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基于R竞争风险模型线图

作者:科研猫 | 西红柿 责编:科研猫 | 馋猫 背景 将竞争风险模型cmprsk包加载到R,使用cuminc()函数和crr()函数可以进行考虑竞争风险事件生存数据单变量分析和多变量分析。...以往推文我们已经详细描述了基于R语言实现方法,这里不再赘述。那么,您如何看待竞争风险模型呢?如何绘制竞争风险模型线图?在这里,我们演示如何绘制基于R线图。...主要原因是,如果哑变量出现在线图中,结果将难以解释清楚。 因此,应避免在线图中使用哑变量。 regplot包regplot()函数可以绘制更多美观线图。...mstate包crprep()函数主要功能是创建此加权数据集,如下面的R代码所示。然后,我们可以使用coxph()函数拟合加权数据集竞争风险模型,再将其给regplot()函数以绘制线图。...RriskRegression包可以对基于竞争风险模型构建预测模型进行进一步评估,例如计算C指数和绘制校准曲线等。

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【Python】基于组合删除数据框重复值

本文介绍一句语句解决组合删除数据框重复值问题。 一、举一个小例子 在Python中有一个包含3数据框,希望根据name1和name2组合(在两行顺序不一样)消除重复项。...import numpy as np #导入数据处理库 os.chdir('F:/微信公众号/Python/26.基于组合删除数据框重复值') #把路径改为数据存放路径 df =...如需数据实现本文代码,请到公众号回复:“基于删重”,可免费获取。 得到结果: ?...从上图可以看出用set替换frozense会报不可哈希错误。 三、把代码推广到 解决组合删除数据框重复值问题,只要把代码取两代码变成即可。...numpy as np #导入数据处理库 os.chdir('F:/微信公众号/Python/26.基于组合删除数据框重复值') #把路径改为数据存放路径 name = pd.read_csv

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Rsweep函数

函数用途 base包sweep函数是处理统计量工具,一般可以结合apply()函数来使用。...函数参数 sweep(x, MARGIN, STATS, FUN = "-", check.margin = TRUE, ...) x:即要处理原数据集 MARGIN:对行或,或者数列其他维度进行操作...…… 下面我们结合几个具体例子来看 #创建一个4行3矩阵 M = matrix( 1:12, ncol=3) 1.每一行都减去这一行均值 #方法一,通过rowMeans函数来计算每一行均值...sweep(M,1,rowMeans(M)) #方法二,通过apply函数来计算每一行均值,MARGIN=1,对行做操作 sweep(M,1,apply(M,1,mean)) 2.每一行都减去这一均值...#方法一,通过colMeans函数来计算每一均值 sweep(M,2,colMeans(M)) #方法二,通过apply函数来计算每一均值,MARGIN=2,对做操作 sweep(M,2,

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R替换函数gsub

Rgsub替换函数参数如下 gsub(pattern, replacement, x, ignore.case = FALSE, perl = FALSE, fixed = FALSE,...vector举例如下: > x <- c("R Tutorial","PHP Tutorial", "HTML Tutorial") > gsub("Tutorial","Examples",x) #将...Tutorial替换成Examplers [1] "R Examples" "PHP Examples" "HTML Examples" 还有其他一些例子来灵活使用这个函数,结合正则表达式。...,我们知道组织病理分期分成stage I,stage II,stage III和stage IV四个分期 接下来我们试着把组织病理分期从四个组合并成两个组,并转换成因子 我们使用gsub函数...,并转换成因子 我们还是使用gsub函数 #删除组织病理学分期末尾A,B或者C等字母,例如Stage IIIA,Stage IIIB stage=gsub("[ABCD]$","",clin$ajcc_pathologic_stage

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MySQL索引前缀索引和索引

正确地创建和使用索引是实现高性能查询基础,本文笔者介绍MySQL前缀索引和索引。...,因为MySQL无法解析id + 1 = 19298这个方程式进行等价转换,另外使用索引时还需注意字段类型问题,如果字段类型不一致,同样需要进行索引计算,导致索引失效,例如 explain select...第二行进行了全表扫描 前缀索引 如果索引值过长,可以仅对前面N个字符建立索引,从而提高索引效率,但会降低索引选择性。...前缀字符个数 区分度 3 0.0546 4 0.3171 5 0.8190 6 0.9808 7 0.9977 8 0.9982 9 0.9996 10 0.9998 索引 MySQL支持“索引合并...); Using where 复制代码 如果是在AND操作,说明有必要建立联合索引,如果是OR操作,会耗费大量CPU和内存资源在缓存、排序与合并上。

