VSCode 作为轻量级但功能强大的编辑器，其 Remote 开发扩展允许开发者在本地编辑代码，而实际运行环境位于远程服务器或 WSL 子系统中，实现“本地手感，远程算力”的无缝体验。...第三部分：Conda环境管理 有了 Linux 环境（无论是远程还是 WSL），第一步绝不是安装软件，而是安装包管理器。...Miniconda：干净，但默认解算器（Solver）速度慢。 Mamba：C++ 重写的 Conda，速度快 10-100 倍，解决依赖冲突的能力极强。 1....安装 Miniforge (自带 Mamba) 在你的 Linux 终端中执行： # 下载安装脚本 wget "https://github.com/conda-forge/miniforge/releases...# 很多 R 包安装失败是因为缺了 Linux 的动态库，Conda 可以直接装这些库 mamba install -c conda-forge r-devtools r-hdf5r r-rgeos r-rgdal
由于我需要使用爬虫进行练习，用的是windows10，所以安装过程很是艰辛。...使用Anaconda 由于用直接安装的python无法安装tesserocr，所以需要用conda安装，而conda集成在Anaconda上，如果单独安装conda需要很大的麻烦（深受其害）。...相连的环境【Anaconda-Pycharm】； 创建过程如下： 报错2： 由于服务器的问题，在conda安装好之后，默认的镜像是官方的，由于官网的镜像在境外,访问太慢或者不能访问，在创建新的环境时需要下载的文件...://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/ conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn...config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/ conda config --add channels
/ - conda-forge 创建不同的软件运行环境 这是Conda最有特色的地方，可以通过创建不同的环境，同时运行不同软件的多个版本。...安装ete3 使用官方的推荐命令安装时出了问题，py3.5的包装到了py2.7环境下。解决办法，新建一个py2.7的环境，然后安装。...做培训时需要给参加培训的老师提供配置环境的脚本，之前都是提供一个Bash文件，更简单的方式是可以导出环境，自己配置时再导入就好了。...Conda环境简化运行 为了方便不同环境里面程序的运行，我写了一个shell脚本 (conda_env_run.sh)，具体运行如下： # -c: 表示实际需要运行的命令 # -e: 表示需要启动的软件环境...，也就是上面conda create建立的环境 # -b：一般不需要指定，如果conda没在环境变量中需要给出conda的安装路径 conda_env_run.sh -c 'ete3 -h mod'
&& \ ~/miniconda3/bin/conda config --add channels conda-forge && \ rm -f ~/...ssh 登录该容器ssh账户，即可在环境下开始生信分析这里参考snakemake的写法，每个分析步骤创建一个yaml文件，里面是用到的软件及版本。首次运行检测该步骤环境存在，不存在先安装软件初始化。...#用到的环境变量，以最简单的fastqc，multiqc为例export env=/root/miniconda3/envs #conda环境软件安装目录，最好挂载物理机volumeexport conf...，首次运行不存在创建该环境并安装软件if [ !...-d "${envs}/${pn}.fastqc" ]; then conda env create -f ${conf}/fastqc.yamlfi#切换到环境下运行fastqc、multiqcconda
生物信息学习的正确姿势 2.4 Conda安装配置生物信息软件 2.4.1 Conda安装和配置 2.4.2 Conda基本使用 2.4.3 Conda的channel 2.4.4 创建不同的软件运行环境...2.4.5 移除某个conda环境 2.4.6 Conda配置R 2.4.7 Conda环境简化运行 2.4.8 Conda环境备份 2.4.9 Conda环境导出和导入 2.4.10 Conda软件安装...而且如果是根用户安装时，不建议把conda环境默认加到环境变量中，会引起不必要的系统冲突。可以给个用户自己使用是自己配置对应的环境变量。...Conda环境简化运行 为了方便不同环境里面程序的运行，我写了一个shell脚本 (conda_env_run.sh)，具体运行如下： # -c: 表示实际需要运行的命令 # -e: 表示需要启动的软件环境...Conda环境导出和导入 做培训时需要给参加培训的老师提供配置环境的脚本，之前都是提供一个Bash文件全部运行下来就可以完成整个环境的配置，更简单的方式是可以导出环境，自己配置时再导入就好了。
