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R语言广义加性混合模型(GAMM)分析长沙气象因子、空气污染、PM2.5浓度、显著性检验、逐日变化可视化

本研究旨在使用R语言中的广义加性混合模型(GAMM)方法,帮助客户来探索长沙地区气象因素与空气污染之间的关系,并进一步研究它们对PM2.5浓度变化的影响。...在分析过程中,我们将考虑多种气象因素,如温度、湿度、风速等,并结合空气污染指标,如PM10、SO2、NO2等,来建立相应的GAMM模型。...在冬季,天气寒冷,大气层稳定,风力较小,这导致颗粒物在空气中滞留时间较长。此外,冬季是取暖季节,燃煤和木材燃烧释放的颗粒物也会增加。...它可以用于解决包含非线性关系和随机效应的数据建模问题。 GAMM模型主要用于处理长期观测数据和重复测量数据,其中数据可能受到时间、空间或其他相关因素的影响。...混合模型(Mixed Models)的优点:GAMM模型可以处理数据中的随机效应,比如个体间的差异或层级结构中的变化。

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    详解线性回归、朴素贝叶斯、随机森林在R和Python中的实现应用!(附代码)

    主要学习在R语言和Python中这些算法的理论和实现应用。 谁能从这篇指南中获益最多? 本文要讲的内容,可能是作者写过的最有价值的指南了。...非监督式学习(Unsupervised Learning) 工作机制:在该算法中,我们不预测或估计任何目标变量或结果变量。...随机森林(Random Forest) 随机森林是决策树的总体专有名词。在随机森林算法中,我们有一系列决策树(因此,被称为“森林”)。...森林选择(在所有树中)获得票数最多的分类。 每棵树的种植&培育过程: 1. 假设训练集中的案例数为N,则使用重置抽样法在N个案例中随机抽取样本。该样本将作为此树生长的训练集。 2....m表示从M中随机选择m个变量,该m中最好的切分将被用来切分该节点。M值在森林生长过程中保持不变。 3. 每棵树都尽可能地生长,不进行任何修剪。

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    基于R语言混合效应模型(mixed model)案例研究|附代码数据

    您的随机效果是嵌套还是交叉?在我的研究中,随机效应是 嵌套的,因为每个观察者记录了一定数量的试,并且没有两个观察者记录了相同的试验,因此Test.ID嵌套在Observer中。...交叉随机效应的形式为(1 | r1)+(1 | r2)...,而嵌套随机效应的形式为(1 | r1 / r2)。在这里,您可以指定混合模型将使用最大似然还是受限最大似然来估计参数。...如果您的随机效应是嵌套的,或者只有一个随机效应,并且您的数据是平衡的(即,每个因子组中的样本量相似),则将REML设置为FALSE,因为您可以使用最大似然率。...然后,您应该做的是从模型中删除固定效果和随机效果,然后进行比较以找出最合适的效果。一次删除固定效果和随机效果。保持固定效果不变,并一次删除一个随机效果,然后找出最合适的效果。...所有模型都对数据中方差的分布进行假设,但是在贝叶斯方法中,这些假设是明确的,因此我们需要指定这些假设的分布。在贝叶斯统计中,我们称这些 先验。

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    R语言 线性混合效应模型实战案例

    探索merMod对象的内部 在上一个教程中,我们为嵌套数据拟合了一系列随机拦截模型。我们lmerMod将更深入地研究在拟合此模型时生成的对象,以便了解如何使用R中的混合效果模型。...让我们把注意力转向下一个随机效应。 探索组变化和随机效果 您很可能适合混合效果模型,因为您直接对模型中的组级变化感兴趣。目前还不清楚如何从结果中探索这种群体水平的变化summary.merMod。...数据框包含每个组的随机效果(这里我们只对每个学校进行拦截)。当我们要求lme4随机效应的条件方差时,它被存储在attribute那些数据帧的一个中作为方差 - 协方差矩阵的列表。...这种结构确实很复杂,但它很强大,因为它允许嵌套,分组和跨级随机效果。此外,创建者lme4已经为用户提供了一些简单的快捷方式,以便从ranef.mer对象中获得他们真正感兴趣的内容。...为此,我们选择了12个随机病例,然后我们模拟了extro它们在6所学校中的每一所学校的预测值。

