最近需要在内网的windows环境下部署R分析平台，内网遇到的最大困就是安装R语言的软件包和对应的依赖包。...第一步 先下载安装包和依赖包Getpackage 安装的包名...，D:/Downloads/第二步 批量安装将第一步下载的zip压缩包复制到内网环境下，我这里以D:/packages目录为例。...install.path 安装的包名
安装ggstatsplot时,没有针对当前版本的R包....于是用下面方式手动安装 package_url="https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/ggstatsplot/ggstatsplot_0.9.2....tar.gz" install.packages(package_url, repos=NULL, ask = F, update = F) 但这种方式不能自动安装依赖: #ERROR: dependencies...parameters’, ‘performance’, ‘statsExpressions’ are not available for package ‘ggstatsplot’ 用devtools下载特定版本R包..., 并自动安装依赖. require(devtools) install_version('ggstatsplot', version = '0.9.2')
说明# 脚本自动递归下载给定包列表deb包及其依赖包，深度3层； 若指定参数则下载给定的包及其依赖包（目前仅支持指定1个包，不支持多包）； 若无参数则默认下载列表中给出的包机器依赖包； 下载到当前目录；.../auto_deps_log # 需要获取其所依赖包的包 # 或者用$1，从命令行输入库名字 libs="gdisk logrotate pciutils systemd lvm2 udev logrotate...added" apt-get download $added $j done libs=$newlist done 参考文献# shell获取命令行参数 apt一键下载deb包及其依赖
CentOS6.3 x86_64 最小化安装版安装vim yum -y install vim 通过这个命令可得出安装vim所得依赖包如下 Transaction Summary =
问题 你想安装和使用一个 R 包。...如果想要将所有已安装的软件包更新为可用的最新版本，使用以下命令： update.packages() 如果你在 Linux 系统上使用 R ，管理员可能已经在系统上安装了一些 R 包，由于普通用户没有更改权限...其他 导入包也可以使用require()函数。下表显示了 R 包安装相关的命令及描述。...R包 remove.packages 移除一系列已安装的R包 installed.packages 将已经安装的R包更新到最新版本 setRepositories 设定当前的R包的资源库列表 通过命令行安装...R 包 R CMD INSTALL aplpack_1.1.1.tgz # 安装aplpack包 从其他资源库安装 R 包 devtools 包提供了从其他流行的 Git 资源库或其他 URL 上安装
2、作用：实现特定的功能，你需要什么功能，安装相应的R包就行。说人话就是使用智能手机，需要使用微信与人聊天，你就按照微信APP，需要上腾讯视频看电视剧，你就安装腾讯视频APP。...3、在哪可以找R包： （1）官方网站CRAN网站下载，使用“install.packages（）”函数来安装 （2）Bioconductor网站下载，主要是生物生信相关的...R包，使用 “BiocManager::install()来安装 （3）github网站，是R包作者写的，没有经过审核，使用”devtools::install_github...几乎不使用，使用时需要写明R包的作者，就是指明选择谁写的R包。...说人话，智能手机安装的腾讯视频，只要你不卸载，就一直在你的手机里，需要看电视剧是打开APP，看完电视了你退出APP，再次看电视时还需要再次打开APP。所有“加载”R包就相当于打开APP。
关于R和RStudio安装在这里就不再介绍了，网上有很多相关内容，如果安装过程有困难可以后台私信我。 PS.本次内容为R包安装及初识向量。 ? PART2 R包安装 问：什么是R包？...答：包是R函数、数据、预编译代码以一种定义完善的格式组成的集合。它们提供了种类繁多的默认函数和数据集。...（对于刚接触R的同学来说可能看起来比较抽象，但是没关系，我们会在后续的学习中慢慢了解R包的概念） 1.R包安装：第一次安装一个包，使用命令install.packages()即可。...#示例：安装ggplot2包 install.packages('ggplot2') install.packages("ggplot2") 值得注意的一点是，包的名称需要放在单引号''或者双引号""...中 2.R包载入：安装完成后，想要调用这个包中的命令、数据等信息，就需要先载入这个包，需要用到的命令为library()。
