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R语言中的偏最小二乘PLS回归算法

p=4124 偏最小二乘回归: 我将围绕结构方程建模(SEM)技术进行一些咨询,以解决独特的业务问题。我们试图识别客户对各种产品的偏好,传统的回归是不够的,因为数据集的高度分量以及变量的多重共线性。...PLS是处理这些有问题的数据集的强大而有效的方法。 主成分回归是我们将要探索的一种选择,但在进行背景研究时,我发现PLS可能是更好的选择。我们将看看PLS回归和PLS路径分析。...我不相信传统的扫描电镜在这一点上是有价值的,因为我们没有良好的感觉或理论来对潜在的结构做出假设。此外,由于数据集中的变量数量众多,我们正在将SEM技术扩展到极限。....,2004年,“初步指南偏最小二乘分析”,Understanding Statistics,3(4),283-297中可以找到关于这个限制的有趣讨论。...R平方 $ R2Xy解释Xy的方差T $ y.pred y-预测 $ resid 残差 $ T2 T2经济系数 Q2第二季度交叉验证这个包中有很多,我强烈建议阅读优秀的教程来了解更多信息

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R语言中的偏最小二乘回归PLS-DA

主成分回归(PCR)的方法 本质上是使用第一个方法的普通最小二乘(OLS)拟合来自预测变量的主成分(PC)(点击文末“阅读原文”获取完整代码数据)。 这带来许多优点: 预测变量的数量实际上没有限制。...让我们开始使用R 癌症/无癌标签(编码为-1 / 1)存储在不同的文件中,因此我们可以将其直接附加到完整的数据集,然后使用公式语法来训练模型。...(_x_轴)训练的模型中获得的平均准确度(_y_轴,%)。...在这种情况下,PLS-DA和PCA-DA表现出最好的性能(准确度为63-95%),并且这两种模型在诊断新血清样品中的癌症方面都表现出色。...这可能是一个有趣的癌症生物标志物。当然,必须进行许多其他测试和模型来提供可靠的诊断工具。 本文选自《R语言中的偏最小二乘回归PLS-DA》。

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    R语言中的偏最小二乘回归PLS-DA

    p=8890 主成分回归(PCR)的方法 本质上是使用第一个方法的普通最小二乘(OLS)拟合来自预测变量的主成分(PC)(点击文末“阅读原文”获取完整代码数据)。...相关视频 这带来许多优点: 预测变量的数量实际上没有限制。 相关的预测变量不会破坏回归拟合。 但是,在许多情况下,执行类似于PCA的分解要明智得多。...让我们开始使用R 癌症/无癌标签(编码为-1 / 1)存储在不同的文件中,因此我们可以将其直接附加到完整的数据集,然后使用公式语法来训练模型。...(_x_轴)训练的模型中获得的平均准确度(_y_轴,%)。...在这种情况下,PLS-DA和PCA-DA表现出最好的性能(准确度为63-95%),并且这两种模型在诊断新血清样品中的癌症方面都表现出色。

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    R语言中的偏最小二乘回归PLS-DA

    p=8890 主成分回归(PCR)的方法 本质上是使用第一个方法的普通最小二乘(OLS)拟合 来自预测变量的主成分(PC)。这带来许多优点: 预测变量的数量实际上没有限制。...相关的预测变量不会破坏回归拟合。  但是,在许多情况下,执行类似于PCA的分解要明智得多。 今天,我们将 在Arcene数据集上执行PLS-DA,  其中包含100个观察值和10,000个解释变量。...让我们开始使用R 癌症/无癌标签(编码为-1 / 1)存储在不同的文件中,因此我们可以将其直接附加到完整的数据集,然后使用公式语法来训练模型。...(x轴)训练的模型中获得的平均准确度(y轴,%)。 ...在这种情况下,PLS-DA和PCA-DA表现出最好的性能(准确度为63-95%),并且这两种模型在诊断新血清样品中的癌症方面都表现出色。

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    R语言实现偏最小二乘回归法 partial least squares (PLS)回归

    p=8652 偏最小二乘回归是一种回归形式 。  当使用pls时,新 的线性组合有助于解释模型中的自变量和因变量。 在本文中,我们将使用pls在“ Mroz”数据集中使用预测“收入”。  ...mean((pls.pred-Mroz$income[test])^2) ## [1] 63386682  我们将使用传统的最小二乘回归模型运行数据并比较结果。...## [1] 59432814 最小二乘模型比部分最小二乘模型好一点,但是如果看一下模型,我们会看到几个不重要的变量。...<-predict(lm.fit,Mroz[test,])mean((lm.pred-Mroz$income[test])^2) ## [1] 57839715  误差降低得更多,这表明最小二乘回归模型优于偏最小二乘模型...此外, 偏最小二乘模型很难解释。因此,最小二乘模型是最受欢迎的模型。

