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Rtidyverse公式函数

本文写作由来是知识星球一个朋友对如何在 tidyverse 系列包中使用公式函数(单侧公式)不太熟悉,所以通过本文分享一下我心得。...img 公式保存了创建它环境 使用到 R 朋友几乎都用过公式,它在统计建模方面给了我们极大方便。不过,公式相比于数值、逻辑值这些数据类型,有什么特点吗?...")= 从属性部分我们可以看到公式保存了创建它环境。...计算残差 最开始图形显示了 x 和 y 是一个线性关系,假设我们目前有一个任务:构建回归模型并手动计算残差,绘制结果图。 我们来看看如何操作。...好模型结果残差分布和我们实际加入噪声分布应该是差不多: mean(df$rs) #> [1] -1.19e-15 sd(df$rs) #> [1] 1.03 提醒 tidyverse 中使用单侧公式简化匿名函数构造

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R语言计算大量栅格图像平均值、标准差

本文介绍基于R语言中raster包,批量读取多张栅格图像,对多个栅格图像计算平均值、标准差,并将所得新栅格结果图像保存方法。   ...在文章R语言raster包读取栅格遥感影像中,我们介绍了基于R语言raster包,对单张或多张栅格图像加以平均值、标准差计算方法;但这一篇文章中标准差计算方法仅仅可以对一张栅格图像全部像元加以计算...,即标准差计算结果是一个具体数值,而不是一景结果影像;无法对多张、多时相栅格图像进行计算。...当然,前述提到文章R语言raster包读取栅格遥感影像中方法也是可以对多个栅格图像计算平均值。...随后,我们即可在指定路径下找到我们刚刚计算得到多个栅格图像标准差结果。

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我承认tidyverse已经脱离了R语言范畴

就我个人而言,Python更适合写流程,平时建模都是用R语言处理好数据,交予第三方软件,最后用Python串起来。不得不说,R语言tidyverse是真的好,非常高效。...从某种角度,只学R语言没有接触过tidyverse用户,看到R代码,觉得它已经脱离了R语言范畴!!!...最近在学习tidyverse,批量方差分析之前都是用for循环,然后用formula处理模型,再把结果保存为list形式,现在学习了tidyverse操作,可以用pivot_longer将所有性状进行长数据转化...(统计学习心法:万物皆可回归,有时可以分类)介绍,学习心法很重要,学习框架很重要,而学习R语言高效方法就是在tidyverse下学习,问题来了,tidyverse怎么学?...当然看最新电子书,纸质版都out了:R语言学习看最新版电子书不香嘛? ---- 大家好,我是邓飞,一个持续分享农业数据分析师

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R语言操作otu丰度表:分行列计算平均和标准差

这个是数据集中按行求标准差 image.png 3 这个公式计算方法是先按照行求平均值得到一个向量a,按行求标准差得到一个向量b,最后是按照列来进行abs(x-a)/b image.png 4 这个公式就是把...3得到新数据集按照行求和然后再除以数据维度 代码如下 library(readxl) library(tidyverse) readxl包用来读取数据tidyverse用来操作数据 readxl...("sample") -> df dim(df) df image.png 按照行求平均值和标准差 sample_mean<-apply(df,1,mean) sample_sd<-apply(df...x,y,z){ return(abs(x-y)/z) } apply(df,2, myfun,sample_mean,sample_sd) -> newdf newdf image.png 计算最后...小明数据分析笔记本 小明数据分析笔记本 公众号 主要分享:1、R语言和python做数据分析和数据可视化简单小例子;2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记;3、生物信息学入门学习资料及自己学习笔记

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Python | Numpy:详解计算矩阵均值和标准差

在用 Python 复现 CRITIC 权重法时,需要计算变异系数,以标准差形式来表现,如下所示: Sj表示第 j 个指标的标准差,在 CRITIC 权重法中使用标准差来表示各指标的内取值差异波动情况...数据如下: 二、详解计算均值和标准差 初始化一个简单矩阵: a = np.array([ [1, 2, 3], [4, 5, 6], [7, 8, 9] ]) a 分别计算整体均值...# 每一列均值 print("每一行均值:", np.mean(a, axis=1)) # 每一行均值 分别计算整体标准差、每一列标准差和每一行标准差: print("整体方差..., np.std(a, axis=1)) # 每一行标准差 结果如下: 三、实践:CRITIC权重法计算变异系数 导入需要依赖库: import numpy as np import pandas...X[i, j] = (X[i, j] - xmin[j]) / xmaxmin[j] # 越大越好 X = np.round(X, 5) print(X) 如下所示: 按列计算每个指标数据标准差

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基于现代R语言【Tidyverse、Tidymodel】机器学习方法与案例分析

