我正在使用SimpleITK读取MetaImage数据。有时我只需要访问元数据(它存储在一个key=value .mhd文件中)，但我找到的唯一方法是调用ReadImage，这非常慢，因为它将整个数组加载到内存中。import SimpleITK as sitk
origin = mhd.GetOrigin()direction =
浏览 21提问于2017-12-17得票数 2
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我将读取一个nifti图像，并更改体素的值，然后保存新的nifti图像，与主图像相似，但只是体素值不同。换句话说，我希望我在分割图像中的标签是从0到7，而不是有不同的数字。
浏览 391提问于2021-01-05得票数 1
我有一个代表上传图片(.nii)的io.ByteIO对象，有没有办法从它获取simpleITK对象？一种糟糕的解决方法是先写入文件，然后使用simpleITK读取它
浏览 30提问于2020-06-25得票数 1
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读取图像切片的SimpleITK
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我碰巧在我的硬盘上有一个非常大的.mha文件(9.7 Gb)，这是一个大脑的3D图像。我知道这个图像的形状，为了报告的需要，我想提取它的一个切片，以便获得可以保存为.png的2D图像。问题是我的16 Gb内存的计算机不允许我加载完整的图像，因此我想知道是否有一种方法可以在不加载整个图像的情况下提取此图像的2D切片。对于较小的图像，我使用<code>D0</code>并将其提供给<code>
浏览 27提问于2020-07-31得票数 1
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从.mha文件读取头信息
、、、
我只想从.mha文件中读取标题。理想情况下，它会给我同样的感觉，就像只使用元数据读取.mhd文件一样。我正在使用SimpleITK进行阅读，虽然它可以很好地读取图像，但我特别希望创建一个元数据字典。HeaderSize = X
其中X是
浏览 6提问于2021-04-08得票数 0
我正在尝试使用SimplyITK和Numpy从BraTS 2019年数据集加载大量的NIFTI图像。 SimpleITK.SimpleITK.Image, numpy array: images read as image, images read as numpy array/SimpleITK-Notebooks/01_Image_Bas
浏览 0提问于2020-08-11得票数 2
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default, May 6 2020, 11:45:54) [MSC v.1916 64 bit (AMD64)] 我正在尝试从BraTS 2019 dataset中使用SimplyITK和Numpy加载大量的NIFTI图像。这是我用来将图像加载到numpy数组中的代码。/SimpleITK-Notebooks/01_Image_Basics.html return images, images_array 此代码适用于最小的数据</em
浏览 27提问于2020-08-11得票数 0
我已经从DICOM文件计算了两个点(x，y，z)之间的距离，以得到线的长度，结果是以像素为单位的，如何将其转换为mm或cmm
浏览 17提问于2021-03-02得票数 1
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我试图翻转图片1中显示的图像，以匹配图像2的方向，但我不确定如何。这就是如何以形象为导向：有什么想法吗?例如，我如何在Python中使用SimpleITK或nibabel来实现这一点？
浏览 24提问于2022-09-21得票数 2
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我知道SimpleITK可以读取Nifty (.nii)格式的3d图像，而且它还支持nii.gz压缩版本。但是，我无法加载nii.zip文件。如果我试图直接解压缩/解压缩，这些文件会抛出错误，而且也不会被SimpleITK识别为可读的格式之一。
参考数据集可在：中找到
浏览 1提问于2019-08-27得票数 1
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如何在ITK中加载和写入..mhd/..raw格式的3D图像？我尝试使用以下代码，但由于加载图像的维数显示为0、0、0，所以没有加载。
有人能指出我正在犯的错误吗？
浏览 5提问于2016-06-14得票数 2
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对于3D图像的配准和分割，我有一些疑问：
加载dicom图像:在DCE中有4000个切片和总共100个堆栈，所以每个堆栈中有40个.如何使用GDCM simpleITK函数将它们加载到4D数组中？配准精度: SimpleITK重叠比测量或重叠距离需要分割和标记。目前，利用区域生长或阈值分割对各种图像都是不容易的。假设我只想手动地、交互式地选择一个区域。是否有可能做到这一点？当使用simpleITK写图像函数写入d
浏览 9提问于2017-03-22得票数 0
如何使用适用于C#的SimpleITK读取原始文件？我在Windows (64位)上使用SimpleITK C# 0.5.1版String fileName = @"d:\Temp\MRI\t1_icbm_normal_1mm_pn3_rf20new ImageFileReader();Image image = reader.Execute();
例如，它适用于.png或分析图像，但不适用于原始图像。有没有办法在<e
浏览 9提问于2012-10-27得票数 1
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我想在Python3中使用simpleItk裁剪3D图像 首先，加载图像并获取numpy数组 image_ct = sitk.ReadImage(path_ct, sitk.sitkInt16)array_gt = array_gt[center[0]-50:center[0]+51, center[1]-50
浏览 143提问于2020-04-21得票数 1
目标:我想要一个1步的解决方案，将.mnc文件转换为.mha文件 代码： import SimpleITK as sitk
/tmp/SimpleITK-buildFile "/home/russ&#x
浏览 137提问于2019-10-14得票数 0
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load系列函数如下所示def load_series(path):
reader = sitk.ImageSeriesReader()
浏览 0提问于2018-08-14得票数 5
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据我所知，<code>D0</code>不读取元数据。我尝试使用<code>D1</code>，但它只读取一个文件。如何在转换格式时将元数据从DICOM堆栈复制到Nifti文件？
浏览 12提问于2020-08-05得票数 0
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我想将视频文件的帧加载到一个numpy数组中。我希望框架是正确直立的，这意味着我需要读取视频文件中的方位元数据，并相应地旋转加载的帧。我有一种加载框架的方法(opencv的python绑定)，所以我所需要的只是读取视频文件的定向元数据。我正在尝试读取运行在Ubuntu14.04机器上的python中从我的.MOV中记录下来的一个iPhone文件。我看过的东西：
元</e
浏览 5提问于2015-01-05得票数 5
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我正在尝试使用从python中的JPG读取XMP数据。但是，我遇到了几个映像，其中库无法加载任何XMP数据：>>> file_to_dict("/path/to/file.jpg()方法不会引发任何异常，如果以文本形式打开图像，我可以看到格式正确的图像元数据。最后，(显然不那么挑剔) exif
浏览 11提问于2015-01-02得票数 1
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