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    R语言偏最小二乘回归PLS回归分析制药产品化学制造过程数据、缺失值填充、变量重要性

    p=34046 PLS回归主要的客户来自于化学、药品、食品和塑料行业。在本文中,我们将使用此类背景下的示例(点击文末“阅读原文”获取完整代码数据)。 相关视频 什么是偏最小二乘回归(PLS回归)?...偏最小二乘回归(Partial Least Squares, PLS)是一种将预测变量降维为一组不相关的成分,并在这些成分上执行最小二乘回归的技术,而不仅仅是在原始数据上执行回归。...将产品产量提高1%将使每批收入增加大约十万元: 启动R并使用以下命令加载数据: 数据包含了176次制造过程的57个预测变量(其中12个描述输入的生物材料,45个描述制造过程的预测变量)。...这捕获了预测变量中的45.95%的变异性和结果变量(产量)中的73.37%的变异性。 曲线中的最低点表示最优值,即交叉验证中最小化误差的最佳值。...我们也可以看到存在着积极但较低的相关性,这是有道理的。如果过程良好,那么产品就会出色。 本文选自《R语言偏最小二乘回归PLS回归分析制药产品化学制造过程数据、缺失值填充、变量重要性》

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    R语言GAMLSS模型对艾滋病病例、降雪量数据拟合、预测、置信区间实例可视化|附代码数据

    GAMLSS模型是一种半参数回归模型,参数性体现在需要对响应变量作参数化分布的假设,非参数性体现在模型中解释变量的函数可以涉及非参数平滑函数,非参数平滑函数不预先设定函数关系,各个解释变量的非线性影响结果完全取决于样本数据...正态与伽马的比较探讨了数据中是否存在正偏性。正态与幂指数的比较表明了峰度的可能性,而BCPE则显示出数据中是否同时显示了偏度和峰度。GAIC将帮助我们在不同的分布之间进行选择。...检验模型使用R函数ks.test()提供的Kolmogorov-Smirnovness拟合测试测试正态模型(或任何其他模型)的充分性在这里是不可取的,因为我们必须估计分布参数u和o,所以测试无效。...---- 最受欢迎的见解1.R语言多元Logistic逻辑回归 应用案例2.面板平滑转移回归(PSTR)分析案例实现3.matlab中的偏最小二乘回归(PLSR)和主成分回归(PCR)4.R语言泊松Poisson...回归模型分析案例5.R语言混合效应逻辑回归Logistic模型分析肺癌6.r语言中对LASSO回归,Ridge岭回归和Elastic Net模型实现7.R语言逻辑回归、Naive Bayes贝叶斯、决策树

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    R语言多元统计包简介:各种假设检验 统计方法 聚类分析 数据处理

    mnormt包提供元t分布和多元正态分布的密度和分布函数,并可产生随机数。sn包提供多元偏t分布和偏正态分布的密度、分布、随机数函数。...pls包提供偏最小二乘回归(PLSR)和主成分回归;ppls包可做惩罚偏最小二乘回归;dr包提供降维回归方法,如....plsgenomics包做基于偏最小二乘回归的基因组分析。relaimpo包可评估回归参数的相对重要性。...superpc包利用主成分做有监督的分类,classPP包则可为其做投影寻踪(projection pursuit),gpls包用广义偏最小二乘做分类。...14) 矩阵处理(Matrix manipulations): R作为一种基于向量和矩阵的语言,有许多处理矩阵的强有力的工具,由包Matrix和,SparseM实现。

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    数学建模及其基础知识详解(化学常考知识点)

