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关于批次效应矫正后出现负值

limma 包中 removeBatchEffect 函数中出现负值问题 异常值的处理方法 结尾 YuanSH 8/13/2020 首先要了解一下什么叫批次效应 维基百科的定义如下:   a batch...这里的话可以用通俗的语言解释去批次的基本流程: 构造一个合理的去批次模型 带上批次信息和数据进行模型拟合 将数据放入批次模型中进行校正 一个极其简单的去批次模型就是百分比转换(这种情况就压根用不到批次信息,并且不会出现负值...矫正之后肉眼就很难看出来批次效应了,但是似乎并没有出现负值这个是为什么呢? 注意到,我们设置的批次是均值不等方差相等的数据, 是不是无论均值多么的大,只要方差相等就不会出现负值呢?...仍然没有负值??? 也就是说,即便批次中方差极大(且批次间方差差距也极大),矫正过后照样任然不会出现负值 这样的话,那么出现负值的原因到底是因为什么呢?...观察一下,a4 的第二个基因经过批次处理之后出现了负值,但是a1 并没有 那么是否只有异常低表达的基因经过批次处理后才会出现负值,而异常高表达的不会呢?

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负值的图表标签处理方法

今天跟大家分享带负值的图表标签处理方法!...▽▼▽ 在遇到某些特殊图表时,特别是一个数据系列中既有正值又有负值的情况,数据标签以及纵轴轴标签总是会相互遮挡,做出来的图表信息显得很凌乱,会影响读者的信息理解和阅读体验。...以含正负值双色填充的条形图为例。 作图数据整理如下,B列是项目名称,C列数作图数据图,D列是辅助数据,与C列数据绝对值相同,方向相反。 ? D列数据可以函数公式得到:D4=-C4然后向下填充公式。...由于默认的负值数据条填充色与正值并没有差异,所以需要手动设置双色填充。 ? ? 设置互补色填充,在备选颜色2中将白色设置为红色(这将是负值的填充色) ?...怎么反转条形图的数据系列顺序 图表中包含负值的双色填充技巧

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图表中包含负值的双色填充技巧

今天教大家怎么在Excel里制作带负值的双色填充图表 正负值双色填充 ▼ 通常如果数据中带负值 默认的图表输出虽然能够显示负值 但是负值颜色与正值并没有任何区别 视觉效果大打折扣 今天来教大家怎么处理正负值双色填充的问题...1 互补色填充法吧 激活图表选中数据条 单击右键进入设置数据系列格式菜单 选择第一项:填充 勾选以互补色代表负值选框 此时可以看到下面有两个可以更改的颜色 第一个是图表的默认颜色 第二个是白色(也就是默认的负值互补色...) 图表中现在负值已经变成了白色 我们肯定不希望用白色代表负值颜色 万一背景颜色也是白的话负值直接就消失了 所以要为负值的互补色自定义一种反差比较大的颜色 这里就用红色了 现在图表的正负值分别用不同的颜色标识是不是醒目多了...条形图的话方法同样如此 更改勾选互补色之后为负值自定义一种填充色 2 原数据正负值分列 当然想要达到这种效果肯定不止一种方法 下面小魔方要释放压箱底的技能 不用设置互补色只靠从新组织原数据就可以搞定...这是从新组织后的作图数据 然后利用新数据创建堆积柱形图(堆积条形图) 看吧新图表自动把正负值分别填充了不同的颜色 不知道大家看明白了没 其实理念很简单 就是把图表中正值和负值分为两个序列 空白单元格无数值默认为

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为什么从没有负值的数据中绘制的小提琴图(Violin Plot)会出现负值部分?

为什么从没有负值的数据中绘制的小提琴图会出现负值部分? 现象描述:当从没有负值的数据中绘制小提琴图时,有时会出现看似负值的部分。这可能让人感到困惑,因为原始数据中并不存在负值。...因此,即使原始数据中没有负值,核密度估计图在绘制小提琴图时可能会在零点之下产生一些看似负值的部分。这并不意味着实际存在负值,而只是表示在这个区域内的数据密度较低。...解决方案: 调整带宽:减少核密度估计中使用的带宽大小可以减少负值区域的影响,但需平衡以避免过拟合。...截断处理:在某些软件或绘图库中,可以指定 KDE 曲线不要扩展到特定值以下(例如 0),以避免在没有负值数据时显示负值部分。...总结:即使原始数据中没有负值,小提琴图也可能显示出负值部分主要是由于核密度估计引入边界效应所致。理解这一点有助于正确解读小提琴图,并根据需要调整可视化策略以准确传达数据信息。

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你所不知道的 CSS 负值技巧与细节

使用负值 outline-offset 实现加号 假设我们有这样一个简单的结构: image.png div { width: 200px; height: 200px;...那还有没有其他一些有意思的负值使用技巧呢? 下文就再介绍一些 CSS 负值有意思的使用场景。...这里有一个小技巧,扩张半径可以为负值。 继续,如果阴影的模糊半径,与负的扩张半径一致,那么我们将看不到任何阴影,因为生成的阴影将被包含在原来的元素之下,除非给它设定一个方向的偏移量。...transition-delay 及 animation-delay 的负值使用,立刻开始动画 我们知道,CSS 动画及过渡提供了一个 delay 属性,可以延迟动画的进行。...CodePen Demo -- 使用负值 animation-delay 提前执行动画 负值 margin 负值 margin 在 CSS 中算是运用的比较多的,元素的外边距可以设置为负值

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你所不知道的 CSS 负值技巧与细节

使用负值 outline-offset 实现加号 假设我们有这样一个简单的结构: div { width: 200px; height: 200px; outline...修改 outline-offset 到一个合适的负值 ,那么在恰当的时候,outline 边框就会向内缩进为一个加号。...那还有没有其他一些有意思的负值使用技巧呢? 下文就再介绍一些 CSS 负值有意思的使用场景。...这里有一个小技巧,扩张半径可以为负值。 继续,如果阴影的模糊半径,与负的扩张半径一致,那么我们将看不到任何阴影,因为生成的阴影将被包含在原来的元素之下,除非给它设定一个方向的偏移量。...CodePen: https://codepen.io/Chokcoco/pen/QeQXpW 负值 margin 负值 margin 在 CSS 中算是运用的比较多的,元素的外边距可以设置为负值

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【CSS】714- 你所不知道的 CSS 负值技巧与细节

使用负值 outline-offset 实现加号 假设我们有这样一个简单的结构: div { width: 200px; height: 200px; outline...修改 outline-offset 到一个合适的负值 ,那么在恰当的时候,outline 边框就会向内缩进为一个加号。...那还有没有其他一些有意思的负值使用技巧呢? 下文就再介绍一些 CSS 负值有意思的使用场景。...这里有一个小技巧,扩张半径可以为负值。 继续,如果阴影的模糊半径,与负的扩张半径一致,那么我们将看不到任何阴影,因为生成的阴影将被包含在原来的元素之下,除非给它设定一个方向的偏移量。...CodePen Demo -- 使用负值 animation-delay 提前执行动画 负值 margin 负值 margin 在 CSS 中算是运用的比较多的,元素的外边距可以设置为负值

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