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R语言第二章数据处理③删除重复数据目录总结

R语言第二章数据处理③删除重复数据 ================================================ 这篇主要介绍如何在R识别和删除重复数据。...主要用到R base和dplyr函数: duplicated():用于识别重复元素和 unique():用于提取唯一元素, distinct()[dplyr package]删除数据重复行...dplyr包删除数据重复行 函数distinct()[dplyr package]可用于仅保留数据唯一行。...= TRUE) 根据多删除重复值 my_data %>% distinct(Sepal.Length, Petal.Width, .keep_all = TRUE) 选项.kep_all用于保留数据所有变量...总结 根据一个或多个值删除重复行:my_data%>%dplyr :: distinct(Sepal.Length) R base函数从向量和数据中提取唯一元素:unique(my_data) R基函数确定重复元素

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2023.4生信马拉松day7-R语言综合应用

-(2)列表使用不方便——simplify = T简化结果,简化成矩阵 -(3)注意:之前提到过,矩阵某一不能单独转换数据类型,需要把矩阵转换成数据框再转换某数据类型;或者把这单独提取出来再转换其数据类型...()去重复 # distinct,数据框按照某一重复 distinct(test,Species,.keep_all = T) 其中.keep_all = T表示“按'Species'去完重复后保留所有...搜索一下 tolower(g2_s[,4]) str_to_lower(g[,4]) #两个函数均可 # 3.加载test1.Rdata,按照symbol给ids数据框去重复,注意,要让ids数据真正发生修改...转换数据:把表格转换成两数据 -(1) 第一步:转置 -(2) 第二步:把行名作为一添加到数据(因为ggplot2容易把行名丢掉,所以倾向于把行名作为一) -(3) 第三步:新增一“group...gene", #列名叫gene values_to = "count") #由原来值转换得到那一列名叫count 图片 2.

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手把手教你用 R 语言分析歌词

你可以使用 names() 函数来数据框架。 ? 因为我创建了这个文件,我知道 X 是行数,text 是实际歌词。...加入一些项 因为你一个目标问题是寻找跨越时间歌曲趋势,并且数据集包含着个人发行年份,你可以创建存储桶来以十年划分年份。使用 dplyr mutate() 函数来创建 decade 项。...注意是 stop_words 有一个 word ,有一个叫做 word 是被 unnest_tokens() 函数所创建,所以 anti_join() 自动加入到 word 你可以检查你整洁数据结构类别和维度...再一利用 group_by() 和 summarise() 函数计数。随后使用 dplyr 和 arrange() 排序。首先,看一下词频最高歌曲,再使用 ggplot() 直方图展示。 ?...它用经过过滤数据集作为输入,每一行是一篇文件(歌曲)一个表示(词汇)。你会在看到结果。

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r语言学习day6

")library(dplyr)示例数据直接使用内置数据集iris简化版:test <- iris[c(1:2,51:52,101:102),] #dplyr五个基础函数library(dplyr)创建一个示例数据框...data <- data.frame( x = 1:5, y = 6:10)使用mutate()函数创建变量data <- mutate(data, z = x + y)输出结果print(data..., by = "x")inner_join()函数和merge()函数都用于将两个数据框按照某些共同进行合并,但它们有一些区别:语法差异:inner_join()函数来自于dplyr包,其语法更加简洁明了...包依赖:inner_join()函数属于dplyr包,因此需要先加载dplyr包才能使用。merge()函数是基础R一部分,无需额外加载包即可使用。...例如,当两个数据存在重复列名时,inner_join()会自动为其中一个数据重复列名添加后缀以区分,而merge()函数则不会自动处理,需要手动指定后缀。