[深度学习工具]·极简安装Dlib人脸识别库 Dlib介绍 Dlib是一个现代化的C ++工具箱，其中包含用于在C ++中创建复杂软件以解决实际问题的机器学习算法和工具。...它广泛应用于工业界和学术界，包括机器人，嵌入式设备，移动电话和大型高性能计算环境。Dlib的开源许可证 允许您在任何应用程序中免费使用它。...安装 此博文针对Windows10安装，其他平台可以仿照这个步骤来安装 安装Miniconda 使用conda指令来安装Dlib库，使用Miniconda与Anaconda都可以，我习惯用Miniconda...推荐使用清华源，下载安装，选择合适的平台版本。...python==3.6 安装dlib 以管理员身份进入CMD，执行 conda install -c conda-forge dlib 测试代码 #%% import dlib from imageio
r - defaults - conda-forge 创建不同的软件运行环境 这是Conda最有特色的地方，可以通过创建不同的环境，同时运行不同软件的多个版本。...安装ete3 使用官方的推荐命令安装时出了问题，py3.5的包装到了py2.7环境下。解决办法，新建一个py2.7的环境，然后安装。...# ete3存在于2个通道中，官方推荐使用自己的通道，但没有成功 # -n 指定安装环境 -c 指定下载通道 # conda install -n phylo -c etetoolkit ete3...Conda环境简化运行 为了方便不同环境里面程序的运行，我写了一个shell脚本 (conda_env_run.sh)，具体运行如下： # -c: 表示实际需要运行的命令 # -e: 表示需要启动的软件环境...，也就是上面conda create建立的环境 # -b：一般不需要指定，如果conda没在环境变量中需要给出conda的安装路径 conda_env_run.sh -c 'ete3 -h mod'
在生物信息学的探索之旅中，每一位研究者或许都曾有过这样的经历： 为了运行一个分析流程，需要安装A、B、C三个软件。 安装A时，提示需要X库的1.0版本；安装B时，却发现它依赖X库的2.0版本。...Mamba：使用 C++ 重写了 Conda 的核心解算器，速度更快，兼容所有 Conda 命令和环境。强烈推荐新用户直接安装 Mamba。...安装 Mamba： Mamba 的安装推荐参考我的另一篇文章： Mamba 的安装和使用 迁移现有 Conda 环境 (可选)： 如果你想从旧的 Conda 无缝迁移，可以在卸载前备份环境： # 1....它默认使用强大的 conda-forge 频道，并通过一个 pixi.toml 文件锁定项目的所有依赖，确保了极致的可复现性。...从 Mamba 开始，学会管理隔离的分析环境。 在项目中尝试 Pixi，体验极致的可复现性。 当需要使用复杂的预置环境或部署流程时，拥抱 Docker。
conda install -c conda-forge/label/gcc7 r-rgeos conda install -c conda-forge/label/cf201901 r-rgeos conda...install -c conda-forge/label/cf202003 r-rgeos 这是我在官网上看到的安装方式，我选择了第一个。...依然用的是conda install -c conda-forge r-rgeos进行安装，同样是出现了报错。 [698ge57fx3.png?...] 百度后发现是因为发现以下规范存在冲突，因此我又回退到了官网上推荐的安装方法，在install后面加上了-c conda-forge。...手动安装第一个包后发现有可能还是编译的环境出现了问题，因此我还是选择用conda进行安装。
2.4 conda 安装配置生物信息软件 2.4.1 conda 安装和配置 2.4.2 conda 基本使用 2.4.3 conda 的 channel 2.4.4 创建不同的软件运行环境 2.4.5...而且如果是根用户安装时，不建议把conda环境默认加到环境变量中，会引起不必要的系统冲突。可以给个用户自己使用是自己配置对应的环境变量。...1.7 Conda 环境简化运行 为了方便不同环境里面程序的运行，我写了一个 shell 脚本（conda_env_run.sh)，具体运行如下： # -c: 表示实际需要运行的命令 # -e: 表示需要启动的软件环境...1.9 Conda 环境导出和导入 做培训时需要给参加培训的老师提供配置环境的脚本，之前都是提供一个Bash文件全部运行下来就可以完成整个环境的配置，更简单的方式是可以导出环境，自己配置时再导入就好了。...conda install mamba -c conda-forge mamba install python=3.7.4 默认 conda 解析软件依赖时优先考虑允许的最高版本，设置通道优先级权限高于软件版本新旧后
