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R语言数据分析与挖掘(第四章):回归分析(1)——一元回归分析

参数:formula 类对象"formula"(或一个可以强制这一类):将装有模型的一个象征性的描述。“详细信息”型号规格的细节。...参数:data 一个可选的数据框,列表或环境(as.data.frame到一个数据框或对象强制转换)包含在模型的变量。...参数:subset 一个可选的向量指定要在装修过程中使用的观测的子集。 参数:weights 一个向量。指定用于回归的每个观测值的权重。...指定奇异拟合是否报错,默认TRUE。 参数:contrasts 可选列表。模型因子对应的列表,为模型的每一个因子指定一种对照方式,默认值为NULL。...一个或多个offset条款可以包括公式代替,以及,如果超过指定使用它们的总和。

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R for data science (第一章) ②

每个图使用不同的可视对象来表示数据。 ggplot2语法,我们说它们使用不同的geom。 geom是绘图用于表示数据的几何对象。 人们经常根据情节使用的几何类型来描绘情节。...geom_smooth。许多geom,如geom_smooth(),使用单个几何对象来显示多行数据。对于这些geoms,您可以将组审美设置为分类变量以绘制多个对象。...ggplot2将为分组变量的每个唯一值绘制一个单独的对象。实际上,每当您将美学映射到离散变量,ggplot2都会自动将这些geoms的数据分组(如线型示例中所示)。...image.png 如果将映射放在geom函数,ggplot2会将它们视为图层的本地映射。 它将使用这些映射来仅扩展或覆盖该层的全局映射。 这使得可以不同层显示不同的aesthetics。...您可以使用相同的想法为每个图层指定不同的数据。 在这里,我们的平滑线仅显示mpg数据集的子集,即小型汽车。 geom_smooth()的本地数据参数仅覆盖该层的ggplot()的全局数据参数。

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ggplot2--R语言宏基因组学统计分析(第四章)笔记

坐标:将对象的位置映射到绘图平面上。位置通常由两个坐标(x,y)指定,但可以是任意数量的坐标。此外,坐标变换发生在统计变换之后 面处理:更一般的情节称为条件图或网格图。...ggplot2,层负责创建我们绘图上感知到的对象。层由四个部分组成:数据和几何映射、统计变换(STAT)、几何对象(GEOM)和位置调整(Wickham 2010)。一个图可能有多个图层。...空图 应该在aes()函数中指定数据帧需要绘图的任何信息。本例,我们通过aes()函数实现美学映射:分别指定x和y变量。但是,只绘制了一个空白的GGPlot。...第二步,加点 第三步,为了绘制具有平滑曲线的散点图,我们在上一个plot对象添加了一个名为geom_smooth()的附加几何层。...输出显示,plot对象添加了一个附加层,该层使用线性模型进行拟合。曲线也有置信带,我们可以设置se=FALSE来关闭置信带。

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R语言数据分析与挖掘(第四章):回归分析(4)——logistic回归

前面我们介绍的回归方法,一般适用于数值型数据对象,对于分类数据类型就不再适用。对于分类数据对象,我们需要引入广义线性回归方法,比如logistic回归和poisson回归模型。...binomial(link = "logit"); Data:指定用于回归的数据对象,可以是数据框、列表或能被强制转换为数据框的数据对象: Weights:一个向量,用于指定每个观测值的权重: Subset...:一个向量,指定数据需要包含在模型的观测值; Na.ction:一个函数,指定当数据存在缺失值的处理办法,用法与Im的一致; Start:一个数值型向量,用于指定现行预测器参数的初始值; Etastart...:一个数值型向量,用于指定现行预测器的初始值; Mustart:一个数值型向量,用于指定均值向量的初始值: Offset:指定用于添加到线性项的一组系数恒为1的项: Contol:指定控制拟合过程的参数列表...,“glm.ft”表示用于拟合,“model.frame"表示可以返回模型框架; X:逻辑值,指定是否返回“横型矩阵”,默认值为FALSE: Y:逻辑值,制度是否能够返回响应变量,默认值为TRUE; Contrasts

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【Node.js】01 —— fs模块全解析

大部分场景下,尤其是强调高性能和高并发的应用,应当优先考虑使用异步I/O。 异步过程,Node.js可以继续执行其他任务,提高了程序的并发性能。...回调函数接收两个参数:错误对象(如果有错误发生)和一个fs.Stats对象,该对象包含了文件或目录的各种状态信息。 fs.statSync(path) ——同步获取文件状态信息。...此方法仅接收一个参数:文件路径(必需),并直接返回一个fs.Stats对象,如果不成功,则抛出错误。...该方法接收一个必填参数路径,用于指定要创建的新目录的完整路径。还可以传入一个可选的options对象,其中可以设置权限模式或启用递归创建父目录等功能。...,特别是类Unix系统(如Linux、Mac OS X等)