    5、混合方法:组合评价法 二、插值和拟合(数值计算方法) 1、插值 1.1、牛顿插值 1.2、拉格朗日插值 1.3、埃米尔特插值 1.4、样条插值 2、拟合 2.1最小二乘拟合 2.2最佳逼近(...(参考: 1、什么是相关系数 2、皮尔逊、斯皮尔曼、肯德尔相关系数介绍及其在特征选择中的应用) 2、正态分布均值假设检验方法 常用方法:t检验,Z检验,卡方检验,F检验等 3、正态分布检验 利用观测数据判断总体是否服从正态分布的检验称为正态性检验...是统计判决中重要的一种特殊的拟合优度假设检验。常见方法有:偏度和峰度,图示法,非参数检验。...(小样本) 四、回归 (参考:超级干货 :一文读懂回归分析 ) 1、线性回归、局部加权线性回归 2、多元回归(估计方法的分为普通、广义最小二乘法,广义允许在误差项存在异方差或自相关,注意拟合优度指标...多重共线性:解释变量之间由于存在精确相关关系或高度相关关系而使模型估计失真或难以估计准确。共线性的存在会使得回归系数的最小二乘估计量误差较大。

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    MATLAB偏最小二乘回归(PLSR)和主成分回归(PCR)分析光谱数据|附代码数据

    点击标题查阅往期内容R语言实现偏最小二乘回归法 partial least squares (PLS)回归Matlab中的偏最小二乘法(PLS)回归模型,离群点检测和变量选择R语言实现偏最小二乘回归法...回归分析Python用PyMC3实现贝叶斯线性回归模型使用R语言进行多项式回归、非线性回归模型曲线拟合R语言中的偏最小二乘回归PLS-DAR语言生态学建模:增强回归树(BRT)预测短鳍鳗生存分布和影响因素...R语言实现偏最小二乘回归法 partial least squares (PLS)回归Matlab中的偏最小二乘法(PLS)回归模型,离群点检测和变量选择偏最小二乘回归(PLSR)和主成分回归(PCR)...R语言进行多项式回归、非线性回归模型曲线拟合R语言中的偏最小二乘回归PLS-DAR语言生态学建模:增强回归树(BRT)预测短鳍鳗生存分布和影响因素R语言生态学建模:增强回归树(BRT)预测短鳍鳗生存分布和影响因素...R语言实现偏最小二乘回归法 partial least squares (PLS)回归Matlab中的偏最小二乘法(PLS)回归模型,离群点检测和变量选择偏最小二乘回归(PLSR)和主成分回归(PCR)

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    偏最小二乘回归(PLSR)和主成分回归(PCR)分析光谱数据|附代码数据

    点击标题查阅往期内容R语言实现偏最小二乘回归法 partial least squares (PLS)回归Matlab中的偏最小二乘法(PLS)回归模型,离群点检测和变量选择R语言实现偏最小二乘回归法...回归分析Python用PyMC3实现贝叶斯线性回归模型使用R语言进行多项式回归、非线性回归模型曲线拟合R语言中的偏最小二乘回归PLS-DAR语言生态学建模:增强回归树(BRT)预测短鳍鳗生存分布和影响因素...R语言实现偏最小二乘回归法 partial least squares (PLS)回归Matlab中的偏最小二乘法(PLS)回归模型,离群点检测和变量选择偏最小二乘回归(PLSR)和主成分回归(PCR)...R语言进行多项式回归、非线性回归模型曲线拟合R语言中的偏最小二乘回归PLS-DAR语言生态学建模:增强回归树(BRT)预测短鳍鳗生存分布和影响因素R语言生态学建模:增强回归树(BRT)预测短鳍鳗生存分布和影响因素...R语言实现偏最小二乘回归法 partial least squares (PLS)回归Matlab中的偏最小二乘法(PLS)回归模型,离群点检测和变量选择偏最小二乘回归(PLSR)和主成分回归(PCR)

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    机器学习面试

    你可以选非常多的k值,可以做出一个岭迹图,看看这个图在取哪个值的时候变稳定了,那就确定k值了,然后整个参数估计不稳定的问题就解决了。 ---- 10,偏最小二乘回归。...偏最小二乘回归也可以用于解决自变量之间高度相关的问题。但比主成分回归和岭回归更好的一个优点是,偏最小二乘回归可以用于例数很少的情形,甚至例数比自变量个数还少的情形。...听起来有点不可思议,不是说例数最好是自变量个数的10倍以上吗?怎么可能例数比自变量还少,这还怎么计算?可惜的是,偏最小二乘回归真的就有这么令人发指的优点。...所以,如果你的自变量之间高度相关、例数又特别少、而自变量又很多(这么多无奈的毛病),那就现在不用发愁了,用偏最小二乘回归就可以了。...偏最小二乘回归还有一个很大的优点,那就是可以用于多个因变量的情形,普通的线性回归都是只有一个因变量,而偏最小二乘回归可用于多个因变量和多个自变量之间的分析。