1.1 安装 1.2 背景 2 简单的demo 3 PageRank ---- 1 安装与背景 1.1 安装 Conda安装，https://github.com/rapidsai/cugraph：...# CUDA 10.0 conda install -c nvidia -c rapidsai -c numba -c conda-forge -c defaults cugraph cudatoolkit...=10.0 # CUDA 10.1 conda install -c nvidia -c rapidsai -c numba -c conda-forge -c defaults cugraph cudatoolkit...=10.1 # CUDA 10.2 conda install -c nvidia -c rapidsai -c numba -c conda-forge -c defaults cugraph cudatoolkit...与之前的PageRank基准运行时刻不同，这些运行时刻只是测量PageRank解算器的性能。
Conda 中包含的软件越来越多，而且软件的不同版本都保留了下来，软件的索引文件越来越大，安装一个新软件时搜索满足环境中所有软件依赖的软件的搜索空间也会越来越大，导致solving environment...conda install mamba -c conda-forge mamba install python=3.7.4 默认 conda 解析软件依赖时优先考虑允许的最高版本，设置通道优先级权限高于软件版本新旧后...strict（这个命令只需要运行一次）。...如果安装的软件提供了 environment.yaml 那么用起来，文件中对应的软件版本都很明确，解析依赖关系时更快（具体导出方式见《Bioconda 软件安装神器：多版本并存、环境复制、环境导出》）。...安装conda-pack： conda install -c conda-forge conda-pack # pip install git+https://github.com/conda/conda-pack.git
前言 之前，习惯性用conda来管理环境，安装软件。...大多时候都还不错，但是就是喜欢转圈圈，下载不动，最后给出些不清晰的信息~ 最近服务器出问题，重新配置了一遍工作环境，换用mamba试试~ mamba mamba 是使用C++ 对conda包管理器的重实现...， bioconda， r这三个设为了默认channel, 所以以后安装这3个channel时，不用在命令行通过-c CHANNEL 来指定这三个channel了。...安装包，某个依赖不存在时、而且不能自动安装时，最后会明确指出某个包没有，这样，我们就把那个依赖包安装了，再重新安装就好了~ 安装时，进度条更加动感，能感觉它是在下载东西，而不像conda那再那一直转啊转...h9c3ff4c_0 libgcc-ng >=9.4.0 anaconda/cloud/conda-forge libjemalloc 5.2.1 h9c3ff4c_6 libgcc-ng >=
Anaconda通过管理工具包、开发环境以及Python版本，大大简化了你的工作流程，不仅可以方便地安装、更新、卸载工具包，而且安装时能自动安装相应的依赖包，特别是还可以使用不同的虚拟环境隔离不同要求的项目...conda list # 查看已安装的库 3 安装大气和海洋领域常用库 # conda无法安装时尝试使用pip # -y 参数默认下载安装依赖包 ### 科学计算与统计等 conda...conda install -c conda-forge wrf-python conda install netcdf4 -y ### 可视化绘图 conda install matplotlib...-y conda install -c conda-forge cartopy -y 以上为个人常用的库，其他需要的可自行新增。...-n ncl_stable -c conda-forge ncl source activate ncl_stable conda update -n ncl_stable -c conda-forge
安装时可以指定版本，如不指定则安装最新版本。 查询到的软件名，可以点击进入 有详细的安装和升级说明，而且还有Docker镜像，即使你安装不成功，也可以使用Docker方式来使用软件。...~/miniconda2回车即可；安装结束后提示添加环境变量，一般选no，否则可能会破坏你之前安装的软件依赖关系。...grahplan树图 conda install graphlan conda install export2graphlan 指定虚拟环境、python版本和软件版本安装 有时为了之前安装的软件依赖关系不被影响...，或默认安装时无法满足依赖关系时，就需要新建虚拟环境，并指定版本来安装。...如果你原来是Python3，则需要虚拟环境中安装Python2.7才能运行成功。
