生物数据的处理本质上有两条路线:其中一条是序列本身具有结构特征,那么就可以通过软件算法来实现,比如预测基因,非编码 RNA,重复序列的分析等;另一条路线是序列本身没有结构特征,只能通过与已有序列进行比对,根据已知信息来推测未知信息,比如基因功能注释,16SrRNA 物种鉴定等,常见的一个例子就是得到一条序列,需要判断序列来自于哪个物种,就只能与数据库进行比对。
建设ftp网站看上去是非常难的事情,但其实主要目的还是让各位技术人员或者是各大公司能够更好地整理一下公司的数据。那建设ftp网站怎么创建数据库呢?究竟有几种建造数据库的方法,那接下来就教大家两种创建数据库的方式。
此文介绍一种,每天自动备份网站以及数据库文件,发送EMAIL到邮箱,并上传网站和数据加文件到FTP空间,自动删除旧备份的方法。 首先安装EMAIL发送组件: yum install sendmail mutt 脚本下载地址: AutoBackupToFtp.sh 脚本代码如下(注意修改FTP服务器地址用户名密码): #!/bin/bash #你要修改的地方从这里开始 MYSQL_USER=root #mysql用户名 MYS
此文介绍一种,每天自动备份网站以及数据库文件,发送EMAIL到邮箱,并上传网站和数据加文件到FTP空间,自动删除旧备份的方法。
FileZilla FTP Client这款软件只能手动上传文件到FTP,貌似我还没有找到定时扫描某个本地目录,然后执行定时上传的功能。最近遇到一个问题就是:在服务器上部署到很多个FTP客户端定时程序,每个FTP客户端exe可执行程序功能都是类似的,都是将本地服务器中的某个文件夹下的符合文件规则(如*.json,*.xml)文件通过FTP上传到指定FTP服务器上面的某个目录下。但是开的程序太多了,这样如果需要上传多个比如说雷达文件到多个FTP服务器上时,就会开启多个FTP推送客户端程序,这样服务器上面就产生多个exe可执行程序。 如下图所示:
当你使用SiteGround搭建WordPress或WooCommerce网站后,你会经常登录到两个不同的网站后台:一个是SiteGround的Site Tools后台,用于进行网站的安全、速度优化、FTP工具和网站备份等技术操作;另一个是WordPress网站后台,主要用于管理网站内容、调整前台显示样式和编辑网站功能。本文我们介绍了如何使用SiteGround SITE TOOLS主机站点工具管理网站。
对于企业而言,一个网站就相当企业的形象,既能提高用户对企业的信任也能促进成交率,由此可见,企业网站对企业是多么的重要。但很多企业对网站的搭建都不太了解,以为网站搭建很难,其实只要掌握一些前端跟后端的知识,还是很容易搭建的。下面先给大家分享一下ftP网站建设数据库安装的方法。
NCBI 的分类数据库,包括大于 7 万余个物种的名字和种系,这些物种都至少在遗传数据库中有一条核酸或蛋白序列。其目的是为序列数据库建立一个一致的种系发生分类学。截止到目前,各个物种的统计结果见下表。
GOA全称Gene Ontology Annotation, 是EMBL-EBI构建的一个GO注释信息的数据库。官网如下
mysql数据库中存储着网站最核心最宝贵的数据,如果因为不可预测的原因导致数据损坏或丢失,对一个网站的打击是毁灭性的,一次又一次的教训提醒着我们一定要做好备份,但是手工备份确实比较麻烦,每天都要手工操作一次,
推荐使用便捷高效的 FTP 工具登录,也可以使用 Windows 的本地文件浏览器登录。推荐使用 FileZilla 或者 FlashFXP 。
