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数据处理|数据查重怎么办?去重,就这么办!

数据清洗过程中的典型问题:数据分析|R-缺失值处理、数据分析|R-异常值处理和重复值处理,本次简单介绍一些R处理重复值的用法: 将符合目标的重复行全部删掉; 存在重复的行,根据需求保留一行 数据准备 使用...保留其最大值如下即可: data3 <- aggregate( . ~ ID_REF,data=data, max) 2 dplyr函数 A : ID_REF重复行,保留其均值,同aggregate函数结果一致...library(dplyr) data4 % group_by(ID_REF) %>% summarise_all(mean) ?...arrange(desc(rowMean)) %>% # 选择第一个,即为表达量最大值 distinct(ID_REF,.keep_all = T) %>% #去除rowMean这一列 select...(-rowMean) %>% # 将ID_REF列变成行名 column_to_rownames(var = "ID_REF") ?

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    生信学习小组Day 6-学习R包(L)

    2.dplyr五个基础函数1.mutate()新增列输入代码mutate(test,new = Sepal.Length * Sepal.Width)2.select(),按列筛选输入代码vars select(test, one_of(vars))3.filter()筛选行输入代码filter(test, Species ==..."setosa")4.arrange(),按某1列或某几列对整个表格进行排序图片5.summarise():汇总对数据进行汇总操作,结合group_by使用实用性强图片3.dplyr两个实用技能1.管道操作...%>% (cmd/ctr + shift + M)将左边的运算结果,以输入的方式传递给右边的函数2:count统计某列的unique值4.dplyr处理关系数据1.内连inner_join取交集2.左连...left_join左边的数据全部保留3.全连full_join4.半连接semi_join返回能够与第二个表匹配的第一个表所有记录5.反连接anti_join返回无法与第二个表匹配的第一个表所有记录6.

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    R语言︱数据集分组、筛选(plit – apply – combine模式、dplyr、data.table)

    R语言︱数据集分组 大型数据集通常是高度结构化的,结构使得我们可以按不同的方式分组,有时候我们需要关注单个组的数据片断,有时需要聚合不同组内的信息,并相互比较。...## #dplyr中基本函数 select——子集选取(筛选变量,列) select(Hdma_dat,pclass,survived) ##选择pclass变量 ?...,它的输入参数和计算结果都是数据框,用法相对简单。...##对于数据框 x是对象,subset是保留元素或者行列的逻辑表达式,对于缺失值用NA代替。 Select 是选取的范围,应小于x。...data.table比较简洁一步搞定,dplyr花了两步,不过也dplyr也可以通过%>%来实现一步搞定。%>%的功能是用于实现将一个函数的输出传递给下一个函数的第一个参数。

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    Day6——R包

    vars select(test, one_of(vars))#选择字符向量中的列,select中不能直接使用字符向量筛选,需要使用...one_of函数R语言中使用vars参数指定数据框中需要分析的字段索引范围在R语言中,我们经常需要对数据框进行分析和处理。...这时,我们可以使用vars参数来指定需要分析的字段索引范围,从而提取出感兴趣的字段进行后续操作。vars参数是dply包中select函数的一个参数,它允许我们通过指定字段的索引范围来选择需要的字段。...setosa","versicolor的行#%in%判断前面一个向量内的元素是否在后面一个向量中,返回布尔值。...dplyr两个实用技能管道操作 %>%加载任意一个tidyverse包即可用管道符号#%>% (向右操作符,forward-pipe operator),就是把左侧准备的数据或表达式,传递给右侧的函数调用或表达式进行运行

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    服务器架设笔记——多模块和全局数据

    我们还是通过动态加载配置文件的形式,将这段配置加载进来比较靠谱。         那么我就想,我需要设计一个模块,用于预处理以上的需求——将数据加载到内存中。我给这个模块取名为prepare。...,便将prepare的执行于其他handler之前。..., select_page_key, select_page_conf_path); prepare_map_from_db(r->server->process->pool, "LocationTable..."StageTable", "stage"); return DECLINED; }         这段代码,需要注意的有四个部分: 将request_rec指针r保存到r->pool的内存池中...调用apr_dbd_select最后一个参数传1,可能会导致进程意外退出。 调用apr_dbd_select最后一个参数传0,计算结果个数的apr_dbd_num_tuples函数将错误。

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    学好R语言绘图,你只需这样一个网站就够了

    网站提供搜索功能,可以搜索需要的图形类型,例如heatmap ? 3. 每一个图形都给出了代码 ? 4. 将代码复制到Rstudio中逐条运行 ? 2....最基本的气泡图 geom_point() data % filter(year=="2007") %>% dplyr::select(-year) # Most basic...用 scale_size() 我们需要在上一张图表上改进的第一件事是气泡大小。scale_size()允许使用range参数设置最小和最大圆圈的大小。请注意,您可以使用来定制图例名称name。...data % filter(year=="2007") %>% dplyr::select(-year) # Most basic bubble plot data %>...变得漂亮 一些经典的改进: 使用viridis包装获得漂亮的调色板 使用的theme_ipsum()所述的hrbrthemes包 定制轴职称xlab和ylab 将笔划添加到圆圈:更改shape

