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基础知识 | R语言绘图基础之柱形图

R语言绘图基础之简单柱形图 在视觉性吸引方面,人类绝对是动物界的另类。当一张一张数据分析的统计表摆在眼前时，人们并不能快速的洞察其中的关系。...通常来说，用ggplot2绘图时，默认X轴类别按照字母顺序排列，比如图1 X轴顺序，按照城市首字母进行排序。...这主要是因为ggplot2是根据因子向量的水平按顺序展示的，而不是根据X轴的因子向量顺序排列，因子向量叫做factor，水平向量为level。...⚠️要实现X轴变量的降序，需要改变因子向量的水平顺序，一定要对表格或者因子向量排序后，再改变其水平顺序，才能使得X轴的类别顺序能够匹配Y轴变量的降序呈现。...如果仅仅通过一条语句是无法到达效果的： mydata1<-dplyr::arrange(mydata1,desc(TRUE)） #必须进行如下操作才能实现： order<-sort(mydata1

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    origin2018多因子组柱状图_对比柱状图怎么做

    大家好，又见面了，我是你们的朋友全栈君。 本期目标： 接下来，正文开始： 1，如图1，数据包含两个分组列（X轴），A列表示小分组，B列表示大分组，C/D/E三列表示三个因子列，作为Y轴。...图1 数据输入格式 2，按照上图方式输入数据后，选中数据后，点击菜单栏——绘图——类别——多因子组柱状图-索引数据进行图形绘制，图2。...a: 按照三个因子对柱状图进行颜色设置； b: 图例更新为三个因子； a: 在任意柱子上双击调出绘图属性界面（图5），可知此时为从属模式，将其更改为独立模式后，即可依次单击左侧Layer1下的三个因素...图5 绘图属性界面 图6 分组（多因子）柱子的颜色修改 b: 按上述方式分别对“condition1/condition2/condition3”修改颜色之后，点击确定，得到图7。...注：也可以通过更新图例的方式，其中，图例的自动译码模式那一栏选择多因子组名称在的那一行即可，此处为“长名称”，参见图1。

    3.8K21

    精心整理（含图PLUS版）|R语言生信分析，可视化

    fastqcr QC数据处理 ：测序结果的数据质控及图标展示； Bioinfo|bedtools-操作VCF文件 VCF文件的常见合并，过滤等操作； R|生存分析（1） ：生存分析介绍以及R实现，KM绘图...ggrisk|高效绘制风险因子联动图 ? ggalluvial|炫酷桑基图（Sankey），你也可以秀 ? R|散点图+边际图（柱形图，小提琴图），颜值区UP ?...base + ggplot2 R|绘图边距及布局 ? R-基本绘图参数（Ⅰ） ? ggplot2|详解八大基本绘图要素 ? ggplot2|theme主题设置，详解绘图优化-“精雕细琢” ?...绘图系列|R-corrplot相关图 ? 绘图系列|R-wordcloud2包绘制词云 ? 绘图系列|R-VennDiagram包绘制韦恩图 ? ggplot2|发散性“正负”图 ?...ggstatsplot绘图|统计+可视化，学术科研神器 ? 2-14 |“特殊”的日子，多学一种表达爱的方式 ?

    3.6K41

    origin带误差线的柱状图_怎么加误差棒

    大家好，又见面了，我是你们的朋友全栈君。...A列表示X轴分组，B/D/F/H列表示Y轴数据，C/E/G/I列表示误差数据（此处为标准差）。 注：此处数据设置为关键，需要按照正确，后面才可以绘制带有误差棒的分组柱状图。...图1 数据设置 2，按照上图方式输入数据后，选中数据后，点击菜单栏——绘图——类别——多因子组柱状图-索引数据进行图形绘制，如图2。...a: 按照四个因子对柱状图进行颜色设置； b: 图例更新为四个因子； a: 在任意柱子上双击调出绘图属性界面（图5），可知此时为从属模式，将其更改为独立模式后，即可依次单击左侧Layer1下的四个因素...图5 绘图属性界面 图6 修改分组柱子的颜色 b: 按上述方式分别对“factor1/factor2/factor3/factor4”修改颜色之后，点击确定，得到图7。

