1、R中重复值的处理 unique函数作用：把数据结构中，行相同的数据去除。...<- unique(data) 重复值处理函数：unique，用于清洗数据中的重复值。...2、R中缺失值的处理 缺失值的产生 ①有些信息暂时无法获取 ②有些信息被遗漏或者错误处理了 缺失值的处理方式 ①数据补齐（例如用平均值填充） ②删除对应缺失值（如果数据量少的时候慎用） ③不处理 na.omit...<- na.omit(data) 3、R中空格值的处理 trim函数的作用：用于清除字符型数据前后的空格。...') 使用R.studio的小伙伴，在下载包很慢的的时候，可以使用R的官网站点，在中国地区会快很多，以解决此问题。
我们在训练神经网络的时候，超参数batch_size的大小会对模型最终效果产生很大的影响，通常的经验是，batch_size越小效果越差；batch_size越大模型越稳定。...如何在有限的计算资源下，采用更大的batch_size进行训练，或者达到和大batch_size一样的效果？...结果爆显存了，那么不妨设置batch_size=16，然后定义一个变量accum_steps=4，每个mini-batch仍然正常前向传播以及反向传播，但是反向传播之后并不进行梯度清零，因为PyTorch中的...通过这种延迟更新的手段，可以实现与采用大batch_size相近的效果 References pytorch中的梯度累加(Gradient Accumulation) Gradient Accumulation...in PyTorch PyTorch中在反向传播前为什么要手动将梯度清零？
将DNA序列看作是只包含['A', 'C', 'G', 'T']4个字符的字符串，给一个DNA字符串 ，找到所有长度为10的且出现超过1次的子串。...序列进行整数编码: [‘A’, ‘C’, ‘G’, ‘T’]4个字符分别用[0, 1, 2, 3](二进制形式(00, 01, 10, 11)所表示，故长度 为10的DNA序列可以用20个比特位的整数所表示...1.设置全局整数哈希int g_hash_map[1048576]; 1048576 = 2^20，表示所有的长度为10的 DNA序列。...3.从DNA的第11个字符开始，按顺序遍历各个字符，遇到1个字符即将key右移2位 (去掉最低位)，并且将新的DNA字符s[i]转换为整数后，或运算最高位(第19 、20位)，g_hash_map[key...4.遍历哈希表g_hash_map，若g_hash_map[i] > 1，将i从低到高位转换为10个字符的DNA 序列，push至结果数组。
在NGS的数据分析中，去除PCR重复序列是一个常见的分析步骤，无论是WES/WGS的snp calling，还是chip_seq, ATAC_seq，都需要对原始的bam文件进行过滤，去除其中的PCR重复序列...在samtools中也提供了去除PCR重复的命令markdup, 该命令对输入的bam文件有以下两点要求 必须是经过samtools fixmate命令处理之后的文件 必须是按照比对上染色体坐标位置排序之后的文件...另外，由于fixmate命令要求输入的bam文件为按照read name,即序列名称排序之后的文件，所以在使用markdup命令时，需要以下4步转换过程 # 第一步，按照read name排序bam文件...2. picard MarkDuplicates picard的MarkDuplicates命令称得上是使用的最广泛的去除PCR重复的工具了，要求输入的bam文件为按照比对位置排序之后的文件，用法如下...input.bam # 第二步，运行markdup命令 sambamba markdup positionsort.bam markdup.bam 除了这三种方法之外，还有很多的工具可以去除PCR重复序列
