原文出处:https://www.cnblogs.com/zzliu/p/10156658.html \r 表示将光标的位置回退到本行的开头位置 \b表示将光标的位置回退一位 在python里print...会默认进行换行,可以通过修改参数让其不换行 (1) 在python3里print是一个独立函数,可以通过修改它的默认值来让其不换行 def print(self, *args, sep=' ', end...flush: whether to forcibly flush the stream. """ 将end参数改为其他的字符可以让print不换行,来看代码 print("Dream", "it...") #########结果如下################ Dream-it-possible/Big big world Process finished with exit code 0 \r的应用...利用\r可以实现很多有趣的小功能 在命令行实现倒计时功能 # 显示倒计时 import time for i in range(10): print("\r离程序退出还剩%s秒" % (9-i
这是一般做基因差异表达分析在使用t检验或者其他统计检验中常出现的一个问题。...所遇到的问题: 分析两个样本之间是否存在差异,每个样本三个重复。现在用的是t.test,但有些样本三个重复的值一样(比如有0,0,0或者2,2,2之类的),想问下像这种数据应该用什么检验方法呢?...因为你要用t检验,我给你一个处理思路, 先不分组别,按基因名检查所有样本的基因表达值(循环)是否一样,如果一样就丢掉,如果不一样,则按组别判断样本(每组3个)基因表达是否一样,如果不一样进行t检验寻找一批差异基因...,如果一样,则输出原始的结果,再筛选其中差异大的基因 。...虽然两者都是恒量,但两者可能有差异,却不能用统计检验算。 else: 统计检验 在使用t检验前尽量使用方差分析检验方差同质性。
1.独立样本的t检验 t.test调用格式1:其中是一个数值型变量,x为二分变量 t.test(y~x, data) t.test调用格式2:其中有y1,y2为数值型变量。...2.非独立样本的t检验 如,年长的男性与年轻的男性失业率概率是否相同,此时,年龄与失业率是有关的,所以是非独立的。 非独立样本的t检验假定组间差异呈正态分布。...3.卡方独立性检验 卡方检验可以使用chisq.test()函数对二维表的行变量或者列变量进行检验。...############################################################## 以下为在真实病例中的应用,检验两种不同的疾病与年龄,性别以及发病部位有无显著差异...性别以及发病部位与两种病的关系用卡方独立检验: a<-xtabs(~class+sex,data) b<-xtabs(~class+part,data) chisq.test(a) chisq.test
⑵t-检验 t检验是很常用的一种两组来自正态总体的数据比较检验方法,在R中进行t检验的为t.test()函数。...在R中可以使用wilcox.test()函数来进行秩和分析,其使用方法与t.test()类似。...如果想进一步知道到底那几个地区存在差异,可以进行两两之间的Wilcoxon秩和检验。此外,agricolae包中的kruskal()函数可以同时进行多重比较分析。...p值小于0.05说明节食和性别不是独立的,节食的群体中女性的比例要显著高于男性。...在R中皮尔森卡方检验可以使用卡方检验的chisq.test()函数,示例如下: A=c(52, 19) B=c(39, 3) data=rbind(A, B) colnames(data)=c("cancer
图片对每一个产品的品质都能正确检验的话,便可确保其品质。为了确保每一个产品的品质,必须进行全数检验。...但是,实施抽样检验时,其检验性质必须满足以下各条 件:1.抽样检验的目的在于检验批的合格与否,因此产品可以批来处置。2.即使抽样检验的货批合格,也必须承认当中仍多少有 不良品混入。...必须进行抽样检验的情况(1)破坏性检验时:材料的拉引检验或灯泡的寿命测试等,物品会因测试而破坏时。(2)检验物为连续物体或粉状物时:煤、药品、电线、布料等很难全部检验时。3....(3)比起不完全的全数检验,可以获更高信赖度的结果时:全数检验时,一个检验员在一定时间内所处理的数量很多,由于时间、经济上的限制及作业单调之故,各个检验很容易不正确,信赖度减低。...抽样检验却可以针对选出的样本进行十分正确的检验。而且根据统计方法,由部分数据推断全体的误差程度也可以控制在一定的范围内,是一信赖度颇高的检验。
之前详细介绍了利用R语言进行统计描述,详情点击:R语言系列第三期:③R语言表格及其图形展示、R语言系列第三期:①R语言单组汇总及图形展示、R语言系列第三期:②R语言多组汇总及图形展示 从这个部分我们就开始为大家介绍统计推断的内容了...一些最基础的统计检验基本上都是比较连续数据之间的差异,可能是两个组之间的比较,也可能是单组与特定值或预设值之间的比较,这便是本章的主题了。...我们只要传递一个模型方程,就能通过R中的t.test和wilcox.test来分析这样格式的数据。...我们的目的是比较两组的能量消耗水平是否有差异,所以我们使用如下的t检验(设定数据满足正态分布): > t.test(expend~stature) Welch Two Sample t-test data...所以可以使用常规的t检验来比较。 #Tips:方差齐性检验不能用在配对的数据中,只能用在独立的两组数据上。 E.