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    SAS,Stata,HLM,R,SPSS和Mplus分层线性模型HLM分析学生受欢迎程度数据

    下面的SAS,Stata,R,SPSS和Mplus中使用的过程是其多层次或混合模型过程的一部分,并且可以扩展为非嵌套数据。 但是出于比较的目的,我们将仅研究完全嵌套的数据集。...在此数据的实际应用中,Extrav应该具有固定的效果而不是随机的效果是没有意义的,因为学生外向性的水平应随班级而变化。...HLM结果 R结果 SPSS结果 Mplus结果 现在,我们在VARIABLE语句的WITHIN选项中包括居中的Extrav变量。...此模型的ICC为: 同样,当我们在模型中添加另一个学生级别的效果(包括随机斜率)时,ICC略有增加。...SAS结果 在固定效果表中,有两个交互作用项,其中一个()远不重要,p值> 0.5。 在随机方差分量表中,我们看到外向随机斜率的估计值和性别随机斜率的估计值与零没有显着差异。

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    SAS,Stata,HLM,R,SPSS和Mplus分层线性模型HLM分析学生受欢迎程度数据|附代码数据

    下面的SAS,Stata,R,SPSS和Mplus中使用的过程是其多层次或混合模型过程的一部分,并且可以扩展为非嵌套数据。 但是出于比较的目的,我们将仅研究完全嵌套的数据集。...在此数据的实际应用中,Extrav应该具有固定的效果而不是随机的效果是没有意义的,因为学生外向性的水平应随班级而变化。...HLM结果 R结果 SPSS结果 Mplus结果  现在,我们在VARIABLE语句的WITHIN选项中包括居中的Extrav变量。...此模型的ICC为: 同样,当我们在模型中添加另一个学生级别的效果(包括随机斜率)时,ICC略有增加。 ...SAS结果  在固定效果表中,有两个交互作用项,其中一个()远不重要,p值> 0.5。  在随机方差分量表中,我们看到外向随机斜率的估计值和性别随机斜率的估计值与零没有显着差异。

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    SAS,Stata,HLM,R,SPSS和Mplus分层线性模型HLM分析学生受欢迎程度数据|附代码数据

    下面的SAS,Stata,R,SPSS和Mplus中使用的过程是其多层次或混合模型过程的一部分,并且可以扩展为非嵌套数据。 但是出于比较的目的,我们将仅研究完全嵌套的数据集。...在此数据的实际应用中,Extrav应该具有固定的效果而不是随机的效果是没有意义的,因为学生外向性的水平应随班级而变化。...HLM结果 R结果 SPSS结果 Mplus结果  现在,我们在VARIABLE语句的WITHIN选项中包括居中的Extrav变量。...此模型的ICC为: 同样,当我们在模型中添加另一个学生级别的效果(包括随机斜率)时,ICC略有增加。 ...SAS结果  在固定效果表中,有两个交互作用项,其中一个()远不重要,p值> 0.5。  在随机方差分量表中,我们看到外向随机斜率的估计值和性别随机斜率的估计值与零没有显着差异。

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    使用SAS,Stata,HLM,R,SPSS和Mplus的分层线性模型HLM

    下面的SAS,Stata,R,SPSS和Mplus中使用的过程是其多层次或混合模型过程的一部分,并且可以扩展为非嵌套数据。 但是出于比较的目的,我们将仅研究完全嵌套的数据集。...在此数据的实际应用中,Extrav应该具有固定的效果而不是随机的效果是没有意义的,因为学生外向性的水平应随班级而变化。...HLM结果 R结果  SPSS结果 Mplus结果  现在,我们在VARIABLE语句的WITHIN选项中包括居中的Extrav变量。...此模型的ICC为: 同样,当我们在模型中添加另一个学生级别的效果(包括随机斜率)时,ICC略有增加。 ...SAS结果  在固定效果表中,有两个交互作用项,其中一个()远不重要,p值> 0.5。  在随机方差分量表中,我们看到外向随机斜率的估计值和性别随机斜率的估计值与零没有显着差异。

