今天跟大家分享的是ggplot图表中的一类重要元素——线条。...R语言中ggplot函数系统中涉及到线条的地方有很多，最常见的场景就是我们做geom_line()（折线图）、geom_path（）(路径图),以及图表的绘图区（panel）、图表区、网格系统（grid...今天以一个折线图为例，简要说明ggplot函数中关于线条的主要参数及其效果。...接下来通过对线条内部参数的修改，我们可以体会到ggplot对于线条细节的把控是多么的专注： ggplot(newdata,aes(Company,Sale,group=Year,colour=Year)...以上依次使用的线条粗度值为1,2,3,4,5,6，大家可以通过图表感受到ggplot图表中线条的粗度变化规律。
❝本节来介绍如何使用「geom_ribbon」给线条来添加置信区间并使用代码将其导出到PPT中，下面通过一个小例子来进行展示 ❞ 安装并加载R包 devtools::install_github("davidgohel...tidyverse) library(officer) library(flextable) library(lubridate) 数据可视化 plot % ggplot
有经验的前辈，R里的脚本都是step0、step1、step2，一清二楚，相关内容都集中在Rproject里；
绘制 CGContextDrawPath(ctx, kCGPathFillStroke); CGPathRelease(path); } 垂直和居中绘制文字
只是一个很有趣的线条文字 教程开始 首先进入这个网站https://tools.yum6.cn/line_text/ 生成一个线条字(仅支持字母和数字哦); 如果我们加到源代码里可以直接如下放到
QQ图和ECDF sunqi 2020/8/3 QQ图 用来描述数据正态性的问题，配合正态性检验进行分析 主要的函数和参数 stat_qq() color, shape and size：和之前一样 代码...rm(list = ls()) # 导入需要的包 library(ggplot2) # 用于绘图拼接 library(patchwork) # 用于数据处理分析 library(tidyverse)...# 设置ggplot的主题 theme_set(theme_minimal() + theme(legend.position = "top")) #自定义数据get函数 get_data...结束语 此次为ggplot2系列的最后一次内容，基本的图形已经介绍完毕，总体来说，ggplot语法结构大同小异，用的时候查函数就行。...其实ggplot还可以实现很多绘图的功能，暂时就更新到这里，其他绘图后面有时间再更新，希望能够完善。 love&peace
当然，可以设置条形和散点的样式，如颜色形状等。也可以单独选中某条柱状图和散点标志的样式，以突出某个或某些值。...width=0.05) # 设置线条宽度 plt.scatter(values.index, values.values, color=colors2,...plt.style.use('ggplot') # plt.style.use('dark_background') # 设置黑色背景 plt.rcParams['figure.figsize'] =...，如'r-'，代表红色的实线。...如果想要设置其他颜色，可以利用plt.setp来设置线条样式。
密度图和直方图 sunqi 2020/8/3 Density Plot Density Plot：也称作核密度图 函数和参数 geom_density() color, size, linetype:...颜色、大小和线的类型 fill：填充 alpha：透明度 绘图 # 需要的包 library(ggplot2) theme_set( theme_classic() + theme(legend.position...me为性别分组的均值 me % group_by(sex) %>% summarise(grp.mean = mean(weight)) # 基础绘图单元 p <- ggplot...aes(color = sex)) + # 这个函数很熟悉吧 scale_color_manual(values = c("#868686FF", "#EFC000FF")) # 更改线的颜色和填充颜色和垂直线...=ls()) # 需要的包 library(ggplot2) theme_set( theme_classic() + theme(legend.position = "top") )
ggplot2 中有种类繁多的以 scale 开头的标度函数，可用于控制图形的颜色、点的大小和形状等。例如，我们可以用下面的标度函数手动设置需要的颜色，结果如下图所示。...以上介绍了 ggplot2 包中的映射（mapping）、图形元素（geom）、标度（scale）、分面（facet）和主题（theme）等概念，并展示了它们的基本用法。...我们还可以将直方图和密度曲线同时展示，如下图所示。...如果要把图片用于出版物中，我们可以对图片的尺寸和分辨率等进行设置。...函数 scatterplot3d( ) 提供的参数选项包括设置图形符号、突出显示、角度、颜色、线条、坐标轴和网格线等。下面以 datasets 包里的数据集 trees 为例说明此函数的用法。
ggthemr包提供了一种快速简便的方法来完全更改ggplot2图形的外观，并根据自己的调色板快速创建主题。...这是因为初始化主题的时候，该主题就已经替换到了ggplot使用的默认标度和主题方案，极大提升作图效率。...#install devtools :: install_github（'cttobin / ggthemr' ） 如使用ggplot画三种不同的图。...# Define a set of figures to play with using the Iris dataset point_plot <- ggplot(iris, aes(x=jitter...box_plot <- ggplot(iris, aes(x=Species, y=Sepal.Width, fill=Species)) + geom_boxplot() + labs(x="
这里主要包括单一表格绘制和可视化+表格 两个方面。...虽然表格制作可能Excel更擅长，但考虑到连贯性等问题，这里这里还是觉得有必要介绍一下，具体内容如下： R-单一表格绘制 R-可视化+表格的”混搭“ R-单一表格绘制 这一部分可能有很多优秀的第三方包可以制作...这里主要介绍R-ggpubr包和R-ggpmisc包。...内容如下： ggpubr R-ggpubr包之前的推文(统计绘图 | 一行代码教你绘制顶级期刊要求配图)也介绍其绘制科研图表的方便些，这次的推文则重点介绍其绘制表格的函数，当然还是可以和ggplot2图表对象一起展示的...Of ggpmisc::stat_fit_tb() 更多其他案例大家可参考：R-ggpmisc表格绘制[5] 总结 这篇推文小编几乎汇总了R中所有关于表格(table)制作的所有方法，包括单独绘制以及和ggplot2
R|生存分析 - KM曲线 ，必须拥有姓名和颜值 ? R|生存分析-结果整理 ：一键式输出所有变量的COX结果； R|timeROC-分析 ：时间依赖的生存分析； ?...maftools|TCGA肿瘤突变数据的汇总，分析和可视化 ? maftools | 从头开始绘制发表级oncoplot（瀑布图） ?...TCGA + GEO TCGA|根据somatic mutation绘制突变景观图（oncoplot）和基因词 TCGA数据挖掘 | Xena - TCGA数据下载 TCGA | 以项目方式管理代码数据...base + ggplot2 R|绘图边距及布局 ? R-基本绘图参数（Ⅰ） ? ggplot2|详解八大基本绘图要素 ? ggplot2|theme主题设置，详解绘图优化-“精雕细琢” ?...ggplot2|从0开始绘制直方图 ? ggplot2|从0开始绘制折线图 ? ggplot2|从0开始绘制箱线图 ? 绘图系列|R-corrplot相关图 ?
