从2003年的SARS到如今全球正在经历的COVID-19，每一次重大公共卫生事件的发生，都会对医疗信息化的发展带来一个新的刺激。尤其像我国这样的人口大国，医院需要面对的诊疗压力、经营压力都在逐年增加，必须依靠先进的数字化手段找出有助于临床分析、诊疗辅助的有用信息，以满足临床、管理、科研流程业务和对数据的分析利用需求，增强医院整体竞争优势，促进医、教、研各方面的快速发展。
中台，从字面意思上理解，是位于前台和后台之间。 但关于中台的定义也是百家杂谈，故小编参考网上两种阐述比较清晰的定义。
来源：51CTO 作者：王雪燕 编者按：由51CTO举办的WOT”互联网＋”时代大数据技术峰会上，就职北京大学人民医院院长助理、信息中心主任、医疗大数据研究中心副主任、骨关节科副主任医师的刘帆做了以《大数据时代医院信息化建设之机遇与挑战》为主题的演讲。此次分享主要围绕医疗大数据展开，从中用户可以了解到医疗大数据到底是什么？现在到底有什么样的数据？大数据解决怎么样的问题？本文章是把本次分享干货亮点的整理成文字形式，呈献广大的用户。 ◆ ◆ ◆ 医疗服务模式的发展演化 刘帆表示，技术每一次的变化一定是推动业务流
在多种视网膜异常中，青光眼是世界上不可逆视力丧失的主要原因之一。它涉及视神经纤维的进行性变性。ONH（由视盘（OD）和视杯区域组成）的结构变化是评估青光眼损伤程度的标准方法之一。这些变化导致杯形，即杯相对于外径的扩大，并使用杯盘直径比 (CDR) 捕获。CDR 值较高表明眼睛中存在青光眼。不同的成像方式如光学相干断层扫描、海德堡视网膜断层扫描、眼底成像等用于评估青光眼。其中，彩色眼底（视网膜）成像是一种低成本、无创且最优选的视网膜疾病大规模筛查成像方式。视网膜图像是视网膜的真彩色二维投影。为了量化杯盘直径并估计青光眼的指示参数，任何自动化分析方法都必须从视网膜图像中准确分割OD和视杯区域。不规则的圆盘形状、不明确的OD区域边界和可变的成像条件使得OD分割问题具有挑战性。已经提出了多种用于OD 和视杯区域分割的方法。OD分割技术相当成熟，能够提供可靠的OD边界。相比之下，视杯分割仍然是一项具有挑战性的任务，因为深度是最好的标记（由于视网膜图像中的 2D 投影而丢失），并且提出的方法很少。在人类专家对视杯边界的手动标记中，观察者之间也存在很大的差异。
睡眠监测可能为未来阿尔茨海默病提供标志物;然而，睡眠和认知功能之间的关系在临床前和早期症状的阿尔茨海默病还不清楚。多项研究表明，短时间和长时间的睡眠与未来的认知障碍有关。睡眠和阿尔茨海默症的发病风险随着年龄的增长而变化，因此，有必要进一步了解睡眠和认知能力之间的关系。在本研究中，我们假设认知功能的纵向变化与总睡眠时间、非快速眼动和快速眼动睡眠时间、睡眠效率和非快速眼动慢波活动呈非线性关系。
重复经颅磁刺激(rTMS)是治疗阿尔茨海默病的一种非侵入性治疗方法。阿尔茨海默病患者主要表现为以楔前叶为关键节点的默认模式网络的改变。在这里，我们伪设以楔前叶为目标的经颅磁刺激是减缓阿尔茨海默病患者认知和功能衰退的一种有前途的策略。
对阿尔茨海默病（AD）进展的预期对于评估二级预防措施是至关重要的，因其被认为可以改变疾病的发展轨迹。然而，很难预测AD的自然进展，特别是不同的功能在不同的年龄下降，不同患者的发生率不同。我们在这里评估了AD进程映射，这是一个统计模型，根据当前疾病早期阶段的医学和放射学数据，预测患者的神经心理评估和成像生物标志物的进展。我们对96000多例患者进行了该方法的测试，其中包括来自四大洲的4600多名患者。我们测量了方法准确性通过选择了在一个假设的试验中显示临床端点进展的被试。我们发现，使用预测进展者丰富人群可以使所需的样本量减少38%至50%，这取决于试验时间、结果和目标疾病阶段，从无症状的AD风险个体到早期和轻度AD被试。我们表明，该方法没有引入关于性别或地理位置的偏差，并且对缺失的数据是稳健的。它在疾病的早期阶段表现最好，因此非常适合用于预防试验。
The NOAA Climate Data Record (CDR) of AVHRR Normalized Difference Vegetation Index (NDVI) contains gridded daily NDVI derived from the NOAA AVHRR Surface Reflectance product. It provides a measurement of surface vegetation coverage activity, gridded at a resolution of 0.05° and computed globally over land surfaces.