    6.4K11

    红外光谱的理论计算

    三、频率校正因子 由于计算方法本身的误差以及谐振近似的使用，使得理论计算的红外频率一般无法与实验结果（基频）对上。例如Hartree-Fock方法由于没有电子相关效应，通常会高估10%~12%。...在文献中，针对不同的计算水平，前人已经总结了大量的校正因子，需要注意的是不同方法和不同基组的校正因子都不同，即使同样的方法基组，在不同的文献中由于拟合的数据和方式的不同，校正因子也可能不同。...实验化学家绘制的红外光谱通常纵坐标是透射率，横坐标是从大到小的频率，因此我们一般将图的X和Y轴都颠倒一下，就符合我们常见的红外谱图的样子了。...也可以不使用GaussView绘图，而是从输出文件中获取频率和相应的红外强度进行绘图。...自己根据数据绘制谱图时需要注意的是理论计算得到的谱图是孤立的线，作图时需要使用展宽技术，这方面的原理和操作，我们以后介绍。

    6K10

    【基础】R语言2：数据结构

    =10) # 输出个数为10 ##rep函数：重复数列 rep(a,b) #重复b次a标量与其他编程语言类似R语言是向量化编程a=2向量索引正负整数索引length(x) #向量中有多少个元素x[1]...1.赋值函数matrix（元素数量必须符合分配规则）matrix(1:20,4,5)matrix(1:20,4,byrow=T) #按行分布matrix(1:20,4,byrow=F) #按列分布...2.dim函数dim(x)=c(4,5)# 绘图heatmap.()# 定义矩阵行、列的名字rownames=c("R1","R2","R3")cnamesdimnames(m)=list(rownames...$名称访问3.attach()4.with()单双括号的区别因子factor——用于统计分析因子用factor()函数把字符型向量转换成因子x 因子水平是有次序的(按编码次序)cut()函数连续取值的变量，可以用cut()函数将其分段， 转换成因子使用breaks()参数指定分点， 最小分点要小于数据的最小值

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    天意R笔记|新手必须掌握的R语言基础

    ，byrow参数决定数据是按行还是按列填充，dimnames参数则用于为矩阵添加行名和列名。...例如，可以创建一个包含多个矩阵的三维数组，数组中的所有元素类型必须相同。数组是对向量和矩阵的扩展，适用于处理更复杂的数据。 （四）因子 因子是一种专门用于表示分类或有序类别数据的R数据类型。...可以使用 factor() 函数创建因子，并且可以自定义类别的顺序和标签。...例如， mean() 函数是R中的一个内置函数，用于计算向量或数组的平均值；用户还可以定义自己的函数，如 myFunction(x, y) x + y} 用于实现两数相加。...四、基本函数应用示例 1.创建向量：使用c()函数可以在R中创建一维向量。例如， x <- c(10.4, 5.6, 3.1, 6.4, 21.7) 将一系列数值组合成名为x的浮点数向量。

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    day4 呦呦鹿鸣——R for data science阅读笔记之ggplot（）

    分类变量#绘制条形图检测某一分类变量分布ggplot(penguins, aes(x = species)) + geom_bar()#根据条形的频率依据处理因子函数对条形重新排序 ggplot...(penguins, aes(x = fct_infreq(species))) + geom_bar()处理因子函数fct_inorder()：按它们首次出现的顺序排列。...fct_infreq() ：按每个级别的观测值数（最大在前）fct_inseq()：按级别的数值。数值变量数值变量可以是连续的，也可以是离散的。...= island, fill = species)) + geom_bar()第二个图是通过在几何中设置 position = "fill" 创建的相对频率图，对于比较岛屿之间的物种分布更有用，因为它不受岛屿上企鹅数量不相等的影响...)平滑曲线geom_smooth()三个或更多变量用不同的颜色和形状代表不同观测值将绘图拆分为不同的子图 按单个变量对绘图进行分面facet_wrap() 参数1：公式?

