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ggpubr!一键绘制出版级论文配图,绘图小白福音...

ggpubr提供了一系列简单易用函数,使用户能够快速创建各种常见统计图形,线图、散点图、柱状图、箱线图、直方图、小提琴图、QQ图、核密度图、热力图和配对图等。...ggpubr支持将图形保存为多种常见图像文件格式,PNG、JPEG和PDF等,方便用户进行数据分析和结果呈现。 主要功能和绘图函数: ggline():创建线图,用于展示变量之间趋势和关系。...gghistogram():创建直方图,用于展示单一变量分布情况。可以设置分组、密度曲线和填充颜色。 ggviolin():创建小提琴图,用于展示不同组别之间分布情况。...支持分组、分面和添加自定义标记。 ggqqplot():创建QQ图,用于检验数据是否符合正态分布。支持添加参考线和自定义颜色。 ggdensity():创建密度图,用于展示单一变量分布情况。...支持分组、填充颜色密度曲线。 ggheatmap():创建热力图,用于展示两个变量之间相关性。支持调整颜色映射、标签和注释。 ggpaired():创建配对图,用于展示两组配对数据之间差异。

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【R语言】散点图+直方图+密度曲线(二)

前面给大家介绍 ☞【R绘图】散点图+直方图密度图) 今天小编给大家介绍第二种方法,绘制散点图,并且在散点图上添加直方图密度曲线。我们还是使用☞【R绘图】散点图+直方图密度图)里面使用数据。...这次我们使用R包叫ggExtra #安装相应R包 BiocManager::install("ggExtra") BiocManager::install("ggplot2") #加载相关包 library...(legend.position="none") #删除图注 p 我们可以得到下面这张散点图 接下来我们在这张图基础上本别来添加直方图或者密度曲线 1....(fill = "green"), #指定颜色 yparams = list(fill="orange"), #指定颜色 ) 2.添加直方图 #在散点图上添加..."green"), #指定颜色 yparams = list(fill="orange"), #指定颜色 ) 3.添加直方图+密度曲线 #在散点图上添加密度曲线

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R绘图-ggplot2(1)

#geom_point()完成就是几何对象映射,ggplot2提供了各种几何对象映射,geom_histogram用于直方图,geom_bar用于画柱状图,geom_boxplot用于画箱式图等等...我们可以用前面直方图参数来画side-by-side柱状图,填充颜色或者按比例画图,它们是高度一致。...密度函数图 #说到直方图,就不得不说密度函数图,数据和映射和直方图是一样,唯一不同是几何对象,geom_histogram告诉ggplot要画直方图,而geom_density则说我们要画密度函数图...,在我们熟悉前面语法情况下,很容易画出: ggplot(small)+geom_density(aes(x=price, colour=cut)) ggplot(small)+geom_density...箱式图 #数据量比较大时候,用直方图密度函数图是表示数据分布好方法,而在数据量较少时候,比如很多生物实验,很多时候大家都是使用柱状图+errorbar形式来表示,不过这种方法信息量非常低,

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「R」ggplot2数据可视化

几何对象是用以呈现数据几何图形对象,条形、线条和点。 图形属性是几何对象视觉属性,x坐标和y坐标、线条颜色、点形状等。 数值值和图形属性之间存在着某类映射。...在上述例子中,geom_point()函数在图形中画点,创建了一个散点图。labs()函数是可选,可以添加注释、轴标签、标题等。 ggplot2中有很多函数,并且大多数包含可选参数。...用几何函数指定图类型 ggplot()函数指定要绘制数据源和变量,几何函数则指定这些变量如何在视觉上进行表示。目前,有37个几何函数可供使用。以下列出常用函数。...() 密度图 color, fill, alpha, linetype geom_histogram() 直方图 color, fill, alpha, linetype, binwidth geom_hline...选项 详述 color 对点、线和填充区域边界进行着色 fill 对填充区域着色,条形和密度区域 alpha 颜色透明度,从0(完全透明)到1(不透明) linetype 图案线条(1=实线,

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散点图及数据分布情况

5.13 绘制散点图矩阵 第六章描述数据分布 6.1 绘制基本直方图 6.2 基于分组数据绘制多组直方图 6.3 绘制密度曲线 6.4 基于分组数据绘制多组密度曲线 6.5 绘制频数分布折线图 6.6...默认情况下每个方向添加扰动值为数据点精度40% #也可以通过time和weight进行调整 #使用ChickenWeight数据集,讲述不同饮食对小鸡成长影响 cw_sp <- ggplot(ChickWeight...当x轴y轴都是分类变量时候,气泡图可以表示网格点上变量值 ##使用数据集HairEyeColor包含了592个学生头发眼睛颜色分布 # 创建一个数据框,对男性组和女性组计数求和 hec <- HairEyeColor...#这里可以调整回归参数颜色等。...如果宽度超过了响应数据范围,那么它可能不是适合你数据最好模型 #将密度曲线叠加到直方图上可以为观测值理论分布和实际分布进行比较 #由于密度曲线独影y轴坐标较小,如果将其叠加到未做任何变换直方图上可能很难看清曲线

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R语言绘图之ggplot2

3. ggplot2函数介绍: ggplot2里所有函数可以分为以下几类: 用于运算(我们在此不讲,fortify_,mean_等) 初始化、展示绘图等命令(ggplot,plot,print等)...geom_errorbar 误差线(通常添加到其他图形上,比如柱状图、点图、线图等) geom_errorbarh 水平误差线 geom_freqpoly 频率多边形(类似于直方图) geom_hex...六边形图(通常用于六边形封箱) geom_histogram 直方图 geom_hline 水平线 geom_jitter 点、自动添加了扰动 geom_line 线 geom_linerange 区间...) geom_vline 竖直线 统计变换函数 描述 stat_abline 添加线条,用斜率和截距表示 stat_bin 分割数据,然后绘制直方图 stat_bin2d 二维密度图,用矩阵表示 stat_binhex...,需要用到统计变换 annotate:添加注释 #由于设置文本会覆盖原来图中对应位置,可以改变文本透明度或者颜色例:annotate(geom='text')会向图形添加一个单独文本对象 annotate

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R语言可视化——密度曲线图及其美化!