我的博客即将同步至腾讯云开发者社区，邀请大家一同入驻：https://cloud.tencent.com/developer/support-plan?...在研究 DNA 时，识别 DNA 中的重复序列有时会对研究非常有帮助。 编写一个函数来查找 DNA 分子中所有出现超多一次的10个字母长的序列（子串）。...方法返回true和false来判断子串是否出现超多一次，但是字符串保存的空间消耗大。...复习一下位运算中的按位与或非 按位或规则： 1｜1=1 1｜0=1 0｜1=1 0｜0=0 按位与规则： 1&1=1 1&0=0 0&1=0 0&0=0 非运算规则： ~1=0 ~0=1 再复习一下十六进制...class Solution { public List findRepeatedDnaSequences(String s) { //ACGT的SCII码的二进制表示
cumsum 可以实现整体的累加 > cumsum(1:10) [1] 1 3 6 10 15 21 28 36 45 55 向量中第一个元素为起始，后面是其需要加的数。...cumprod(x) 累乘 > cumprod(1:5) [1] 1 2 6 24 120 cummax 保留出现的最大的那个数，并不断输出 > cummax(c(3:1, 2:0, 4...格式为： by(data, INDICES, FUN) 其中data是一个数据框或矩阵；INDICES是一个因子或因子组成的列表，定义了分组；FUN是任意函数。...通过INDICES 定义的因子，对data 内容进行分组，即将整个data大数据框，划分为了若干个小的数据框，而函数则定义了对这些分组数据处理的方式。...，其将exp 按照symbol 中的信息划分为若干个矩阵，而function 则定义了在同一组（同一symbol）中的列名筛选其中平均值最大的那一列（ which.max(rowMeans(x)) ）。
}else{ mapnew2.put(k,v); } }); System.out.println("不重复的值...："+mapnew); System.out.println("重复的值："+mapnew2);
前言 在[[15-R编程01-基本数据类型及其操作之向量]] 中，我就已经简单的提过，可以通过unique 或duplicated 非常暴力的实现去重。 那么我们可不可以有更好的策略呢？...比我测量的数据中的a 对应了多个连续值，我可不可对这些连续值进行一定的处理呢？ 当然可以。...，按照Unique_Name 中的内容分组，对其对应的fdr 与G_Score 连续数据取中位数。...：[[35-R数据整理07-使用tidyr和dplyr处理数据框2]] 将重复名称进行顺序标记 比如给重复的这三个名称加上1:n,n 是重复的次数： 思路如下： 将表格元素按照是否重复拆分； 将重复元素的表格...，按照名称进行拆分为列表； 利用lapply 遍历列表中的每个数据框，按照顺序给数据框添加1:n 标记，并加上名称列中； 合并先前的内容； ## duplicated or not duplicated_label
基因组注释包括基因组结构注释和基因组功能注释 结构注释的核心是基因识别，为了提高基因识别效率需要首先寻找并标记去除 重复的和低复杂性的序列。 什么是重复序列？...重复序列（repetitive sequence）是在基因组中不同位置出现的相同或对称性序列片段，一般不编码多肽。组织形式有两种：串联重复序列和分散重复序列。...分类 大致分三类： 低度重复序列 中度重复序列 高度重复序列 特点 GC含量低，AT含量高，3'和5'端有直接重复序列存在，有利形成环形结构。...常用数据库 GIRI的RepBase：常用的真核生物DNA重复序列数据库 RepeatMasker:常用的重复序列分析工具 ALU数据库：人和灵长类Alu重复片段 LINE-1数据库...： STR数据库：短的串联重复序列数据库，不再提供服务 ---- 1 RepeatMasker工具 这个工具有webserver版本和命令行版本 Using and Understanding
