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基因测序方面？
容器、腾讯云、gpu、管理、性能
腾讯云对基因测序的容器管理有案例和方案么，GPU最好的计算峰值和峰谷多少？有蓝光盘么，或者有能达到蓝光性能的盘？
浏览 426提问于2018-06-08
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WGCNA中的灰色模块有大小限制吗？
r、bioinformatics、bioconductor
WGCNA分析结果为我们提供了几个模块。这些模块是彩色的，也是用数字编号的。通常，灰色模块也被标记为数字中的0，对应于没有在任何模块中聚类的一组基因。
浏览 16提问于2018-05-18得票数 1
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基因集富集分析
r、database、ontology、bioconductor
我使用cummeRbund函数findSimilar()找到了与我用Cuffdiff识别的差异表达基因最相似的10个基因。这使用了Jensen-Shannon距离，并产生了一个排列有序的基因列表，我现在想要测试的是GO的富集。0.0453928603025379 "XLOC_010786" 0.0469577467848723
我首先手动搜索每一个最相似的基因的GO术语，但我想做一个更可靠的分析
浏览 3提问于2013-07-11得票数 1
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如何使用Cytoscape分析“一对多”数据值
cytoscape、network-analysis
我对使用Cytoscape分析基因之间的分子关系很感兴趣，我一直在阅读Cytoscape网站上的教程，但我不确定如何使用Cytoscape进行“一对多”比较。例如，每个基因通常被指定为“节点”，其“边”对应于与其他基因的交互作用。Cytoscape使用“属性”将节点或边名称映射到特定的数据值。在一个简单的“一对一”比较中，您可能有一个包含10个基因及其表达值的列表，这样每个基因的属性将是1)基因的名称和2)表达值。看起来很清楚Cytoscape将如何使用这些类型的数据来
浏览 1提问于2020-06-02得票数 1
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使用临床参数和基因表达数据对R中特定乳腺癌亚型的基因表达进行聚类
cluster-analysis、bioinformatics、pca、genetics
我有一组来自3个不同亚型的乳腺癌样本的1500个基因的基因表达值及其临床参数。我需要根据乳腺癌亚型对基因表达进行聚类，以找到每个乳腺癌亚型的独特基因。
浏览 15提问于2020-10-26得票数 0
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想问一下，mummer共线性分析的图里有一条序列的一部分（圈起来部分）和参考序列比不上，大概什么原因呢？有什么解决办法吗？
图片
浏览 543提问于2023-09-25
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为什么在大多数verilog代码中，它只能在posedge时钟上工作？我的教授说了一些关于逆变器的特性，它只能在正时钟和负时钟方面都有优势，还提到了一些关于H tree..which的东西，我不明白那是什么。谢谢
浏览 3提问于2018-10-01得票数 0
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有没有办法让苏拉不过滤掉感兴趣的基因？
r、seurat
我试图确定某些基因在Seurat上的表达，但我认为Seurat正在筛选出这些基因。是否有办法调整参数以获得我所提供的集群中感兴趣的基因？谢谢。
浏览 12提问于2022-08-12得票数 -1
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根据一列中的唯一值比较多个数据帧，并在R中的多个数据帧中查找第二列中的重叠值
r、dataframe、compare、intersection、overlap
该分析一次提取每个基因，使用该基因作为参考，并针对每个单独的基因进行测试，以查看这些基因随时间的变化模式是否与第一个参考基因相关。这对每个单独的基因都是重复的。因此，以一个数据帧为例，结果如下所示。第一列包含用作参考基因的基因，如果其他基因与该基因随时间的变化相关，则该值可能会多次出现。b ab d 上面的分析是在多个不同的样本中进行的，所以我将获得多达12个不同样本的数
浏览 16提问于2019-01-27得票数 0
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如何检查FPGA设备是否连接到服务器？
linux、opencl、fpga、intel-fpga
出于某种原因，我只能远程控制包含FPGA的服务器(Intel Arria 10 GX FPGA)。但是当我使用Intel OpenCL中的命令来查找驱动程序时，我无法找到可以使用的FPGA设备。命令如下：aocl diagnose输出结果：
后来，我使用hardinfo检查FPGA是否包括在内，但不幸的是，没有有用的信息。唯一与FPGA相关的是，我在我的服务器下找到了两个关于fpga的文件(Ubuntu16.04)。由于我是第一次使用FPGA<
浏览 14提问于2021-12-07得票数 1
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为R中的读取计数矩阵生成行名时出现问题
r、edge-list、rna-seq
我正在在线学习这篇教程，以分析细胞类型之间的RNA-seq数据。https://combine-australia.github.io/RNAseq-R/06-rnaseq-day1.html 我已经能够使用我自己的数据来执行其中的大部分，但我现在正在尝试执行路径丰富分析seqdata是我的data.frame，其中包含来自分析的所有基因信息，第1列是基因ID名称，第15到24列是载体，其中包含10个样本中每个基因的读取计数信息。我从这个data.
