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ggpubr!一键绘制出版级论文配图,绘图小白福音...

ggpubr提供了一系列简单易用的函数,使用户能够快速创建各种常见的统计图形,如线图、散点图、柱状图、箱线图、直方图、小提琴图、QQ图、核密度图、热力图和配对图等。...ggpubr支持将图形保存为多种常见的图像文件格式,如PNG、JPEG和PDF等,方便用户进行数据分析和结果呈现。 主要功能和绘图函数: ggline():创建线图,用于展示变量之间的趋势和关系。...gghistogram():创建直方图,用于展示单一变量的分布情况。可以设置分组、密度曲线和填充颜色。 ggviolin():创建小提琴图,用于展示不同组别之间的分布情况。...支持分组、分面和添加自定义标记。 ggqqplot():创建QQ图,用于检验数据是否符合正态分布。支持添加参考线和自定义颜色。 ggdensity():创建核密度图,用于展示单一变量的分布情况。...支持分组、填充颜色和密度曲线。 ggheatmap():创建热力图,用于展示两个变量之间的相关性。支持调整颜色映射、标签和注释。 ggpaired():创建配对图,用于展示两组配对数据之间的差异。

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【R语言】散点图+直方图+密度曲线(二)

前面给大家介绍 ☞【R绘图】散点图+直方图(密度图) 今天小编给大家介绍第二种方法,绘制散点图,并且在散点图上添加直方图和密度曲线。我们还是使用☞【R绘图】散点图+直方图(密度图)里面使用的数据。...这次我们使用的R包叫ggExtra #安装相应的R包 BiocManager::install("ggExtra") BiocManager::install("ggplot2") #加载相关的包 library...(legend.position="none") #删除图注 p 我们可以得到下面这张散点图 接下来我们在这张图的基础上本别来添加直方图或者密度曲线 1....(fill = "green"), #指定颜色 yparams = list(fill="orange"), #指定颜色 ) 2.添加直方图 #在散点图上添加..."green"), #指定颜色 yparams = list(fill="orange"), #指定颜色 ) 3.添加直方图+密度曲线 #在散点图上添加密度曲线

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    R绘图-ggplot2(1)

    #geom_point()完成的就是几何对象的映射,ggplot2提供了各种几何对象映射,如geom_histogram用于直方图,geom_bar用于画柱状图,geom_boxplot用于画箱式图等等...我们可以用前面直方图的参数来画side-by-side的柱状图,填充颜色或者按比例画图,它们是高度一致的。...密度函数图 #说到直方图,就不得不说密度函数图,数据和映射和直方图是一样的,唯一不同的是几何对象,geom_histogram告诉ggplot要画直方图,而geom_density则说我们要画密度函数图...,在我们熟悉前面语法的情况下,很容易画出: ggplot(small)+geom_density(aes(x=price, colour=cut)) ggplot(small)+geom_density...箱式图 #数据量比较大的时候,用直方图和密度函数图是表示数据分布的好方法,而在数据量较少的时候,比如很多的生物实验,很多时候大家都是使用柱状图+errorbar的形式来表示,不过这种方法的信息量非常低,

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    「R」ggplot2数据可视化

    几何对象是用以呈现数据的几何图形对象,如条形、线条和点。 图形属性是几何对象的视觉属性,如x坐标和y坐标、线条颜色、点的形状等。 数值的值和图形属性之间存在着某类映射。...在上述例子中,geom_point()函数在图形中画点,创建了一个散点图。labs()函数是可选的,可以添加注释、轴标签、标题等。 ggplot2中有很多函数,并且大多数包含可选的参数。...用几何函数指定图的类型 ggplot()函数指定要绘制的数据源和变量,几何函数则指定这些变量如何在视觉上进行表示。目前,有37个几何函数可供使用。以下列出常用的函数。...() 密度图 color, fill, alpha, linetype geom_histogram() 直方图 color, fill, alpha, linetype, binwidth geom_hline...选项 详述 color 对点、线和填充区域的边界进行着色 fill 对填充区域着色,如条形和密度区域 alpha 颜色的透明度,从0(完全透明)到1(不透明) linetype 图案的线条(1=实线,

