形图: ? 如图中标注的,箱形图体现的主要是中位数和四分位数。...比如,我们可以在直方图中标出平均值和标准差: ?...例如在泡泡图中用图例说明泡泡大小所代表的读数。 在图中标注附加的图像元素,如代表平均值的标示线、代表拟合的虚线曲线等。 备份数据、图像文件和相关代码。

    85120

    统计02:怎样描绘数据

    如果群体总数为偶数,那么中位数就是中间两个成员取值的平均值。按照大于还是小于中位数的标准,成员可以划分为数目相同的两组。...每个成员根据自己取值的大小,拿相应大小的那块儿披萨。把上面的数据绘制成饼图: ? 从图中可以看到,在这场“分大饼”的游戏中,美国和中国占了大的份额。...还有一些绘图是为了呈现群体参数,比如箱形图(box plot)。比如湘北高中身高数据绘制成箱形图: ? 如图中标注的,箱形图体现的主要是中位数和四分位数。...比如,我们可以在直方图中标出平均值和标准差: ?...例如在泡泡图中用图例说明泡泡大小所代表的读数。 在图中标注附加的图像元素,如代表平均值的标示线、代表拟合的虚线曲线等。 备份数据、图像文件和相关代码。

    98410

    带你和Python与R一起玩转数据科学: 探索性数据分析(附代码)

    图表绘制 在这个章节中我们要看一看在Python/Pandas和R中的基本的绘图制表功能。然而,还有其它如ggplot2(http://ggplot2.org/)这样绘图功能更强大语言包可以选择。...R语言的基本绘图的真正用意就是绘制快速而不完善的图。 现在让我们来使用箱线图: ? ? 这是一段简短的箱线图代码,我们甚至没有要图的颜色和图例说明。 回答问题 现在让我们开始正真好玩的章节。...我们可以绘制出分布图以对各个国家的年平均值的分布情况有所了解。我们对单个国家不是非常感兴趣,我们感兴趣的是分布情况本身。 ? ?...传统上,R语言是大多数探索性数据分析工作选择的武器,虽然使用其它的展示能力更佳的绘图程式库是相当方便的,如gglot2。...在这种复杂的情况下,一个进阶的程式库如ggplot2将大放光彩。除了能给我们更漂亮的绘图之外,它的丰富的变现手法和重用性将大大地节省我们的时间。

    2K31

    python pyecharts数据可视化 折线图 箱形图

    ——《月亮与六便士》 文章目录 一、数据获取 二、折线图 三、箱形图 一、数据获取 数据来源:http://www.tianqihoubao.com/aqi/chengdu-201901.html...[9wd1fyy95w.png] 二、折线图 折线图是排列在工作表的列或行中的数据可以绘制到折线图中。...箱形图(Box-plot)又称为盒须图、盒式图或箱线图,是一种用作显示一组数据分散情况资料的统计图。...箱线图的绘制方法是:先找出一组数据的上边缘、下边缘、中位数和两个四分位数;然后, 连接两个四分位数画出箱体;再将上边缘和下边缘与箱体相连接,中位数在箱体中间。...[gm4ivdtllx.png] 利用pyecharts绘制箱线图需要用 prepare_data() 方法将传入的列表中的数据转换为的 min, Q1, median (or Q2), Q3, max

    2.9K30
    领券