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    Python中的循环-比较和性能

    此外,根据《计算机编程艺术》中的Donald Knuth所说,“过早的优化是编程中所有(或至少其中大部分)邪恶的根源”。...准备 我们将导入Python内置程序包random并生成一个列表r,其中包含100.000个伪随机数,范围从0到99(含): import random r = [random.randrange(...列表x和y是通过从r中随机选择n个元素获得的: n = 1_000 x, y = random.sample(r, n), random.sample(r, n) 让我们看看获取具有n个元素的新列表...嵌套循环 现在让我们比较嵌套的Python循环。 使用纯Python 我们将再次处理两个名为x和y的列表。它们每个都将包含100个内部列表,其中包含1.000个伪随机整数元素。...在所有这三种情况下,简单循环都比嵌套循环快一点。 numpy提供的例程和运算符可以大大减少代码量并提高执行速度。在处理一维和多维数组时特别有用。

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    贝叶斯地理统计模型R-INLA-1

    贝叶斯地理统计模型INLA 本次博客主要讲述如何使用R-INLA软件进行空间分析,通过随机嵌套偏微分方程方法和集成的嵌套Laplace渐进法可为潜在高斯随机场模型中的边际分布提供准确而有效的估计。...这允许将非常靠近的点放置在同一三角形中。 特别需要注意的是,我们不希望三角形的角度非常锐化,因为三角形在投影时效果会较差。...在这种情况下,我们的空间数据全部在一组中。 2.4 Stack data 在2.1中,我们告知R-INLA我们在网格的哪些顶点具有采样位置,这给了我们投影仪矩阵A.test。...在第2.2节中,我们定义了SPDE模型。 我们需要告知R-INLA,在哪些采样位置我们有y(response)的数据以及在哪里有x(协变量)数据。...通常是一系列1(用于截距,随机效果和固定效果),及指定的空间A矩阵。 effect 效果。 需要分别指定截距,随机效果,模型矩阵和SPDE。 A与effect是相互联系的。

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    R语言用Rshiny探索lme4广义线性混合模型(GLMM)和线性混合模型(LMM)|附代码数据

    在第一个选项卡上,该函数显示用户选择的数据的预测区间。该函数通过从固定效应和随机效应项的模拟分布中抽样并组合这些模拟估计来快速计算预测区间,以产生每个观察的预测分布。...----点击标题查阅往期内容R语言用潜类别混合效应模型(Latent Class Mixed Model ,LCMM)分析老年痴呆年龄数据左右滑动查看更多01020304在下一个选项卡上,固定效应和组级效果的分布在置信区间图上显示...在第三个标签上有一些方便的方法,显示效果的影响或程度predictInterval。对于每种情况,最多12个,在所选数据类型中,用户可以查看更改固定效应的影响。...点击标题查阅往期内容R语言用潜类别混合效应模型(Latent Class Mixed Model ,LCMM)分析老年痴呆年龄数据R语言贝叶斯广义线性混合(多层次/水平/嵌套)模型GLMM、逻辑回归分析教育留级影响因素数据...R语言用线性混合效应(多水平/层次/嵌套)模型分析声调高低与礼貌态度的关系R语言LME4混合效应模型研究教师的受欢迎程度R语言nlme、nlmer、lme4用(非)线性混合模型non-linear mixed

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    北大数据分析老鸟写给学弟们一封信

    关于实验 在随机实验中,样本被随机分成两组,一组经历处理条件(进入干预组),另一组接受控制条件(进入对照组),然后比较两组样本的效果指标均值是否有差 异。...随机分组使得两组样本“同质”,即“分组”、“干预”与样本的所有自身属性相互独立,从而可以通过干预结束时两个群体在效果指标上的差异来考察实验处 理的净效应。...但是这种方法也是备受争议的,一是因 为它实施难度较大、成本较高;二是因为在干预的影响评估中,接受干预与否通常并不是随机发生的;第三,在社会科学研究领域,完全随机分配实验对象的做法会 涉及到研究伦理和道德问题...通过准实验对干预的影响效果进行评估,由于样本接受干预与否并不是随机发生的,而是人为选择的,因此对于非随机数据,不能简单的认为效果指标的差异 来源于干预。...关于拟合优度、变量选择原则及估计值绝对大小的意义 在人人的“数据分析”小站中,某同学提出这样一个问题:“多元回归分析中,怎么选择自变量和因变量,可以使R方达到80%以上?”