要将已序列化的 JSON 字符串赋值给另一个 JSON 对象中的属性，需要先将 JSON 字符串反序列化。...在 Golang 中的 JSON 序列化表示将一个数据对象（如结构体、切片和 map 等）编码为字节数组（通过 string(jsonBytes) 转换为 JSON 格式的字符串，其中 jsonBytes...反序列化 因为我们想要的 data 属性应该是一个 JSON 对象，所以首先我们要知道的是，在给 data 赋值时，其值必须是一个未序列化的值（未序列化在此处可以理解为非字符串）。...在 Golang 中，一个结构体、切片 和 map 等都是未序列化的值，序列化后的值通常为字节数组 []byte 或字符串。...赋值给了 data，此时 data 的值是一个序列化的 JSON 格式字符串，然后将 result 进行序列化的时候 data 的值就发生了第二次序列化，从而包含了转义符号 /。
（也表示查询的结果） * 参数思：selection表示查询的条件，PHONE_NUMBER+" = ?"...表示根据手机号去查询模式 * 参数五：selectionArgs 表示查询条件对应的值,new String[]{phoneNumber}表示查询条件对应的值 * 参数六：String...,new String[]{MODEL}表示查询该表当中的模式（也表示查询的结果） * 参数思：selection表示查询的条件，PHONE_NUMBER+" = ?"...表示根据手机号去查询模式 * 参数五：selectionArgs 表示查询条件对应的值,new String[]{phoneNumber}表示查询条件对应的值 * 参数六：String groupBy...，希望本文的内容对大家的学习或者工作具有一定的参考学习价值，谢谢大家对ZaLou.Cn的支持。
keep：对重复值的处理方式，可选{'first', 'last', 'False'}。默认值first，即保留重复数据第一条。...二、加载数据 加载有重复值的数据，并展示数据。...导入数据处理的库 os.chdir('F:/微信公众号/Python/26.基于多列组合删除数据框中的重复值') #把路径改为数据存放的路径 name = pd.read_csv('name.csv...从结果知，参数为默认值时，是在原数据的copy上删除数据，保留重复数据第一条并返回新数据框。 感兴趣的可以打印name数据框，删重操作不影响name的值。...但是对于两列中元素顺序相反的数据框去重，drop_duplicates函数无能为力。 如需处理这种类型的数据去重问题，参见本公众号中的文章【Python】基于多列组合删除数据框中的重复值。 -end-
重复，特别是针对一些样本名称的重复问题的处理，是我在进行生信分析时经常遇到的。一种常见的解决策略是先找到重复之处，然后去重。但如果我们想要保留全部的重复ID呢？...一个简单的例子 生成一个非常简单的带重复的序列： r$> data = c("a", "b", "c", "d", "a")...保留唯一值 r$> unique(data)...解决的思路是对重复ID添加标记，可以是前缀或者后缀，这样既能视觉上识别，也能够通过编程的手段识别或者后续对前后缀裁剪。后缀才容易操作，更为推荐。...如果我们仅想要标记出第二次及以后出现的ID，这样能保留大部分的数据不做改动，怎么操作呢？ R自带了make.unique()解决这个问题！
如果需要把一台MySQL中的数据定期归档到另外一台MySQL历史库中，那么很可能会发现会有重复值的问题，导致数据导入会失败，而这个问题其实是和自增列的重复值有关，我们来简单看看。...int, primary key (id)) engine=innodb; Query OK, 0 rows affected (0.02 sec)然后插入3条数据，第一条指定id为1，后面两条id值自增...这个时候使用show create table查看，定义信息中自增列的值为4，即再插入一条记录，id值为4....，它是根据max(id)+1的方式来计算的。...导出数据 mysqldump test t1 > t1.sql 导出的sql文本如下，可以看到里面是指定id值的方式，而非空。 LOCK TABLES `t1` WRITE; /*!
