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【数据分析】R语言中用自助法求统计量置信区间

而自助法(Bootstrap)思路是对原始样本重复抽样产生多个新样本,针对每个样本求取统计量,然后得到它经验分布,再通过求经验分布分位数来得到统计量置信区间,这种方法不需要对统计量有任何理论分布假设...在R中进行自助法是利用boot扩展包,其流程如下: 编写一个求取统计量自定义函数 将上面的函数放入boot()函数中进行运算,得到自助法结果 用boot.ci()函数求取置信区间 让我们用mtcars...其中我们感兴趣是判定系数R-square,希望用自助法求它95%置信区间。...results这个数据结构包括了原始样本统计量(results$t0)和再抽样样本统计量(results$t0),上图左侧直方图表示了再抽样样本统计量经验分布,其中虚线表示了原始样本统计量...下面我们用boot.ci函数从结果中提取置信区间

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Rsweep函数

函数用途 base包sweep函数是处理统计量工具,一般可以结合apply()函数来使用。...函数参数 sweep(x, MARGIN, STATS, FUN = "-", check.margin = TRUE, ...) x:即要处理原数据集 MARGIN:对行或列,或者数列其他维度进行操作...…… 下面我们结合几个具体例子来看 #创建一个4行3列矩阵 M = matrix( 1:12, ncol=3) 1.每一行都减去这一行均值 #方法一,通过rowMeans函数来计算每一行均值...sweep(M,1,rowMeans(M)) #方法二,通过apply函数来计算每一行均值,MARGIN=1,对行做操作 sweep(M,1,apply(M,1,mean)) 2.每一行列都减去这一列均值...#方法一,通过colMeans函数来计算每一列均值 sweep(M,2,colMeans(M)) #方法二,通过apply函数来计算每一列均值,MARGIN=2,对列做操作 sweep(M,2,

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R」说说r模型截距项

y ~ x y ~ 1 + x 很多读者在使用 R 模型构建时可能会对其中截距项感到困惑。上述两个模型都描述了简单线性回归,是等同(完全一致)。...第一个模型隐含了截距项,而第二个模型显式地进行了指定。 当我们了解这一点后,我们在实际操作过程尽量指明截距项,这样能够更加方便自己和他人理解。...y ~ 0 + x y ~ -1 + x y ~ x - 1 上述3个模型都去除了截距项。 如果是 y ~ 1 那么得到模型结果恰好是均值。为什么是均值呢?大家不妨想一想。...相关资料: https://cran.r-project.org/doc/manuals/R-intro.html#Statistical-models-in-R https://stackoverflow.com.../questions/13366755/what-does-the-r-formula-y1-mean

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R」tidyverse 公式函数

基本用法 假设我们要对 df x 和 y 列进行归一化处理,在不使用 scale() 函数情况下,我们可能会手写一个函数: scale2 <- function(x) { (x - mean...第一步:建模 fit <- lm(y ~ x, data = df) 模型构建好后我们提取系数值: cfs <- coef(fit) cfs #> (Intercept) x #>...0.0502 0.9974 第二步:计算残差 得到模型系数后我们就知道了如何计算预测值,将真实值与预测值相减则可以得到残差值。...在公式,我们可以直接使用前面已经定义变量,这里是 cfs。...好模型结果残差分布和我们实际加入噪声分布应该是差不多: mean(df$rs) #> [1] -1.19e-15 sd(df$rs) #> [1] 1.03 提醒 tidyverse 中使用单侧公式简化匿名函数构造

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R替换函数gsub

Rgsub替换函数参数如下 gsub(pattern, replacement, x, ignore.case = FALSE, perl = FALSE, fixed = FALSE,...vector举例如下: > x <- c("R Tutorial","PHP Tutorial", "HTML Tutorial") > gsub("Tutorial","Examples",x) #将...Tutorial替换成Examplers [1] "R Examples" "PHP Examples" "HTML Examples" 还有其他一些例子来灵活使用这个函数,结合正则表达式。...,我们知道组织病理分期分成stage I,stage II,stage III和stage IV四个分期 接下来我们试着把组织病理分期从四个组合并成两个组,并转换成因子 我们使用gsub函数...,并转换成因子 我们还是使用gsub函数 #删除组织病理学分期末尾A,B或者C等字母,例如Stage IIIA,Stage IIIB stage=gsub("[ABCD]$","",clin$ajcc_pathologic_stage