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    基于R语言混合效应模型(mixed model)案例研究

    您的随机效果是嵌套还是交叉?在我的研究中,随机效应是 _嵌套的_,因为每个观察者记录了一定数量的试,并且没有两个观察者记录了相同的试验,因此Test.ID嵌套在Observer中。...交叉随机效应的形式为(1 | r1)+(1 | r2)...,而嵌套随机效应的形式为(1 | r1 / r2)。 在这里,您可以指定混合模型将使用最大似然还是受限最大似然来估计参数。...如果您的随机效应是嵌套的,或者只有一个随机效应,并且您的数据是平衡的(即,每个因子组中的样本量相似),则将REML设置为FALSE,因为您可以使用最大似然率。...然后,您应该做的是从模型中删除固定效果和随机效果,然后进行比较以找出最合适的效果。一次删除固定效果和随机效果。保持固定效果不变,并一次删除一个随机效果,然后找出最合适的效果。...所有模型都对数据中方差的分布进行假设,但是在贝叶斯方法中,这些假设是明确的,因此我们需要指定这些假设的分布。在贝叶斯统计中,我们称这些 _先验_。

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    北大数据分析老鸟写给学弟们一封信

    在随机实验中,样本被随机分成两组,一组经历处理条件(进入干预组),另一组接受控制条件(进入对照组),然后比较两组样本的效果指标均值是否有差异。...随机分组使得两组样本“同质”,即“分组”、“干预”与样本的所有自身属性相互独立,从而可以通过干预结束时两个群体在效果指标上的差异来考察实验处理的净效应。...但是这种方法也是备受争议的,一是因为它实施难度较大、成本较高;二是因为在干预的影响评估中,接受干预与否通常并不是随机发生的;第三,在社会科学研究领域,完全随机分配实验对象的做法会涉及到研究伦理和道德问题...通过准实验对干预的影响效果进行评估,由于样本接受干预与否并不是随机发生的,而是人为选择的,因此对于非随机数据,不能简单的认为效果指标的差异来源于干预。...在人人的“数据分析”小站中,某同学提出这样一个问题:“多元回归分析中,怎么选择自变量和因变量,可以使R方达到80%以上?”

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    R语言混合效应模型(mixed model)案例研究|附代码数据

    您的随机效果是嵌套还是交叉?在我的研究中,随机效应是 嵌套的,因为每个观察者记录了一定数量的试,并且没有两个观察者记录了相同的试验,因此Test.ID嵌套在Observer中。...交叉随机效应的形式为(1 | r1)+(1 | r2)...,而嵌套随机效应的形式为(1 | r1 / r2)。 在这里,您可以指定混合模型将使用最大似然还是受限最大似然来估计参数。...如果您的随机效应是嵌套的,或者只有一个随机效应,并且您的数据是平衡的(即,每个因子组中的样本量相似),则将REML设置为FALSE,因为您可以使用最大似然率。...然后,您应该做的是从模型中删除固定效果和随机效果,然后进行比较以找出最合适的效果。一次删除固定效果和随机效果。保持固定效果不变,并一次删除一个随机效果,然后找出最合适的效果。...所有模型都对数据中方差的分布进行假设,但是在贝叶斯方法中,这些假设是明确的,因此我们需要指定这些假设的分布。在贝叶斯统计中,我们称这些 先验。

    1.3K20

    python 内置模块续写(一)