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    生信学习小组day6--大姚

    * Sepal.Width) 上述一串代码意思是新增一列列名为“new”、数值是Sepal.Length * Sepal.Width的列 2.select(),按列筛选 select(test,1)...##筛出第一列 select(test,c(1,5)) ##同时筛出第一和第五列 select(test,Sepal.Length)## 筛出以列名为Sepal.Length的一列 select(test...") select(test, one_of(vars)) ##筛出以vars中的一系列字符串命名的列 3.filter()筛选行 filter(test, Species == "setosa") #...),mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length)) 三、dplyr两个实用技能 1:管道操作 %>% 可以直接把数据传递给下一个函数调用或表达式 快捷键(cmd/ctr +...中的数据直接传递给group_by函数使用,也可以将分组后的species数据传递给summarise函数使用 test %>% group_by(Species) %>% summarise

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    MySQL Prepare后语句查询性能降低 源码bug排查分析

    源自于业务上遇到的一个先将某个语句Prepare再Execute查询效率很低的问题,而将查询中的参数直接嵌入到SQL语句内并以文本形式执行,则执行反而变得很快。...两者主要的差别是传参方式的不同(返回包格式也不同,这里不展开)。 Text Protocol 是直接将语句中的参数嵌入到 SQL 语句中,以文本的形式整个语句直接传递到数据库。...,然后再执行 COM_STMT_EXECUTE,将实际的参数传入,替换掉占位符 ? 并执行。...所以其检查的第一个条件 r->const_item()(参数是否在整个表达式构造的时候就是 constant 的,无论执行状态)实际上是 overkill。...Execute 的时候这个占位符的值是不是永远和之前每一次 Execute 的时候相同(即r->const_item()为 true),而只需要知道【同一次 Execute 过程内】该占位符 item

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    自学攻略 | R语言数据筛选和修改

    在这里,我只介绍常用的,掌握这些函数就可以熟练读取不同文件了。 read.table(): 这是一个通用的文本文件读取函数,你可以通过 sep 参数指定分隔符(如空格、制表符或逗号)。...dplyr 的核心理念是使用一系列“动词”来描述数据操作,如 filter()(筛选)、select()(选择)、arrange()(排序)、mutate()(新增/修改列)和 summarise()(...管道符可以将前一个函数的输出作为后一个函数的第一个参数,大大提高了代码的可读性,让数据处理流程更加流畅。上面的代码可以理解为“将 patient_data 传递给 replace_na() 函数”。...我们重点讲解了 dplyr 包的强大功能,并通过实际示例演示了 filter()、arrange()、select()、mutate() 和 rename() 等函数的用法。...本系列有关R和Rstudio的文章已经更新了四篇,大家可以尝试处理一下手头的数据,R语言的快速掌握离不开动手实践!下一篇我们将学习R语言函数与参数的介绍。

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    survivalAnalysis——生存分析和相关图的高级接口

    , sex, age, obstruct, perfor, nodes, differ, extent)) %>% forest_plot() #%>%:dplyr包中的管道传参 data=survival...age", "obstruct", "perfor", "nodes", "differ", "extent")) forest_plot(aa1, use_one_hot = F,#如果为TRUE,将接受来自..."breakByYear", nrow = 1,# ncol = NULL,行列数目 legend.title=c("sex","node4","adhere"),#图例,其他ggsurvplot支持的所有参数都可以传递给...forest_plot()用于做图 forest_plot(am) %>%是dplyr包的管道函数,能够将上一步的结果传递给下一步的函数作为参数,具体用法就是 x %>% f(y)—> f(x, y)...上周我们介绍过survminer包,主要功能函数ggsurvplot()中的参数时可以在survivalAnalysis包中kaplan_meier_plot(),kaplan_meier_grid()

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    R︱高效数据操作——data.table包(实战心得、dplyr对比、key灵活用法、数据合并)

    (ID)] 三种数据筛选的方式,dplyr包、base基础包、data.table包。其中,dplyr是select语句,data.table中要注意.()的表达方式。...2、按条件行筛选 从前用subset的方式进行筛选比较多, new=14,select=a:f) (1)单变量 现在data.table与dplyr from_dplyr =...="Hospice"] (3)还有一些复杂结构: dt[a=='B' & c2>3, b:=100] #其他结构 在dt数据集中,筛选a变量等于"B",c2变量大于3,同时将添加b变量,数值等于...%>%的功能是用于实现将一个函数的输出传递给下一个函数的第一个参数。注意这里的,传递给下一个函数的第一个参数,然后就不用写第一个参数了。在dplyr分组求和的过程中,还是挺有用的。...—————————————————————————————————————————————— 六、额外的参数(来源:R语言data.table速查手册) 1、mult参数 mult参数是用来控制i匹配到的哪一行的返回结果默认情况下会返回该分组的所有元素