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R语言中回归模型预测不同类型置信区间应用比较分析

p=13913 我们讨论了使用程序来获得预测置信区间方法。我们将讨论线性回归。...正如在R课堂上(以及在预测模型过程)所回顾,当我们要为预测提供一个置信区间时,建议您为预测器确定置信区间(这将取决于预测误差)参数估计)和潜在值置信区间(这也取决于模型误差,即残差离散度)。...="blue") 蓝色值是可能预测,可以通过在我们观察数据库重新采样获得。...这次,除了绘制新样本和计算预测值之外,我们还将在每次绘制添加噪声,我们获得可能值。...考虑到数据性质(距离不能为负),这是合理。 然后,我们开始讨论使用回归模型

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R语言中回归模型预测不同类型置信区间应用比较分析

p=13913 我们讨论了使用程序来获得预测置信区间方法。我们讨论线性回归。...正如在R课堂上(以及在预测模型过程)所回顾,当我们要为预测提供一个置信区间时,建议您为预测器确定置信区间(这将取决于预测误差)参数估计)和潜在值置信区间(这也取决于模型误差,即残差离散度)。...蓝色值是可能预测,可以通过在我们观察数据库重新采样获得。...这次,除了绘制新样本和计算预测值之外,我们还将在每次绘制添加噪声,我们获得可能值。...考虑到数据性质(距离不能为负),这是合理。 然后,我们开始讨论使用回归模型

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R语言中回归模型预测不同类型置信区间应用比较分析

p=13913 我们讨论了使用程序来获得预测置信区间方法。我们将讨论线性回归。...正如在R课堂上(以及在预测模型过程)所回顾,当我们要为预测提供一个置信区间时,建议您为预测器确定置信区间(这将取决于预测误差)参数估计)和潜在值置信区间(这也取决于模型误差,即残差离散度)。...="blue") 蓝色值是可能预测,可以通过在我们观察数据库重新采样获得。...这次,除了绘制新样本和计算预测值之外,我们还将在每次绘制添加噪声,我们获得可能值。...考虑到数据性质(距离不能为负),这是合理。 然后,我们开始讨论使用回归模型

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Rstack和unstack函数

我们用R做数据处理时候,经常要对数据格式进行变换。例如将数据框(dataframe)转换成列表(list),或者反过来将列表转换成数据框。...那么今天小编就给大家介绍一对R函数来实现这样功能。 这一对函数就叫做stack和unstack。从字面意思上来看就是堆叠和去堆叠,就像下面这张图展示这样。...那么R里面这两个函数具体可以实现什么样功能呢?下面这张图可以帮助大家来理解。unstack就是根据数据框第二列分组信息,将第一列数据划分到各个组,是一个去堆叠过程。...一、unstack 下面我们来看几个具体例子 例如现在我们手上有一个数据框,里面的数据来自PlantGrowth 我们可以先看看PlantGrowth 内容,第一列是重量,第二列是不同处理方式...,后面小编会使用这两个函数来给大家举个真实应用案例,敬请期待。

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数据代码分享|R语言回归分析:体脂数据、公交绿色出行与全球变暖2案例|附代码数据

一个模型就是一个公式之中,一个因变量(dependent variable)(需要预测值)会随着一个或多个数值型自变量(independent variable)(预测变量)而改变。...本文将介绍如何将回归方法应用到你自己数据,主要介绍学习内容: 用线性回归方法来拟合数据方程基本统计原则和它们如何描述数据元素之间关系。...如何使用R准备数据进行回归分析,定义一个线性方程并估计回归模型。..."]=NA datanew=na.omit(data) 相关分析 corrgram(datanew[,c("支持程度.1-7","污染严重"  ,"区域主因" ,"公交出行" , " 使用cor函数来查看不同变量之间相关系数...回归结果 置信区间与预测区间: 置信区间是给定自变量值后,由回归方程得到预测值(实际上是的平均值)置信区间;预测区间是实际值置信区间,在这里称为预测区间。