    ):随机打乱容器中的诸多元素 方法使用示例: 1、random()方法 import random # 随机生成一个0-1之间的随机数 num = random.random() print(num...:\Old_BoyClass_fourth\HammerZe') 5、os.path.dirname(__ file __)方法 获取当前文件路径,可以嵌套使用返回上一层路径 import os...a.txt')) # a文本内容:a文件 # 结果>>>7,a为一个字节,文件为六个字节 3、sys模块 sys.path:获取指定模块搜索路径的字符串集合,可以将写好的模块放在得到的某个路径下,就可以在程序中...~ 2、sys.argv[ ] sys.argv[ ]其实就是一个列表,里边的项为用户输入的参数,关键就是要明白这参数是从程序外部输入的,而非代码本身的什么地方,要想看到它的效果就应该将程序保存了,...动态演示: import sys index_v = sys.argv[1] index_v2 = sys.argv[2:] print(index_v,index_v2) 4、json模块 在不同的编程语言中怎么可以无障碍传输

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    北大老鸟三年数据分析深刻总结——致学弟学妹们

    关于实验 在随机实验中,样本被随机分成两组,一组经历处理条件(进入干预组),另一组接受控制条件(进入对照组),然后比较两组样本的效果指标均值是否有差异。...随机分组使得两组样本“同质”,即“分组”、“干预”与样本的所有自身属性相互独立,从而可以通过干预结束时两个群体在效果指标上的差异来考察实验处理的净效应。...但是这种方法也是备受争议的,一是因为它实施难度较大、成本较高;二是因为在干预的影响评估中,接受干预与否通常并不是随机发生的;第三,在社会科学研究领域,完全随机分配实验对象的做法会涉及到研究伦理和道德问题...通过准实验对干预的影响效果进行评估,由于样本接受干预与否并不是随机发生的,而是人为选择的,因此对于非随机数据,不能简单的认为效果指标的差异来源于干预。...关于拟合优度、变量选择原则及估计值绝对大小的意义 在人人的“数据分析”小站中,某同学提出这样一个问题:“多元回归分析中,怎么选择自变量和因变量,可以使R方达到80%以上?”

    3.1K60

    图解数据分析 | 数据分析工具地图

    结构化查询语言是高级的非过程化编程语言,允许用户在高层数据结构上工作。...结构化查询语言语句可以嵌套,这使它具有极大的灵活性和强大的功能。...R可以在UNIX、Windows和Mac OS等各种平台上编译和运行,还提供了根据用户要求自动安装所有软件包的工具。...https://www.bilibili.com/video/BV1T341117q7 Tableau有个人免费版本,可连接到任何数据源(例如Excel、公司数据仓库等),然后通过网络实时更新创建可视化效果...六、Apache Spark 官网:https://spark.apache.org/ 最大的大型数据处理引擎之一,该工具在Hadoop集群中执行应用程序的内存速度快100倍,磁盘速度快10倍,该工具在数据管道和机器学习模型开发中也很流行

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    图灵奖12 —— 约翰·巴克斯,Fortran和BNF的发明人,却有着不幸的童年

    这些设备的编程是通过将机器代码从一些长期存储介质(如穿孔卡或磁带)加载到主存储器中来完成的。 大多数机器代码是手工编写的,或者是在原始汇编程序的帮助下编写的。...6.1 国际代数语言(IAL) 在欧洲,GAMM (Gesellschaft fu¨r angewandte Mathematik und Mechanik)小组自1955年以来一直致力于定义一种编程语言...1957年10月,GAMM给ACM写了一封信,信中指出,通过合作,两个小组可以相互受益,更好地为计算机界服务。1958年5月27日至6月1日在祖¨rich举行了一次会议。...无论如何,巴克斯于1959年6月15日至20日在巴黎举行的联合国教科文组织信息处理国际会议上,在苏黎世ACM-GAMM会议上展示了他的研究成果《国际代数语言的语法和语义》。...但是,当他在1977年获得美国计算机学会的图灵奖时,他在题为《高级编程的障碍:变量、控制语句和冯·诺伊曼瓶颈》的颁奖演讲中,强烈反对这种"冯·诺伊曼语言"。

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