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    基因日签【20211029】r-蛋白合成的自体控制（内含第26章操纵子小结）

    2021 10/29基因日签 r-蛋白合成的自体控制 .壹. 关键概念 r蛋白操纵子的翻译是由此操纵子的表达产物来控制的，该产物可与多顺反子mRNA上某个位点结合。...操纵子 小结 转录调控是通过反式作用因子和顺式作用位点之间的相互作用来进行的。反式作用因子是调节基因的产物，通常为蛋白质，也有可能是RNA。它可以在细胞内扩散，因此可以作用于任何合适的靶基因。...一些启动子不能被RNA聚合酶识别，或只能被弱识别，除非存在特异的激活因子（正调节物）才能识别。这些激活因子同样也会受到其他一些小分子的调控。...色氨酸代谢途径是通过负阻遏来控制的，辅阻遏物色氨酸是这条途径的产物，它可激活阻遏物，这样它能与操纵基因结合，从而阻止色氨酸合成所需酶的基因表达。trp操纵子也由弱化作用所调控。...mRNA具有吸引核糖体的能力，且大量专一性tRNA能识别不同的密码子，这样也可在翻译水平调控基因的表达。 文字及图片信息均来源于Genes X（中文版），如有侵权请联系删除。 THE END

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    Origin | 堆叠柱状图 | 多列（分组）堆积柱状图

    Origin | 多组堆积柱状图 一、前言 1.1 多组柱状图 1.2 多因子组柱状图 1.3 多因子组箱式图 二、 数据准备及绘图 三、 图形参数修改及设置 3.1 坐标轴及字体调整...二、 数据准备及绘图 如图1所示，输入数据并进行分组。...目标是将同一组（name1-name5）下的数据（group1, group2）绘制成堆叠柱状图，并将不同组的数据放置在一个柱状图中进行比较。...图1 分组堆叠柱状图的数据准备 如图2所示，选中数据后，按照“绘图——基础2D图——堆积柱状图”的顺序进行绘图，结果如图3所示。...图4 堆积数据设置 如图5，选择第一组数据，并在“分组”下勾选“按列标签”，选择应用并确定，结果如图6所示。

    19.9K20

    数据视化的三大绘图系统概述：base、lattice和ggplot2

    数据可视化是数据分析过程中探索性分析的一部分内容，可以直观展示数据集数据所具有的的特征和关联关系等。...主要变量即为图形的两个坐标轴，其中y在纵轴上，x在横轴上。变形：单变量绘图，用 ~ x 即可；三维绘图，用z ~ x*y；多变量绘图，使用数据框代替y ~ x即可。...1.条件变量的用法~ x | A表示因子A各个水平下数值型变量x的分布情况；y ~ x | A * B表示因子A和B各个水平组合下数值型变量x和y之间的关系。...(v=mean(x),h=mean(y), lty=2) # 加线，v是水平线，h是竖直线，线类型为2, panel.lmline(x,y,col="red") # 加线性回归线，...1.5 页面布局 lattice无法使用par()函数，因此需要将图形存储到对象中，然后利用plot()函数中的split = 或position = 选项来进行控制 split的方法，将第一幅图放置到第二幅图的上面

