R中Cox PH模型的置换观测

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r、permutation、survival-analysis、cox

我在生存包中有一个coxph函数所需格式的数据帧。主题的状态可以是0(活着)或1(死)。我想对受试者的状态进行排列，然后重新运行分析。我应该明确地要求我的代码在时间段6之后忽略该人的任何观察结果，还是coxph函数本身会自动执行？

浏览 3提问于2018-01-27得票数 1

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coxme比例风险假设

r、cox-regression、hazard

我正在使用R中的coxme函数{coxme}运行混合效果Cox模型，我想检查比例风险的假设。2015年，类似的问题也在上发布，但没有得到答案。我的问题是: 1)如何在混合效应cox模

浏览 10提问于2016-12-30得票数 0

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R中带coxph (生存包)分层变量模型诊断的误差

r、survival-analysis、survival、cox

我有一个数据集，其中有3个组接受不同媒体的曝光。一组被暴露在三种媒体中的一种。因此，我的coxph模型是分层的：fullModel <- coxph(Surv(time, status) ~ strata(treatment), data = d) test.assump <- cox.zph(full

浏览 5提问于2022-06-24得票数 1

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使用Python和R创建在线预测工具的有用包(提供的示例)

python、r、statistics、tkinter、rpy2

我正在建立一个Cox PH统计模型来预测乳腺癌患者复发的概率。我想为病人或医生创建一个在线界面，让他们能够输入相关的病人特征，并计算复发的概率。下面是一个完美的例子，尽管它适用于前列腺癌：我的基本计划是用python创建工具，并根据用户的输入和我以前拟合的Cox PH模型用R计算概率。该工具需要下拉框和用户输入的数值。我的经验

浏览 7提问于2012-07-11得票数 0

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Xgboost生存时间条目

xgboost、survival、cox

在xgboost 0.81中cox ph生存模型的新实现中，如何指定事件的开始和结束时间？谢谢cph_mod = coxph(Surv(Start, Stop, Status) ~ Age + Sex + SBP, data=data)

浏览 0提问于2018-11-30得票数 4

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如何计算R中Cox回归的影响大小的统计幂？

我很抱歉，这是一个非常普遍的问题，但我的谷歌技能完全失败了。根据Cox PH测试，我想绘制每个效果大小(或至少0.1)的样本大小。一位同事(现在左)在R中产生了一个线性模型幂分析，作为Cox回归的占位符。有一些软件包(pwr)，但没有一个处理Cox回归。我需要在R中这样做，这样我就可以将Cox分析的结果叠加在这个幂分析之上，来指示我的<

浏览 1提问于2018-10-05得票数 0

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R中具有时变协变量的全参数比例风险模型的拟合

r、survival-analysis

我需要拟合一个具有时变协变量的参数PH模型(所以，不是Cox模型)。我们可以在R中这样做吗？我听说survreg函数不能处理时变协变量。我一直在徒劳地寻找可以处理这一问题的软件包。

浏览 3提问于2013-03-06得票数 3

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将cox.zph放入新函数时发生错误

我试图写一个R函数来输出统计测试和图形诊断，同时测试比例风险假设。具体来说，我想将survival::cox.zph和survival::coxph放在R函数中，如下所示。cox.zph(survival::coxph(phmodel, print有一个错误:is.data.frame(数据)中的错误:找不到对象'phdata‘，来自

浏览 5提问于2022-10-14得票数 1

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用R中的生存包实现cox比例风险模型中的非线性关系

r、survival-analysis

我是根据树木普查数据模拟树木死亡率的。人们每隔一段时间就出去，记录树木是生是死。我使用coxph函数来运行一个cox比例风险模型，作为几个预测变量的函数来分析树木死亡率的概率。代码看起来像：然而，我的预测因子之一，树的大小，实际上被期望与死亡概率有一个非线性的关系。具体来说，树木在很小的时候就会死亡，当它们达到“幼年”阶段时，死亡<e

浏览 2提问于2016-06-02得票数 1

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区间截尾数据: Cox比例风险与R中的残差

r、survival-analysis、cox-regression

关于如何使用survival软件包在R中进行生存分析，有相当多的信息(互联网和教科书)。但是我没有找到任何关于当离开审查过的数据时如何做到这一点的信息。问题背景：我想分析具有左截断、事件和右截断的完整数据集。我想按性别绘制Kaplan

浏览 5提问于2017-02-06得票数 1

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R- cox.zph()不返回rho值，p-值与示例不同。

r、cox-regression、survival

当我在Cox模型上运行cox.zph时，我得到的回报与我在其他地方看到的不同。我尝试运行以下代码：library(survminer) #version 0.4.6 这将给出以下返回：age

