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我想进行一个方差分析来识别差异表达的基因。在寻找差异表达的基因之前，我应该使用分位数归一化或中位数绝对偏差来缩放数据，还是应该直接对通过RMA获得的数据应用方差分析？
提前谢谢你
浏览 3提问于2011-03-02得票数 1
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我正在尝试对数据集进行分位归一化，但似乎找不到合适的命令。 在python中，它没有太多的运气。后来，我决定使用R，有一个preprocessCore包，但它说它不能在我的R版本上工作，而且在文档中也没有说明它支持哪些版本。是的，我已经检查过它是我正在使用的最新版本。请帮我做这件事。
浏览 109提问于2019-05-25得票数 0
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简单地说，如何在Python中对大型Pandas数据帧(可能是2,000,000行)应用分位数标准化？ PS。我知道有一个名为rpy2的包，它可以在子进程中运行R，在R中使用分位数归一化。但事实是，当我使用以下数据集时，R无法计算正确的结果： 5.690386092696389541e-05,2.051450375415418849e-05,1.963190184049079707
浏览 90提问于2016-06-21得票数 16
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我有一个包含4列的数据文件，如下所示：0002 0002 -.268465 00091 0091 1.836548 10095 0095 -.1503887 0我使用data <- read.ta
浏览 0提问于2016-04-08得票数 0
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我在RStudio和Excel2011MacOSX中运行RVersion3.0.2。我在4组45,015个值之间执行分位数规范化。是的，我确实知道生物导体的包装，但我的问题更笼统。它可能是任何其他的计算。问题是，当我在Excel中执行(1)“手工”计算，(2)用我从零开始在R中编写的程序时，我得到了非常相似的结果，但结果并不相同。通常情况下，(1)和(2)得到的数值相差不到1.0%，尽管有时会更大。
浏览 1提问于2014-03-19得票数 3
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“规范化”和“规范”在机器学习中有着广泛的应用。
在统计的统计和应用中，归一化可以有一系列的含义。在最简单的情况下，收视率的归一化意味着将在不同尺度上测量的值调整到一个名义上通用的标度，通常是在平均之前。在更复杂的情况下，规范化可能指的是更复杂的调整，目的是使调整后的值的整个概率分布对齐。在教育评估成绩正常化的情况下，可能打算使
浏览 0提问于2019-07-09得票数 0
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R中的二次采样和分位数归一化
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我需要在需要将GBM算法应用于一系列自举复制的地方进行分析。另一个问题是，每次复制都需要有一个分位数归一化结果。我试图最终实现的是1.从主数据集开始2.创建一个包含200个重采样的三维数组3.在每个重采样中对结果变量进行分位数归一化4.在所有样本中运行GBM
现在，我甚至不能进入重采样步骤。resampled[i,j,k]= main[sample(nrow(main), size=1000, re
浏览 0提问于2016-10-06得票数 0
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我知道，您应该使用培训数据中的参数(平均值和stdev)来扩展测试数据。这是相对简单的；但是，如果一个训练数据集(例如，集合A=5个样本)中的样本数量有限，所以我想将两个数据集(即集合A+集合B=10个样本)组合起来，以便有足够的样本进行培训，我能做些什么，以便将这两个集合缩放上下文是，我尝试将来自两个不同的微阵列平台的两个微阵列表达式组合起来，因此它们的表达范围是不同的。
谢谢你提前提供帮助
浏览 0提问于2018-10-31得票数 4
我想跟踪一组图像中的一种颜色。出于这个原因，我使用了中提到的恒定阈值算法。这个方法简单地标记了所有那些在最小和最大阈值之间的像素，红色，绿色，蓝色(或者在我的例子中是色调，饱和度，值)。我的问题是，尽管HSV对光线条件的变化不那么敏感，但我仍然希望从程序中设置阈值，以最大限度地减少假阳性和假阴性的数量。换句话说，该算法将确保最终只标记给定的一组像素，例如校准图像上的矩形。我知道这个
浏览 5提问于2009-10-05得票数 3
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我希望使用DoBy包在R中用网格代码计算光栅值的区域百分位数。某些百分位数完美地工作，另一些则产生或多或少的NA值，在本例中为-9999。造成这种差异的原因是什么？注意:所有NA值都出现在多边形中，与我感兴趣的栅格不完全重叠。然而，这并不能解释为什么某些百分位数计算，而另一些则不。我应用的百分位数函数：
qua
