当我运行我的Snakefile时收到这个错误: Error in rule get_ha_frequency: output: freq.annotated.tsv"file/path/Snakefile", line 29, in __rule_get_ha_frequency
File "/home/users/USER/mambaforge/envs/snakemakeLook above
所以正如标题上说的,我不能带着我的工作流程去执行任何事情,除了所有的规则.当执行all规则时,它正确地找到所有输入文件,所以configfile是好的,每个路径都是正确的。当尝试在没有附加标记的情况下运行时,我会得到Checking status of 0 jobs.Nothing to be done
以下是snakemake教程的高级部分中的一个简短示例:input: lambda wildcards: config[我的理解是,我不能通过调用规则名称来运行snakemake,因为这会导致错误:InputFunctionException in line 9 of Snakefile其次,有<em