我已经使用hclust来识别我的数据中的集群，并确定这些集群的性质。- apply(z,2,sd)d <- dist(nor, method = "euclidean")使用aggregate，我可以看到这三个集群包括一个gg和hh变量均为低值的集群，一个gg和平均hh值较低的集群，以及一个gg和hh值较高的集群
浏览 13提问于2018-09-08得票数 1
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我正在创建一个闪亮的应用程序，它以谷类数据集为例展示了不同的聚类技术，例如分层聚类和k-means聚类。我使用"factoextra“包中的fviz_dend函数来创建我的树状图。我在下面附加了一张使用fviz_dend函数的当前树状图的图片和一张我使用base R中的plot函数创建的树状图的图片。请注意，由
浏览 709提问于2019-10-16得票数 0
我有一个相似矩阵，我用Harry-a工具创建了一个字符串相似矩阵，我想用它绘制一些树状图，看看是否能在数据中找到一些集群/组。，计算指定的相似性度量，并将相似值矩阵写入输出”)我也尝试使用proxy包，同样的问题，我得到的组</em
浏览 2提问于2017-07-12得票数 0
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为什么R中的文本聚类变得模糊了？
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问:为什么文本挖掘数据的聚类树状图变得模糊/messy (见下图链接)？概要:我首先从一个Mongo数据库中获取了大约5500篇电子扫描文章的原始数据，并将其作为Json对象保存在磁盘驱动器中(在这里没有显示，使用Cran Mongolite包获取R)。这里显示的是标准文本处理(使用Cran TM包)来清除“”、“和”、“ing”、“”、“：”等)。这导致了随后的分层聚类，这种聚类看起来很模糊/混乱，因为Json对
浏览 5提问于2016-05-12得票数 0
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可视化集群
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我已经使用hclust()进行了聚类分析，现在我希望将这些聚类绘制到地图上。数据的X和Y坐标可用。最后，我得到了数据点的x，y坐标，以及在该特定点必须可见的特定数字(数据所属的集群)。我已经绘制了树状图，但我希望使用可用的x，y坐标来绘制点。
假设一个数据属于组: 1，它的坐标是x1和y1，我希望将该点标记/标记为1，以表明该特定点属于集群:1。我对R来说真的很陌生。
浏览 0提问于2014-03-13得票数 0
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我编写了一个代码来生成一个树状图，正如您在图像中看到的那样，使用hclust函数。所以，我想帮助解释这个树状图。注意，这些点的位置是接近的。这个树状图的结果是什么，你能帮我吗？labels=Points_properties$Propertie, pos=2)d<-distm(coordinates[,2:1])fit.average<-hclust
浏览 4提问于2022-06-23得票数 3
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MATLAB版本R2011a。我想获得行的置换向量和集群图中的列，就像我可以使用函数那样：>> [~,~,permrows] = dendrogram(linkage(x,'average','euclinkage(x','average','euc')) 6 7 8 9 2 1 3 4 5 10
我发现聚</
浏览 4提问于2012-06-13得票数 4
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我一直在尝试在R中为一些微阵列数据生成热图，并在很大程度上基于在线指令成功地生成了一个热图，但它并不完全符合我的要求。我想要的是基于皮尔逊距离而不是欧几里德距离对数据进行聚类，但我遇到了一些困难。", ColSideColors=c("red","blue") [data.test.factors],col=redgreen,labRow="",hclustfun=function(x) hclust(x,method="complete&
浏览 2提问于2011-07-17得票数 3
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我想创建一个相对较大的数据集(>3000个)的层次聚类树。不幸的是，由于在终端节点包含了如此多的标签，树看起来非常杂乱，并且包含了许多不必要的信息。因此，为了减少混乱，我只想标记一个感兴趣的观察结果。我已经删除了所有标签，但我不知道如何检索和添加我感兴趣的标签。 对于这个MWE，让我们假设，我想将字母k添加到我的树状图中。20)
names(df) <- letters[length(df)]
浏览 9提问于2020-12-16得票数 0
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这同时也是一个理论和实践的问题。我有一个包含一系列点的x，y，z坐标的df。这些点是由图像分割生成的3D表面上的点。我试图解决的问题是，这些点是否随机分布在这个曲面上，或者它们是否表现出某种聚集性。我在R中测试这个。 dist_df <- dist(df_mat
