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Seurat新版教程:分析空间转录组数据(

随着转录组技术的发展,空间转录组已经正式走向商业化时代,作为单细胞数据分析的工具箱的Seurat与时俱进,也相应地开发了空间转录组分析的一套函数,让我们跟随卑微小王看看Seurat官网教程吧。...本教程演示如何使用Seurat v3.2分析空间解析的RNA-seq数据。虽然分析流程类似于Seurat的单细胞RNA-seq分析流程,但我们引入了交互可视化工具,特别强调了空间和分子信息的集成。...本教程将介绍以下任务,我们相信这些任务在许多空间分析中都很常见: 归一化 降维与聚类 检测spatially-variable特性 交互式可视化 与单细胞RNA-seq数据集成 处理多个片(multiple...Seurat的SpatialFeaturePlot功能扩展了FeaturePlot,可以将表达数据覆盖在组织组织。...我们可以在UMAP空间(使用DimPlot)或使用SpatialDimPlot将分群的结果显示在图像

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    外国asp空间常见问题解答

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