说实话，自从之前好好学习了一下入门的R以后，一直没有用过R，很多东西都忘了，还是需要靠做笔记方便日后查阅。 本期讲一下R包的几种来源以及安装指定版本R包的几种方法。 R包来源及安装方法 1....CRAN网站 可以理解为R包的官网，凡是需要通过CRAN下载的R包，都可以通过install.packages("pkg_name")来安装。 2....安装指定版本R包 复现文章或R包的更新与当前的R版本或R代码不兼容时，就需要考虑安装某个特定版本的R包了，这里列一些常见的安装指定版本R包的方法供大家参考。...源码安装 在这里也许能找到你需要的R包历史版本。...CMD安装 这种方法需要依赖Rtools wget https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/limma/limma_1.8.10.tar.gz R
简介 平常在各种R语言群里，总会遇到关于安装R包的问题，例如：搭载在github上的R包，由于网速（外网）原因而无法下载该怎么办？...这里小编分享下平常逼不得已才使用的“下三滥”方法——直接下载包，通过本地安装。 网上好多解决方案都是基于R gui的，但现实中使用Rstudio这个IDE会更多些。...接下来以gmm包在Rstudio下安装为例： 教程 使用bing搜索该包，找到相应网站[1]。 关键词：R包名称+R，或者可以再加上CRAN。 ?...搜索技巧：R包名称+R 找到Downloads板块，下载对应的压缩包 这里以mac为例 ?...这个方法对一些有很多依赖包的包可能会很头疼，就怕安装完成，他还说你有其他包没安装，那你只能“将错就错”了！
一般来说就是Windows电脑的中文用户名需要修改电脑系统的环境变量，R包下载等等。...但是今天有一个学员起初是下载R包无法联网，所以失败，根据我们的经验当然是options(download.file.method = 'libcurl')就轻轻松松解决啦，不过这次居然是仅仅是解决了R自带...R包下载问题，使用BiocManager仍然是无法安装R包，如下所示： ?...='libcurl') 果然，现在在Windows电脑里面R语言的安装R包和下载文件就OK啦。...接下来就继续安装R包吧 使用管理员打开R哦，然后就 options()$repos options()$BioC_mirror options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn
tidyverse安装失败，install.packages('tidyverse') 错误原因大概是其中有个依赖包xml2安装不上，解决办法是yum install libxml2-devel，这样就可以安装...xml2了，也可以安装tidyverse了
说实话，自从之前好好学习了一下入门的R以后，一直没有用过R，很多东西都忘了，还是需要靠做笔记方便日后查阅。 本期讲一下R包的几种来源以及安装指定版本R包的几种方法。 R包的来源 1....CRAN网站 可以理解为R包的官网，凡是需要通过CRAN下载的R包，都可以通过install.packages("包名")来安装 2....Bioconductor 里面多是跟生信相关的R包，通过BiocManager::install("包名")来安装，今天的例子edgeR和limma都可以通过这种方法安装。 3....安装指定版本R包 复现文章或R包的更新与当前的R版本或R代码不兼容时，就需要考虑安装某个特定版本的R包了，这里列一些常见的安装指定版本R包的方法供大家参考。...CMD安装 这种方法需要依赖Rtools wget https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/limma/limma_1.8.10.tar.gz R
问题描述：我使用的是ubuntu18系统自动的py2.7还有pip9，还算是方便，在安装以前的基于pytho的软件的时候发现使用pip安装python包的时候会多次安装依赖包，虽然我设置了豆瓣镜像，安装速度非常快...，但是这样重复安装基础包是不是有点浪费呢？...https://pypi.douban.com/simple cnvkit pip install --index-url https://pypi.douban.com/simple HTSeq 上面的会安装...numpy, pysam, HTSeq Successfully installed HTSeq-0.10.0 numpy-1.14.5 pysam-0.14.1 很明显 pysam-0.14.1 就被安装了两次...而且我查看目录： ls -lh $HOME/.local/lib/python2.7/site-packages 也的确看到包对应的文件夹更新了。
vimrc.tiny 将 compatible 修改为 nocompatible 非兼容模式 解决方向键变ABCD的问题 添加 set backspace=2 解决backspace键失灵的问题 方法２ 安装强大一点的版本...vim 原因很简单，ubuntu预安装的是tiny版本，导致我们使用产生不便 安装vim的full版本，键盘使用就正常了 即： 卸载tiny版本 sudo apt-get remove vim-common...安装full版本 sudo apt-get install vim ２．修改apt源配置文件先备份原来的sources.lis搜集网上有用的链接，修改源配置文 别忘了更新： sudo apt-get...update sudo apt-get upgrade ３．安装aptitude