本次讲的是差异箱线图的绘制,在基因表达量、生态学实验数据统计(如发芽率、产卵量、性比等等)等方面应用比较多。 先看看示例图(以孵化率为例): 那么这样的图该如何绘制呢?...第一步、准备数据 数据格式如下(未截全,展示部分): 第二步、运行代码 将数据导入Rstudio中,复制粘贴以下代码即可出图: #安装并加载ggplot2和ggpubr install.packages...("ggplot2") install.packages("ggpubr") library(ggplot2) library(ggpubr) #设置工作目录(这里注意R中'/'和Windows中'...\'是不同的) setwd("D://桌面内容//test") #读取输入文件 library(readxl) data <- read_excel("D:/桌面内容/test/data.xlsx")...#提取data数据集中第2列,第3列的列名 x=colnames(data)[2] y=colnames(data)[3] #显示Treatment中因子水平名称 group=levels(factor
我最近在研究TCGA的RNAseq数据表达差异性的分析,常用的并且最简单的方法是统计量T检验。下面用一个例子来验证T检验的弊端问题所在。...两配对样本的T检验是利用来自两个总体的配对样本,推断总体的两个均值是否显著差异,从而推断两个总体是否存在差异。...−−−−−−−−−−−−−−−−√ S_{w} = \sqrt{\frac{(n_{1}-1)S_{1}^{2} + (n_{2}-1)S_{2}^{2}}{n_{1}+n_{2}-2}} 通过对T检验的...P值来判断是否存在差异,从而判断数据是否来自同一个样本。...可以明显发现,两个数据来自不同分布,差异很明显,但是T检验的P值却为1,表明不存在差异,与图像的结果明显不符合。这就是T检验的不足。 关于T检验的改进方法介绍,在下一次分享中将会介绍。
T检验是用来检验两组数据之间均值是否有差异的一种方法,比如下面我们用到的数据包括20个男生和20个女生的体重数据。...试验设计是自然群体下(人们正常生活,没有可以控制自己的体重)探究 男生和女生之间的体重是否有差异? 或者男生的体重是否大于女生? 再或者男生的体重是否小于女生?...于是在理想的群体中随机抽取20个男生和20个女生测量体重,记录数据。 这时候的统计检验方法就可以选择T检验。...本篇文章的内容参考https://www.datanovia.com/en/lessons/how-to-do-a-t-test-in-r-calculation-and-reporting/how-to-do-two-sample-t-test-in-r...翻译过来就是平均值差异不等于0,就是均值有差异。
from=search&seid=2721954210688527324 娱乐之余,记录一下视频中涉及到的统计学知识点。...image.png 第一个小知识点:R语言里产生符合均匀分布的随机数的函数是runif() https://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/stats/html...image.png 为了验证这个想法使用Kolmogorov-Smirnov Test检验(简称K-S检验)验证数据是否符合均均分布 第二个知识点:R语言只中K-S检验的函数是ks.test() https...://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/stats/html/ks.test.html 假设检验的原假设H0是数据符合指定分布,P值小于0.05拒绝原假设 >...接下来是k样本Anderson-Darling检验 主要作用是检验几个样本是否来自同一总体 R语言里的实现函数是ad.test() install.packages("nortest") library
