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基因型填充前的质控条件简介

影响基因型填充准确率的因素有很多,比如分型结果的质量,填充软件的选择,reference panel的选择,样本量的大小, SNP的密度等等。 为了提高填充的准确率,我们需要在填充前进行质量过滤。...对于原始的分型结果,可以根据一些条件进行筛选和过滤,得到高质量的分型结果,用于后续的填充。...分型结果本质上是一张由样本和SNP位点构成的表格,对应的过滤手段也分成了两个大的方向,针对SNP位点的过滤和针对样本的过滤。...这里的质控条件和GWAS分析的质控条件是一致的,本文基于case/control的GWAS分析,讲解下常用的过滤条件。...对原始分型结果进行质控,可以提高基因型填充的准确率,进一步保证后续GWAS分析的准确性。

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Base64 的 JavaScript 实现 js-base64

wiki上给的解释: https://en.wikipedia.org/wiki/Base64 编码规则 Base64编码的思想是是采用64个基本的ASCII码字符对数据进行重新编码。...它将需要编码的数据拆分成字节数组。以3个字节为一组。按顺序排列24 位数据,再把这24位数据分成4组,即每组6位。再在每组的的最高位前补两个0凑足一个字节。...这样就把一个3字节为一组的数据重新编码成了4个字节。当所要编码的数据的字节数不是3的整倍数,也就是说在分组时最后一组不够3个字节。这时在最后一组填充1到2个0字节。....decode('aHR0cDovL3d3dy5iYWlkdS5jb20='); // http://www.baidu.com Base64.decode('55m+5bqm'); // 百度...Base64.decode('aHR0cDovL3d3dy5iYWlkdS5jb20'); // http://www.baidu.com github源代码: https://github.com/

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    在字节,编码前的技术调研我是怎么做的?

    由于某次需求的需要,我进行了一次技术调研,内容是调研前端将 pdf 文件转为图片的解决方案,我接到这个需求的第一时间,立马打开搜索引擎,翻看了十分钟后,很快啊得出了一个口头结论 但这肯定是不行的,十分钟就能整明白的事情就不叫技术调研了...,如果十分钟就能完全确定的事情就没必要大费周折了 比如,你新启动一个项目,在 vue 和 react 中犹豫,不知道到底用哪个好,如果这个问题放到5年前,你可能确实需要调研一番,但放到当下这个时间点,显然就没必要了...,十分钟足以判断 为什么5年前需要呢?...调研方向 现存方案 得益于前端生态的百花齐放,对于同一个问题可能存在很多种解决方案,抛开那些重复的轮子以外,剩下的方案既然能够存在下去就说明它们有存在的理由,必然都有各自的优缺点,也都有各自最适合使用的场景...开箱即用的肯定比需要一大堆配置项的要好,没有额外学习成本的肯定比需要专业知识的要好(比如 webgl 就是专业知识),业务侵入度越低越好,如果能有官方/社区的最佳实践可参考那就最好不过了 缺陷及隐患 关注缺点的优先级高于关注优点的优先级

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    【快速阅读一】带蒙版的均值模糊快速实现以及其在填充无效区域时的应用。

    最近遇到一个需求,从相机获取的数据局部区域存在空值,即那些地方没有有效数据,如果直接赋值为0,则很有可能得到错误的结果,如果不填充值,很多算法又无法进行,因此,需要一种填充算法把这些空白区域设置成合适的值...我想了一下,有几个算法可  能可以解决这个问题:   1、inpainting(修复)算法,Inpainting本身就是一种修复算法,可以从周边领域的信息填充未知区域的值,这个开源的在Opencv里有2...但是这个算法的步骤实际上都是迭代算法,一步一步由空值边缘向空值内部慢慢填充,直到填充完成或者达到指定的迭代步数。        ...通过这样的修改,只要取适当的模糊半径, 就可以利用空值周边有用的信息来填充空值区域了,而且空值处的填充值也是和领域有关的,不是随机值,体现了领域相关性。   ...如下图所示,左图中那些纯黑色的部分(像素值为0)即为空值区域,右图是模糊半径为20的时候的修复效果,无效区域均有了有效值(右图有些边界很明显,这个其实可以通过适当的放款无效点的范围来改进)。