在Windows环境下如果做数据的备份、转移和还原是非常简单的,直接使用可视化的操作,然后通过远程桌面操作,同时可以通过远程桌面或者文件夹共享的方式将备份文件转移到另外一台服务器上。
本文将向大家展示一种黑客入侵数据库的方法,希望能引起大家的警惕。想知道黑客入侵数据库的方法首先要深究黑客入侵数据库的目的。 经过调查发现黑客入侵者入侵数据库的最终目标要么是获取数据库敏感数据、要么是获取数据库控制权限、要么是获取数据库所在操作系统控制权限、要么是获取数据库所在网络环境的部分控制权限。其中获得任意的访问权限是达成上述目的的第一步(无论是数据库控制权还是数据库所在操作系统控制权)。 对于没有用户名和密码的黑客来说,绕过身份验证的过程成了整个过程的第一步。绕过身份验证的方法有很多,其中最常规的是利
遗传变异的数据库注释非常简单,就是从数据库里面下载记录文件,然后根据坐标对应一下即可,甚至很多成熟的工具都可以自动下载数据库以及比对,就跟我们前面讲到的把vcf文件注释到dbSNP数据库的ID一样简单。我在多年前的直播我的基因组讲过很多了:
ODOO数据库的备份和还原有两种方法,一种是利用ODOO自带的自动化备份工具Database auto-backup 进行备份,并在WEB页面进行数据库还原,另一种是GB级别以上的备份方法,本文先描述第二种备份方法,然后下篇发布第一种利用ODOO自带自动化工具进行备份方法。
站长平时会用各种方法备份。包括手动备份、自动备份、定时备份等等不同方法。对于运维人员来说不是难事,对于站点较多的新手站长来说是有一点困难的,毕竟新手在技术方便还是弱了一些。为了能够有更多的时间运营网站,我们可以用宝塔面板的自动备份功能,把网站备份到ftp空间里面去。这样既可以节省时间精力,又做到了多重备份。如果你也感兴趣的话,可以跟着魏艾斯博客下面的文章内容去看看。
The Metasploit Framework 的简称。 MSF 高度模块化,即框架由多个 module 组 成,是全球最受欢迎的渗透测试工具之一 是一款开源安全漏洞利用和测试工具,集成了各种平台上常见的溢出漏洞和流行的 shellcode ,并持续保持更新。 metasploit 涵盖了渗透测试全过程,可以在这个框架下利用现有的 Payload 进行一系列的渗透测试
Gene Ontology是研究基因功能的重要数据库之一,在进行GO的富集分析时,需要提供所有基因对应的GO注释信息,本文介绍几种获取该信息的方式。
基因组学在生物学科的发展中,具有划时代的意义。同时,很多人在刚进入生物信息学领域时,最先接触的也往往是组装基因组,注释基因组。这在我们生信技能树的公号里有详细的教程,需要者可去公号get资源。前面jimmy老师介绍了sra和ebi这两个高通量测序数据存放中心:
你可以从 PrestaShop 官方下载最新的版本,下载地址为:http://www.prestashop.com/en/download.
对一些Linxu操作不太熟悉的用户可以在VPS上安装web控制面板来简化添加网站或数据库等操作,常用的有cPanel、DirectAdmin、Virtualmin/Webmin、Kloxo这几种web控制面板,但是cPanel、DirectAdmin、Kloxo都是收费的控制面板,并且比较占用系统内存和资源,一般被空间销售商用作虚拟空间的销售;Virtualmin/Webmin是一款免费并且占用系统资源比较小的web控制面板,非常适合在VPS上安装。Hi-VPS强烈建议安装Virtualmin/Webmin作为VPS上的web控制面板.