${qiu[*]}" exit fi #不能超过数组长度 if [ $1 -ge ${qiu_chang} ];then echo "不能超过数组长度" exit fi #根据下标来删除数组中的元素...RANDOM%qiu_chang]` #输出一下 echo ${qiu[$shu]} shuzu let qiu_chang-- done 日期：2018/6/12 介绍：从数组里随机抽一个，但不会重复
查找重复值、移除重复值，都是Excel中的经典问题，可以使用高级筛选功能，也可以使用复杂的公式，还可以使用VBA。...在VBA中，也有多种方式可以移除重复值，这里介绍RemoveDuplicates方法，一个简洁实用的方法。 示例数据如下图1所示，要求移除数据区域A1:D7中第3列（列C）中的重复值。...其中，参数Columns是必需的，指定想要移除重复值的列。注意，可以指定多列。...如果想要指定多个列，使用Array函数： Range("A1:E15").RemoveDuplicates Columns:=Array(3, 5), Header:=xlYes 此时，如果这两列中的值组合是重复的...示例：获取每个超市中销售量最多的区域 下面的数据是各超市在不同区域的销售量，已经按照销售量进行了统一排名，现在要获取每个超市销售量最多的区域，也就是说对于列C中重复出现的超市名称，只需保留第1次出现的超市名称的数据
最近公司在做关联图谱的项目，想挖掘团伙犯罪。在准备关系数据时需要根据两列组合删除数据框中的重复值，两列中元素的顺序可能是相反的。...本文介绍一句语句解决多列组合删除数据框中重复值的问题。 一、举一个小例子 在Python中有一个包含3列的数据框,希望根据列name1和name2组合(在两行中顺序不一样)消除重复项。...import numpy as np #导入数据处理的库 os.chdir('F:/微信公众号/Python/26.基于多列组合删除数据框中的重复值') #把路径改为数据存放的路径 df =...由于原始数据是从hive sql中跑出来，表示商户号之间关系的数据，merchant_r和merchant_l中存在组合重复的现象。现希望根据这两列组合消除重复项。...从上图可以看出用set替换frozense会报不可哈希的错误。 三、把代码推广到多列 解决多列组合删除数据框中重复值的问题，只要把代码中取两列的代码变成多列即可。
方法1 生成的值为从 0 开始，每次增加 1。实现如下： function getUniqId(){ getUniqId._id = '_id' in getUniqId ?..._id; } 方法2 生成的值为现在至格林威治时间 1970 年 01 月 01 日 00 时 00 分 00 秒(北京时间 1970 年 01 月 01 日 00 时 00 分 00 秒)的总毫秒数。...实现如下： function now(){ return (Date.now && Date.now()) || new Date().getTime(); } 方法3 生成的值为 GUID(全局唯一标识符...全局唯一标识符（GUID，Globally Unique Identifier）是一种由算法生成的二进制长度为128位的数字标识符。GUID主要用于在拥有多个节点、多台计算机的网络或系统中。...在理想情况下，任何计算机和计算机集群都不会生成两个相同的GUID。GUID 的总数达到了2128（3.4×1038）个，所以随机生成两个相同GUID的可能性非常小，但并不为0。
Excel中同时删除多行合并重复值的问题不复杂，但也有人会犯错，以下对其具体操作方法以及容易犯的错误分别进行描述。...一、删除重复值操作方法 选中所有列，单击“删除重复值”，在弹出窗口中，仅勾选A列和B列（即去掉C列前的勾），然后确定即可，如下图所示： 操作结果如下，可以看出，相应的C列的内容也已被一并删除...： 二、删除重复值容易犯的错误 有些用户在操作删除重复项时，由于Excel的使用习惯是想对什么操作就选什么，于是仅选择了A列和B列（没有连C列一起选中），然后单击“删除重复项”，如下图所示...在线M函数快查及系列文章链接（建议收藏在浏览器中）： https://app.powerbi.com/view?...r=eyJrIjoiZDVhZDBlMTYtNDkzNC00YWFjLWFhMmMtMmI3NTk2Y2ZhMzc3IiwidCI6ImUxMTAyMjkxLTNkYzUtNDA1OC1iMDc3LWQ0YzU4YWJkMWRkOCIsImMiOjEwfQ
一、题目描述 所有 DNA 都由一系列缩写为 'A'，'C'，'G' 和 'T' 的核苷酸组成，例如："ACGAATTCCG"。在研究 DNA 时，识别 DNA 中的重复序列有时会对研究非常有帮助。...编写一个函数来找出所有目标子串，目标子串的长度为 10，且在 DNA 字符串 s 中出现次数超过一次。...L 的滑动窗口。...检查滑动窗口中的序列是否在 HashMap中。 如果是，则找到了重复的序列，将序列假如到HashSet中。 否则，将序列添加到 HashMap中。...在执行的循环中，有N−L+1 个长度为 L 的子字符串，这会导致 O((N−L)L) 时间复杂性。
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