下面的示例中，我们将绘制一个包含多个数据系列的折线图。 首先，确保已经安装了Matplotlib库。...（可以根据需要自定义图表的样式、颜色和标签） 2、散点图 散点图（Scatter Plot）：用于显示两个变量之间的关系，通常用于观察数据的分布、异常值或类别之间的关系。...创建一个或多个包含数据系列的散点图。...，其中包含两个不同的数据系列，每个系列都具有不同的颜色、标记和大小。...使用多个数据系列以及自定义的颜色、透明度和边界线等属性来创建一个直方图。
重复，特别是针对一些样本名称的重复问题的处理，是我在进行生信分析时经常遇到的。一种常见的解决策略是先找到重复之处，然后去重。但如果我们想要保留全部的重复ID呢？...一个简单的例子 生成一个非常简单的带重复的序列： r$> data = c("a", "b", "c", "d", "a")...虽然是同样的ID，但它有可能关联多种可能的事件。例如，一个肿瘤患者，它可以有肿瘤和正常两种组织的样本，这可能写在不同的行。亦或者肿瘤样本有不同的位置来源的信息等等，但共用一个样本ID。...解决的思路是对重复ID添加标记，可以是前缀或者后缀，这样既能视觉上识别，也能够通过编程的手段识别或者后续对前后缀裁剪。后缀才容易操作，更为推荐。...如果我们仅想要标记出第二次及以后出现的ID，这样能保留大部分的数据不做改动，怎么操作呢？ R自带了make.unique()解决这个问题！
遇到这个问题是在使用ggtree可视化展示进化树的时候，我想给进化树的枝分组映射颜色，对应的推文是跟着Nature Genetics学画图：R语言ggtree给进化树的枝分组映射颜色 第一步是准备进化树文件...image.png 加载需要用到的R包 library(treeio) library(ggtree) library(ggplot2) 读取树文件和分组信息 tree<-read.tree("practice.tree...image.png 这个结果右侧的图例最下方式有一个NA的，如果不想要那个NA加一行代码 scale_color_discrete(na.translate=FALSE) 参考链接是 https://stackoverflow.com...geom_tiplab(offset = 0.1)+ scale_color_manual(values=colors, na.translate=FALSE) 将图例的线更改的粗一点...image.png 欢迎大家关注我的公众号 小明的数据分析笔记本 需要示例数据和代码 点赞 点击在看 然后在后台留言 20210605 就可以了 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享：1、R语言和python
今天尝试解决使用ggplot2画图时的一个问题，图例不按规矩出牌。 ggplot2的作者们在测试时发现更新版本也出这问题了，正好可以用于简单说明。 本来是一个这样的图形 ? 新版本变成了 ?...而我是画两个相似的图形时出现这问题，数据结构一样，然后画图后图例的顺序变了~ 根据文档，默认使用了某种“秘密魔法”？！...下面是一个例子： dat <- data.frame(x = LETTERS[1:3], y = 1) p <- ggplot(dat, aes(x, y, fill = x, colour = 1:3...如果我们要改变图例顺序，按下面的操作，将color变成1，然后fill使用默认排序： # And we can reverse the order p + guides( color = guide_colorbar...当然，如果你理解了上面的英文文档，怎么设定怎么排都是可以的。
用R语言的pheatmap 包画热图可以给行或者列添加注释，比如添加个分组信息 示例代码 test = matrix(rnorm(200), 20, 10) test[1:10, seq(1, 10,...image.png 但是如果添加多组注释信息的话，他的图例是从上到下依次排列，如果太多图例就会超过绘图边界，比如 annotation_col<-data.frame(group=factor(c(rep...image.png 我有四个图例需要展示，但是这张图只出现了3个 当然可以通过增加图片的高度让第四个图例显示出来 ? 但是如果注释信息再多也不能够一直拉长图片高度呀！...有一个办法是更改图例的大小，但是没有找到参数来调节。 还有一个办法是：现在图例的单列，能不能改为多列显示？...他的图例自动就换为两列了 调整图例的大小 https://jokergoo.github.io/ComplexHeatmap-reference/book/legends.html 但是具体的用法还得仔细看看
本次总结来源网络，有多处参考 在R语言中，去掉重复数据的函数是：duplicated 删掉所有列中数据一样的： >test <- data.frame( x1 = c(1,2,3,4,5,1,3,5...duplicated(test),] #删掉所有列上都重复的 x1 x2 x3 1 1 a a 2 2 b b 3 3 c c 4 4 d d 5 5 e e 7 3...b c 选择性的删除重复的 > test[!
