我在生物信息学方面做了几项研究工作，并使用Matlab进行研究。Matlab有很多强大的工具，而且很容易使用。我确实考虑过基因组测序和预测代谢途径。我想知道其他人认为什么是最好的？或者，可能没有一种特定的语言，而是几种最适合生物信息学工作的语言，这些工作数学繁重，需要处理大量数据。
浏览 3提问于2010-06-08得票数 9
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一些简单的生物体有一个环状的DNA分子作为基因组，分子没有开始也没有结束。这些环形基因组可以被看作是沿着圆周书写的一系列整数。现在的问题是:设计一种交换排序算法，使用最少的交换次数对循环排列进行排序。
浏览 0提问于2013-05-09得票数 0
> sessionInfo()Platform: x86_64-apple-darwin17.0 (64-bit)我正试图在GVIZ上加载mm10小鼠基因组的表意图轨迹。但现在给了我以下错误： value3L错误:在UCSC，似
浏览 3提问于2021-10-05得票数 0
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日安， chromosome start end 1 10000 10005 2 13123 13130我有这样的目标表：1 100021 10004
通过对基因组进行筛选，使染色体、==、、染色质、和的位置介于Start和e
浏览 2提问于2022-03-08得票数 0
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我是用计量经济学中的2SLS方法估计的，现在我想用遗传算法来估计它。有没有人能帮我从哪里开始？有没有相关的论文(用遗传算法估计联立方程组)？你知道我的健身功能应该是什么吗？
谢谢你的帮助。
浏览 1提问于2010-10-11得票数 0
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我必须在基因组序列中搜索模式wTTTAYRTTTW，其中W = A或T，Y = C或T，R = A或R。应该允许某些不匹配，即字符串和它们的位置完全匹配。我的方法是： }sub trans_pat my $pat=shift; $pat=$pat1)/g)
print FH1 "match at\t
浏览 0提问于2012-06-20得票数 1
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将SNP ID映射到基因组坐标
、、、、
我有几个 in (即rs16828074、rs17232800等)，我想从获得它们在Hg19基因组中的坐标。
我更喜欢使用R来实现这个目标。怎么做？
浏览 8提问于2013-11-27得票数 11
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我赞成有两个类别，一个是基因组类，一个是突变类。这种突变类将提供突变基因组的方法，方法是以基因组为输入，并返回突变的基因组。此外，该实现还将为每个过程设置类，如选择、交叉等。这样，我们以后就可以选择从突变类中派生出各种类型的突变。我认为它也将
浏览 0提问于2019-07-25得票数 2
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话虽如此，仅GA是可以的，但我想用神经网络来加强它，即使我没有神经网络的实际工作知识(没有正规的理论CS教育)。在对这个主题做了一些阅读之后，我发现可以使用神经网络来训练基因组，以提高结果。假设我有一个基因组(一组基因)，比如如何使用神经网络(我假设是MLP?)来训练和改进我的基因组？除此之外，由于我对神经网络一无所知，我一直在寻找实现某种形式的强化学习，使用我的
浏览 0提问于2010-03-17得票数 9
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我在试着刮掉维基百科上的“基因组”页面我只想抓取像“术语的起源”，“测序和绘图”，“病毒基因组”，“原核基因组”，“真核基因组”之类的小标题，包括下面的子标题，基因组大小，等等。headers = read_page_soup.find_all(re.compile(r'h\d+'))
return headers 问题是，无论我如何具体地过滤掉我的标签，我仍然可以从导航菜单中获
浏览 30提问于2021-03-17得票数 1
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我试着为我的项目学习和实现一个简单的遗传算法库。此时，进化，种群的选择已经做好了准备，我正在尝试为我的遗传进化引擎在Java和Scala中实现一个简单的好的突变操作符，比如 (GMO)。我在论文 (P.Mateo，I.Alberto)中找到了一些关于高斯突变算子(GMO)的信息，第6和第7页。但是，我有一些问题需要找到关于如何在Java中实现这个高斯变异算子和这个算子的其他有用变体
浏览 3提问于2011-06-08得票数 13
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我有缺失值的基因组数据，我想通过使用可用的值来计算每对基因的表达水平之间的距离。然后我想找出K个最近的邻居来填补空缺？我如何在R中做到这一点呢？对不起，我是新接触基因组数据的人，我在任何地方都找不到这些信息。
谢谢。
浏览 1提问于2013-03-19得票数 0
我有一个相当大的数据集，研究整个基因组中的SNPs。我正在尝试生成一个热图，它基于在整个基因组中x个碱基对的滑动窗口内有多少SNP具有超过50的BF (贝叶斯因子)值来缩放。例如，在第一个1,000,000个碱基对中可能有5个感兴趣的SNP，然后在接下来的1,000,000个碱基对中有3个SNP，依此类推，直到我到达基因组的末端，这将用于生成单行热图。2347062 -1.209000033 234706
浏览 12提问于2021-04-22得票数 0
我正在使用R Gviz软件包来绘制我的深度测序数据。我在研究酿酒酵母基因组。当我把染色体表意图添加到我的图中时，着丝点就不会被绘制出来。genome = "sacCer3", chromosome = "chrI")
相反，当我使用人类基因组做同样的操作时IdeogramTrack(genome = "hg19", ch
浏览 1提问于2019-06-26得票数 0
我有来自细菌基因组的RNA-seq数据(2个不同处理的3个重复)，并使用DeSeq2计算了基因的log2fc (padj < 0.05)。更新:基因组已经发布并进行了注释，因此我有每个基因对应的基因组坐标。也许它就像合并这些信息一样简单。但并不是所有的基因都是差异表达的，所以它变得更加复杂。然而，我想要log2 RNA的变化(y轴)与基因组坐标(x轴)。但我在网上找了一遍也没找到。有没有人知道
浏览 51提问于2020-07-05得票数 0
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我的问题与线程有关，我想同时执行我的基因组。基因组2左左右左炸弹..。这些动作或动作在玩家还活着之前都是有效的。我想应用这些移动在我的球员(AI)使用线程。这个游戏是实时的，每帧都会触发移动。每个基
浏览 0提问于2018-04-06得票数 2
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我研究的是生物学，特别是DNA，通常是基因组测序所产生的数据大小有问题。然而，DNA测序技术的一个主要问题是所产生的数据的大小(对于整个基因组来说，通常比千兆字节多得多)。我知道在不同的计算机上，整数的大小是不同的，但它仍然比四种选择具有更多<e
浏览 3提问于2014-06-25得票数 4
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这些关系是：我的问题是，即使用户没有购买产品，用户也可以添加索赔，只要用户知道序列号，而我应该允许用户只为用户购买的产品添加索赔。为了插入声明，我使用了以下查询：我需要用键修改表关系来修复上面的问题，还是使用更具体的查询？更好的是，这应该如何运作背后的逻辑是什么？
浏览 0提问于2021-08-07得票数 0
使用数据选项卡中的Excel时，会有一个过滤器选项。我希望将其实现到我一直在开发的程序中。它可能只有一行代码那么简单。如果您知道任何事情，或者在此版本/编程语言中不可能，请让我知道
谢谢!有关更多信息:我希望使用排序选项来应用筛选器，以便在打开我创建的excel文档时，用户不必突出显示所有内容，然后单击数据选项卡并选择筛选器。源数据不会有任何影响。
浏览 1提问于2010-07-14得票数 0
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