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    【数据分析 R语言实战】学习笔记 第九章(下)岭回归及R实现 广义线性模型

    9.4岭回归及R实现 岭回归分析是一种专用于共线性数据分析的有偏估计回归方法,实质上是一种改良的最小二乘估计法,它是通过放弃最小二乘法的无偏性,以损失部分信息、降低精度为代价获得回归系数更为符合实际、更可靠的回归方法...为β的岭回归估计,其中k为岭参数。显然,岭回归估计β值比最小二乘估计值稳定,当k=0时的岭回归估计就是普通最小二乘估计。 岭迹图: ?...根据岭迹图我们可以选择合适的k值,称为岭迹法,其一般原则是: (1)各回归系数的岭估计基本稳定; (2)最小二乘估计的回归系数符号不合理时,岭估计参数的符号变得合理 (3)回归系数没有不合乎实际意义的绝对值...,允许响应概率分布为指数分布族中的任何一员。...各种常见的指数型分布及其主要参数 ? 典型的连接函数及对应分布 ? 广义线性模型的参数估计一般不能用最小二乘估计,常用加权最小二乘法或最大似然法估计,各回归系数β需用迭代方法求解。

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    【视频讲解】偏最小二乘结构方程模型PLS-SEM分析白茶产业数字化对共同富裕的影响|附代码数据

    p=36314 分析师:Qiancheng Yu 本文将通过视频讲解,展示如何用偏最小二乘结构方程模型PLS-SEM分析白茶产业数字化对共同富裕的影响,并结合Python用偏最小二乘回归Partial...偏最小二乘的优缺点 优点: 偏最小二乘(PLS)提供了一种多因变量对多自变量的回归建模方法,特别适用于处理变量之间的多重共线性问题。...Python用偏最小二乘回归Partial Least Squares,PLS分析桃子近红外光谱数据可视化 PLS,即偏最小二乘(Partial Least Squares),是一种广泛使用的回归技术,...点击标题查阅往期内容 Matlab中的偏最小二乘法(PLS)回归模型,离群点检测和变量选择 01 02 03 04 偏最小二乘回归 现在是时候优化偏最小二乘回归了。...其次,它找到最小化均方误差的组件数,并使用该值再次运行偏最小二乘回归。在第二次计算中,计算了一堆指标并将其打印出来。 让我们通过将最大组件数设置为40来运行此函数。

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    R语言对回归模型进行回归诊断

    因为在对回归模型建模的时候我们使用了最小二乘法对模型参数的估计,什么是最小二乘法,通俗易懂的来说就是使得估计的因变量和样本的离差最小,说白了就是估计出来的值误差最小;但是在使用最小二乘法的前提是有几个假设的...这里我就引用《R语言实战》的内容了,在我大学中的《计量经济学》这本书讲的更为详细,不过这里主要是介绍使用R语言对模型进行回归诊断,所以我们就不说太详细了; 假定 正态性:对于固定的自变量值,因变量值成正态分布...,也就是说因变量的是服从正态分布的 独立性:Yi值之间相互独立,也就是说Yi之间不存在自相关 线性:因变量和自变量是线性相关的,如果是非线性相关的话就不可以了。...上面只是借用了一个小小例子来讲解了一下R语言做回归模型的过程,接下来我们将一下如何进行回归诊断,还是原来的那个模型,因为使用LM函数中会有一些对结果评价的内容,因此我们用PLOT函数将画出来; R代码如下...右下:主要是影响点的分析,叫残差与杠杆图,鉴别离群值和高杠杆值和强影响点,说白了就是对模型影响大的点 根据左上的图分布我们可以知道加个非线性项,R语言实战里面是加二次项,这里我取对数,主要是体现理解 R

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    R语言非线性回归和广义线性模型:泊松、伽马、逻辑回归、Beta回归分析机动车事故、小鼠感染、蛤蜊数据、补剂钠摄入数据|数据分享