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Power Query批量处理函数详解

; 第2参数是需要改变及操作(正常情况是由列名和操作函数组成,也可以是空列表); 第3参是去除第2参数中指定后剩余所需要进行处理函数; 第4参数是找不到第2参数指定标题时是忽略处理(1)还是返回错误处理...---- 例1: 此函数必要参数只有2个,所以我们先用最基础2个参数来进行操作。 ? 如果要把成绩统一减10分的话,那就在第2参数这里使用列名和对应操作函数即可。...例3 第3个参数是一个函数,是在第2参数指定以外表格所有需要进行操作。 在前面的操作,成绩和学科都有了操作,那剩余其他(姓名列)也需要进行操作,那就要使用到第3参数了。...如果第2参数学科写错或者定义了其他未在操作表列名,则可以通过第4参数来控制返回。...因为指定里有 “班级”,但是在原来表格不存在,所以会产生错误,但是第4参数有指定1,也就是忽略错误,最终返回结果如图所示。除了找到成绩列表外,其余数据都在后面添加了个“A”。 ?

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Rstack和unstack函数

我们用R做数据处理时候,经常要对数据格式进行变换。例如将数据框(dataframe)转换成列表(list),或者反过来将列表转换成数据框。...那么今天小编就给大家介绍一对R函数来实现这样功能。 这一对函数就叫做stack和unstack。从字面意思上来看就是堆叠和去堆叠,就像下面这张图展示这样。...那么R里面这两个函数具体可以实现什么样功能呢?下面这张图可以帮助大家来理解。unstack就是根据数据框第二分组信息,将第一数据划分到各个组,是一个去堆叠过程。...一、unstack 下面我们来看几个具体例子 例如现在我们手上有一个数据框,里面的数据来自PlantGrowth 我们可以先看看PlantGrowth 内容,第一是重量,第二是不同处理方式...,后面小编会使用这两个函数来给大家举个真实应用案例,敬请期待。

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Rgrep和grepl函数

在日常数据分析过程,我们经常需要在一个字符串或者字符串向量查找是否包含我们要找东西,或者向量那几个元素包含我们要查找内容。...这个时候我们会用到R中最常用两个函数,grep和grepl。...其实grep这个函数也并非是R所特有的,在linux模式匹配也用grep这个函数,前面我就给大家简单介绍过☞Linux xargs grep zgrep命令。...我们先来看看grep和grepl这两个函数用法。 这两个函数最大区别在于grep返回找到位置,grepl返回是否包含要查找内容。接下来我们结合具体例子来讲解。...☞讨论学习Rgrepl函数 参考资料: ☞Linux xargs grep zgrep命令 ☞讨论学习Rgrepl函数

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使用VBA删除工作表重复行

标签:VBA 自Excel 2010发布以来,已经具备删除工作表重复行功能,如下图1所示,即功能区“数据”选项卡“数据工具——删除重复值”。...图1 使用VBA,可以自动执行这样操作,删除工作表所有数据重复行,或者指定重复行。 下面的Excel VBA代码,用于删除特定工作表所有所有重复行。...如果只想删除指定(例如第1、2、3重复项,那么可以使用下面的代码: Sub DeDupeColSpecific() Cells.RemoveDuplicates Columns:=Array...(1, 2, 3), Header:=xlYes End Sub 可以修改代码中代表列数字,以删除你想要重复行。...注:本文学习整理自thesmallman.com,略有修改,供有兴趣朋友参考。

