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(22)
视频
沙龙
1
回答
尝试在python上按索引合并时出错
python
、
pandas
我正在遵循此链接中发布的解决方案这是我的两个data.frames
eQTL
-103
eQTL
-105
eQTL
-106
eQTL
-111
eQTL
-112 \ENST00000494149.2 0.674490 -1.085325 -0.828465 0.116309 -0.186756
浏览 10
提问于2019-07-10
得票数 2
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1
回答
从字符矩阵中计算一个值
r
矩阵由caracter向量组成,如下所示:[1,] "GT:DS:GP" "0/1:0.790/0:0.006:0.994,0.006,0" "0/0
浏览 0
提问于2018-03-07
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1
回答
从另一个文件中提取行并在python中将唯一字段保存在单独的文件中。
python
、
parsing
、
pattern-matching
lookup with gzip.open("values.gz", "r") as
eqtl
: for key in lookup:
浏览 2
提问于2017-06-08
得票数 2
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2
回答
Flask使对象列表单元化
python
、
json
、
serialization
、
flask
super(EqtlJSONEncoder, self).default(obj) def get(self):
eqtl
2 = EqtlByGene(2, 'PTEN', 0.2) return jsonify(eqtls_by_ge
浏览 0
提问于2014-01-29
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1
回答
Bonferroni校正在
eQTL
分析中的应用
r
、
bonferroni
我已经使用
eqtl
包完成了MatrixEQTL分析。me <- Matrix_
eQTL
_engine( gene = gene, output_file_name = output_file_nameMatrix_
eQTL
_engine中提取的,该代码还包含用于设置内容的代码。 我将阈值pvalue设置为0.05,但我想知道是否有一种方法可以通过测试来找到这个脚本中包含的阈值。
浏览 5
提问于2021-05-17
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1
回答
如何解释双管道的awk命令?
awk
我有一个这样的文件:PANEL FILE ID CHR P0 P1 HSQ BEST.GWAS.ID BEST.GWAS.Z
EQTL
.ID
EQTL
.R2
EQTL
.Z
EQTL
.GWAS.Z NSNP NWGT MODEL MODELCV.R2 MODELCV.PV TWAS.Z TWAS.P NA .
浏览 17
提问于2020-05-07
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2
回答
textFieldDidEndEditing替代方案
iphone
、
xcode
、
ios
、
uibutton
、
uitextfield
} int
eqtl
[qty.text length];int eptl = [price.text length]; if (
浏览 2
提问于2011-06-05
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1
回答
隐式对象在R中的应用函数
r
、
apply
我正在循环中处理一个特殊的对象--来自Matrix_
eQTL
的Matrix_
eQTL
对象--并且我想知道它是否可以被“应用”中的任何函数重写。 让我用一个玩具例子来解释它。
浏览 4
提问于2020-04-14
得票数 1
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1
回答
在Linux中如何在将数据输入到另一个Python文件时保留Python语法?
python
、
linux
它被设置为将其输出发送到file1.py: python script1.py > file1.py file1.py的内容如下: 19/11/2020 19:40:17 ['MGLU3', 'VIVT4', '
EQTL
3我只想“匹配”列表如下: [('MGLU3', 'R$ 24,64'), ('VIVT4','R$ 46,39'), ('
EQTL
3', 'R$ 21,12
浏览 6
提问于2020-11-20
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1
回答
如何在R中的大文件转换步骤中添加循环
r
、
loops
我正在使用以下脚本进行
eQTL
分析,使用基因表达数据作为input.xlsx,它将基因作为行,表达式值作为列,样本名称作为列标题。snps$LoadFile('newFile', delimiter = '\t', skipColumns = 186) useModel = modelANOVA, output_f
浏览 32
提问于2021-02-04
得票数 1
1
回答
在自定义div之间的R表示中呈现R代码时出错
r
当我将R代码放在自定义的div in R演示文稿中时,我遇到了一个能够呈现R代码的问题。所以我设置了一个新的div类,它将数据分成两列,但是这些div中的R代码返回markdown文本。```{r, echo=FALSE}库(GridExtra)annotation_data =read.csv(“数据/chr7_15_qtl_genes.csv”) annotation_summary = read.table("Data/chr7_15_qtl_genes_summary.
浏览 2
提问于2016-03-02
得票数 0
1
回答
可以从PostgreSQL读取data.table吗?
r
、
data.table
、
rpostgresql
library(RPostgreSQL)...data <- as.data.table(dbGetQuery
浏览 1
提问于2015-02-07
得票数 8
1
回答
如何计算每个基因的关联数量
r
我有一个使用MatrixEQTL进行
eqtl
分析的输出文件ch01_76563780 GW_06g072920
浏览 14
提问于2021-05-19
得票数 0
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1
回答
R-运行具有不同设计矩阵的多个线性模型的更快方法
r
、
performance
、
vectorization
、
linear-regression
我有一个数据矩阵,其中每一列都对应于一些测量的物质浓度,我需要将每种物质回归到其他每种物质,并使用一些固定的校正协变量。由于设计矩阵一直在变化,像RcppArmadillo包中的fastLm()这样的函数在本质上没有多大用处(我之前查看过 )。Ncol <- ncol(mat) for(j in se
浏览 2
提问于2015-03-30
得票数 1
2
回答
检查文件是否被截断
file
、
unix
、
curl
、
ssh
、
wget
我从ftp地址下载了许多gz文件:
浏览 13
提问于2022-05-29
得票数 0
2
回答
特定字符串的数据提取
json
、
bash
、
bioinformatics
、
data-extraction
、
text-manipulation
我想从"method": "eQTLs"和"value": "xxxx"中提取特定的数据(
EQTL
),并将它们放入两个列(选项卡分隔),如下所示。
浏览 18
提问于2022-11-08
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1
回答
在python中使用requests或urllib时出现"OSError:[Errno 0] Error“
python
、
python-requests
、
urllib
Whole_Blood']# using requests print(f'Getting
eQTL
Getting
eQTL
for tissue Adipose_Visceral_Omentum...------------------
浏览 2
提问于2020-10-31
得票数 1
1
回答
有没有一种方法可以使用Python上的“openpyxl”找到当前的迭代行?
python
、
openpyxl
from openpyxl import load_workbook symbol = '
EQTL
3'mes = data[5
浏览 0
提问于2019-08-21
得票数 0
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1
回答
正则表达式将子模式'hello1,2,3‘替换为'hello’,而不影响其他编号模式
python
、
regex
预期产出: 有人能帮我做到这一点吗?
浏览 1
提问于2017-06-22
得票数 0
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3
回答
在使用lapply()时,如何打印所有列并防止插入?
r
、
lapply
1597 0.00515331 0.022282 0.817129 0.890449757 0.79289055858df <- read.table("/data/coloc_
eQTL
/combined_GWAS_skin_
eQTL
_AL.txt", header = TRUE) lapply(names(
浏览 4
提问于2022-11-23
得票数 2
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