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    散点图及数据分布情况

    5.13 绘制散点图矩阵 第六章描述数据分布 6.1 绘制基本直方图 6.2 基于分组数据绘制多组直方图 6.3 绘制密度曲线 6.4 基于分组数据绘制多组密度曲线 6.5 绘制频数分布折线图 6.6...默认情况下每个方向添加的扰动值为数据点精度的40% #也可以通过time和weight进行调整 #使用ChickenWeight数据集,讲述不同饮食对小鸡成长的影响 cw_sp ggplot(ChickWeight...当x轴y轴都是分类变量的时候,气泡图可以表示网格点上的变量值 ##使用数据集HairEyeColor包含了592个学生头发眼睛颜色的分布 # 创建一个数据框,对男性组和女性组计数求和 hec 的参数如颜色等。...如果宽度超过了响应的数据范围,那么它可能不是适合你数据的最好模型 #将密度曲线叠加到直方图上可以为观测值的理论分布和实际分布进行比较 #由于密度曲线独影的y轴坐标较小,如果将其叠加到未做任何变换的直方图上可能很难看清曲线

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    R语言绘图之ggplot2

    3. ggplot2的函数介绍: ggplot2里的所有函数可以分为以下几类: 用于运算(我们在此不讲,如fortify_,mean_等) 初始化、展示绘图等命令(ggplot,plot,print等)...geom_errorbar 误差线(通常添加到其他图形上,比如柱状图、点图、线图等) geom_errorbarh 水平误差线 geom_freqpoly 频率多边形(类似于直方图) geom_hex...六边形图(通常用于六边形封箱) geom_histogram 直方图 geom_hline 水平线 geom_jitter 点、自动添加了扰动 geom_line 线 geom_linerange 区间...) geom_vline 竖直线 统计变换函数 描述 stat_abline 添加线条,用斜率和截距表示 stat_bin 分割数据,然后绘制直方图 stat_bin2d 二维密度图,用矩阵表示 stat_binhex...,需要用到统计变换 annotate:添加注释 #由于设置的文本会覆盖原来的图中对应的位置,可以改变文本的透明度或者颜色例:annotate(geom='text')会向图形添加一个单独的文本对象 annotate

    4.3K10

    更强的可视化:最全ggplot2扩展包整理

    ggh4x:定制刻面、多种色标和其他选项 ggbeeswarm 在较小的数据集中展示每个数据点的分布和密度。 survminer:利用ggplot2绘制生存曲线图。...ggalluvial:绘制流程图和分层桑基图 ggridges:绘制密度图和堆叠图,用于展示数据在一个连续变量上的分布。 ggside:用于创建分面图(faceted plots)的扩展包。...更多ggplot2扩展包介绍 ggthemes 提供了多种预定义的主题和颜色选项。 plotly 在网页上创建动态和可交互的图表。...ggfortify 更方便地处理和绘制多种类型的统计图形。 ggExtra 向 ggplot2 散点图添加边际密度图或直方图。 ggradar 使用 ggplot2 构建雷达图。...gghalves 向ggplot图添加半几何图。 ggstance ggstance 实现常见 ggplot2 几何体的水平版本。 ggcorrplot 使用ggplot2可视化相关矩阵。

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    R语言可视化——密度曲线图及其美化!

    今天跟大家分享关于密度曲线图及其美化技巧! 密度曲线图可能平时大家用的不多,不过其实没什么神秘,它的功能于直方图一样,都是用于表达连续型数值变量的分布形态。...案例还是使用之前的关于钻石的那个数据集。 ? 密度曲线图所使用的图层函数为geom_density() ,而且函数内position参数位置类型与我们之前讲到的直方图、柱形图(条形图时一样的)。...上面说过colour控制点、线条颜色、fill控制区域颜色,但是密度曲线算是一个另类,仔细看上图你会发现,它不同于折线图,因为每条密度曲线都是一个闭合曲线,所以他是允许使用fill参数填充闭合区域的:...你会发现这样出来的图形除了密度曲线内部除了被填充颜色之外,整体形状与使用colour参数填充线条颜色是一样的。...那么我们依次尝试其他几种参数情况下的密度曲线图呈现何种效果: 堆积:(position="stack") ggplot(diamonds,aes(x=price,fill=clarity))+geom_density