浏览 0提问于2018-04-21得票数 1
我正在手动创建一个hclust对象(即创建一个具有所需插槽的列表，然后将其类更改为hclust)。已知了合并模式、分叉高度、叶节点的顺序和叶节点的标签。我的目标(以及测试手段)是绘制出最终的树状图。我无法用参数创建可绘制的hclust对象。下面是一个可重复的R代码块，我使用它生成并绘制我的树状</e
浏览 0提问于2019-10-27得票数 1
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我有一组大小不同的9张有向图，我想使用图聚类来创建一个树状图，说明它们的结构相似性，类似于在NetConfer网络比较工具中所做的工作。据我所读，图核似乎是一种公认的量化图之间相似性的方法，而包图核使得许多图核方法在R ()中可用。该包承诺“使用由包计算的内核矩阵，我们可以轻松地执行诸如classifi阳离子、回归和对图结构样本的聚类等任务”1。
但是，我不知道如何通过聚类方法使用内
浏览 1提问于2020-06-24得票数 0
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我在R中有一个24行10,000列的数字矩阵。这个矩阵的行名基本上是文件名，我从中读取了24行中的每一行对应的数据。除此之外，我还有一个包含24个条目的单独因子列表，指定这24个文件所属的组。主要分为3类:醇类、碳氢化合物和酯类。，看看矩阵中的数据是如何聚类的。现在我想在树状图中根据它们所属的组，即酒精，碳氢化合物或酯，对文件名进行着色。我看了论坛上张贴的不同例子，比如
，但无法为我的数据实现它。我不确定如何将row.names
浏览 3提问于2015-06-29得票数 5
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我正试图将从科学数据中产生的数据矩阵进行聚类。我知道我希望如何完成聚类，但不知道如何在R中完成这一壮举。28请考虑A1，A2，A3是一个单一治疗的三个复制，与B和C因此，我想分层次地对这个矩阵进行聚类，以查看列之间的所有差异，具体来说，我将创建一个树状图(树
浏览 1提问于2013-08-08得票数 4
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我用三个生态数据集生成了树状图，使用了相同的代码，但每个数据集的对象都是唯一的。树状图中的每一片叶子都是一个调查区，物种的存在/丰富程度推动了聚类的进行。
我把树状图分成3组，每组进行颜色编码。这对于使用欧几里得距离聚类的所有三个数据集和使用Bray距离的两个数据集都很好。然而:第三个数据集在使用Bray时将两片叶子聚在一起，并强制颜色代码进行循环，尽管指定了k= 3，但仍然创建了k=4组
浏览 8提问于2022-05-18得票数 0
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在R中绘制漂亮和对齐的彩色树状图
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我正在使用Sparcl包()来绘制R中的树状图。在我的具体问题中，我是根据一个标准对组进行聚类，我想通过基于另一个标准的着色来可视化(其目的是表明集群与另一个特性重合(或不重合)。我已经在Sparcl包中做到了这一点，突出了我想强调的节点：d <- dist(as.matrix(df))
hc = hclust但不能为任何分支着色)(在图片中这是"Dendrogr
浏览 6提问于2015-12-16得票数 1
我正在使用与模块函数相关的包在Python 3中进行聚类分层聚类(Python 3)实验，我发现了函数令人费解的行为。我没有问题地对数据进行聚类，得到一个链接矩阵，Z，使用linkage_vector()和method=ward。我使用的由10680个矢量组成，每个矢量都有20个维度。所以，我再次运行了前面代码中所示的聚类过程，但是这次只使用了包含至少一个副本的55个向量的数据子集。True
因此，that集群<em
浏览 3提问于2017-10-04得票数 2
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library(latticeExtra)x <- t(as.matrix(scale(mtcars)))row.ord <- order.dendrogram(dd.row)
col.ord <- order.dendrogram
浏览 4提问于2011-07-13得票数 36
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我试图将分层集群显示为、venn图、或任何其他有用的显示(除了)、树状图。我希望能够在许多不同的视图类型中显示我的数据。目前这样做将绘制一个树状图：plot(x)
或在本例中显示集群数据的任何其他有意义的内容。最好我希望能够在闪亮的中做到这一点，但是一个简单的R示例就足够了。提前谢谢你。
浏览 3提问于2014-10-21得票数 4
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这种双聚类技术将首先生成用户集群，然后生成页面clusters.after，它将用户集群和页面集群结合起来生成双集群。现在，我不知道应该使用哪种集群技术来实现此目的。最好的聚类将从该矩阵生成一致的双色图。
浏览 2提问于2014-05-07得票数 0
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