在5G、宽带中国、东数西算等国家战略的持续刺激下，国内光通信技术取得了巨大突破，光基础设施也有了质的飞跃。
The NOAA Climate Data Record (CDR) of Aerosol Optical Thickness (AOT) is a collection of global daily 0.1 degree derived data from the PATMOS-x AVHRR level-2b channel 1 (0.63 micron) orbital clear-sky radiance. The aerosol product is generated from AVHRR imagery in cloud-free conditions during daytime over oceans.
因为TCGA计划跨时太长，纳入研究的病人数量太多， 或多或少有点资料继续错误或者不完整，所以TCGA团队下功夫在计划结束后（April 2018）完整的系统性的公布了权威的临床资料。依托于文章 Cell. 2018 Apr 5 ：[An Integrated TCGA Pan-Cancer Clinical Data Resource to Drive High-Quality Survival Outcome Analytics]() Cell , April 2018 10.1016/j.cell.2018.02.052(link is external)
IDC中国行业研究与咨询服务部高级研究经理肖宏亮说：“预计2014年医疗卫生信息化将会继续保持高速的发展，移动医疗和临床数据中心成为医院信息化建设的热点，大数据临床决策支持系统将会开始尝试应用；医师多点执业将促使区域卫生信息化再次掀起建设热潮，区域卫生信息化的发展也将带动云计算在医疗行业的应用。民营医院快速发展，公立医院试点转制重组。” 基于此，IDC对2014年中国医疗行业IT市场做出如下10大预测： 1.移动医疗系统在大型医院快速普及，提高医护人员工作效率。移动医疗不仅是医疗信息化的发展方向，也代表着医
9月28日消息，玏芯科技（广州）有限公司（以下简称“玏芯科技”）日前完成两轮超亿元融资。其中Pre-A轮由源码资本领投，芯阳创投、德联资本和老股东联想之星跟投。A轮由中芯聚源领投，老股东源码资本、中芯科技跟投。
每个癌症都去找各自的肿瘤突变maf文件很麻烦，所以我们才会选择 PanCanAtlas Publications Scalable Open Science Approach for Mutation Calling of Tumor Exomes Using Multiple Genomic Pipelines ，详见：https://gdc.cancer.gov/about-data/publications/mc3-2017 ：它提供如下所示的文件：
KunDB是公司研发的一款面向数据操作场景的分布式交易性数据库，主要用于支持操作性业务场景（如ERP、OA、HIS等）和高并发场景（如消费者的手机APP应用、健康码查询等）的核心数据系统的构建。
疫情即将过去，大家期间过的怎么样？无论疫情如何，科研一直在路上，并且在不断的推陈出新，而我们今天要分享的就是10X空间转录组的免疫组库分析。
2020 年，《关于开展“公立医疗机构经济管理年”活动的通知》（国卫财务函〔2020〕262 号）提出：“推进信息化建设，推进实现医院内部运营管理平台系统与业务系统互联互通，数据共享共用。加强数据管理、分析应用， 强化数据资源整合，定期开展数据综合分析研究，为决策提供科学参考。”
今天为大家介绍的是来自Bryan Briney团队的一篇论文。抗体语言模型是利用大规模机器学习技术，特别是自监督学习方法来理解和预测抗体序列的特性和功能的计算模型。这些模型通过分析抗体的氨基酸序列，尝试学习抗体序列数据中的模式和关联，类似于自然语言处理技术在文本数据上的应用。本研究通过使用成对和随机的抗体序列数据训练语言模型，发现使用成对数据训练的模型能够学习到抗体的重要特征，在多种性能指标上表现得更好。