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ggpmisc--给你的曲线添加回归方程

某些情况下,可能需要添加方差分析表或汇总表作为绘图注释。...背景介绍 ggplots中支持基于计算和模型拟合的注释可以作为新的统计信息来实现,这些统计信息对绘图数据进行计算,并将结果传递给现有几何图形。...然而这种方法相当繁琐且容易出错,因此小编给大家介绍一个可以为各种模型拟合函数绘制预测值、残差、偏差和权重的R包ggpmisc,可以轻松地实现与拟合模型相关的注释和绘图!..., formula = formula) + stat_fit_deviations(formula = formula, colour = "red") + geom_point() 添加权重...scale_fill_outcome() + theme_dark() 小编总结 作为ggplot2的扩展包,ggpmisc可以方便的给我们的图片添加公式、残差等等多种注释,ggpmisc包也不断更新

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HAProxy配置文件详解和ACL功能

指定代理负载均衡算法,支持的算法有: roundrobin(默认):根据权重进行轮询,服务器的处理时间保持均匀分布,这是最平衡、最公平的算法。...此算法是动态的,表示权重可以haproxy运行时调整后端服务器的权重并生效; static-rr:基于权重进行轮询,与roundrobin类似,但是为静态方法,haproxy运行时调整其服务器权重不会生效...使用了basic认证,url的param一般都会使用user=XXX。使用该算法会对该参数进行hash运算,然后除以总权重以决定分配到哪台后端server。...没有匹配的"use_backend"规则为实例指定默认后端。...stats realm:stats auth身份认证的提示信息。设置的提示信息,如果有空白字符,则需要转义。仅在与"stats auth"配合使用时有意义。

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HAProxy用法详解 最详细中文文档

支持的算法有: 3.11 roundrobin:基于权重进行轮叫,服务器的处理时间保持均匀分布,这是最平衡、最公平的算法。...此参数仅在与“stats auth”配置使用时有意义。 :实现HTTP基本认证显示浏览器的领域名称,用于提示用户输入一个用户名和密码。...3.16 stats admin stats admin { if | unless } 指定的条件满足启用统计报告页面的管理级别功能,它允许通过web接口启用或禁用服务器,不过,基于安全的角度考虑...默认情况下,HTTP请求是在请求结束进行记录以便能将其整体传输时长和字节数记入日志,由此,传较大的对象,其记入日志的时长可能会略有延迟。...;指定首部,其名称不区分大小写,且括号“()”不能有任何多余的空白字符。

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HAProxy配置文件详解及常用案例

支持的算法有: 2、 roundrobin:基于权重进行轮叫,服务器的处理时间保持均匀分布,这是最平衡、最公平的算法。...此参数仅在与“stats auth”配置使用时有意义。 :实现HTTP基本认证显示浏览器的领域名称,用于提示用户输入一个用户名和密码。...可以结合“stats realm”参数提示用户认证给出一个领域说明信息。使用非法用户访问统计功能,其将会响应一个“401 Forbidden”页面。...默认情况下,HTTP请求是在请求结束进行记录以便能将其整体传输时长和字节数记入日志,由此,传较大的对象,其记入日志的时长可能会略有延迟。...;指定首部,其名称不区分大小写,且括号“()”不能有任何多余的空白字符。

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生信技能树七天学习小组 Day4笔记——R语言基础

(1)此时颜色不会传达关于变量的信息,仅仅改变图的外观(2)手动设置图形属性,是将其作为几何对象函数的一个参数,位置aes()函数的外面(3)图形属性要是有意义的值,例如颜色名称是一个字符串color...1.6.2 几何对象函数geom_point()geom_smooth()ggplot2的每个几何对象函数都有一个mapping参数同一张图中可以放置多个几何对象ggplot(data = mpg)+...,mapping = aes(x=displ,y=hwy))+ geom_point()+ geom_smooth()这里x、y传递给了ggplot()函数作为全局映射可以不同的图层显示不同的图形属性...()1.6.3 练习题(1)绘制折线图、箱线图、直方图和分区图,应该分别使用哪种几何对象?...不显示图例(4)geom_smooth()函数的se参数的作用是什么?

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R语言学习笔记-Day5

alpha = 0.5, #透明度为50 % shape = 8) #点的形状映射:按照数据框的某一列定义某个属性#可以将点设置成多个颜色,与数据对应,而非统一颜色#统一设置的参数从属于...geom_function(),输入值为"颜色"(可设置为多个颜色,但不建议);映射的参数从属于aes(),输入值为行名#自行指定映射的具体颜色scale_color_manual(value=c("color...","color"))##必须先有aes(color)###可用16进制颜色编码进行指定###也可用色彩R包paletteer#图形分类关系与设置颜色参数空心(无填充):color;实心(无边框):color...geom函数所画出来的所有元素被称为几何对象几何对象可叠加(同一张图展示多图像)多张图存在图层顺序!...()aes()代表映射,只有键入该函数才能从数据读取相应的内容可以已有公共设置下进行二次映射代码不报错不代表没错!!!