目 正文 自定义ggplot2图的图例。这里我们要修改非数据组件，通常通过theme（）命令来完成。 此页面受到ggplot2（？theme）帮助页面的强烈启发。...image.png 修改图例中的分类名字 basic+labs( colour = "name1", shape = "name2" ) ?...image.png 删除图例中的一类 basic + guides(shape=FALSE) ?...一些自定义图例的测试 # 图例被红框包裹 basic + theme( legend.box.background = element_rect(color="red", size=2),...# 设置图例中的标题 basic + theme(legend.title = element_text(face = "bold")) ?
Date : [[2022-01-06_Thu]] Tags : #R/index/02 #R/R可视化 #R/R数据科学 #其他/答粉丝问题 前言 感觉ggplot 绘图中的图例/legend，完全可以作为一个单独的内容讲很久...之前的是让图例在外围到处溜达，现在让图例进入主图中。...默认下，如果是多个图都指定了某个分组： 图例标记也会非常智能的显示的。...比如我同时设置了图例的color 与fill 元素，制造图标具有背景的效果： 然而图例显示也加了一层外框： 如何去掉这个外框呢？...问题来了 在[[89-R可视化21-利用aplot拼图实现类似热图注释柱效果]] 中我提到过，下面这个图： 这样的好处是，注释柱可以堆叠在一起，比较节约空间；但是，不同类型的色块柱的图例却会“缝合”在一起
画一条可爱的python（蟒蛇）： import turtle#引入库函数turtle（画图的小乌龟） def drawSnake(rad, angle, len, neckrad): for...画笔颜色 turtle.seth(-40)#乌龟画笔起始方向 drawSnake(40,80,3,pythonsize/2)#调用函数开始画图 main() 运行之后就能看到可爱蟒蛇的绘画过程了
前面介绍了多个样本均数的多重比较，多样本非参数检验后的多重比较： R语言多个样本均数的多重比较 R语言非参数检验后的多重比较 今天学习下重复测量数据的多重比较，本篇内容和课本结果差异较大，如有错误欢迎指出...课本封面 重复测量方差分析 使用课本例12-1的数据，直接读取： df12_3 <- foreign::read.spss("E:/各科资料/医学统计学/研究生课程/析因设计重复测量/9重复测量18-9...数据一共7列，第1列是患者编号，第2列是诱导方法（3种），第3-7列是5个时间点的血压。...，课本中分成了3个方面。...在R里面进行正交多项式的探索略显复杂，首先定义要对时间变量（这里是times）进行正交多项式转变，我们这里有5个时间点，所以是1次方到4次方： contrasts(df.l$times) <- contr.poly
当图例中只需要展示一个元素时，还有一种特殊用法，代码如下 >>> x = np.linspace(0, 2 * np.pi, 50) >>> plt.plot(x, np.sin(x)) >>> plt.legend...对于图例而言，我们最常修改的属性就是图例的位置了，在matplotlib中，可以通过以下loc参数来调整图例的位置，有两种设置方式，第一种用表示位置的字符串来定义图例位置，纵向的位置用lower,center...采用这种赋值方式时，有两种特殊取值，第一个为center,表示无论在水平还是垂直方向上，都位于图片的正中心，第二个是best, 也是默认取值，以不和已有元素重叠为标准，自动计算最佳的图例位置。...第二种设置方式通过两个0到1的浮点数，来指定图例左下角在axes中的位置，将axes的左下角视为(0, 0), 将右上角视为(1, 1)， 用法如下 >>> x = np.linspace(0, 2 *...0x0943ACB8> >>> legend.texts [Text(0, 0, 'sin'), Text(0, 0, 'cos')] >>> legend.texts[0].set_color('r'