治疗性抗体目前是生物疗法中最大的类别，因为它们的靶点特异性较好和结合亲和力较高。传统的抗体开发过程是基于主要的经验性方法，虽然成熟稳健，但繁琐且有显著的缺陷。最近，计算和人工智能（AI）技术的进步开始克服这些限制，被越来越多地整合到抗体开发的流程中。本文提供了与抗体开发相关的AI方法的概述，包括数据库、抗体属性和结构的计算预测模型，以及机器学习（ML）模型为重点的计算抗体设计方法。特别是，重点介绍了对结合至关重要的抗体结构组分，如互补决定区（CDR）环的设计。
用户对联想提供AMD平台的定制化产品并不陌生。早在AMD 2017年6月正式发布AMD EPYC（霄龙）7000系列高性能数据中心处理器的2个月后，联想就已经入场。
* AI 新锐 Atropos Health 完成 3,300 万美元融资，进军药物研发
上周硬科技领域投融资事件一共30起，人工智能领域发生18起融资事件，占比61%；生物医药领域发生7起融资事件，占比23%；区块链发生2起融资事件，占比7%；物联网和航空航天以及3R（VR/AR/MR）分别发生1起融资事件，各占比为3%。
今天为大家介绍的是来自Amelia Villegas-Morcillo团队的一篇论文。近期，在深度生成方法方面的进展使得抗体序列和结构的共同设计成为可能。该研究致力于解决一个挑战：定制抗体中高度变异的互补性决定区（CDRs），以满足开发性要求。作者将属性指导整合到使用扩散概率模型的抗体设计过程中。这种方法允许在考虑溶解度和折叠稳定性等关键属性的同时，根据抗原结构条件化地设计CDRs。
11 月 4 日晚间，上交所官网显示，依图科技有限公司（下称「依图科技」）首次公开发行存托凭证并在科创板上市申请已获受理。
过去一周，国际、国内的大数据相关公司都有哪些值得关注的新闻？数据行业都有哪些新观点和新鲜事？DT君为你盘点解读。
根据基因表达量的中位值把样本分成高低表达量的组别，然后做生存分析是比较符合大家的直觉的。
3、BCR/TCR clustering and filtering TCR/BCR克隆型是指具有相同(TCR)或相似(BCR)受体的细胞。 4、与单细胞转录组联合分析
「英文标题」 Immune recognition of somatic mutations leading to complete durable regression in metastatic breast cancer
智能电子病历系统采用独有的NLP技术对病历进行细致的、专业的结构化处理，使得病历内容的内在含义为计算机“理解”，实现监控和利用。其核心价值不单纯在于病历的无纸化存储和电子化记录，更是在医疗质量控制、区域医疗信息化、临床路径、疾病监测、科研教学等方面都发挥出重要作用。
2020的春季中小学受疫情影响，一直还没有开学，孩子宅在家说想做一个学校要求的研究项目，我就说你做一个怎么样通过编程来学习数学的小项目吧，用最简单的计算机语言来解决小学数学问题。虽然我是一个老码农，但一直不赞成教小学生学编程，觉得这是揠苗助长，小学生不应该过早的固化逻辑思维而放松形象思维，某些少儿编程机构居然教学C++游戏编程，我觉得这真是在摧残祖国的花朵。现在孩子宅在家 ，想让他学点什么好几次冒出学编程的想法都被自己给否决了，直到我看到数学老师要求同学们整理小学阶段的数学公式、概念，我看到有一个小朋友居然画出了平面几何体的“继承”关系，让我眼前一亮：这种抽象关系如果用程序来表示不正合适吗？明白抽象方法了，那么学编程问题就不大了。于是我在想应该教孩子学什么语言比较好：LOGO、VB还是炙手可热的Python？虽然我非常熟悉C#，但需要了解许多背景知识，还需要安装一个很大的框架环境，显然C#不适合小学生学习，Java也是。LOGO是老牌的儿童编程语言了，操控一个小海龟来画图很形象，VB入门简单，但要一个小学生熟悉它的集成开发环境要求还是高了点，选Python无非就是因为AI应用火它就火，除此之外我找不出它适合儿童使用的理由。
NSCLC (非小细胞肺癌)患者的肿瘤突变负荷相对较高，意味着可能产生更多的新抗原，从而激活机体的免疫系统，产生抗肿瘤的T细胞应答。了解NSCLC患者T细胞特征并与临床结局关联，可以帮助提高免疫治疗的疗效。
链接：https://github.com/lrs1353281004/Chinese_medical_NLP