浏览 2提问于2019-11-23得票数 1

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coxModelFrame.coxph( object )中出错:调用coxph时对象集x=TRUE无效

survival-analysis、cox-regression、survival、cox、hazard

以下示例适用于正在构建Cox比例风险模型并尝试生成预测误差曲线的任何人，但得到的错误声明如下： coxModelFrame.coxph( object )出错:调用coxph时对象集x=TRUE无效。)library(doMC) 数据 #Load and store the比例风险 fitform1

浏览 168提问于2019-03-11得票数 1

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生存模型的XGBoost (Python)预测

python、xgboost

Xgboost的文档意味着使用Cox PH损失训练的模型的输出将是个人预测乘数的指数(相对于基线风险)。没有办法从这个模型中提取基线风险来预测每个人的整个生存曲线吗？生存: Cox :对右截尾生存时间数据的Cox回归(负值被认为是右截尾)。请注意，在风险比标度上返回预测值(即比例风险函数h(t) = h0(t) * HR中的HR=exp(H0))

浏览 4提问于2018-11-28得票数 3

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cox.zph如何处理随时间变化的协变量？

r、cox-regression

我有一个有5个时间相关变量和2个时间自变量的coxph模型.我想检验比例风险假设，除了鞅和偏差残差，使用cox.zph。我的问题是，这个函数如何处理随时间变化的协变量？在阅读之后，我不确定这是否是建议的适合度测试来评估时变协变量的PH假设。+CODE_06+factor(clima)+TP_media7 > c

浏览 5提问于2014-06-30得票数 6

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生存分析:伪观察与分层考克斯回归。哪一个更好？

machine-learning、statistics、survival-analysis

我一直在研究Cox回归方法在流失预测中的生存分析。$\boldsymbol{β} \in \mathbb{R}^D$：各系数的指数给出了一个危险比。这些应该是恒定的w.r.t时间(比例假设)。$\boldsymbol{X}\in \mathbb{R}^{N\倍D}$：$N$示例客户集分层<e

浏览 0提问于2018-05-18得票数 3

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cox ph值的最终预测精度

r、cox-regression、survival

我想开发一个带有r的，用它来预测输入并评估模型的准确性。对于评估，我想使用。train_ind, ] s <- Surv(train.lung$time, train.lung$status)cox.ph2<- coxph(s~age+meal.cal+wt.loss, data=train.lung) pred <- predict(cox.<

浏览 0提问于2018-06-05得票数 0

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Cox模型，coxph()，无事件对照处理，种子萌发

r、survival-analysis、cox-regression

我的数据集是种子萌发实验的结果。感兴趣的主要变量是“对待”变量(具有3个级别的分类变量)。在我的脚本中，我试图通过比较PH系数百分比来找出不同处理之间是否存在差异，哪一个是最好的，以及在多大程度上。2)如果违反了危险假设(PH)的相称性，我应该如何处理我的数据才能继续构建cox模型？我进行了深入的研究，但还不能理解如何在我的模型

浏览 2提问于2019-02-04得票数 1

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正态回归和生存回归的预测限

linear-regression、cross-validation、survival-analysis、cox-regression

我知道，我建立的普通ML模型无法很好地预测2009年后安装的管道的泄漏持续时间。我这么说的原因是因为我首先根据他们的“安装年”对数据进行了排序，然后做了一个训练测试拆分，看看它如何在预测测试数据集中发挥作用，我得到了%93R平方，但当我在火车测试拆分中关闭了混洗功能时(这意味着与正常的火车测试拆分不同，子集是随机选择的，数据将按第一个%80训练和最后%20个测试的顺序排列)，看看它是否可以预测他们<

浏览 0提问于2019-01-28得票数 0

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用时间相关系数和样条绘制coxph对象的HR估计值

r、spline、cox-regression

我想把估计的危险比作为时间的函数来绘制，在coxph模型中，基于样条项的时间相关系数。我使用函数tt创建了时间相关系数，类似于这个直接来自?coxph的例子。# Fit a time transform model using current age tt=function(x,t,...) pspline(x + t

浏览 2提问于2015-06-28得票数 7

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如何在多变量Coxph中得到特定变量的wald检验？

r、survival-analysis、cox-regression、multivariate-testing

我使用R生存包拟合了一个多变量Cox模型，如下所示：data(lung)res.cox1coxph(formula = Surv(time, status) ~ sex + ph.karno模型(**sex + ph.k

浏览 4提问于2020-06-02得票数 2

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