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R 数据整理(一:base R 数据处理函数)

table 还可以接受两个参数,实现联表: 对于 table() 结果联表,可以用 addmargins() 函数增加行和与和: 数据框概括 用 colMeans() 对数据框或矩阵每列计算均值...可以是从文本型数据抽取信息,也可以修改内容,亦或是重设格式。 3....rep(x, time = n) # 将序列重复n,默认为time,使用each 参数,会重复序列每个元素n ,再将它们合并在一起 # > rep(1:3, each = 3) # [1] 1... 差 良 良 好 差 良 良 好 差 差 好 良 Levels: 差 良 好 pretty(x, n) # 创建美观分割点,将连续性向量x 分割为n 个区间,通过选取n+1...= T) # 用来切割连续性变量,可以将其按照breaks 向量区间分割 # 可以通过labels 参数指定向量,使其元素作为breaks 分割后值,ordered_result 默认True

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Day6——R包

vars <- c("Petal.Length", "Petal.Width")select(test, one_of(vars))#选择字符向量,select不能直接使用字符向量筛选,需要使用...one_of函数R语言中使用vars参数指定数据需要分析字段索引范围在R语言中,我们经常需要对数据框进行分析和处理。...数据框是一种二维表格结构,其中包含了多个变量(字段)和观测值(行)。在进行数据分析时,有时我们只对数据特定字段感兴趣,而不需要使用所有的字段。...这时,我们可以使用vars参数来指定需要分析字段索引范围,从而提取出感兴趣字段进行后续操作。vars参数是dply包select函数一个参数,它允许我们通过指定字段索引范围来选择需要字段。...unique值计数函数计算数据集中唯一值数量count(test,Species)## Species n##1 setosa 2##2 versicolor 2##3 virginica

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dplyr数据处理

() select()函数用于筛选有用,第一个参数还是数据库,第二个参数以及后面是需要列名,列名有多种书写方式,可以使用冒号作为范围,也可以使用 stars_with,ends_with...另外,当想要把几个需要移到前面,可以配合使用 everythins()函数,将剩余添加到后面。...mtcars %>% dplyr::sample_n(10) mtcars %>% dplyr::sample_frac(0.2) 六、创建变量 有时需要对已有变量进行重新计算,例如计算几列和...,会某一取对数,这样将生成变量,这个时候可以使用 mutate 函数。.../People) 七、统计 使用 summarise()可以对每一单独进行计算,例如求和,求平均值等,这些都可以使用apply 系列函数来完成,summarise()一般都配合 group_by

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UseGalaxy.cn生信云|零代码使用Tiverse优雅地处理数据

Dplyr Distinct keep unique rows distinct 函数用于去除数据重复观测,仅保留唯一观测。它可以基于指定数据框进行去重操作,确保每个观测都是唯一。...Dplyr Mutate create, modify, and delete columns mutate 函数用于添加变量或修改现有变量,能够基于已有数据创建变量,支持对数据框进行实时变量操作和修改...Dplyr Rename columns rename 函数用于重命名数据变量名,能够快速修改变量名称,使得数据列名更符合用户需求和习惯。...Tidyr Pivot Longer from wide pivot_longer 函数用于将宽格式数据转换为长格式数据,能够根据用户指定数据多个整理成一对 “名-值” 对,便于进一步分析和处理...Tidyr Pivot Wider from long pivot_wider 函数用于将长格式数据转换为宽格式数据,能够将数据分成多个,根据指定列名进行展开,使得数据以更直观宽格式形式呈现

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生信代码:数据处理( tidyverse包)

可视化,建模以及形成可重复性报告数据分析全流程。...dplyr包下主要是以下几个操作: select()——选择 filter/slice()——筛选行 arrange()——对行进行排序 mutate()——修改/创建 summarize(...1 mutate() mutate()与基础函数transform()相似,都可以添加,但是允许引用刚刚创建: mydata <- tibble(x1=c(2,2,6,4),...start_with("n")) 3 filter() filter()是对数据行方向选择和筛选,选出符合我们条件某些行: df %>% filter( type== "english", score...,如果后续要使用到,需要保存下来 5 arrange() R base包涉及到排序包括 sort(),rank(),order(),而在dplyr与排序相关是arrange()包,默认是从高到低进行排序