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R in action读书笔记(17)第十二章 重抽样与自助法

另外一个非常重要包是glmperm,它涵盖了广义线性模型置换检验依靠基础抽样分布理论知识,置换检验提供了另外一个十分强大可选检验思路。...无需假设一个特定理论分布,便可生成统计量置信区间,并能检验统计假设。比如,你想计算一个样本均值95%置信区间。假设均值样本分布不是正态分布: (1) 从样本随机选择10个观测,抽样后再放回。...(2) 为生成R自助法所需有效统计量重复数,使用boot()函数对上面所写函数进行处理。 (3) 使用boot.ci()函数获取第(2)步生成统计量置信区间。...:其他对生成待研究统计量有用参数,可在函数传输 boot()函数调用统计量函数R次,每次都从整数1:nrow(data)中生成一列有放回随机指 标,这些指标被统计量函数用来选择样本。...boot()函数返回对象所含元素 t0 从原始数据得到k个统计量观测值 t 一个R × k矩阵,每行即k个统计量自助重复值 你可以如bootobject$t0和bootobject$t这样来获取这些元素

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R语言用线性回归模型预测空气质量臭氧数据

这是在所有独立值均为零情况下模型将预测值。 低系数  Solar.R 表示太阳辐射对预测臭氧水平没有重要作用,这不足为奇,因为在我们探索性分析,它与臭氧水平没有很大相关性。...Error 是系数估计标准误差 t value 以标准误差表示系数值 Pr(>|t|) 是t检验p值,表示检验统计量重要性 标准误差 系数标准误差定义为特征方差标准偏差: 在R,可以通过以下方式计算模型估计标准误差...进一步统计 该summary 函数提供以下附加统计信息  :多个R平方,调整后R平方和F统计。 ...多个R平方 R平方倍数表示确定系数。...置信区间 置信区间是解释线性模型有用工具。

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逻辑回归(对数几率回归,Logistic)分析研究生录取数据实例

稍后我们将展示一个例子,说明如何使用这些值来帮助评估模型拟合。 我们可以使用confint函数来获得系数估计值置信区间。注意,对于logistic模型置信区间是基于剖析对数似然函数。...我们也可以通过使用默认方法,只根据标准误差来获得CI。 我们可以用wald.test函数来检验等级整体效应。系数系数顺序与模型顺序相同。...这一点很重要,因为wald.test函数是按照系数模型顺序来参考。我们使用wald.test函数。...b提供了系数,而Sigma提供了误差项方差协方差矩阵,最后Terms告诉R模型哪些项要被测试,在本例,4、5、6项是等级水平三个项。...我们可以使用同样逻辑,通过对之前置信区间进行指数化,得到概率及其置信区间。为了把这些都放在一个表,我们用cbind把系数置信区间按列绑定起来。

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巧用R各种排名窗口函数

函数对比 SQL窗口函数语句中over语句中两个关键词:partition by和order by,R语言中也有与之一一对应函数: ?...1 row_number函数 R语言中row_number函数与sqlrow_number函数相同,对group_by后面字段进行分组,按照order_by后面字段排序,生成一个连续不重复编码...2 min_rank函数 R语言中min_rank函数与sqlrank函数相同,row_number函数对order_by后面字段相同记录编码是不同,min_rank就是解决这个问题,对相同记录编码相同...同样得到与sql相同输出结果: ? 4 ntile函数 R语言中ntile函数与sqlntile函数相同,把每一组分成几块,块数由参数n决定: ?...总结 简单介绍R语言中4个排名窗口函数函数名几乎与sql4个排名窗口函数一样(除了min_rank与rank),但R语言排名窗口函数输出结果与sql输出结果有点不同:R语言数据结果不改变原来数据顺序

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