    # fit r2(clam_gamma) 这是正态的吗? 你可能会问为什么这里使用伽马分布而不是正态分布?我们可以用正态误差和对数链接进行glm拟合。...在R中,我们可以使用两种形式来参数化二项逻辑回归 - 这两种形式是等价的,因为它们将结果扩展为成功次数和总试验次数。...:主成分回归PCR、岭回归、lasso、弹性网络elastic net分析基因数据(含练习题) Python中LARS和Lasso回归之最小角算法Lars分析波士顿住房数据实例 R语言Bootstrap...R语言用LASSO,adaptive LASSO预测通货膨胀时间序列 R语言自适应LASSO 多项式回归、二元逻辑回归和岭回归应用分析 R语言惩罚logistic逻辑回归(LASSO,岭回归)高维变量选择的分类模型案例...Python中的Lasso回归之最小角算法LARS r语言中对LASSO回归,Ridge岭回归和弹性网络Elastic Net模型实现 r语言中对LASSO回归,Ridge岭回归和Elastic

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    Matlab中的偏最小二乘法(PLS)回归模型,离群点检测和变量选择|附代码数据

    R语言中的偏最小二乘回归PLS-DA 01 02 03 04 蒙特卡洛交叉验证(MCCV)的PLS 说明如何对PLS建模进行MCCV。...---- 点击标题查阅往期内容 R语言实现偏最小二乘回归法 partial least squares (PLS)回归 R语言中的block Gibbs吉布斯采样贝叶斯多元线性回归R语言Lasso回归模型变量选择和糖尿病发展预测模型...预测心脏病数据和可视化分析 基于R语言实现LASSO回归分析 Python用PyMC3实现贝叶斯线性回归模型 使用R语言进行多项式回归、非线性回归模型曲线拟合 R语言中的偏最小二乘回归PLS-DAR语言生态学建模...:增强回归树(BRT)预测短鳍鳗生存分布和影响因素 R语言实现偏最小二乘回归法 partial least squares (PLS)回归 Matlab中的偏最小二乘法(PLS)回归模型,离群点检测和变量选择...偏最小二乘回归(PLSR)和主成分回归(PCR) R语言如何找到患者数据中具有差异的指标?

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    Matlab中的偏最小二乘法(PLS)回归模型,离群点检测和变量选择|附代码数据

    ----点击标题查阅相关内容R语言中的偏最小二乘回归PLS-DA左右滑动查看更多01020304蒙特卡洛交叉验证(MCCV)的PLS说明如何对PLS建模进行MCCV。...----本文摘选 《 Matlab中的偏最小二乘法(PLS)回归模型,离群点检测和变量选择 》 ,点击“阅读原文”获取全文完整资料。...----点击标题查阅往期内容R语言实现偏最小二乘回归法 partial least squares (PLS)回归R语言中的block Gibbs吉布斯采样贝叶斯多元线性回归R语言Lasso回归模型变量选择和糖尿病发展预测模型...R语言实现LASSO回归分析Python用PyMC3实现贝叶斯线性回归模型使用R语言进行多项式回归、非线性回归模型曲线拟合R语言中的偏最小二乘回归PLS-DAR语言生态学建模:增强回归树(BRT)预测短鳍鳗生存分布和影响因素...R语言实现偏最小二乘回归法 partial least squares (PLS)回归Matlab中的偏最小二乘法(PLS)回归模型,离群点检测和变量选择偏最小二乘回归(PLSR)和主成分回归(PCR)

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    Matlab中的偏最小二乘法(PLS)回归模型,离群点检测和变量选择|附代码数据

    ----点击标题查阅相关内容R语言中的偏最小二乘回归PLS-DA左右滑动查看更多01020304蒙特卡洛交叉验证(MCCV)的PLS说明如何对PLS建模进行MCCV。...----本文摘选 《 Matlab中的偏最小二乘法(PLS)回归模型,离群点检测和变量选择 》 ,点击“阅读原文”获取全文完整资料。...----点击标题查阅往期内容R语言实现偏最小二乘回归法 partial least squares (PLS)回归R语言中的block Gibbs吉布斯采样贝叶斯多元线性回归R语言Lasso回归模型变量选择和糖尿病发展预测模型...R语言实现LASSO回归分析Python用PyMC3实现贝叶斯线性回归模型使用R语言进行多项式回归、非线性回归模型曲线拟合R语言中的偏最小二乘回归PLS-DAR语言生态学建模:增强回归树(BRT)预测短鳍鳗生存分布和影响因素...R语言实现偏最小二乘回归法 partial least squares (PLS)回归Matlab中的偏最小二乘法(PLS)回归模型,离群点检测和变量选择偏最小二乘回归(PLSR)和主成分回归(PCR)

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