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GWAS分析中变量区分(性别?PCA?不同品种?)

变量定义 plink进行GWAS分析时,变量都要是数字变量,因子变量需要转化为dummy变量(哑变量)然后与数字变量合并,通过--covar进行合并。...什么是变量 注意:GWAS中变量和一般模型中变量是不一样。...「一般模型:」 y = F1 + F2 + x1 + x2 F1, F2为因子,特点是因子,比如不同颜色(红黄绿) x1,x2为变量,特点是数值,不如初生重,PCA值等数值 ❝变量是指数字类型变量...❞ 「GWAS模型中:」 y = x1 + x2 GWAS中只有变量,所谓因子,也是变量一种 在GWAS分析汇总,因子也是转化为虚拟变量(dummy)放到模型中 实例演示 「举个例子:」 library...❞ 所以,统计课本里面,方差分析和线性回归分析,都是基于一般线性模型(GLM),放到GWAS分析中,就可以解释因子变量和数字变量,以及PCA变量区别了。

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R语言分析变量之间非线性关系

p=6366 最近我被问到我 - [R和Stata软件包是否能够适应变量之间非线性关系。答案是肯定,在这篇文章中,我将说明如何做到这一点。...为了说明,我们将模拟具有两个协变量X1和X2以及连续结果ý非常大数据集。...然后我们需要告诉smcfcs如何估算x1,然后被动地估算x1sq变量。鉴于我们对真实数据生成模型了解,我们应该如何归认于x1?...- 虽然它从一个与指定实体或结果模型兼容插补模型中推算每个协变量,但这并不意味着这些插补模型中每一个都是相互兼容。...具体而言,用于分配其他变量模型可能不兼容。 更有效方法是为数据指定单个联合模型,并在其隐含条件分布下进行估算。例如,这可以使用JAGS来实现。

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R语言调整随机对照试验中基线变量

有时估计值会高于真实值,有时低于真实值,但只要平均值等于目标值,我们就会说估算值是无偏见变量调整 现在让我们考虑调整一个或多个基线变量,在我们分析中随机化时。...这通常通过拟合结果回归模型来完成,随机组和基线变量作为变量。 我们可以使用R来说明这一点。我们将模拟n = 50个受试者小型研究数据,随机化50%治疗= 0和50%治疗= 1。...通过调整X获得估计值更接近真实值1,并且标准误差更小,表明更精确估计。通过调整变量获得精确度取决于变量和结果之间相关性强度。...调整变量假设 我们已经看到,调整基线变量可以提高我们治疗效果估计精确度。但要做到这一点,我们已经拟合了一个更复杂回归模型。...事实证明,在逻辑回归中调整基线变量会降低治疗效果估计精确度,但(会增加相应假设检验能力)。

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【Kotlin 程】程上下文 ( 程上下文构成要素 | 指定程上下文元素组合 | 程上下文元素继承关系 | 程上下文元素几种指定形式 | 默认 | 继承 | 自定义指定 )

文章目录 一、程上下文构成要素 二、指定程上下文元素组合 三、程上下文元素继承关系 四、程上下文元素几种指定形式 ( 默认 | 继承 | 自定义指定 ) 一、程上下文构成要素 ----...使用 launch 或 async 程构建器 启动 程时 , 都要 指定一个 程上下文 , 如果没有指定 , 则使用默认程上下文 EmptyCoroutineContext ; 下面是...* 该上下文中与另一个上下文中具有相同键元素将被删除。...( 默认 | 继承 | 自定义指定 ) ---- 程任务 程上下文元素 由以下几种形式指定 : ① 默认 程上下文 CoroutineContext : 下面代码中 launch 构建程就是默认参数..." 中示例 ; ③ 自定义 程上下文 CoroutineContext 元素参数 : 在 程构建器 中指定 程上下文参数 优先级最高 , 可以 覆盖 默认值 和 继承自父类 程上下文元素