clinvar 和 OMIM 数据库类似,都是存储了人类变异位点和表型之间的关系。网址如下:
以下代码对 Windows 下 MariaDB 10.1.18,Ubuntu 下 MySQL 5.7.23 测试可行。
2.ncbi中SRA的ftp下载链接为: ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/sra/, SRA数据库的格式为:
ftp是我们互联网当中非常常见的一个文件,传输协议,也就是说,我们在使用互联网的时候,想要双向传输,也就是通过服务器和其他用户的电脑进行连接的时候,就需要用到ftp这个双向传输协议。那么我们的云数据库怎么创建ftp呢?首先我们要理解FTP服务器的概念,之后了解它有什么作用,就能够很清楚的知道该怎么使用这项功能了。
卡盟整站源码是该网站的内核程序,内核是Ecshop,类似平台开钻之类整站程序,也是重要的源码文件,其中包含了各种源码类型文件,比较全,安装操作比较简单。卡盟整站源码是一个点卡销售/充值平台程序,可以开钻,自动发货点卡,充值点卡,充值QB,如果自己想搭建卡盟的朋友可以下载使用。
5.使用Metasploit框架的scanner/ip/ipidseq模块寻找能够满足TCP空闲扫描要求的空闲主机。
UNI-SELECT 是一家专注于汽车零部件分销的领先企业,致力于为全球客户提供优质的汽车维修、保养和美容产品,以满足不断变化的市场需求。多年来,UNI-SELECT 凭借卓越的服务和高品质的产品赢得了众多荣誉和认可,不断推动着整个汽车零部件供应链的发展。
Windows下MySQL数据库安装配置详解 目录 一、概述 二、MySQL安装 三、安装成功验证 四、NavicatforMySQL下载及使用 一、概述 MySQL版本:5.6.21 下载地址:
Discuz!全称:Crossday Discuz! Board,是一套免费使用的社区论坛软件系统,由北京康盛新创科技有限责任公司推出,目前最新版本是Discuz! X3.4。自面世以来,Discuz!已拥有18年以上的应用历史和数百万网站用户案例,是全球成熟度最高、覆盖率最大的论坛软件系统之一。用户可以在不需要任何编程的基础上,通过简单的设置和安装,在互联网上搭建起具备完善功能、很强负载能力和可高度定制的论坛服务。Discuz!的基础架构采用世界上最流行的web编程组合PHP+MySQL实现,是一个经过完善设计,适用于各种服务器环境的高效论坛系统解决方案,无论在稳定性、负载能力、安全保障等方面都居于国内外同类产品领先地位。
Typecho是一个基于PHP的简洁的开源博客程序。它使用多种数据库(MySQL,PostgreSQL,SQLite)储存数据,在GNU GPLv2许可证下发行。Typecho的前身是开源博客程序Magike,由Typecho项目的发起人JoyQi(70)开发。该团队的最初形成,是在wordcamp china的活动上,后来有更多成员加入了这个项目,之后改名为Typecho。这个名字来源于团队内部的头脑风暴:Type,有打字的意思;Echo,意思是回声、反馈、共鸣,也是PHP里最常见、最重要的函数。将这两个词合并在一起,就有了Typecho。
线程组是线程的集合。每个线程代表一个使用被测应用程序的用户。基本上,每个线程模拟一个真实的用户对服务器的请求。
一些分析需要与数据库进行比对,例如 blast 比对,物种分类鉴定等,这里我们下载两个数据库,一个是 NCBI 提供的一个用于 blast 比对的新冠病毒库,另外是利用 centrifuge 软件进行宏基因组测序鉴定新冠病毒的库。
SQLBackupAndFTP 是一款用于备份 SQL Server、MySQL 和 PostgreSQL Server 数据库的实用软件,执行定期的完整备份、差异备份和事务日志备份,备份完成后产生的备份压缩包文件可以将它们存储在本地、FTP 服务器或云存储中(比如Amazon S3 、Google Drive、OneDrive),支持备份作业成功或失败的时候分别指定电子邮件发送备份结果。