PostgreSQL中NULL的意义 PG中,NULL可以表示空numeric值;不能进行数学操作符计算,NULL参与的结果都是NULL。 1、NULL是什么 首先需要理解NULL值是什么。...有一些特殊的语句可以针对 NULL 测试该值,但除此之外,没有任何语句可以用于测试 NULL 值。 让我们做一些有趣的比较,这将清楚 PostgreSQL 中 NULL 的概念。...函数返回参数中第一个非NULL的值,要求参数中至少有一个是非NULL的,如果参数都为NULL则报错: COALESCE (NULL, 2 , 1); 3)NULLIF 另外一个函数是NULLIF,如果两个参数相等...这是离婚领域中的 KID 没有意义的示例。我们不能设置 true 或 false,所以 NULL 在这里是正确的值。...数字 0 具有重要意义,因此它不能用于表示空的数字字段,即某个时间的未知值。 在这个例子中,有 3 个学生:Alice 有 90 分,Bob 有 0 分,而 Davis 还没有分数。
今年8月份写了一篇文章介绍了normalized stochasticity ratio (NST),可以计算随机性和确定性的比例。...详见: PNAS:NST方法定量生态过程中的随机性 最近文章的作者将该方法打包上传到了CRAN中。...根据指定的概率,个体被随机分为不同的种类。 samp.ab: 样本的总丰度 prob.ab:在一个特定的样本中,每个物种的个体被抽取的概率。...有多种距离矩阵及零模型构建的方法可选。不同方法得到的结果存在一定的差异。详见我之前文章的介绍。...ST、NST的分布情况及各组ST、NST差异的显著性。
由于众所周知的原因,国内的主流浏览器都是双核浏览器:基于Webkit的内核用于常用网站的高速浏览,基于IE的内核主要用于部分网银、政府、办公系统等网站的正常使用。...以360浏览器为例,优先通过Webkit内核渲染主流网站,只有少量的网站通过IE内核渲染,以保证页面兼容性。...出现一个控制手段——“内核控制标签”,只要你在自己的网站里增加一个meta标签,告诉360浏览器这个网站应该用哪个内核渲染,那么360浏览器就会在读取到这个标签后,立即切换对应的内核,并将这个行为应用于这个二级域名下所有网址...浏览器默认内核的指定只需在head标签中添加一行代码即可: 若页面需默认用极速核,增加标签: 若页面需默认用ie兼容内核..."renderer" content="ie-comp"> 若页面需默认用ie标准内核,增加标签: content的取值为
但是,blank finals必须在使用之前初始化,且必须在构造函数中初始化。...test3.modifiedFinal(a,in); System.out.println(in.li_a); } } 5、final methods: 可以锁住该method,不让继承类改变其意义...的方法名相同不是覆盖,与父类中同方法名的方法没有任何关系(除了名字相同)。 ...,不能被overrid,即使子类中恰好有同名的method,也不会产生什么效果;其中两者的区别是在子类中可以出现与private方法有相同签名的方法,而public或protected的final方法不能被重写...PS:以前读书时老师说java中final定义常量,只说对了一半,对基本类型是对的,对String也是对的,因为String虽然是对象,但不会出现String变量地址不变而其内容发生改变的情况(String
在这篇文章中,我们将看到测试通常不会按预期执行,因此,我认为,应该谨慎使用。 偏差拟合度检验 由于偏差度量衡量了模型预测与观察结果的接近程度,我们可能会考虑将其作为给定模型拟合度检验的基础。...由于偏差可以作为将当前模型与饱和模型进行比较的轮廓似然比检验得出,因此可能性理论会预测(假设模型被正确指定),偏差遵循卡方分布,自由度等于参数数量的差异。...在R中执行拟合优度测试 现在看看如何在R中执行拟合优度测试。...有1000个观测值,我们的模型有两个参数,因此自由度为998,由R作为残差df给出。...,lower.tail = FALSE) } 现在,显着偏差测试的比例降低到0.0635,更接近标称的5%1类错误率。