abline()、hline()与vline() 在R的基础绘图系统中我们可以在已绘制的图床上通过abline来添加线条，在ggplot2中当然也有类似的方法： geom_abline()： ...我们主要使用两个参数控制线条的位置，slope控制斜率，intercept控制截距，下面是一个简单的例子，我们在散点图层上叠加截距为20，斜率为2的直线： library(ggplot2) p <-...()： 如果你想添加的直线垂直于x轴，则可以使用geom_vline()来快捷地添加垂直线条，xintercept传入的参数即为线条在x轴上的位置，若传入向量则可同时添加多条线条： library...，我们先从一维的说起： geom_density()： 和R基本绘图系统中的密度曲线绘制方法很接近： library(ggplot2) data <- data.frame(matrix(rnorm...') v geom_density2d()： 和density()类似，只是我们可以通过density2d来绘制二维变量的概率密度分布： v <- ggplot(data, aes(X1, X2)
版本为3.6.3 conda deactivate # 退出当前环境 conda remove --name r --all #移除r环境 03 Step3.安装R包 Conda安装R包有两种方式（以ggplot2...为例）： 第一种方式是使用conda命令安装： source activate r conda install -c r-ggplot2 #R包通常需要以r-开头，以ggplot2为例。...requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("ggplot2...") #用install.packages命令： install.packages(ggplot2) 小编总结 非Root权限下，在Anaconda环境中安装R和R包，你学会了吗？
ggplot(diamonds,aes(x=price))+geom_density() ?...里面的线条颜色是通过colour参数进行控制（一定要记好colour与fill两个颜色填充参数的区别，colour控制线条、点颜色、fill控制区域颜色，所以在散点图、曲线、折线图途中使用colour参数...上面说过colour控制点、线条颜色、fill控制区域颜色，但是密度曲线算是一个另类，仔细看上图你会发现，它不同于折线图，因为每条密度曲线都是一个闭合曲线，所以他是允许使用fill参数填充闭合区域的：...你会发现这样出来的图形除了密度曲线内部除了被填充颜色之外，整体形状与使用colour参数填充线条颜色是一样的。...因为套用的配色模板中颜色数量上限是6个，而我们的分类变量类别有8个，所以最后两个类别的线条色、填充色改成了默认。
交流群有一个昵称是“今西”的小伙伴说他做了一个常规的转录组分析，实验和对照两个组，各三个样本。...control两个分组需要看表达量差异，而且case 和 control两个分组内部都是10个病人。...的aes和aes_string的差异： # 成功的绘图 ggplot(gencounts, aes_string (x='condition', y= colnames(gencounts)[i]))...✦ 标度（Scales）是将数据的取值映射到图形空间，例如用颜色、大小或形状来表示不同的取值，展现标度的常见做法是绘制图例和坐标轴。...✦ 主题（theme）控制细节显示，例如字体大小和图形的背景色。
ggpmisc和gginnards两个包包含了ggplot2很多扩展的功能。 介绍其中几个实用函数。...install.packages("ggpmisc") library(gginnards) library(ggpmisc) stat_poly_eq 可以直接获得曲线拟合的方程，p值，决定系数(R^2)， AIC和BIC...等指标，不需要自己计算和标注了。...sqrt(x)) # give a name to a formula formula <- y ~ poly(x, 3, raw = TRUE) # user specified label ggplot...花式加标签 ##例子 my.cars <- mtcars[c(TRUE, FALSE, FALSE, FALSE), ] my.cars$name <- rownames(my.cars) p <- ggplot
color: "#457FFB" } } } } ] （1）设置折线线条颜色
数字 showLimits 是否显示图表限值(y轴最大、最小值)，默觉得1(True) showColumnShadow 是否显示各条形图间的阴影（若柱面图在一起并列的话...鼠标放到柱面上时显示的提示信息的分隔符 showhovercap=’1′ 鼠标放到柱面上时是否显示提示信息 hoverCapBgColor=‘ffffff’提示信息背景颜色 图表和画布的样式...numDivLines 画布内部水平分区线条数，数字 divLineColor 水平分区线颜色，6位16进制颜色值 divLineThickness...numVDivLines 画布内部垂直分区线条数，数字 vDivLineColor 垂直分区线颜色，6位16进制颜色值 vDivLineThickness... XML数据节点和经常使用属性
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