三因素重复测量方差分析 sunqi 2020/7/26 概述 三因素重复测量资料方差分析，在这项研究中，研究人员想要评估饮食和运动对10个久坐的人减肥的影响。...10个参与者完成了所有四项试验，每次试验持续9周，在每次试验的开始(t1)、中间(t2)和结束(t3)测量体重减轻评分。...为了确定饮食、运动和时间对减肥评分是否存在显著的交互作用，可以进行三向重复测量方差分析。...8.41e-06 * 0.274 ## 7 diet:exercises:time 2.00 22.00 14.246 1.07e-04 * 0.147 # 进行事后检验 ## 如果3个因素存在交互作用...结束语 无论是三因素还是两因素，总体的思路就是如果存在交互作用，就不断的分层分层,如果不存在交互，那就直接进行事后比较。 love&peace
情节发展必须包括一个图例，以帮助观众理解信息。但是，并非所有情况都可以通过 Plotly 的默认图例设置来适应。本文将讨论如何在 Python 中手动将图例颜色和字体大小应用于 Plotly 图形。...例 在此示例中，我们通过定义包含三个键的数据字典来创建自己的数据帧：“考试 1 分数”、“考试 2 分数”和“性别”。随机整数和字符串值使用 NumPy 分配给这些键。然后我们使用了 pd。...legend_font_color参数设置为“=red”以更改图例文本的颜色，legend_font_size参数设置为 14 以增加图例文本的字体大小。...这些参数控制图上显示的图例的颜色和字体大小。 最后，使用 Plotly 中的 show（） 函数显示绘图。...生成的图显示了餐厅顾客的总账单和小费金额之间的关系，标记的大小由另一个变量调整，并由支付账单的人的性别着色。图例字体颜色设置为绿色，字体大小设置为 14 以提高可读性。
1、R中重复值的处理 unique函数作用：把数据结构中，行相同的数据去除。...<- unique(data) 重复值处理函数：unique，用于清洗数据中的重复值。...“dplyr”包中的distinct() 函数更强大： distinct(df,V1,V2) 根据V1和V2两个条件来进行去重 unique()是对整个数据框进行去重，而distinct()可以针对某些列进行去重...<- na.omit(data) 3、R中空格值的处理 trim函数的作用：用于清除字符型数据前后的空格。...') 使用R.studio的小伙伴，在下载包很慢的的时候，可以使用R的官网站点，在中国地区会快很多，以解决此问题。
欢迎关注R语言数据分析指南 ❝本节来介绍一款R包「gguidance」，其主要可以用来自定义设置图例及刻度条，在实际操作中非常的实用，下面小编来简单介绍几个案例来做展示，希望各位观众老爷能够喜欢，更多详细文档请参考作者官方文档...❞ 官方文档 ❝https://github.com/teunbrand/gguidance ❞ 加载R包 install.package("pak") pak::pak("tidyverse/ggplot2...Engine displacement", y = "Highway miles per gallon") + theme(axis.line = element_line()) 设置图例布局...p + aes(colour = paste(cyl, year)) + guides(colour = "legend_cross") 设置图例颜色 p + aes(colour = class...) + guides(colour = "legend_string") 设置图例两端形状 p + aes(colour = cty) + scale_colour_viridis_c(guide
image.png 我选择使用R语言的ggplot2来实现，这个是箱线图和热图的拼接，右侧的热图可以借助geom_point()函数实现，将点的形状改为正方块，数值按照正负来映射颜色，按照一定的数值来映射大小...基本的思路有了。今天的推文记录一个小知识点是 如何将图例远离主图并且给放到右上角去 首先是构造一份数据 df<-data.frame(x=LETTERS[1:4],y=1:4) df ?...image.png 拉大图例与主图的距离 使用theme()函数中的legend.box.margin参数来调节 ggplot(data=df,aes(x=x,y=y))+ geom_col(aes...image.png 还有另外两个知识点是调节图例的标题和图例的距离以及图例的文本和图例的距离 分别需要用到legend.spacing.y和legend.spacing.x参数 ggplot(data=...image.png 欢迎大家关注我的公众号小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享：1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子；2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记