浏览 63提问于2020-01-03得票数 0
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在anova之前进行缩放？
normalization、bioinformatics、anova
我想进行一个方差分析来识别差异表达的基因。在寻找差异表达的基因之前，我应该使用分位数归一化或中位数绝对偏差来缩放数据，还是应该直接对通过RMA获得的数据应用方差分析？
提前谢谢你
浏览 3提问于2011-03-02得票数 1
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时钟周期循环限制的VHDL语言
loops、for-loop、vhdl、clock、cycle
我想知道瓶颈在哪里，在FPGA不能再运行这些代码之前，可以运行多少次迭代。我可以合成代码，但是当我把时钟频率提高到48 the以上时，.bit流文件就不能再被FPGA读取了。
浏览 0提问于2015-05-16得票数 0
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我有一台Windows PC，它在端口9000上运行TCP服务器。我也有一个FPGA，它是直接连接到PC通过一个10G端口。FPGA可以发送以太网帧来建立和维护与服务器的TCP连接，就是这样。也就是说，FPGA可以发送初始SYN，响应SYN-ACK等。
但是，我怀疑服务器需要握手才能确认初始的FPGA SYN。在FPGA能够与TCP服务器建立TCP连接之前，所需的最小握手量是多少？
浏览 0提问于2013-05-16得票数 0
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用于大型数据集的LDA替代方案
r、classification、projection
我正在分析一个大的R基因表达数据集，有100个样本和50.000个基因。
我已经对样本间的模式做了一些非常有用的PCA预测。现在，我想对数据做一些预测，最大限度地扩大我对样本的标签之间的差异。
浏览 1提问于2015-03-18得票数 1
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哪一个更复杂？计算64位CRC还是用不同多项式计算两个32位CRCs？
complexity-theory、fpga、crc
我想知道在FPGA上64位CRC与同一FPGA上的两个32位CRCs (不同的多项式)相比是怎样的。两位32位CRC是否比执行单个64位CRC更复杂？要花点时间还是很快？如何计算复杂性(或进行复杂性分析)？
如有任何帮助，将不胜感激。
浏览 2提问于2021-06-01得票数 1
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用定义的细胞群绘制X轴上基因的小提琴图
r、bioinformatics、violin-plot
这与单细胞RNA测序数据分析有关.谢谢你在这个问题上的任何想法！
浏览 11提问于2022-10-01得票数 0
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在excel上计数数据类别
excel
在我的基因组分析的最后一部分，我必须制作一个与基因功能相关的饼图。我有一个excel电子表格，上面有基因功能和相应的字母类别(COG字母栏D在屏幕截图中)，为了制作饼形图，我需要按C列过滤，这样我就可以根据我在分析的某些部分看到的基因组数量来调整基因组的数量，然后计算这个字母在大约4000个基因的列表中出现了多少次。
浏览 3提问于2021-06-21得票数 0
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我正在回归另一个基因子集上的一个基因。然后我使用stepAIC来减少解释基因的数量。如何获得非省略变量的索引，以便对其进行分析？
浏览 0提问于2013-08-26得票数 0
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