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    R语言绘图之ggplot2包「建议收藏」

    如颜色,形状,大小)的一个映射。..., 默认情况下为离散变量, 按默认的颜色标度标记为桃红色 比较以下三种方法 ggplot(UG,aes(score,income),colour=sex)+geom_point() ggplot(UG,...3.分组 是ggplot2种映射关系的一种, 默认情况下ggplot2把所有观测点分为了一组, 如果需要把观测点按额外的离散变量进行分组处理, 必须修改默认的分组设置。...1.直方图 #直方图 ggplot(small.diamonds)+geom_histogram(aes(x=price)) 还可以按照不同的变量填充不同色,比如切工、钻石颜色 ggplot(small.diamonds...而柱状图是分类数据,按类别计数 3.密度函数图 #密度函数图 ggplot(small.diamonds)+geom_density(aes(x=price,color=clarity))#color指定颜色

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    「R」数据可视化4 : 直方图条形图

    在对数据可视化的时候,我们需要明确想要展示的信息,从而选择最为合适的图突出该信息。本系列文章将介绍多种基于不同R包的作图方法,希望能够帮助到各位读者。 什么是直方图/条形图?...因此不同组之间通常是连续的,且间隔一致。数据的连续性体现在图像上就是柱子之间并没有间隔。因此,直方图可以粗略地表示出数据分布密度,被用于密度估计。 ?...ggplot2提供了绘制直方图和条形图的功能,分别为geom_bar()和geom_histogram()。...所以前者我们做直方图,后者我们做条形图。 2)如何使用ggplot2做直方图 首先我们来看看钻石重量的直方图。...ggplot(diamonds, aes(carat,fill=cut)) + geom_histogram(bins = 20,color='black')+#分为20个组,添加边框 theme_bw

    2.8K20

    可视化绘制技巧|对多图合理排版布局

    使用ggExtra包可以非常轻松的在图形中添加边缘分布图,可以添加的图形包括直方图,箱线图和密度图。 下面的代码首先绘制了一幅散点图,然后添加了边际图形,如图7所示。...图7 添加边际图形 上面的代码中使用了ggMarginal函数为散点图添加编辑图形。默认添加的是密度曲线。代码’ggMarginal(scatterPlot)’表示为图形添加密度曲线。...从图中可以看到,散点图同时添加了密度曲线和直方图。 四、 在ggplot中插入一个外部图形元素 使用annotation_custom()函数,可以在图中添加表,图和其他的元素。...最后使用annotation_custom函数添加创建好的图形元素。...图9 添加图形元素 从图可以看到,箱线图被添加到了图形的左下角的位置。使用这种方式可以以任意的方式合并图形。在这种情况下,需要注意的是,图形之间可能存在覆盖的显现,这种情形是需要避免的。

    2.7K20

    R in action读书笔记(22)第十六章 高级图形进阶(下)

    它弥补了R中创建图形缺乏一致 性的缺点,使得用户可以创建有创新性的、新颖的图形类型。ggplot2中最简单的绘图方式是利用qplot()函数,即快速绘图函数。...对于直线图,colo将把线条颜色与变量水平联系起来,对于密度图和箱线图,fill将把填充颜色与变量联系起来。...对于单变量图形(如直方图),则省略y xlab、ylab :字符向量,设定横轴和纵轴标签 xlim、ylim :二元素数值型向量,分别指定横轴和纵轴的最小值和最大值 library(ggplot2) mtcars...playwith()函数允许用户识别和标注点、查看一个观测所有的变量值、缩放和旋转图形、 添加标注(文本、箭头、线条、矩形、标题和标签)、修改视觉元素(颜色、文本大小等)、应用先前存储的图形风格,以及以多种格式输出图形结果...Theme(主题)菜单上的一些选项仅与基础图形契合的很好,一些则与ggplot2图形契合的较好(如标注),还有些对ggplot2图形无效(如识别点)。

    1.4K20

    天天Get 新技能!!

    如你所见,直方图上叠加核密度图,专业来说,核密度估计是用于估计随机变量概率密度函数的一种非参数方法。核密度图是用来观察连续型变量分布的有效方法。...绘制密度图的方法: plot(density(x)) 其中的x是一个数量型向量,由于plot()函数会创建一副新的图形,要向一幅已经存在的图形上叠加密度曲线,可使用lines()函数: >par(mfrow...小提琴图基本上是核密度图以镜像方式在箱线图上的添加。在图中,白点是中位数,黑色盒型的范围是下四分位点到上四分位点,细黑线表示须,外部形状即核密度估计。...可以通过添加参数groups来选定一个因子,用以指定x中元素的分组方式。如果这样做,参数gcolor可以控制不同组标签的颜色,cex可控制标签的大小。...点和标签的颜色来自color,点以填充的形式表示。