概述 比例尺在地图中是一个非常重要的概念,有着辅助读图的作用。本文在ol框架下,实现webgis中的比例尺功能。 实现效果 概念 在课本中,对其的定义是:地图上所表示的空间尺度称作比例尺。...在webgis中,比例尺代表的是一个像素代表实际中多少米,因此在不同的级别比例尺不同。在webgis中,跟比例尺对应的还有一个概念叫做分辨率。...在标注切片下,分辨率和比例尺的对应关系如下: 实现 在ol中比例尺的实现代码逻辑如下: const minWidth = 60 const dom = document.getElementById(...dom.innerText = scale + unit currentZoom = map.getView().getZoom() }) 实现代码比较简答,下面简单做一个分析: minWidth是展示比例尺最小的宽度...,也是后面计算比例尺的一个基准; 比例尺的展示是通过一个浮动的div来展示的; 通过当前分辨率计算60个像素对应的图上的距离,并做取整处理;
这样的话两个分组之间的不同单细胞亚群的比例差异其实往往是需要最后使用流式细胞等价格相对低廉的实验技术去扩大样品队列去验证一下。...而不同单细胞样品的不同亚群比例差异,前面我们介绍过:展示细胞比例变化之balloonplot和马赛克图,以及 展示细胞比例变化之桑基图,但它们通常并没有分组比较。...首先,仍然是经典的降维聚类分群和标记基因对亚群进行命名,如下所示: 经典的降维聚类分群 这些基因大家基本上都是可以背诵下来了,然后,可以根据样品的分组拆开看单细胞亚群比例差异: 单细胞亚群比例差异...return(c(tmp$p.value, tmp$estimate[1]-tmp$estimate[2])) })) head(df) 可以看到,这26个单细胞亚群,在2个分组的比例差异都不大...geom_vline(xintercept=c(0),lty=3,col="black",lwd=0.5) ggsave("p1.pdf",width = 5,height = 4) 效果如下所示: 不同亚群比例差异的火山图展现
介绍 定性资料比如等级,毒性,应答等,可以以具有分级的因子的形式表示,比如(+ ++, +++),分别对应因子的1,2,3种水平,这样不同组样本只要看这些数据的等级的排列是否一致就可以判断这两个群体的分布是否有差异...(秩和检验)。...数据 比如数据如下 我们这里想要知道A、B处理毒性是否有差异 ?...默认wilcox双尾检验所以要除以2,如果你wilcox做的是单尾检验,这里不用除以2 print(zscore) 参考资料 https://stats.stackexchange.com/questions.../330129/how-to-get-the-z-score-in-wilcox-test-in-r
// shell脚本中$符号的意义 // 今天是远程办公的第4天,渐渐的找到了一点在家办公的节奏了,改了几个shell脚本,在改动过程中,发现还有一些知识点需要巩固,这里写出来,加深下印象。...关于$符号,大家肯定都不陌生,在shell脚本中,$的作用还是比较大多的,这里将所有的$组合都列出来,大家可以看下效果。 $组成的命令大概有下面几个: $0,$1...$?,$!...的结果是0 可以看到,第一次运行ls -l a.txt的时候,由于我们的目录中没有a.txt这个文件,所以返回是1,第二次由于test.sh文件是存在的,所以返回的结果是0 3 $$ $$指的是脚本运行的当前进行...,脚本运行完会睡眠10s,脚本中打印出来了值60658,此时我们查看当前脚本的进程号,发现子进程的进程id是60658 4 $*和$@ 这两个放在一起,主要是因为他们都代表引用的所有参数,单独打印出来结果...反应的是脚本中某个命令的进程号。
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