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Excel公式技巧:基于单列多个条件求和

标签:Excel公式,SUMPRODUCT函数 基于条件求和通常使用SUMIF函数或者SUMIFS函数,特别是涉及到多条件求和时。然而,随着条件增多,公式将会变得很长,难以理解。...而使用SUMPRODUCT函数,可以判断同一多个条件且公式简洁。 如下图1所示示例。...*($C$2:$C$12)) 公式,使用加号(+)来连接条件,表明满足这两个条件之一。...也可以使用下面更简洁公式: =SUMPRODUCT(($A$2:$A$12="东区")*(($B$2:$B$12={"超市1","超市2"}))*($C$2:$C$12)) 公式,使用了花括号,允许在其中放置多个条件...,因此,如果需要满足条件更多的话,就可以通过逗号分隔符将它们放置在花括号,公式更简洁。

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五大方法添加条件-python类比excellookup

40,100) for i in range(60)]).reshape(20,3),columns=["语文","数学","英语"]) df['总成绩'] = df.sum(axis=1) df 添加一条件...这个函数依次接受三个参数:条件;如果条件为真,分配给新值;如果条件为假,分配给新值 # np.where(condition, value if condition is true, value...-np.select # 方法四 np.select # np.select()函数,给它提供两个参数:一个条件,另一个对应等级列表。...# 在conditions列表第一个条件得到满足,values列表第一个值将作为新特征该样本值,以此类推 df6 = df.copy() conditions = [ (df6['...,是进行分组依据, 如果填入整数n,则表示将x数值分成等宽n份(即每一组内最大值与最小值之差约相等); 如果是标量序列,序列数值表示用来分档分界值 如果是间隔索引,“ bins”间隔索引必须不重叠

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巧用R各种排名窗口函数

函数对比 SQL窗口函数语句中over语句中两个关键词:partition by和order by,R语言中也有与之一一对应函数: ?...1 row_number函数 R语言中row_number函数与sqlrow_number函数相同,对group_by后面字段进行分组,按照order_by后面字段排序,生成一个连续不重复编码...2 min_rank函数 R语言中min_rank函数与sqlrank函数相同,row_number函数对order_by后面字段相同记录编码是不同,min_rank就是解决这个问题,对相同记录编码相同...同样得到与sql相同输出结果: ? 4 ntile函数 R语言中ntile函数与sqlntile函数相同,把每一组分成几块,块数由参数n决定: ?...总结 简单介绍R语言中4个排名窗口函数函数名几乎与sql4个排名窗口函数一样(除了min_rank与rank),但R语言排名窗口函数输出结果与sql输出结果有点不同:R语言数据结果不改变原来数据顺序

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Python基于Excel长度不定数据怎么绘制折线图?

本文介绍基于Python语言,读取Excel表格数据,并基于给定行数范围内指定数据,绘制多条曲线图,并动态调整图片长度方法。  首先,我们来明确一下本文需求。...现有一个.csv格式Excel表格文件,其第一为表示时间数据,而靠后几列,也就是下图中紫色区域内,则是表示对应日期属性数据;如下图所示。  ...我们现在希望,对于给定行数起始值与结束值(已知这个起始值与结束值对应第一数据,肯定是一个完整时间循环),基于表格后面带有数据几列(也就是上图中紫色区域内数据),绘制曲线图;并且由于这几列数据所表示含义不同...,希望用不同颜色、不同线型来表示每一数据。...首先,通过plt.figure(figsize = ((idx_end - idx_start) * 0.45, 5))动态设置图片尺寸,使用plt.plot()函数绘制每个指标的预测值和实际值;同时,

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Python基于Excel数据绘制动态长度折线图

本文介绍基于Python语言,读取Excel表格数据,并基于给定行数范围内指定数据,绘制多条曲线图,并动态调整图片长度方法。   首先,我们来明确一下本文需求。...现有一个.csv格式Excel表格文件,其第一为表示时间数据,而靠后几列,也就是下图中紫色区域内,则是表示对应日期属性数据;如下图所示。   ...我们现在希望,对于给定行数起始值与结束值(已知这个起始值与结束值对应第一数据,肯定是一个完整时间循环),基于表格后面带有数据几列(也就是上图中紫色区域内数据),绘制曲线图;并且由于这几列数据所表示含义不同...,希望用不同颜色、不同线型来表示每一数据。...首先,通过plt.figure(figsize = ((idx_end - idx_start) * 0.45, 5))动态设置图片尺寸,使用plt.plot()函数绘制每个指标的预测值和实际值;同时,

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