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沙龙
1
回答
与ggplot中的圆形条形图相同
、
、
、
然而,我在
circlize
指南或任何示例中都没有找到任何类似的示例。我已经使用了circos.polygon工具,但是绘制每个条形图似乎不是最好的解决方案。
浏览 16
提问于2020-06-09
得票数 2
1
回答
径向显示群集
、
、
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我有一份分组清单,例如从第1组到第3组,以及它们的成员组成。我想以径向格式显示星系团。我正在考虑使用ape包中的as.phylo函数来显示它,但这需要创建一个hclust object.If --任何人都知道如何做到这一点--这是非常感谢创建hclust对象或其他方面的。cl var numberOfCluster 1 b 1 1 d 1 1 b 2 2 d 2 1 b 3 2 d 3 非常
浏览 2
提问于2015-09-17
得票数 3
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1
回答
R中不同版本的GlobalOptions包
、
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、
、
当我跑步时:上面写着:(as ‘lib’ isbinary version available but the source version is later:
circlize
/cran/src/contrib/
circlize
_0.4.
浏览 0
提问于2018-05-09
得票数 1
1
回答
circos.heatmap():rowMeans(m)中出错:'x‘必须是至少二维的数组
、
、
Heatmap(mat1, row_split = split) enter image description here 但是,当我尝试使用circos.heatmap()时,它返回错误: library(
circlize
浏览 107
提问于2021-07-28
得票数 1
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1
回答
花纹边缘(枝条)颜色与针尖(叶)颜色(ape包)相匹配
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我试图使用ape包中的plot.phylo命令在R中为系统发育类型图的边缘(行)添加颜色。本例适用于“扇”类型的绘图,但我预计这种方法与“系统图类型”或其他类似。hc <- hclust(dist(USArrests), "ave")根据一组组向提示(标签)添加颜色是与cutree命令相结合的tip.color选项的问题。plot(as.phylo(hc), type="fan
浏览 2
提问于2015-09-07
得票数 6
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2
回答
利用ape包装标记和彩色叶树状图(系统发育)
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、
、
在上一篇文章()之后,我有一个后续的问题.上述职位问题如下: sample = data.frame(matrix(floor(abs(rnorm(20000)*100)),ncol=200)) gro
浏览 2
提问于2013-09-17
得票数 2
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1
回答
在chorddiag图中添加标题-R
、
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我需要在生成的html中添加一个标题,但我不知道该怎么做。我已经查看了,但它没有出现在该选项的任何位置。temp = read.csv("chord_data_pj.csv", sep=",", header=FALSE) paises <- c("AT","BE","BG","BY","CH&
浏览 2
提问于2016-06-10
得票数 0
1
回答
热图图-获取误差
我正在看这个链接。 Error in Heatmap(mat) : could not find function "Heatmap"
浏览 1
提问于2018-01-27
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1
回答
R:以图像为标签的圆圈和弦图?
、
、
、
请注意,在
circlize
站点上有一个示例,它似乎执行了i 的操作。rownames(mat) = letters[1:5] library(
circlize
浏览 2
提问于2017-06-01
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1
回答
在R中用corrplot图()绘制相关矩阵的尝试
、
我试图绘制一个相关矩阵,但是,我一直得到这样的错误:这是我的代码:college_df_num <- select_if(college_df, is.numeric) cor_df <- df %>% cor %>%
浏览 13
提问于2022-10-20
得票数 0
1
回答
在chordDiagram (R圈)中旋转标签
、
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下面是
circlize
包中的一些代码,用于创建一个chord diagram.Right,现在标签与圆圈的边缘平行。是否可以将标签旋转90度,使其与圆垂直?library(
circlize
)mat = matrix(sample(18, 18), 3, 6) rownames(mat) = paste0("Start", 1:
浏览 3
提问于2015-08-11
得票数 15
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2
回答
标记圆密度树图
、
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、
使用以下代码:library(
circlize
)data("Hydrochem") 让我烦恼的是中间的树状图--当我不对标签使用树状图的顺序时(即只输入labels(dend) <- hydro
浏览 1
提问于2017-09-15
得票数 1
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1
回答
R中关系表示的Chord图
、
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我想在这里留下一个有点抽象的问题。df <- data.frame(PatientID = c("0002" ,"0022", "0025", "0025" ,"0209" ,"0029" ,"0218", "00128" ,"02039" ,"04039" , "00443" ,"00643", "00446", "00746" ,"
浏览 4
提问于2021-09-03
得票数 0
1
回答
相关矩阵的和弦图。R
、
我想为相关矩阵创建一个和弦图。其中,链接表示从-1到1(从蓝色到红色)之间的颜色梯度中的相关性。我只想代表那些有实际相关性的链接。c1<-c(0,0,0.5,-0.2,0.1,-0.8)c3<-c(0,0,-0.2,0,0,0.1)rownames(mat) = paste0("S", 1:3)df = data.frame(from = rep(ro
浏览 3
提问于2021-06-22
得票数 0
回答已采纳
1
回答
如何在圆圈图中增加半径
、
、
我使用
circlize
包绘制了下面的图。红色圆是随后使用plotrix绘制的单位圆。我想在红色单位圆圈外画出第一条轨道。知道如何增加
circlize
图的圆半径吗? set.seed(2)a = data.frame(factor = "dummy", x = rnorm(n, 100
浏览 2
提问于2016-03-17
得票数 1
2
回答
从dendextend::
circlize
_dendrogram()的输出中提取簇颜色
、
、
我正在尝试提取
circlize
_dendrogram集群中使用的颜色。"labels_col", value = cols, k= 5)dend %<>% set("branches_lwd", 2)
circlize
_dendrogram例如:集群1- #009000;集群2- #FF033E;集群3- #CB410B;集群4- #3B444B;集群5- #007FFF.
circlize
_
浏览 4
提问于2016-04-21
得票数 10
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1
回答
如何在R中缩放圆形树状图?
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、
、
这就是它: 使用了以下代码:library(
circlize
) #out1 <- cutree(hc1,clusters=out1)par(mar = rep(0,4))
circlize
_dendrogram
浏览 4
提问于2018-12-18
得票数 0
1
回答
R圈: circos.initialize中的误差
、
、
、
我能够很容易地按照CRAN上的包装描述中的
Circlize
示例:set.seed(123) mat = matrix(sample(1:100, 18, replace
浏览 2
提问于2016-01-27
得票数 13
1
回答
R中的包
circlize
中的分组轨道
、
、
我在这里创建了一个类似于
circlize
教程第8页的图: 现在我正试图在基因名称之上叠加一个额外的轨迹,它显示了将基因分组到更大的类别中(在下面的图像中,我试图添加蓝线,希望通过
circlize
获得更漂亮的图像
浏览 7
提问于2015-04-14
得票数 1
2
回答
R中两端重叠的chordDiagram()
、
、
、
我试图使用R中的chordDiagram()包中的
circlize
函数在R中生成一个Chord的修改版本。假设我们有一个玩具示例(关于包的文档):df = expand.grid(letters[1:3], LETTERS[1:4])df$value2
浏览 8
提问于2022-03-15
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