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Webpack 实用技巧高效实战

本文是一些零散的功能记录、关键点配置和 Tips,大部分从使用过程总结而来,并不是手册翻译也不是入门讲解,正在入手 Webpack 或在使用遇到问题的同学可以看看是否刚好解决到你的问题,如果有老司机也欢迎指出错误...手动指定 loader 的默认位置: resolveLoader: { //指定默认的loader路径,否则依赖走到上游会找不到loader root: path.resolve( __dirname...手册写的很明白使用 CommonsChunkPlugin 插件来处理。这个插件支持很多种传参和设置,我比较喜欢下面这种对象传递,这样可以指定生成多个包: entry: { a:"....这时再在 a.js 或 b.js 及其依赖引用 common1 包包含的库,将不会再被重复打包到各自的 bundle 。...要注意的是:如果没有指定 target 为 node,而代码里有 require Node 的原生模块(例如http、url等)但又没有设置 Alias,也就是找不到这些模块,Webpack 会尝试一个兼容逻辑

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数据处理神器tidyverse(2)ggplot2

几何对象的形式由geom_xxx()函数定义,基于数据变量的几何对象的属性(位置,大小,颜色)由美学(aes())函数指定geom_xxx()函数)。...使用+将图层添加到ggplot对象。可能最常见的geom层是geom_point。 geom_point()里面,您将指定从变量到所需几何对象的美学映射。...我们还可以使用geom_smooth()点上添加平滑的趋势线图层。...相反,当您按年计算平均预期寿命,首先按“大陆”分组。...image 基于变量的更多美学映射 到目前为止,我们只指定了从数据到geom对象的x和y位置美学映射。 但您也可以指定其他类型的美学映射,例如使用变量来指定点的颜色。

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R语言之 ggplot 2 和其他图形

以 geom 开头的一系列函数用于指定图形元素,包括点、线、面、多边形等。下面使用点(point)这种几何对象来展示数据,结果如下图所示。...2.分布的特征 探索数据的过程,最基本的手段就是观察单个变量的取值情况。对于连续型变量,可以绘制直方图或密度曲线图。 下面用之前提及的 MASS 包里的数据集anorexia 作图。...labs(x = "Weight change (lbs)") + theme_bw() p1 其中,参数 binwidth 用于设置组距,默认值为全距除以 30,作图可以尝试设置不同参数值以得到比较满意的结果...需要注意的是,用静态的三维散点图描述 3 个变量之间的关系,可能会受到观察角度的影响。... R 的应用,可视化是一个非常活跃的领域,新的包层出不穷。网站 The R Graph Gallery 收集了各种新颖的图形以及相应的示例代码,值得对可视化感兴趣的读者关注。

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Python实现随机性操作的多种方法

random.choices()方法接受weights参数来指定每个候选项的选择权重,k参数指定选择的次数,这里选择一次,所以k=1。...使用概率分布对象Python的一些库还提供了概率分布对象,可以方便地进行基于概率的选择。...下面以scipy.stats库为例,展示如何使用概率分布对象:from scipy.stats import binom​def make_decision(probability): return...我们使用正态分布对象norm来生成符合指定均值和标准差的连续值。...;使用自定义概率分布函数来进行选择,可以根据自定义的概率分布生成选择结果;使用加权随机选择方法,可以根据选项的权重进行选择;使用概率分布对象来生成符合指定分布的连续值;使用随机游走、马尔可夫链、蒙特卡洛方法

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使用ggpubr包的stat_cor函数一步到位绘制相关性散点图并且添加统计学指标

to add the correlation library(ggpubr) ggplot(expression_data, aes(x= CD3D, y = CD4)) + # geom_smooth...method = "pearson") 如下所示: 正负值相关性 该如何系统性学习ggplot呢 如果你要从ggplot2开始一步步调制成为它这样的美图,需要下很深的功夫,一张统计图就是从数据到几何对象...✦ 数据(Data),最基础的是可视化的数据和一系列图形映射(aesthetic mappings),该映射描述了数据的变量如何映射到可见的图形属性。...✦ 几何对象(Geometric objects, geoms)代表图中实际看到的点、线、多边形等。...✦ 统计转换(Statistical trassformations, stats)是对数据进行某种汇总,例如将数据分组创建直方图,或将一个二维的关系用线性模型进行解释。

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