当使用ggplot2作图的时候如果多个图拼接到一起，图例互相之间有一样的时候，比如如下的情况（我们用R语言内置的鸢尾花的数据集做三个散点图） ?...ggplot(df,aes(x=V1,y=V4))+ geom_point(aes(color=V5))+ theme_bw() ggarrange(p1,p2,p3,ncol = 3) 因为三个图的图例是一样的...，我们完全可以只显示一个图例就够了。...image.png 还有一个legend参数用来控制图例的位置 ggarrange(p1,p2,p3,ncol = 3, common.legend = T, legend...但是目前还不知道如何使用ggplot2自带的函数来操作，查资料的时候发现了一个R包lemon里有一个reposition_legend()函数 参考资料的链接是 https://cran.r-project.org
最近看到了一个需求，想要监听图例元素的鼠标事件（不限于点击），所以光靠监听「legendselectchanged」就不够用了。...为此，打算尝试一下仿制图例 简易版 一开始，先做了个简易版 直接改配置项的、不可复用的简易版 思路很简单，就是用柱图的一个柱子充当图例，监听鼠标点击事件，触发「legendSelect」或者「...legendUnSelect」动作： 增加一个 gird，设定图例（柱图）所在直角坐标的位置； 增加一个 xAxix 和一个 yAxis，放到步骤 1 的 grid 中，设置为隐藏； 增加一个 series-bar...，这样省下的时间就可以起身活动一下，比如去逛一下小超市~（把体力劳动和脑力结合起来，有益身心，胜于吃药） 于是把简易版的思路提炼、完善了下： 函数传入原配置项，返回增加「仿制」图例后的新配置； 设置一个隐藏的原版图例...准备一个「仿制」图例元素的 series，这次打算利用线图（series-line）实现，因为线图可以自定义数据节点的形状（symbol）； 遍历原配置中 option.series，用于「仿制」图例
常规气泡图的图例 示例数据就直接用内置的鸢尾花的数据集了 library(ggplot2) colnames(iris) ggplot(iris,aes(x=Sepal.Length,y=Sepal.Width...我开始想复杂了，以为需要去图例相关的参数里进行设置，原来直接更改点的形状就好了，给shape参数设置成21就好了 ggplot(iris,aes(x=Sepal.Length,y=Sepal.Width...image.png 这样的话图上的点也都变成空心的了，如果想把图上的点设置成实心的，就再增加一个fill参数就好了 ggplot(iris,aes(x=Sepal.Length,y=Sepal.Width...image.png 这里还可以看到图例是带灰色背景的，如果想要去掉怎么办呢？...="black", fill = "transparent"))+ geom_circle(aes(x0=5,y0=3.5,r=
/zenodo.org/record/6332981#.YroV0nZBzic https://github.com/Jingning-Zhang/PlasmaProtein/tree/v1.2 今天的推文重复一下论文中的...coord_cartesian(ylim = c(0,0.5)) + scale_fill_manual(values = as.character(eqtls$cls)) im1 image.png 这里新接触到一个R...包latex2exp，用来添加比较复杂的文本公式之类的很方便，需要好好学习一下 第二个小图b im2 <- ggplot(eqtls, aes(x = 1:49,y=V3, size=sample))...coord_cartesian(ylim = c(0,0.25)) + scale_fill_manual(values = as.character(eqtls$cls)) im2 image.png 贡献的图例...ggplot2作图的图例可以单独提取出来然后和其他图去拼图 最后是拼图 p <- ggarrange(ggarrange(im1, im2, nrow
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