    4.4K30

    R语言函数的含义与用法，实现过程解读

    单独输入x则会将值打印出来。也可以打印倒数： > 1/x > y x, 0, x)   也可以将向量作为元素。 2.2 向量运算     操作是按照向量中的元素一个一个进行的。...如果var()的参数是一个n*p的矩阵，那么函数的值是一个p*p的样本协方差矩阵，认为每行是一个p变量的样本向量。 sort(x)返回一个与x具有相同长度的向量，其中的元素按招升序排列。...通俗点说，因子就是将对象的值分成不同的组（levels）。 用函数factor()创建一个因子，levels按序排列(字母序或数值序)。...这个值是所需文本字符（包括绘图字符）的大小，与默认文本大小相关。 B  坐标轴和标记 很多R的高级图形都有坐标轴，你可以使用低级图形函数axis()自己创建坐标轴。...第一个值是行数，第二个值是列数。这两个参数唯一的区别是mfcol把图按列排入，mfrow把图按行排入。上图所示的版式可用mfrow=c(3,2)创建；上图显示的是绘制四幅图后的情况。

    4.7K120

    R语言函数的含义与用法，实现过程解读

    单独输入x则会将值打印出来。也可以打印倒数： > 1/x > y x, 0, x)   也可以将向量作为元素。 2.2 向量运算     操作是按照向量中的元素一个一个进行的。...如果var()的参数是一个n*p的矩阵，那么函数的值是一个p*p的样本协方差矩阵，认为每行是一个p变量的样本向量。 sort(x)返回一个与x具有相同长度的向量，其中的元素按招升序排列。...通俗点说，因子就是将对象的值分成不同的组（levels）。 用函数factor()创建一个因子，levels按序排列(字母序或数值序)。...这个值是所需文本字符（包括绘图字符）的大小，与默认文本大小相关。 B  坐标轴和标记 很多R的高级图形都有坐标轴，你可以使用低级图形函数axis()自己创建坐标轴。...第一个值是行数，第二个值是列数。这两个参数唯一的区别是mfcol把图按列排入，mfrow把图按行排入。上图所示的版式可用mfrow=c(3,2)创建；上图显示的是绘制四幅图后的情况。

    5.7K30

    R语言广义相加（加性）模型（GAMs）与光滑函数可视化

    你可能没有直接使用check()——会输出其他诊断结果，也会产生四个模型诊断图。...---- 点击标题查阅往期内容 01 02 03 04 使用plot函数在绘图设备上绘制多个面板，并将各个绘图排成一行。...plot(mod) 二维光滑_函数_的默认绘制方式是使用plot()。 和因子光滑_函数_交互项，相当于光滑曲线的随机斜率和截距，被画在一个面板上，颜色被用来区分不同的随机光滑_函数_。...) + f2(x2) fac <- factor(fac) y <- f + rnorm(n) * 2 plot(mod) 含有因子-光滑_函数_交互项的更复杂的GAM的结果，bs = 'fs'。...可以处理mgcv可以估计的大多数光滑_函数_，包括带有因子和连续副变量的按变量光滑_函数_、随机效应光滑_函数_（bs = 're'）、二维张量积光滑_函数_，以及带有参数项的模型。

    1K30

    R语言混合效应逻辑回归（mixed effects logistic）模型分析肺癌数据|附代码数据

    对于连续的预测因子，我们使用小提琴图。所有的原始数据都按癌症阶段分开显示。...在一个逻辑模型中，结果通常是对数几率（也叫对数），这是线性化指数化的对数几率，不在线性尺度上概率对于表格来说，人们经常呈现的是几率比。对于可视化来说，对数或概率比例是最常见的。...我们通过获取 并将感兴趣的特定预测因子，比如说在j列，设置为常数来创建 。如果我们只关心预测器的一个值，那就是。...例如，假设我们的预测模型的范围是5到10，我们想要6个样本，，所以每个样本将与前一个样本相隔1，它们将是. 然后我们创建不同的k个不同的Xi，其中，在每种情况下，第j列被设置为某个常数。...ggplot(  aes(Probs)) + geom_histogram() +即使使用平方根尺度，将较低的数值拉长，它仍然是极其偏斜的。据估计，绝大多数人的病情缓解的概率不到0.1。

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