机器学习已经成为继理论、实验和数值计算之后科研“第四范式”,是发现新规律,总结和分析实验结果利器。...机器学习涉及理论和方法繁多,编程相当复杂,一直是阻碍机器学习大范围应用主要困难之一,由此诞生了Python,R,SAS,STAT等语言辅助机器学习算法实现。...在各种语言中,R语言以编程简单,方法先进脱颖而出,本次机器学习基于现代R语言,Tidyverse,Tidymodel语法。...一:基础知识1.Tidymodel,Tidyverse语法精讲2.机器学习基本概念3.机器学习建模过程4.特征工程二:回归1.线性回归略谈2.岭回归3.偏最小二乘法4.Lasso回归与最小角度回归5....XGBOST5.总结图片五:其它方法1.支持向量机2.深度学习基础3.可解释机器学习图片图片六:降维1.主成分分析2.广义低秩模型3.Autoenconders图片图片七:聚类与分类1.K-均值聚类2

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R 语言中矩阵计算

作者:张丹(Conan) 来源:http://blog.fens.me/r-matrix/ 前言 R 是作为统计语言,生来就对数学有良好支持。矩阵计算作为底层数学工具,有非常广泛使用场景。...用R语言很好地封装了,矩阵各种计算方法,一个函数一行代码,就能完成复杂矩阵分解等操作。让建模人员可以更专注于模型推理和业务逻辑实现,把复杂矩阵计算交给R语言来完成。...本文总结了 R 语言用于矩阵各种计算操作。 1....K.matrix(r, c=r) ,返回阶数为 p=r*c 方阵,对于 r 行 c 列矩阵 A,计算 A 和 t(A) 直积。 计算公式: ?...c=r) 使得 r 阶 c 阶子列表分量,计算r 行和 c 列单位矩阵列向量外积导出方阵。

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R极客理想系列文章】R语言中数学计算

前言 R是作为统计语言,生来就对数学有良好支持,一个函数就能实现一种数学计算,所以用R语言做数学计算题特别方便。如果计算器中能嵌入R计算函数,那么绝对是一种高科技产品。...本文总结了R语言用于初等数学中各种计算。 目录 1. 基本计算 2. 三角函数计算 3. 复数计算 4....方程计算是数学计算一种基本形式,R语言也可以很方便地帮助我们解方程,下面将介绍一元多次方程,和二元一次方程解法。...4.4 二元一次方程组 R语言还可以解二次方程组,当然计算方法,其实是利用于矩阵计算。 假设方程组:是以x1,x2两个变量组成方程组,求x1,x2值 ? 以矩阵形式,构建方程组 ?...我们看到两条直线交点坐标,就是方程组两个根。多元一次方程,同样可以用这种方法来解得。 通过R语言,我们实现了对于初等数学各种计算,真的是非常方便!

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Day6-学习笔记(2024年2月3日)

学习RR包是多个函数集合,具有详细说明和示例,学习生信R语言必学原因是丰富图表和biocductor各种生信分析R包,包使用是一通百通,以dplyr为例,讲解一下R包一、安装和加载R包1...取决于你要安装包存在于CRAN网站还是Biocductor,存在于哪里?可以谷歌搜到。3.加载R包library()和require(),两个函数均可。...从大到小5.summarise():汇总,(对数据进行汇总操作,结合group_by使用实用性强)summarise(test, mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))#计算...Sepal.Length平均值和标准差先按照Species分组,计算每组Sepal.Length平均值和标准差group_by(test, Species)summarise(group_by(test...ctr + shift + M)test %>% group_by(Species) %>% summarise(mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))(加载任意一个tidyverse

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学习R

R包是多个函数集合,具有详细说明和示例。...Sepal.Length平均值和标准差eg:先按照Species分组,计算每组Sepal.Length平均值和标准差group_by(test, Species)summarise(group_by...Species),mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))dplyr两个实用技能管道操作 %>% (cmd/ctr + shift + M)同时执行三件事(加载任意一个tidyverse...,而bind_cols()函数则需要两个数据框有相同行数函数和R学习方式快速查看函数帮助文档?...dplylr可以用问号连接任何想知道使用方式函数名称找R包介绍页面(善用搜索引擎,或者找帮助)##Vignettes这个单词硬翻译会翻译成“小插图”,其实就是作者写网页版教程,不是每个R包都有的,可以运行代码试试看

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ggraph带你绘制网络饼图

欢迎关注R语言数据分析指南 ❝本节来介绍如何使用igraph+scatterpie来绘制网络饼图,下面小编就通过一个案例来进行展示数据为随意构建无实际意义仅作图形展示用,添加了详细注释希望各位观众老爷能够喜欢...❞ 加载R包 library(tidyverse) library(igraph) library(ggraph) library(graphlayouts) library(ggforce) library...g <- sample_pa(20, 1) # 为网络中每个节点添加名为"A"属性,属性值为从均值为0,标准差为1正态分布中随机生成绝对值 V(g)$A <- abs(rnorm(20, sd...= 1)) # 为网络中每个节点添加名为"B"属性,属性值为从均值为0,标准差为2正态分布中随机生成绝对值 V(g)$B <- abs(rnorm(20, sd = 2)) # 为网络中每个节点添加名为..."C"属性,属性值为从均值为0,标准差为3正态分布中随机生成绝对值 V(g)$C <- abs(rnorm(20, sd = 3)) # 使用layout_with_stress函数计算节点布局坐标

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