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R语言探索BRFSS数据可视化

p=9266 设定 加载包 在本实验,我们将使用dplyr软件包探索数据,并使用ggplot2软件包对其进行可视化以进行数据可视化 library(ggplot2)library(dplyr) 载入资料...我们数据集包含491775个观测值(行)和330个变量() ---- 第1部分:数据 关于BRFSS 行为风险因素监视系统(BRFSS)是每年对美国超过40万人进行电话调查。...2011年进行了超过50万此类采访,使用随机抽样收集了电话采访和手机访问样本,从一个州根据密度按分层抽样方法获得了电话样本,而手机样本则是从一个随机抽样抽取。  ...is.na(sex))%>% select(physhlth,sleptim1,menthlth,sex) 我们创建了一个数据框V1,其中包含4个连续变量。...V2 研究问题3: 变量V3存储由3个目标变量组成数据

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算法基础-散列表与开放寻址

散列表是数组扩展,一般数组可以在 O(1) 时间复杂度内进行随机读取,而散列表则使用一个特殊数来为各个元素分组在查找元素,只需要用特殊函数计算一,就可以知道元素存放位置 散列表基本结构是一个关键字数组和链表...,此时称为哈希冲突 开放寻址法 在开放寻址法,如果需要往散列表插入一个元素,则需要用一种方法按顺序探查散列表,直到找到一个空槽来存放新元素。...因为如果它存在的话,那么它应该会在当前空槽位置 散函数扩展 为了解决冲突问题,需要对散函数进行扩展,将探查次数作为自变量加入到原散函数 即在原扩展函数基础上,引入了探查次数,当第一探查时...该方法会导致被占用槽位出现集群,即一大串连续占用槽位,因此平均查找时间也会大大增加 二探查 二探查使用数来探查空槽位 该方案优点是不会出现连续集群,但是仍有一个缺点:如果 h(k1)...== h(k2),那么后序探查顺序也会完全一致,这会造成轻度集群,称为“二集群” 双重散 双重散使用两个哈希函数来防止出现集群 这样好处是难以出现不同 k 值对应相同槽位,也就避免了集群出现

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R 数据整理(七:使用tidyr和dplyr处理数据框 2.0)

2.2 sample_n dplyr sample_n(tbl, size) 函数可以从数据集 tbl 随机无放回抽取 size 行,如: > d.class %>% sample_n(size...在 dplyr rename() 中用 “新名字 = 旧名字” 格式修改变量名,如: d2.class % dplyr::rename(h=height, w=weight...对于待分离对象(col),不必加上引号;但对于即将创建(into),需要使用引号,由于是两,这里使用向量创建。sep参数设定读取表格信息时以何符号作为分隔符。...对于即将合并,需要使用引号;但对于想要合并多个列名,可以不用使用引号。sep 参数设定多合并后不同数据分隔使用分割符。...实际上,tibble 允许存在数据类型是列表 (list) ,子数据框就是以列表数据类型保存在 tibble

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快速掌握R语言中类SQL数据库操作技巧

(本章节为R语言入门第二部分总结篇:数据操作) 本章内容布局思路:思来想后,想到SQL查询查询思路可以作为本章节布局思路 1.了解表结构/数据结构 2.对表一些数据做出修改、替换、甚至生成新字段...merge函数和dplyr*_join等函数,另外sqldf函数(SQL)亦可以实现数据连接功能。...= c(Ozone, Temp)) 4.3 数值分段 数值分段,就是把一个连续数值型数据,按区间分割为因子类型离散型数据。...,大多都是基于索引来完成 > #用order()函数来生成索引,再匹配数据数值上面。...去重与找重 去重,是把向量重复元素过滤掉。找重,是把向量重复元素找出来。

