使用WGCNA软件包对共表达的基因进行分析。在这里，我试图形成一个类似于表达数据的数据框架，它将包含临床特征。traitRows = match(lowNoduleSamples, allTraits$sample); #here is the line i get wrong values as NAswhile i know they all should match
datTraits = allTraits[traitRows, -1]; #then this lines
浏览 36提问于2021-07-05得票数 0
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匹配包的Match函数非常直观地估计匹配技术。但是，当要匹配的变量包含NAs时，就会出现问题，因为函数将返回任意数量NAs的错误。最近我遇到了这种情况，并想问是否有一种方便的方法来处理包中的NAs。似乎没有关于数据的规范，而且我不想每次在某个地方有一些NAs
浏览 4提问于2022-01-21得票数 0
然而，我在控制日志文件(或发送到终端)中包含了哪些消息时遇到了问题，并且无法找到任何解决方案来排除一个特定的R包加载消息：
错误:添加错误以验证它是否正确地打印到文件中
我想保持我的日志文件尽可能干净和点(并避免在终端中的杂乱)，并为此希望删除包加载消息。我
浏览 1提问于2019-03-27得票数 1
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我有一个名为data的数据框架。我有一个名为ColB的列，其中包含所有nA值，还有一个名为ColC的列，其中包含所有整数值，而不包含NAs。当我使用子集语法时，我得到了一些错误的结果(全部是NAs)：但是，当我使用which函数运行相同的语法时，我没有得到任何结果，正如我所期望
浏览 1提问于2015-04-22得票数 0
我试图计算一个邻接矩阵的加权拓扑重叠，但我不知道如何使用numpy正确地完成它。执行正确实现的R函数来自WGCNA ()。是的，我知道rpy2，但如果可能的话，我会尝试轻量级的。 A_tom[i,j] = w_ij
A_tom = (A_tom + A_t
浏览 0提问于2019-06-13得票数 8
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在我努力解决这里提到的问题时：
我继续从WGCNA复制我需要的代码到我自己的软件包并安装了它。显然，我现在可以在没有任何问题的情况下加载包(因为我不需要GO.db部分)。错误消息：.C中的错误(“corFast”，x= as.double(x)，nrow = as.integer(nrow(x))，ncolx = as.integer(ncol(x))，：‘。我确实想使用WGCNA提供的</
浏览 1提问于2016-05-18得票数 1
我在包中运行函数多样性，但我的数据集包含许多NAs。该函数按行(即绘图)计算多样性，但如果该行具有NAs，则返回NAs。我看过了，但是没有找到使用这个函数的NAs的解决方案。解决这个问题的唯一方法(也许)是每次运行函数时都删除带有NAs的列，但是手工操作将花费很长时间。我不能简单地从dataset中删除所有<e
浏览 2提问于2022-01-27得票数 0
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我希望将Test的值和更多的值逐一比较，然后在第三列中输出比较的结果(让我们称之为匹配)。如果Test和更多的值匹配，我希望输出一个1来匹配，如果它们不匹配，我希望输出一个0来匹配。还希望包含一些内容，告诉R如何在Test或更多列中处理NAs (即，如果这些列中有安娜，则在Match列中<em
浏览 7提问于2022-10-11得票数 0
可以替换相应的值，使用匹配函数提供错误的NAs are not allowed in subscripted assignments，请帮助我获得预期的输出。Values)] <- as2$Values_b
NAs
浏览 1提问于2020-09-25得票数 0
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摘要：I有一个栅格数据集，其中包含NA值，并且希望计算它的变异函数，而忽略NAs。我该怎么做？我尝试了gstat包，但似乎无法得到一个能够工作的函数调用。我已经收集到，基本上我需要<em
浏览 0提问于2012-05-24得票数 5
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我想对矩阵中的每一行执行t测试。第一个是它包含NAs，第二个是在某些行中没有足够的数据-整行中只有一个值。
你知道避免这个问题的方法吗？我想创建一个函数，它首先忽略NAs，如果行中只有1个值，它应该将NA作为t-test的输出。我通常使用pi0包中的函数- matrix.t.test
浏览 18提问于2016-07-20得票数 2
我有一个很大的数据集(1121行x 532列)。我有几个NAs (n= 3015)。我该怎么做呢？我尝试使用na.omit函数清除数据集中的缺失值，但R忽略了找到NAs的整行。
这对我来说是一个问题，因为在此操作之后，我得到了一个只有641行的数据集。每一列表示刻度的名称和条目编号(即IUI23 ...
浏览 1提问于2015-09-23得票数 0
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粗略精确匹配
、、
我试图在一个包含6549个观察值和94个变量的数据集上运行粗略的精确匹配。我已经排除了NAs，并在"Polity2>/ 7“(处理)上运行匹配。但是，当我开始运行该命令时，我遇到了以下错误消息：Error invector [0]
In a
浏览 2提问于2016-01-08得票数 2
当我在df中缺少值时，使用RCompAngrist包的kclass()函数有问题。它是一个函数，用来计算一个“有限信息最大似然”估计量，它的左手边有一个因变量，右边有两个部分。它基于AER包的ivreg()函数。下面是一个最小的工作示例，它将重现错误。：
cbind中的错误(x_exo，z，x_endo，y)：矩阵的行数必须匹配</em
浏览 2提问于2015-10-04得票数 1
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我需要完成从WordClim数据库中提取的非洲大陆19个栅格层之间的成对皮尔逊相关。我想要检查哪些变量层与我的模型更相关/更重要。为此，我尝试使用栅格软件包中的layerStats函数，但在执行我的输出不包含数值后，所有的行和列都显示了NAs值。下面是我的脚本。
浏览 1提问于2015-08-19得票数 8
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用pearson方法求出保持第三个变量固定的两个变量之间的偏相关关系。这是我遇到的错误：
事实上，我在数据中丢失了一个值，并且(na.rm=T)没有与我一起工作
浏览 2提问于2017-10-08得票数 1
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我从data.frame函数得到的cSplit似乎有问题。在没有NAs的情况下，我无法从下面的代码中提取列：输出是一个Named logi向量，而不是一个没有包含NAs行的列的data.frame。这个问题主要是由于data.frame输出的cSplit函数<
浏览 3提问于2016-03-04得票数 2
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我正在尝试使用R中的包中的函数，在对数据进行模型拟合之后，当我试图获得对训练数据本身的预测时，我遇到了以下错误(在预测测试数据时也遇到了相同的错误)错误可追溯到函数的方法。data=Dataset, met
浏览 5提问于2020-10-21得票数 0
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