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R语言利用基线变量提高随机对照试验效率

也就是说,治疗效果边际或未调整比值比不同于以一个或多个基线变量为条件治疗效果。这意味着如果调整基线测量,真实治疗效果估计实际上与边际未调整治疗效果不同。...以提高精度估计边际处理效果 基本思想是我们可以通过添加增强函数来修改由边际(未调整)处理效果估计器求解估计方程,该函数利用基线变量。 这是一个二进制变量,指示受试者被随机分配到哪个治疗组。...我们将表示基线变量向量。 由于我们假设这里是二元,我们将使用这两个模型逻辑回归模型。...正如我们预期那样(平均而言),条件处理效应幅度大于边际效应。 现在我们将估计边际治疗效果,但利用基线变量来获得更精确估计。 接下来,我们必须适应两个工作模型和。...semiPara < - (y~1,endpoint =“dichotomous”,data,trt.id =“z”, endCtrlPre = q0hat,endTreatPre = q1hat) 我们首先指定结果变量

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记一次程环境下类成员变量污染问题

我维护项目采用技术框架是php中基于swoole一个web框架叫做swoft。该框架是程环境,并且是模仿springboot一个注解式php框架。...我做一个需求,发生了程环境下类成员变量污染问题。...于是我仔细看了代码,我通过职责链模式将结果传递到了每一个类成员变量中,而BeanFactory::getBean这个方法默认是获取单例类,于是类成员变量在没有保护情况下被其他程污染了。...他这里思路是:将日志存放在类成员变量messages中,这是一个数组,当这个数组中元素大于刷盘数量时,将该数组中日志记录刷入文件中。...这个日志重复问题可以通过写一个简单接口,就直接打印4条日志,然后10个线程并发访问,结果不一定是40条日志被打印,该结果足以证明程污染类成员变量问题。

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stata对包含变量模型进行缺失值多重插补分析

p=6358 多重插补已成为处理缺失数据常用方法 。 我们可以考虑使用多个插补来估算X中缺失值。接下来一个自然问题是,在X插补模型中,变量Y是否应该作为变量包含在内?...(意味着Y是因变量而X是变量),我们希望生成这样插补我们得到Y | X模型中参数有效估计。...将结果考虑在内 假设如果我们反过来将X结果考虑为Y(作为X插补模型中变量),则会发生以下步骤。X | Y插补模型将使用观察到X个体来拟合。...要继续我们模拟数据集,我们首先丢弃之前生成估算值,然后重新输入X,但这次包括Y作为插补模型中变量: mi impute reg x = y,add(1) Y对X,其中使用Y估算缺失X值 多重插补中变量选择...选择要包含在插补模型中变量一般规则是,必须包括分析模型中涉及所有变量,或者作为被估算变量,或者作为插补模型中变量

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变量删除与替换

变量删除 1.从前面开始删除变量内容 [root@localhost test]# path=${PATH} [root@localhost test]# echo $path /usr/local/...,一个#表示从前面删除匹配最短路径。...2.从后面开始删除变量内容 #表示从前面开始删除变量内容,而%则表示从后面开始删除变量内容。...总结如下: 变量设定方式 说明 ${变量#关键词} 若变量内容从头开始符合『关键词』,则将符合最短数据删除 ${变量##关键词} 若变量内容从头开始符合『关键词』,则将符号最长数据删除 ${变量%关键词...} 若变量内容从尾向前符合『关键词』,则将符合最短数据删除 ${变量%%关键词} 若变量内容从尾向前符合『关键词』,则将符合最长数据删除 ${变量/旧字符串/新字符串} 若变量内容符合『旧字符串』则