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    真的!森林图(Forest Plot)全部绘制技巧都在这了~~

    今天这篇推文,小编就带大家了解一下森林图(Forest Plot) 的绘制方法,主要内容如下: 森林图(Forest Plot)的简单介绍 R-森林图(Forest Plot)绘制方法 Python-森林图...森林图(可以将观察到的效果、置信区间以及每个研究对象的权重等信息全部表示出来,是一种简单直观地展示单一研究和汇总研究的可视化图表。...R-森林图(Forest Plot)绘制方法 使用R绘制森林图(Forest Plot)的方法比较多,这里重点介绍R-forestplot包和R-ggforestplot包绘制。...R-forestplot包绘制 这一部分我们直接使用提供的数据进行绘制,重点在于展示forestplot包中一些绘图参数的设置。...使用的方法也较为简单,希望可以给小伙伴们带来绘图便利,当然,更多绘图函数和参数,还需自行探索哈~~ 参考资料 [1] forestplot包介绍: https://cran.r-project.org/

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    超简单的绘制技巧都在这了

    今天这篇推文,小编就带大家了解一下森林图(Forest Plot) 的绘制方法,主要内容如下: 森林图(Forest Plot)的简单介绍 R-森林图(Forest Plot)绘制方法 Python...森林图(可以将观察到的效果、置信区间以及每个研究对象的权重等信息全部表示出来,是一种简单直观地展示单一研究和汇总研究的可视化图表。...R-森林图(Forest Plot)绘制方法 使用R绘制森林图(Forest Plot)的方法比较多,这里重点介绍R-forestplot包和R-ggforestplot包绘制。...R-forestplot包绘制 这一部分我们直接使用提供的数据进行绘制,重点在于展示forestplot包中一些绘图参数的设置。...使用的方法也较为简单,希望可以给小伙伴们带来绘图便利,当然,更多绘图函数和参数,还需自行探索哈~~ 参考资料 [1] forestplot包介绍: https://cran.r-project.org/

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    真的!森林图(Forest Plot)全部绘制技巧都在这了

    今天这篇推文,小编就带大家了解一下森林图(Forest Plot) 的绘制方法,主要内容如下: 森林图(Forest Plot)的简单介绍 R-森林图(Forest Plot)绘制方法 Python-...森林图(可以将观察到的效果、置信区间以及每个研究对象的权重等信息全部表示出来,是一种简单直观地展示单一研究和汇总研究的可视化图表。下面,小编再附上森林图各个绘图元素间关系的解释图: ?...R-森林图(Forest Plot)绘制方法 使用R绘制森林图(Forest Plot)的方法比较多,这里重点介绍R-forestplot包和R-ggforestplot包绘制。...R-forestplot包绘制 这一部分我们直接使用提供的数据进行绘制,重点在于展示forestplot包中一些绘图参数的设置。...使用的方法也较为简单,希望可以给小伙伴们带来绘图便利,当然,更多绘图函数和参数,还需自行探索哈~~ 再小的技能,也应该被认真对待。

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    森林图(Forest Plot)绘制技巧大汇总!!

    今天这篇推文,小编就带大家了解一下森林图(Forest Plot) 的绘制方法,主要内容如下: 森林图(Forest Plot)的简单介绍 R-森林图(Forest Plot)绘制方法 Python-森林图...森林图(可以将观察到的效果、置信区间以及每个研究对象的权重等信息全部表示出来,是一种简单直观地展示单一研究和汇总研究的可视化图表。...R-森林图(Forest Plot)绘制方法 使用R绘制森林图(Forest Plot)的方法比较多,这里重点介绍R-forestplot包和R-ggforestplot包绘制。...R-forestplot包绘制 这一部分我们直接使用提供的数据进行绘制,重点在于展示forestplot包中一些绘图参数的设置。...使用的方法也较为简单,希望可以给小伙伴们带来绘图便利,当然,更多绘图函数和参数,还需自行探索哈~~ 参考资料 [1]forestplot包介绍: https://cran.r-project.org/web

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    R语言之 dplyr 包

    这个包以一种统一的规范更高效地处理数据框。dplyr 包里处理数据框的所有函数的第一个参数都是数据框名。 下面以 MASS 包里的 birthwt 数据集为例,介绍 dplyr 包里常用函数的用法。...1.使用 filter( ) 和 slice( ) 筛选行 函数 filter() 可以基于观测值筛选数据框的一个子集。第一个参数是数据框名,第二个参数以及随后的参数是用来筛选数据框的表达式。...select(birthwt, bwt, age, race, smoke) 请注意,MASS 包里有一个同名函数 select( ),如果同时加载了 dplyr 包和 MASS 包,R 会默认使用较后加载的包里的函数...为了避免混淆,我们可以使用符号 :: 特别指明使用某一个包里的函数,例如 dplyr::select( )。之后我们将会对函数 select( ) 作进一步介绍。...传递操作符 %>% 将该符号之前的对象传递给符号后面的函数并作为函数的第一个参数值。

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