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数据处理|R-dplyr

1)安装、加载dplyr包、准备数据 install.packages("dplyr") #加载dplyr使用dplyr包处理数据前,建议先将数据集转换为tbl对象。...data(iris) #本文使用iris示例数据集。 2)数据记录筛选(行筛选) filter函数:按指定条件筛选符合条件逻辑判断要求数据记录。...Width) #计算一个或多个并删除原 6)数据汇总 summarize()函数实现数据集聚合操作,将多个值汇总成一个值 summarise(iris,avg = mean(Sepal.Length...sample_n(mtcars, 50, replace = TRUE) #随机有重复取50行数 10)数据联结 dplyr包也提供了数据连接操作,如左连接、右连接、内连接等: inner_join...11)数据合并 dplyr也添加了类似cbind()函数和rbind()函数功能函数,它们是bind_cols()函数和bind_rows()函数。

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Python入门之数据处理——12种有用Pandas技巧

例如,我们想获得一份完整没有毕业并获得贷款女性名单。这里可以使用布尔索引实现。你可以使用以下代码: ? ? # 2–Apply函数 Apply是一个常用函数,用于处理数据和创建变量。...由此我们得到了需要结果。 注:第二个输出中使用了head()函数,因为结果包含很多行。 # 3–填补缺失值 ‘fillna()’可以一性解决:以整列平均数或众数或中位数来替换缺失值。...由于我已经知道有一信用记录是非常重要,如果我预测拥有信用记录的人贷款状态是Y(贷款成功),而没有的人为N(贷款失败)。令人惊讶是,我们在614个例子中会有82+378=460正确。...加载这个文件后,我们可以在每一行上进行迭代,以类型指派数据类型给定义在“type(特征)”变量名。 ? ? 现在信用记录修改为“object”类型,这在Pandas中表示名义变量。...◆ ◆ ◆ 结语 本文中,我们涉及了Pandas不同函数,那是一些能让我们在探索数据和功能设计上更轻松函数。同时,我们定义了一些通用函数,可以重复使用以在不同数据集上达到类似的目的。

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RNA-seq入门实战(三):在R里面整理表达量counts矩阵

连续求贤令:曾经我给你带来了十万用户,但现在祝你倒闭,以及 生信技能树知识整理实习生招募,让我走大运结识了几位优秀小伙伴!...他前面的分享是: Counts FPKM RPKM TPM CPM 转化 获取基因有效长度N种方 下面是他对我们b站转录组视频课程详细笔记 本节概览: 从featureCounts输出文件获取...table(duplicated(symbol)) #统计重复基因名 ###使用aggregate根据symbol相同基因进行合并 counts <- aggregate(counts...初步过滤低表达基因与保存counts数据 我们数据中会有很多低表达甚至不表达基因,在后续分析可能会影响数据分析判断,因此需要对低表达基因进行筛除处理。筛选标准不唯一,依自己数据情况而定。...这里只展示了获取基因表达TPM值,如果还想了解如何获得FPKM值请参考文章:获取基因有效长度N种方法第二部分内容以及Counts FPKM RPKM TPM 转化。

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使用R或者Python编程语言完成Excel基础操作

Excel基础表格操作 在Excel,对表格数据进行增删改查(即增加、删除、修改、查询)以及排序和筛选等操作是常见数据处理任务。以下是一些基本操作方法: 1....修改数据 直接修改:选中单元格,直接输入数据使用查找和替换:按Ctrl+F或Ctrl+H,进行查找和替换操作。 4. 查询数据 使用公式:在单元格输入公式进行计算。...data <- read.csv("path_to_file.csv") 增加使用mutate()添加。...通过dplyr和tidyr包,我们可以轻松地对数据进行复杂操作。 在R语言中,即使不使用dplyr和tidyr这样现代包,也可以使用基础包数来完成数据操作。...然而,如果你想要使用Python更基础内置数据结构和功能来处理数据,你可以使用列表(List)、字典(Dictionary)和内置数来完成一些简单操作。

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