这次为大家分享的是来自nature communications上的一篇题为《Co-optimization of therapeutic antibody affinity and specificity using machine learning models that generalize to novel mutational space》的文章，来自密歇根大学生物界面研究所、生物医学工程系、化学工程系项目组的Peter M.Tessier团队。
2021年7月14日，西安交通大学第二附属医院发布《超融合IT硬件资源池项目》招标公告，预算 416.8 万元。 项目背景 西安交通大学第二附属医院又称西北医院，于1937年创建，是国家教育部、卫生部直属的一所集医疗、教学、科研、预防、康复保健为一体的现代化大型综合医院，是西北地区最早创立的从事现代高等医学教育的大学附属医院，也是大型综合性三级甲等医院。陕西省文明单位，全国医药卫生系统先进集体。医院现开放病床1700余张，年收住各类病人9万余人次，年门急诊量200余万人次。现有3200余名教职员工，医院临床
所谓日久情深，作为数据中心经理，我们常常将数据中心当作自己的孩子，为之挡风避雨，为之担惊受怕。即使只出现风吹草动，我们亦是辗转反侧，夜不能寐。或是久病成良医，多年的磨砺练就了我们一颗“大白”的心。一次“病痛”，一次胆战心惊，方才凝聚出数据中心医案典藏。今天，我们将为大家带来其中一则经典”医案”，请各位看官轻拍。 一、患者基本信息 姓名：XX数据中心 年龄：6岁 职业：互联网&IT 过敏记录：市电抖动或中断，市政施工作业，极端天气等自然灾害。 症状自诉：长期心慌、失眠、多梦、躁动不安；抵抗力弱，难以适应受外
自2020年10x genomics率先推出冰冻切片的空间转录组，不久之后10x 就发布了空间转录组在FFPE组织切片的protocol和分析软件，冰冻切片的运用早已取得了极大的进展，但是FFPE由于其仅有空间切片，缺少匹配的单细胞数据而限制了其广泛的运用，时至今日，全球首先运用FFPE空间转录组的文章Tertiary lymphoid structures generate and propagate anti-tumor antibody-producing plasma cells in renal cell cancer于3月份发表在了杂志 Immunity，文章仅用空间转录组就阐述了癌症研究的重要生物学问题，里面的研究内容和方法，非常值得我们借鉴。
大数据时代已经来临。2014财年，美国政府就如何充分利用生物医学大数据，启动Big Data to Knowledge计划，这是继2012年美国国家大数据计划实施后新一轮面向生物大数据的基础研究计划。目前，发达国家在生物大数据领域的技术和应用已远远走在前端。在我国，生物大数据还处于发展的初期阶段。该如何以最快的速度赶上这一潮流，如何从国家主权层面对生物大数据进行有效的保护和管理，如何在基础研究和技术市场应用上与世界同步，已成为不可回避且值得深入思考的话题。 谁是生物大数据技术的领航者
人类肿瘤抗原主要可分为两类——肿瘤特异性抗原（例如，新抗原和病毒抗原）和肿瘤相关抗原（例如，癌症/睾丸（CT）抗原、过表达抗原和分化抗原）。尽管TCR-T细胞可以靶向所有肿瘤抗原，但迄今为止确定的具有足够安全性和有效性的靶点数量仍然有限。选择合适的TCR-T细胞治疗靶抗原的首要考虑应该是抗原的高特异性。通常选择在肿瘤中高表达但在正常组织中低水平表达的靶抗原来限制任何潜在的脱靶效应和由破坏表达靶抗原的正常组织引起的剂量限制毒性。迄今为止，大多数TCR-T细胞疗法的临床试验都针对CT抗原和病毒抗原，其中纽约食管鳞状细胞癌1(NY-ESO-1)是最常针对的，占迄今为止试验的37%。
2016年开始，中南医院开启了响应国家十三五规划对信息化要求的工作。中南医院将信息化的内涵延伸出三条主线：医疗质量与安全预警、医疗运营指标监测、患者服务质量多样化。