浏览 1提问于2016-03-23得票数 0
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从到目前为止的分析，我注意到相同推文的原始分数和百分位数分数通常有很大的差异，在某些情况下，分数甚至在相反的两端(例如，宜人性原始分数: 0.21，宜人性百分位数分数0.76)。此外，在我的样本群体的总体水平上，百分位数得分的人格特质内的方差要高得多，而原始得分的方差非常低(每个性状的所有观察值都在0.1-0.2的</e
浏览 1提问于2018-09-07得票数 0
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我在R中找到了两个用于计算十进制的线程，但是，dplyr::ntile和quantile()这两种方法都产生了不同的输出。事实上，dplyr::ntile()无法输出适当的十进制文件。方法1:使用来自线程的ntile()，我们可以使用ntile()。ntile(vector,10)如果我们分析这一点，我们就会发现没有10分位数方法2:现在使用<e
浏览 2提问于2017-01-14得票数 20
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R中的分位数映射
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我正在尝试使用不同的技术对降水和温度的正确PRECIS数据进行偏置，以便从中选择最好的一个。我在R中使用'qmap‘程序包时遇到一个错误。它有助于以2D图的形式给出面积平均(2DNetcdf) dataset的结果，当用观察dataset验证时，也显示出改进的相关性。当我试图在整个3D数据集上运行相同的函数时，我面临着一个问题。nas] : object of type 'S4' is not subsettable&qu
浏览 13提问于2018-01-24得票数 1
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我试图为ID制作十进制文件，并在A、表单4四分位数的中为ID生成。因此，B的四分位数将取决于A的十进制数，以下是我的尝试：require(OneR)foo1 <- foo1 %>% mutate(checkB = bin(B,nbins = 4,labels = c(
浏览 1提问于2019-10-24得票数 0
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R中的图分位数
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我试图找出矩阵的列的平均，平均±标准差和某些分位数(5%，50%，95%)。
现在，从这个数据集中，我想找到上面的分位数。我希望每次都能得到上述平均值(均值、标准差、分位数)。然后，如何绘制一个图，其中x轴是时间t (t=1 to t=20)，y轴是基金值，并显示了所有5条线(平均±标准差、5%分位数、50%分<e
浏览 2提问于2013-11-03得票数 4
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我有一个非常简单的问题，我可以解决，但我更愿意用R来做更有效的事情，使用像dplyr.这样的东西，也就是说，这个问题对于一个相当擅长这个软件包的人来说可能是非常简单的。我想计算第87个百分位数的分数。在此之后，我想将该分数归一化到0到1的范围内。下面的第二行利用了dplyr的强大功能。., c(0.87)))
然后，我计算了第87个百分位数的<
浏览 1提问于2015-01-08得票数 3
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我在R中生成了以下数据：library(survival)
N <- 2000x1 <- rbinom(cens)mean(cens)对此，我采用了以下截尾分位数回归模型：
q2 <- crq(St~x1 + x2 + x1x2,tau=.9
浏览 4提问于2015-01-19得票数 1
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我正在标准化我的数据，并希望最终存储一个四舍五入的小数后4位数字。 下面的语句给了我一个标准化的结果，但是我如何将每个数字舍入到小数点后的4位数字。df_new = df.loc[:,"pos_score":"neg_sub_score"].div(100, axis=0) 原创：18.685714285714287 归一化后：.1868 (需要)归一化后：.18685714285714287 (当前)
浏览 25提问于2019-03-25得票数 1
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我正在开发一个基于过去单位成本的Spotfire成本估算工具。单位由多个不同的部件组成，这些部件被分组到不同的成本代码中。第一部分很简单，我简单地制作了一个基于成本代码和中位数成本的交叉表，并在交叉表底部添加总和。当前交叉表屏幕截图这就是我需要帮助的地方:我需要使用spotfire指南其他部分的中位数总和来进行进一步的计算，如归一化，并将其放入一个自动生成的</
浏览 33提问于2020-03-12得票数 0
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