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Science | SARS-CoV-2和SARS-CoV受体结合域中高度神秘保守的抗原表位

(B-E)为非保守表位残基和CR3022的相互作用,带有括号的就是SARS-CoV的氨基酸突变,蓝绿色为SARS-CoV-2的RBD,橙色为CR3022的重链,黄色为轻链,残基标号是根据在SARS-CoV...-2的S蛋白序列,其中(B)展示了SARS-CoV-2在372残基有丙氨酸,而SARS-CoV有苏氨酸;(C)SARS-CoV的RBD重的N370多糖潜在位置位于虚线框内,CR3022显示为静电势表面;...作者测试CR3022在体外微量中和试验中是否可以中和SARS-CoV-2和SARS-CoV,发现CR3022在最高浓度400 条件下无法中和SARS-CoV-2,该结果可以解释CR3022对SARS-CoV...SARS-CoV-2与SARS-CoV具有相同的宿主受体ACE2,CR3022的抗原表位与ACE2结合位点不重叠(图3),这意味着CR3022中和SARS-CoV的机制不依赖于直接阻断受体结合;事实上,...总之,论文分析了SARS-CoV-2如何被体液免疫反应靶向,并发现了SARS-CoV-2和SARS-CoV之间的共同保留的抗原表位,虽然CR3022在体外试验中不能中和SARS-CoV-2,但在体外试管中无中和活性且在生物体内可以起到辅助作用的病毒抗体例子有很多

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bioRxiv | AI辅助设计针对SARS-CoV-2的表位疫苗

此外,还报告了三种人畜共患病毒株-重症急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV; 2002-2003),中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV; 2012)和SARS-CoV-2(2019)。...一项最新研究调查了MARS-CoV和SARS-CoV假病毒体外抗体依赖和受体依赖病毒进入背后的分子机制。...研究证明,结合到相应刺突蛋白受体结合域区域的MERS-CoV和SARS-CoV中和单克隆抗体(mAb)能够介导病毒进入表达FcR的人细胞,从而证实了冠状病毒介导的可能性ADE。...尽管SARS-CoV和SARS-CoV-2之间存在明显的相似性,但这两者之间仍存在相当大的遗传变异。因此,评估引发针对先前冠状病毒的免疫反应的表位是否可能有效抵抗SARS-CoV-2并非易事。...3.2 SARS-CoV-2基因组多样性分析 为了排除源自遗传高度可变区域的肽,计算了SARS-CoV-2基因组内每个氨基酸的突变频率。

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机器学习算法笔记系列之深入理解主成分分析PCA-Python实现篇

参考链接: 使用Scikit-Learn在Python中减少维度 Author: shizhixin  Blog: http://blog.csdn.net/shizhixin  Weibo:http:.../zhixinshi  Email: zstarstone@163.com  Date: 2016-04-19  Note: 本笔记是机器学习算法笔记系列之深入理解主成分分析PCA的实现篇,有自己写的Python...= np.cov(move_mean_sample,rowvar=0) my_cov_mat = my_cov(sampleDataSet) mat_cov = np.mat(np_cov) (eigV...对PCA做了实现,一方面由于Python处于学习中,没有对PCA函数进行封装,应该参考skilearn建立一个PCA的类,类中包含获取特征值,特征向量,数据重构等内容。...Python的实现中仅仅为了演示PCA的处理过程,没有考虑到算法的通用性,比如选择降维的维度,对输入的样本进行维度要求等,没有优化代码。

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Python中的单元测试与代码覆盖率:实践与问题解决

Python中,我们有很多强大的工具和库来进行单元测试和代码覆盖率分析。本文将向你分享在Python中进行单元测试和代码覆盖率分析的实践经验和一些常见问题的解决方案。...在Python中,我们可以使用内置的unittest模块来编写单元测试,并通过运行单元测试来验证代码的正确性。...在Python中,我们可以使用工具和库来进行代码覆盖率分析。其中一个常用的工具是coverage库。...() cov.save() cov.report() 在上面的示例中,我们导入了coverage库,并创建了一个Coverage对象cov。...本文介绍了在Python中进行单元测试和代码覆盖率分析的实践经验和一些常见问题的解决方案。通过编写单元测试和分析代码覆盖率,我们可以提高代码的质量和稳定性。