    1.2K50

    (数据科学学习手札37)ggplot2基本绘图语法介绍

    ,末尾的2是因为Hadley写包的一个习惯——对先前的版本不满意便写一个新版本的名称不变仅在末尾加上2,如reshape2等;   按照《图形的语法》一书中的观点,一张统计图形就是从数据到点、线或方块等几何对象的颜色...qplot非常相似,只需要将图形属性和变量名放到函数aes()内即可,但要注意,这里不像qplot默认的图层为散点图,使用ggplot时如果不+geom_部分,则没有图层会被创建,例如: library...中创建了基础的数据映射之后,又接连添加了两个图层,第一个图层绘制出以因子转化后的cyl为shape的散点图,第二个图层绘制出以因子转化后的cyl为colour的光滑拟合曲线,这时summary我们的p也可以观察到分图层的各图层信息...只接受数据框输入,而且,对于一个已经创建好的基于数据框1的绘图对象p,可以用p %+% 数据框2 的形式直接替代原来的数据集: library(ggplot2) data <- mtcars p 的数据集中若涉及连续型与离散型间的转换,就需要注意一下,因为有些图在这种情况会因为不兼容的原因而绘图失败。

    7K50

    ggplot2绘制散点图配合拟合曲线和边际分布直方图

    图形展示 图形解读 ❝此图使用经典的企鹅数据集进行展示,在散点图的基础上按照分组添加拟合曲线及回归方程与R,P值,后使用ggExtra添加密度曲线与数据分布直方图,使用已有R包进行绘制非常的方便,此图大概有以下几点注意事项...它们有一些相似之处,但也有一些关键的区别。 ❞ stat_poly_line 是一个在 ggplot2 图形中添加多项式回归线的函数。这个函数直接计算多项式回归模型,并将拟合线添加到图形上。...它允许指定多项式的阶数,即回归方程中最高次项的次数。可直接在图形上添加拟合线,而不是基于数据点的平滑。 geom_smooth是一个更通用的函数,用于在 ggplot2 图形中添加平滑曲线或拟合线。...它支持多种平滑方法,包括局部回归(loess)、光滑样条(smooth spline)和线性模型。它可以自动选择平滑参数,还可以显示拟合线周围的置信区间。...回归方程的添加 ❝stat_poly_eq:用于添加多项式回归方程和相关统计量(如 R2、p 值等)的标签。这个函数不仅仅限于线 性回归,还可以用于更高阶的多项式回归。

    2K70

    一小时掌握R语言数据可视化

    ,右边是按照指定的一个维度展示不同的颜色 > ggplot(data, aes(x, y)) + geom_point(colour="red") > ggplot(data, aes(x, y)) +...请尊重原创,转载请注明来源网站www.shareditor.com以及原始链接地址 使用geom_bar来画直方图 直观上看,直方图是表达一种累积量,因此默认的直方图的高度是counts或sum,也就是像下面这样子...(aes(weight=y)) > ggplot(data, aes(x,y)) + geom_bar(stat = "identity") 如果我们想要把多种取值的统计数目累加显示在柱状图上,可以这样...(y)), position="fill") 利用geom_density画概率密度曲线 概率密度就是某些值出现的频次多少的一个曲线,并做平滑,如下: > x 密度图,并且用不同颜色来表示不同的y值,那么我们可以用描边的方式(左),也可以用填充的方式(中),当然也可以两者结合 > ggplot(data, aes(x, colour = factor

    1.2K120

    (数据科学学习手札38)ggplot2基本图形简述

    abline()、hline()与vline()   在R的基础绘图系统中我们可以在已绘制的图床上通过abline来添加线条,在ggplot2中当然也有类似的方法: geom_abline():   ...():   如果你想添加的直线垂直于x轴,则可以使用geom_vline()来快捷地添加垂直线条,xintercept传入的参数即为线条在x轴上的位置,若传入向量则可同时添加多条线条: library...contour为F: # 密度图函数,通过fill设置填充颜色数据为密度,geom设置绘制栅格图 p ggplot(data, aes(x = X1, y = X2)) + stat_density2d...() 为我们的填充设置透明度,并将边框也赋以对应的颜色: p ggplot(mpg, aes(class, hwy, fill=factor(class), colour=factor(class...,因为前面也说过,这里就举几个由朴素的直方图扩展开的示例: library(ggplot2) p ggplot(diamonds, aes(carat)) + geom_histogram

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