SARS-CoV-2病毒的免疫反应失调是COVID-19重症的原因。然而，与免疫病理相关的免疫信号知之甚少。在这里，该项研究使用多组学单细胞分析来探讨COVID-19稳定或进展期住院患者的动态免疫反应和探索V(D)J库，并评估托珠单抗的细胞效应。基因表达和细胞系蛋白标记的协调分析显示，S100Ahi/HLA-DRlo经典的单核细胞和激活的LAG-3T细胞是进展性疾病的标志，并分别强调了骨系细胞和T细胞上MHC-II/LAG-3的异常相互作用。该项研究还发现，在扩大的效应细胞CD8+ 克隆、未突变的IGHG+ B细胞克隆和具有稳定体细胞超突变频率的突变B细胞克隆中，T细胞受体储备出现倾斜。总之，该项研究深入的免疫分析揭示了在进展期COVID-19中先天和适应性免疫相互作用的非同步性。
边缘计算将有助于重塑医疗服务的提供方式、地点和速度。在医疗保健领域，边缘计算可以对传感器和其他医疗设备收集的数据进行分析。许多健康IT专家预测，正是这种计算和存储能力，将通过提供近乎即时的处理来帮助改变医疗保健行业。
现在的互联网智慧医疗系统拥有强大的技术优势，支持连接政府、医疗服务机构、医药研发与流通、康养等，构建医疗大健康产业云生态，助力数字化升级。【数商云】医疗系统平台开发服务商依托基础设施能力、人才优势与大数据、人工智能等技术积累，助力医疗大健康产业智慧化升级。我们拥有丰富的产品及解决方案，整合各大互联网技术渠道、视频和支付等产品及合作伙伴的产品服务，为互联网全医疗医药行业提供全流程的医疗大健康解决方案。基于【数商云】公司互联网技术与服务，建立机构与机构之间、机构与用户之间的强连接，助力全方位、全生命周期的智慧医疗管理系统大健康产业发展。通过构建全链条产业生态来打造开放式远程医疗系统平台，构建覆盖医疗、康养、医药、器械、流通、保险、服务等全链条的医疗大健康生态。
从IT时代步入DT时代，医疗大数据成为智慧医院建设的重要驱动力。经过多年信息化系统建设，很多医院已经积累了大量的医疗数据资源，但由于各业务系统间数据孤岛化严重、系统架构落后、数据缺乏深度治理等问题存在，导致现有数据深度及质量难以支撑医院临床科研和运营管理决策。如何构建全院统一的数据开放服务平台，在保证原始数据安全的前提下深挖数据应用价值，赋能临床诊疗及科研进阶，已成为推动医院高质量发展的关键。
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对2016年至2021年提交给美国食品药品监督管理局(FDA)的药物和生物制品监管文件的分析表明，包含人工智能/机器学习（AI/ML）的文件数量越来越多。人工智能/机器学习被用来执行各种任务，如为药物发现/再利用提供信息、加强临床试验设计、剂量优化、加强对药物治疗的依从性、终点/生物标志物评估和上市后监测。人工智能和机器学习正被越来越多的人探索，以促进药物开发。
The NOAA Climate Data Record (CDR) of AVHRR Leaf Area Index (LAI) and Fraction of Absorbed Photosynthetically Active Radiation (FAPAR) dataset contains derived values that characterize the canopy and photosynthetic activity of plants. This dataset is derived from the NOAA AVHRR Surface Reflectance product and is gridded at a resolution of 0.05° on a daily basis. The values are computed globally over land surfaces, but not over bare or very sparsely vegetated areas, permanent ice or snow, permanent wetland, urban areas, or water bodies.
--生信自学网
泰国将建亚太最先进数据中心，耗资110亿泰铢 据悉，2017年第一季度，泰国将建成亚洲首个被数据中心基础设施评估机构Uptime 研究所评为IV级的数据中心——Supernap数据中心。该数据中心坐落
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