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Shell变量:Shell变量定义、赋值和删除

在 Bash shell 中,每一个变量值都是字符串,无论你给变量赋值时有没有使用引号,值都会以字符串形式存储。...这种方式比较适合定义显示纯字符串情况,即不希望解析变量、命令等场景。 以双引号 " "包围变量值时,输出时会先解析里面的变量和命令,而不是把双引号中变量名和命令原样输出。...我建议:如果变量内容是数字,那么可以不加引号;如果真的需要原样输出就加单引号;其他没有特别要求字符串等最好都加上双引号,定义变量时加双引号是最常见使用场景。...删除变量 使用 unset 命令可以删除变量。语法: unset variable_name 变量删除后不能再次使用;unset 命令不能删除只读变量。 举个例子: #!...免责声明:本站发布内容(图片、视频和文字)以原创、转载和分享为主,文章观点不代表本网站立场,如果涉及侵权请联系站长邮箱:zbxhhzj@qq.com进行举报,并提供相关证据,查实之后,将立刻删除涉嫌侵权内容

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Python变量变量定义、赋值、修改、删除等操作

Python变量是用于存储数据标识符。变量可以存储各种类型数据,例如数字、字符串、列表、字典等。在Python中,变量定义、赋值、修改、删除等操作非常简单。...以下是Python变量教程,包括变量定义、赋值、修改、删除等操作: 变量定义 在Python中,可以使用任何名称来定义变量,只要满足以下条件: 变量名只能包含字母、数字和下划线。...变量名必须以字母或下划线开头。 变量名不能是Python关键字,如if、while、for等。 变量定义非常简单,只需要指定变量名,然后使用等号将其赋值给一个值。...例如: x = [1, 2, 3] x[0] = 4 在上面的示例中,变量x值由[1, 2, 3]更改为[4, 2, 3]。 变量删除 可以使用del语句删除变量。...修改和删除等操作对于编写有效Python代码非常重要。

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stata如何处理结构方程模型(SEM)中具有缺失值变量

p=6349 本周我正和一位朋友讨论如何在结构方程模型(SEM)软件中处理具有缺失值变量。我朋友认为某些包中某些SEM实现能够使用所谓“完全信息最大可能性”自动适应变量缺失。...在下文中,我将描述我后来探索Statasem命令如何处理变量缺失。 为了研究如何处理丢失变量,我将考虑最简单情况,其中我们有一个结果Y和一个变量X,Y遵循给定X简单线性回归模型。...接下来,让我们设置一些缺少变量值。为此,我们将使用缺失机制,其中缺失概率取决于(完全观察到)结果Y.这意味着缺失机制将满足所谓随机假设缺失。...具体来说,我们将根据逻辑回归模型计算观察X概率,其中Y作为唯一变量进入: gen rxb = -2 + 2 * y gen r =(runiform()<rpr) 现在我们可以应用Statasem...现在我们再次有偏差估计,因为Y和X联合常态假设不再成立。因此,如果我们使用此选项,当我们缺少变量时,我们会发现联合正态假设是至关重要

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【Kotlin 程】Flow 异步流 ⑥ ( 调用 Flow#launchIn 函数指定流收集程 | 通过取消流收集所在程取消流 )

文章目录 一、调用 Flow#launchIn 函数指定流收集程 1、指定流收集程 2、Flow#launchIn 函数原型 3、代码示例 二、通过取消流收集所在程取消流 一、调用 Flow...#launchIn 函数指定流收集程 ---- 1、指定流收集程 响应式编程 , 是 基于事件驱动 , 在 Flow 流中会产生源源不断事件 , 就是 发射元素操作 ; 拿到 Flow 流后..., 开始 收集元素 , 按照顺序逐个处理产生事件 ( 元素 ) ; 调用 Flow#launchIn 函数 , 传入 程作用域 作为参数 , 可以 指定 收集 Flow 流元素 程 ; 在上一篇博客...【Kotlin 程】Flow 异步流 ⑤ 中 , 调用 Flow#flowOn 函数 , 可以 指定 Flow 流发射元素 程 ; Flow#launchIn 函数返回值是 Job 对象 ,...Thread.currentThread().name}") } .launchIn(CoroutineScope(Dispatchers.IO)) // 在指定程作用域中处理收集元素操作

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​2021-03-06:go中,公共变量程安全吗?赋值操作是原子吗?为什么?