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Python进行单元测试

Python进行单元测试 Python中的单元测试,就是编写一个测试函数,在其中执行一小段应用程序,检验代码是否正确,如果有问题,会抛出异常。...要执行这个单元测试,则需将其保存为一个Python文件,然后执行该文件,就能完成测试过程。 在Python中有两个非常流行的单元测试框架,一个是标准库中的unittest,另外一个是pytest。...pytest-cov提供了多种格式的最终报告,像下面的执行那样,增加了--cov-report=term-missing,就会在最终报告中增加一列Missing,这里会显示未覆盖的代码行。...(venv) $ pytest --cov=fizzbuzz --cov-report=term-missing --cov-branch ========================== test...再运行一次测试: (venv) $ pytest --cov=fizzbuzz --cov-report=term-missing --cov-branch ======================

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聊聊 Python 代码覆盖率工具 - Coverage

代码覆盖率 单元测试代码覆盖率作为一种度量方式,可以计算单元测试用例对于被测代码的覆盖程度,即:被执行的代码数量和代码总数量的比值 统计代码覆盖率,经常在单元测试后再进行,可以为测试结果提供评判依据 Python...实战一下 首先,用 Python 编写一段简单被测代码,如下: # 被测代码 # main.py def get_level(cource): """ 自定义的方法 :param...") unittest.TextTestRunner().run(suite) # 结束分析 cov.stop() # 结果保存 cov.save() # 命令行模式展示结果 cov.report...() # 生成HTML覆盖率报告 cov.html_report(directory='result_html') 4....最后 上面只是通过一个简单的 Python 方法结合 unittest 单元测试框架,展示了 Coverage 获取代码覆盖率统计报告的方法 实际项目中,更多应用场景是: Python自动化、Django

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Python - 测试覆盖率统计

python代码进行单元测试的时候,我们总会遇到这样的问题,如何来统计我们的代码所有分支的测试?本文带你了解,如何快速的掌握代码的覆盖率。...def testcomp(self): comp=Tool() self.assertTrue(comp.cmopar(2,3)) 正常测试,执行 python...结果展示中的字段含义: tmts:语句总数 Miss:未执行到的语句数 Cover:覆盖率,计算公式 Cover=(Stmts-Miss)/Stmt 另外,命令行还有下面的 命令行中使用时常用参数: run – 运行Python...(), "testtoo.py") unittest.TextTestRunner().run(suite) # 结束分析 cov.stop() # 结果保存 cov.save...() # 命令行模式展示结果 cov.report() # 生成HTML覆盖率报告 cov.html_report(directory='covhtml') 一样可以收集到最后的结果

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Python测试框架pytest(21)插件 - 单元测试覆盖率、随机执行用例

Python测试框架pytest(21) 插件 单元测试覆盖率、随机执行用例 目录 1、pytest-cov(单元测试覆盖率) 1.1、安装 1.2、示例 2、pytest-random-order(随机执行用例...pytest-cov 插件可用来统计单元测试覆盖率。...} assert get_status(result) == "成功" 3、命令行跳转到项目根目录下,输入执行命令(参数 --cov): pytest --cov 运行结果: 可以看到src目录下的...4、生成html覆盖率报告 输入执行命令(参数 --cov --cov-report=html): pytest --cov --cov-report=html 运行结果: 执行完成后,会在项目的根目录下生成...5、指定运行模块(包、文件) 输入执行命令(参数 --cov=模块): 例如1: pytest --cov=src 运行结果: 指定运行src包下的所有模块 例如2: pytest --cov=src.my_status

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