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    【小工匠聊密码学】-- Base64算法

    即将任意的内容转换为可见的字符串形式。 1.2、Base64 编码表 ? Base64编码表 1.3、Base64 算法由来 以前发送邮件只支持可见字符的传送。...由此,需要有一个方法将不可见的字符转换为可见的字符,便产生了Base64编码算法。...(即:如果一个数据有6个字节,可编码后将包含6/3*4=8个字节) (2)当数据的长度无法满足3的倍数的情况下,最后的数据需要进行填充操作,即补“=” ,这里“=”是填充字符,不要理解为第65个字符 2.2...编码规则 (1) 将原始数据3个一组,按位进行分割为 每6位一个字节的形式,进行转换,形成新的4个字节。这四个字节才通过Base64编码表进行映射,形成最后实际的Base64编码结果。...(2)如果原始数据最后无法凑成3个字节,则补填充,以“=”作为替换,代表没有数据。

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    斗智斗勇的反爬取实践

    1.数据加密反扒:在服务端对数据进行特定算法的加密, 在客户端利用JS进行动态输出解密(如何保护前度解密文件是重点!)...描述: 它是网络上最常见的用于传输8bit字节代码的编码方式之一, 采用base64编码具有不可读性即所编码的数据不会被人直接看出; 可将二进制数据编码为适合放在URL中的形式, 除此之外还可以放在请求头响应头进行传输...补充: Javascript 原生的 BASE64(ASCII) window.atob() 解码 与 window.btoa() 转码 但是他们并不支持中文的Base64编码需要下面自己写的 utf...-8 decode 的实现; Window.atob() # 函数用来解码一个已经被base-64编码过的数据。...var base64=new BASE64(); // 多次base64解码 return base64.decode(base64.decode(content)["\x72\x65\x70

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    Java Base64 编码解码方案总结

    在实际应用上,Base64除了能将Binary资料可视化之外,也常用来表示字串加密过后的内容。如果要使用Java 程式语言来实作Base64的编码与解码功能,可以参考本篇文章的作法。...只是这个sun.mis c套件所提供的Base64功能,编码和解码的效率并不太好,而且在以后的Java版本可能就不被支援了,完全不建议使用。...= base64.encodeToString(textByte);System.out.println(encodedText);//解码System.out.println(new String(base64...Java 8之后的作法 Java 8的java.util套件中,新增了Base64的类别,可以用来处理Base64的编码与解码,用法如下: final Base64.Decoder decoder =...实际测试编码与解码速度的话,Java 8提供的Base64,要比sun.mis c套件提供的还要快至少11倍,比Apache Commons Codec提供的还要快至少3倍。

    2.1K20

    Python 标准类库-因特网数据处理之Base64数据编码

    该模块提供将二进制数据编码为可打印ASCII字符并将这种编码解码回二进制数据的功能。它为RFC 3548中指定的编码提供编码和解码功能。...RFC 3548 编码适用于对二进制数据进行编码,以便可以安全地通过电子邮件发送,用作URL的一部分,或作为HTTP POST请求的一部分。编码算法与uuencode程序不同。 该模块提供了两个接口。...altchars 可选参数,必须是字节类对象或长度至少为2的ASCII字符串(多余的字符会被忽略),按序分别用于替换解码前s中与+, /的替代字符为+和/,等价于base64.urlsafe_b64decode...validate 如果为False(默认值),则在填充检查前,将丢弃既不在标准 Base64 字母表之中也不在备用字母表中的字符。...type=1' 历史接口 base64.decode(input, output) 解码二进制input文件的内容,并将生成的二进制数据写入output文件。

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