1.【下载】 python -m pip install –upgrade pip
R包安装的方式 之前在学习数据挖掘课程的时候，就按照小洁老师教的方法整理过相应的笔记啦，R包安装与使用 那我们先回顾一下，基本的R包安装方法——配置好镜像，然后按照对应的来源安装需要的R包。...) #安装R包 括号里面写入需要安装的包的名字 2...."EnhancedVolcano") #安装需要的R包 3....Github上R包 如果是github上的包，可以采用输入作者名以及R包名字之后使用命令进行安装 安装Github上的包 #使用devtools安装 install.packages('devtools...() #查看已安装的R包 search() #查看已载入的R包 查看已经安装的R包 查看已经载入的R包 R包安装成功的唯一标准：library()没有error——小洁老师
接口自动化使用的是python的behave框架，因此需要折腾python了，而公司配的笔记本是windows的，因此要在windows下折腾python了 # 步骤 项目中使用的setup.py文件来管理依赖的...，通过ide直接安装依赖的时候提供mysql-python安装失败，如下 MySQLdb/_mysql.c(29) : fatal error C1083: Cannot open include file...安装wheel，通过pip install wheel安装即可 2. 安装whl包，这个包从https://link.jianshu.com/?...下载相应的版本，然后通过pip install 安装下载好的whl文件 3....然后再执行pip install mysql-python # 后记 是经过多次尝试后，成功了，其中也安装过vcforpython，说是因为windows缺少编译组件，如果上面步骤不成功，可以尝试安装下这个编译环境
yum自动下载RPM包及其所有依赖的包至/root/rpm目录： yum install --downloadonly --downloaddir=/root/rpm 切换到下载目录...rpm中批量安装 rpm -ivh * --nodeps --force yum命令本身就可以用来下载一个RPM包，标准的yum命令提供了downloadonly (只下载)的选项来达到这个目的。...yum install --downloadonly 默认情况下，一个下载的RPM包会保存在下面的目录中: /var/cache/yum/x86_64/[centos/fedora-version...]/[repository]/packages 以上的[repository]表示下载包的来源仓库的名称(例如：base、fedora、updates) 另外一个重要的事情是在CentOS/RHEL 6...或更早期的版本中，你需要安装一个单独yum插件(名称为 yum-plugin-downloadonly)才能使用 downloadonly 命令选项： yum install yum-plugin-downloadonly
R语言入门mac——安装【附安装链接】 这里写目录标题 R语言入门mac——安装【附安装链接】 一、总体安装步骤 1 安装R 2下载RStudio 二、R包安装 一、总体安装步骤 1 安装R RStudio...需要R 3.0.1+ 下载链接：https://cran.rstudio.com/ 2下载RStudio 下载链接：https://rstudio.com/products/rstudio/download.../ 二、R包安装 下面展示 r包安装代码 rm(list = ls()) options()$repos options()$BioC_mirror options(BioC_mirror="https
通常来说，R包的安装主要有四种方法，包括：1）从R语言官网上直接下载相关R包并安装；2）从Bioconductor上下载R包并安装；3）从Github上下载R包并安装；4）手动安装R包。...接下来我将和大家分享R包的具体安装： 1）首先获取下载的R包的名字，比如下载metafor这个R包，可以先在官网（https://www.r-project.org/）上找到这个包，了解一下这个包的详细内容和使用说明...，接下来使用： install.packages('metafor') 即可顺利安装该R包。...3）接下来便是安装源自Github（https://github.com/）的R包了，它的步骤和安装源自Bioconductor的R包类似，需要先安装devtools包，然后用devtools包里的install_github...，github中的R包需要在其前面加上该包所在的库名，否则无法进行下载安装。
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