2021-03-06:go中,公共变量程安全吗?赋值操作是原子吗?为什么? 福哥答案2021-03-06: 这是面试中被问到。实力有限,真正答案还不知道。...我想法是a=1是原子操作,a=b不是原子操作。实际开发中,不大可能是a=1这种情况,可以说是程不安全。...答案1: 不是程安全, 赋值非原子操作, 需要加锁要么就做原子操作, 否则会引起data race。 评论如下: 题016_ 卓熊 7:39:15 Go很多操作并没有做太多处理,还是沿用了c。...所以公共变量程安全,赋值操作是否原子跟变量类型及机器架构有关(指令集)。....github.io 16:28:09 今天每日一题是我过最快一次 题078_ Tnze 10:27:04 公共变量不是程安全,赋值操作不是原子 Tnze 10:27:45 这是由于线代多核

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mfc学习之路--如何删除通过控件新增变量

刚刚学校mfc的人都会遇到这样一个问题(比如我),在照做书做一个mfc程序,给控件新增变量变量类型错了,但是变量名对了,然后想要加个正确时候提示"已经存在该对象",然后就傻了,不知道该怎么删除这个错误变量...开发工具提供了增加变量功能但是并没有删除功能,所以如果想要删除某个错误变量就要手动去代码中找到该变量,然后手动删除.下面说具体方法.   ...新增一个变量这个变量存在于两个位置,一个是头文件中项目名+Dlg.h文件,另一个是源文件中项目名+Dlg.cpp文件,比如我项目名是abc,那么变量将会存在于abcDlg.h和abcDlg.cpp中,...然后在每个文件中用Ctrl+f组合键搜索你要删除变量名,然后删掉它所在所以位置.

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linux用户环境变量和系统环境变量_Linux系统中删除文件命令

大家好,又见面了,我是你们朋友全栈君 linux环境变量和Windows环境变量一样,分系统环境变量和用户环境变量,系统环境变量对所有用户有效,而用户环境变量只对当前用户有效,下面以jdk为例进行两种环境变量配置...2.用户环境变量配置 这里我为了更好区分,普通用户使用jdk版本为1.7. cd /home/用户名 ,进到普通用户家目录下,可以看到用户环境变量文件.bash_profile(该文件为隐藏文件)...bash_profile,JAVA_HOME为jdk所在目录: 保存后执行 source .bash_profile立即生效,执行java -version后可以看到jdk版本为1.7,说明用户环境变量配置生效了...以上为系统环境变量及用户环境变量配置,如果既配置了系统环境变量,又配置了用户环境变量,最终会以用户环境变量配置为准。...如发现本站有涉嫌侵权/违法违规内容, 请发送邮件至 举报,一经查实,本站将立刻删除

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linux中删除export变量名中某个值

在Linux中,如果你想要从export变量名中删除某个值,可以使用以下方法:查看当前export变量值在终端中输入以下命令,查看当前export变量值: echo $EXPORT_VARIABLE...删除变量名中某个值如果你想从export变量名中删除某个值,可以使用sed命令: export EXPORT_VARIABLE=$(echo $EXPORT_VARIABLE | sed 's/:<value...如果你要删除值出现多次,以上命令只会删除第一次出现值。...验证变量值是否已经被删除在终端中输入以下命令,查看当前export变量值是否已经被删除: echo $EXPORT_VARIABLE 如果输出结果中不包含你要删除值,则表示变量值已经被成功删除...注意:以上命令只是在当前终端中删除了export变量某个值。如果你想要永久删除某个值,需要将相关命令添加到~/.bashrc或.bash_profile文件中。

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