在上周的文章KEGG数据库不会下载?了解下API!里,我介绍了基于KEGG API来获得所有基因的id,并通过wget遍历所有id来get基因的序列。对计算机比较了解或已经尝试过的朋友可能会意识到,虽然KEGG数据库整体并不是很大(原核生物大概5G),但是反复访问API地址耗时甚长!基于国内高校网速现状,全部下载可能需要长达数月甚至一年的时间!需要注意这里的耗时主要来源于反复访问KEGG API地址而不是下载数据本身,假如可以减少访问次数,那么就能大大缩短KEGG数据库下载时间。比较幸运的是,API指令中允许多个基因并行检索,如下所示:
使用shell脚本实现对Oracle数据库的监控与管理将大大简化DBA的工作负担,如常见的对实例的监控,监听的监控,告警日志的监控,以及数据库的备份,AWR report的自动邮件等。本文给出Linux 下使用 shell 脚本来实现自动FTP备份档案。
RNAcentral是由EBI开发的一个非编码RNA数据库,整合了Ensembl,GENCODE,LNCipedia, miRbase, Rfam等多个数据库中的非编码RNA信息,旨在为ncRNA的研究提供一个统一的参照,网址如下
2、将备份的ftp所有文件上传至新的空间FTP内,将备份的sql上传到新空间的数据库phpmyadmin内。
2、登陆后,左边是管理栏目,右边就是显示的系统状态,可以很清楚的看到当前服务器的系统各项信息,如图:
对于数据库的稳定性,高可用,跨平台以及海量数据库的处理,Oracle 数据库通常是大型数据库和大企业的首选。尽管如此,仍然不乏很多中小企业想要品尝一下Oracle腥味,因此在Oracle环境中也有不少中小型数据库。出于成本的考虑,通常有可能就搞个标准版了,跑在Linux上。谁叫Oracle太贵呢?对于中小企业而言,选择合理的才是最好的。对我们这些个搞DB的,贵的一定有贵的道理,我们也可以都进多几斗米。哈哈......典型的打工者的心态哟。言归正传,中小企业的成本限制了我们搞高可用,RAC和DG也就比较少了。最近就碰到这样的情形,就是能否模拟DataGuard来保护数据库。我们知道DataGuard可以实时将数据库从主库切换到备库,或者从备库再切换回主库,实现无缝对接,从而避免由于硬件故障所带来的数据损失。下文即是基于上面的情形来使用rman catalog方式从某种程度上模拟DataGuard来更大程度地保护数据。
“小博客站点没有攻击价值”这个观点,是个很害人的观点,特别是对很多小白站长们来说,因为现在的互联网环境下攻击你的服务器已经不需要“价值”了,攻击你想要的是你的服务器资源,比如:端口、IP、CPU、硬盘、内存这些,用来当做“肉鸡”出售给需要的人、用来当做“挖矿(可以理解为是赚取比特币行为)”客户端等等。甚至可以说攻击你服务器或者网站的仅仅是个自动执行的爬虫代码而已,无人值守型的还是。所以,不要再抱着“小博客站点没有攻击价值”这个观点来蒙蔽自己了,否则那就真的是“麻木不仁”了!
下载原始测序数据: 在GEO数据库搜索GSE87182, 这里没有直接给出ftp地址,需要先从BioProject找到SRA号,可以得到RNA-Seq的SRA的accession_list,共64组数
之前写了利用命令行工具创建LinuxMac系统下网站备份的文章,但是windows系统无法采用命令行工具进行网站备份,这个时候我们就需要借助第三方工具了。欲知详情,且看下文介绍。 目前仍有很多网站运营商没有做好备份工作,一旦网站突然“罢工”或遭到病毒感染,一切数据、资源、心血都将付诸东流。 前期准备 有的网站托管商会提供备份服务,当然你也可以购买一些附加的备份服务和插件。但本文的写作前提是你的网站托管商不提供备份服务,我们自己通过免费的软件进行网站备份。 首先,准备以下三个工具: 1.Filezilla
在经过基因组组装或转录组差异基因表达量分析之后,对其结果进行注释是比较重要的一步,如何注释以及如何得到精确的注释结果?
我们也可以结合其他的端口扫描工具,比如专门的3389、1433等等的端口扫描工具;
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