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沙龙
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回答
树修改软件
、
我需要一个程序: 1)将括号格式的树可视化成图像;2)允许修改该图像上的树结构;3)图像上的修改将自动反映在括号格式的树中。 现在有一个用javascript编写的程序,它执行步骤1,而不是其他两个步骤。我想知道是否有人知道一个软件可以完成所有三个步骤。 括号内的树如下所示: [S [NP Trump][VP [V likes][NP Twitter]]] 使用该程序的可视化如下所示: 📷 我想要这个程序的原因是,当树变得非常复杂时,就很难修改已修改过的树,因为有太多的括号需要跟踪。 因此,我想要做的主要事情是能够在可视化中修改树(比如将“喜欢”更改为“讨厌”),并且更改会以括号内的格式反映出
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提问于2019-08-27
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回答
强制从bash脚本代码内部刷新到stdout文件
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我正在尝试开发一个用Python代码(Ete软件)编写的生物信息软件的输出。我在上尝试了详细的命令( stdbuf ),但是没有工作,因为我已经看到stdbuf命令只能从shell执行,而不能从bash()执行。 此外,在Python中,我发现了以下可能很有趣的函数: import sys sys.stdout.flush() 但我不知道如何在下面附加的下一个bash脚本中实现。 其目的是,如果我只使用bash脚本中的选项-o和-e (如您所见),输出将以不连续的方式打印到logs_40markers,这不允许我看到错误。我可以直接从shell工作,但我的互联网连接不稳定,实际上每晚都有停电,
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提问于2022-05-19
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回答
ModuleNotFoundError:重置基本环境后没有名为“conda”的模块
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我喜欢拥有极小的base conda环境。我意外地在这个环境中安装了一堆包,所以我尝试删除它们: 我按照的建议运行了以下命令:conda install --revision 0 -n base 但是,当我运行以下脚本重新安装要点时: conda install -c conda-forge wget rsync pv ipython jupyter jupyterlab pandas numpy biopython r-recommended python=3 -y conda install -c bioconda pullseq samtools bbmap hmmer ncbi-ge
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提问于2019-12-09
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