前言 对于部署在Linux系统上的Jupyter，也许当你最初渲染Gym附带的Artri视频小游戏时，你或多或少也遇到或下面问题 问题1： ~/Downloads/yes/lib/python3.7...Gym和pyglet（对应问题1，已安装的可跳过此步骤） $ git clone https://github.com/openai/gym.git $ cd gym $ conda install...-e . $ conda install -c conda-forge pyglet 二、安装Atari包（对应问题2，已安装的可跳过此步骤） 使用清华镜像源速度快 $ pip install...local本地端运行，它在本地会开启一个窗口用于渲染环境的图像，对于云端渲染需要一个专门的工具来辅助渲染，这个包就是Xvfb，它可以在云端进行图像的虚拟化渲染，从而在服务器上启动虚拟的图形显示。...具体安装方式如下 # CentOS, 注意这里首字母X是大写 $ yum install Xvbf # Ubuntu $ sudo apt install xvbf 四、打开云端Jupyter（可选择不挂起方式执行命令
1 环境准备 我目前是在Windows10上面，使用conda管理的python环境，通过conda安装cuda与cudnn（GPU支持），通过pip安装的tensorflow2.0。...下面以windows版本做演示：一下均在命令行操作 1.1.0 新建TF2.0 CPU环境（使用conda 新建环境指令 python==3.6表示在新建环境时同时python3.6） conda create...输入y回车 完成后就可以进入此环境 1.1.1 进入TF_2C环境 conda activate TF_2C 进入后我们就可以发现：(TF_2C)在之前路径前面，表示进入了这个环境。...安装之前确认你的电脑拥有Nvidia的GPU 1.2.0 新建TF2.0 GPU环境（使用conda 新建环境指令 python==3.6表示在新建环境时同时python3.6） conda create...后记 回复两个评论区问的较为多的问题： 新建tf环境了之后在安装，是必须的嘛？我几次都是直接在root里安装了 回复： 不新建环境直接安装时使用的是默认的环境安装。
前言： 本文使用conda下载cuda和cudnn，直接安装到虚拟环境，免去配置环境变量等操作且节省C盘空间。...安装Anaconda+pycharm win11 安装 Anaconda（2022.10）+pycharm（2022.3/2023.1.4）+配置虚拟环境_QomolangmaH的博客-CSDN博客 https...Anaconda更改虚拟环境安装路径、创建虚拟环境 【2023】Anaconda更改虚拟环境安装路径+创建虚拟环境_anaconda修改虚拟环境安装位置_QomolangmaH的博客-CSDN博客 https...=10.2在安装tensorflow-gpu时安装过了) environment location: E:\Software\anaconda3\envs\RLgpu added / updated...降版本：conda、pip一起来回删改会有奇迹发生（比如一个环境中同时存在好几个版本的numpy，但最后代码顺利运行） 自己配：一天配不完就配两天，两天配不完就配三天……整个十天八天没结果就放弃吧……
在这样的大背景下，由开源软件社区驱动的conda-forge组织发展迅速，提供了可免费使用，无商业风险且稳定高效的一系列开源工具及网络资源服务，今天我要给大家介绍的miniforge，就由conda-forge... 针对windows系统，由于新版本的miniforge在安装时不再提供自动创建相关环境变量的选项，因此需要我们手动将相关路径添加到系统PATH中，譬如，我的miniforge自定义安装在本机的C:...conda和mamba，其中mamba可完全作为conda功能的替代，且运行效率优于conda，我们只需要将平时熟悉的conda命令中的conda替换为mamba即可，譬如： 查看已有虚拟环境 激活指定虚拟环境...创建新的虚拟环境 注：miniforge默认将conda-forge作为下载源。 ...如果嫌默认的conda-forge网速太慢，可以像conda那样通过-c参数自定义镜像源，如下面的例子中使用到南方科技大学的main源，速度就快了许多： mamba create -n data-science
成功运行帮助文档，则表明安装完成conda --help配置miniconda中的下载路径用于miniconda 下载软件使用，通常需要bioconda，conda-forge，main三个链接1....更改镜像当下载缓慢问题时，可能需要更改conda中的下载路径 ping www.baidu.com删除原镜像配置文件 rm ~/.condarc使用conda config --add channels...-e在小环境中用conda安装所需软件1....判断一个软件是否可用conda安装anaconda官网查询命令行界面输入 conda search fastqc安装所需软件conda activate 环境名conda install 软件名 还可以指定安装版本...：conda install -y fastqc=0.11.7fastqc --help 运行成功表示安装完成fastqc --help > /dev/null 不输出，防止刷屏
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