今天跟大家分享关于密度曲线图及其美化技巧! 密度曲线图可能平时大家用不多,不过其实没什么神秘,它功能于直方图一样,都是用于表达连续型数值变量分布形态。...案例还是使用之前关于钻石那个数据集。 ? 密度曲线图所使用图层函数为geom_density() ,而且函数内position参数位置类型与我们之前讲到直方图、柱形图(条形图时一样)。...上面说过colour控制点、线条颜色、fill控制区域颜色,但是密度曲线算是一个另类,仔细看上图你会发现,它不同于折线图,因为每条密度曲线都是一个闭合曲线,所以他是允许使用fill参数填充闭合区域:...你会发现这样出来图形除了密度曲线内部除了被填充颜色之外,整体形状与使用colour参数填充线条颜色是一样。...那么我们依次尝试其他几种参数情况下密度曲线图呈现何种效果: 堆积:(position="stack") ggplot(diamonds,aes(x=price,fill=clarity))+geom_density

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R语言绘图之ggplot2包「建议收藏」

颜色,形状,大小)一个映射。..., 默认情况下为离散变量, 按默认颜色标度标记为桃红色 比较以下三种方法 ggplot(UG,aes(score,income),colour=sex)+geom_point() ggplot(UG,...3.分组 是ggplot2种映射关系一种, 默认情况下ggplot2把所有观测点分为了一组, 如果需要把观测点按额外离散变量进行分组处理, 必须修改默认分组设置。...1.直方图 #直方图 ggplot(small.diamonds)+geom_histogram(aes(x=price)) 还可以按照不同变量填充不同色,比如切工、钻石颜色 ggplot(small.diamonds...而柱状图是分类数据,按类别计数 3.密度函数图 #密度函数图 ggplot(small.diamonds)+geom_density(aes(x=price,color=clarity))#color指定颜色

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「R」数据可视化4 : 直方图条形图

在对数据可视化时候,我们需要明确想要展示信息,从而选择最为合适图突出该信息。本系列文章将介绍多种基于不同R包作图方法,希望能够帮助到各位读者。 什么是直方图/条形图?...因此不同组之间通常是连续,且间隔一致。数据连续性体现在图像上就是柱子之间并没有间隔。因此,直方图可以粗略地表示出数据分布密度,被用于密度估计。 ?...ggplot2提供了绘制直方图和条形图功能,分别为geom_bar()和geom_histogram()。...所以前者我们做直方图,后者我们做条形图。 2)如何使用ggplot2做直方图 首先我们来看看钻石重量直方图。...ggplot(diamonds, aes(carat,fill=cut)) + geom_histogram(bins = 20,color='black')+#分为20个组,添加边框 theme_bw

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可视化绘制技巧|对多图合理排版布局

使用ggExtra包可以非常轻松在图形中添加边缘分布图,可以添加图形包括直方图,箱线图和密度图。 下面的代码首先绘制了一幅散点图,然后添加了边际图形,如图7所示。...图7 添加边际图形 上面的代码中使用了ggMarginal函数为散点图添加编辑图形。默认添加密度曲线。代码’ggMarginal(scatterPlot)’表示为图形添加密度曲线。...从图中可以看到,散点图同时添加密度曲线和直方图。 四、 在ggplot中插入一个外部图形元素 使用annotation_custom()函数,可以在图中添加表,图和其他元素。...最后使用annotation_custom函数添加创建图形元素。...图9 添加图形元素 从图可以看到,箱线图被添加到了图形左下角位置。使用这种方式可以以任意方式合并图形。在这种情况下,需要注意是,图形之间可能存在覆盖显现,这种情形是需要避免

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R in action读书笔记(22)第十六章 高级图形进阶(下)

它弥补了R中创建图形缺乏一致 性缺点,使得用户可以创建有创新性、新颖图形类型。ggplot2中最简单绘图方式是利用qplot()函数,即快速绘图函数。...对于直线图,colo将把线条颜色与变量水平联系起来,对于密度图和箱线图,fill将把填充颜色与变量联系起来。...对于单变量图形(直方图),则省略y xlab、ylab :字符向量,设定横轴和纵轴标签 xlim、ylim :二元素数值型向量,分别指定横轴和纵轴最小值和最大值 library(ggplot2) mtcars...playwith()函数允许用户识别和标注点、查看一个观测所有的变量值、缩放和旋转图形、 添加标注(文本、箭头、线条、矩形、标题和标签)、修改视觉元素(颜色、文本大小等)、应用先前存储图形风格,以及以多种格式输出图形结果...Theme(主题)菜单上一些选项仅与基础图形契合很好,一些则与ggplot2图形契合较好(标注),还有些对ggplot2图形无效(识别点)。

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天天Get 新技能!!

如你所见,直方图上叠加核密度图,专业来说,核密度估计是用于估计随机变量概率密度函数一种非参数方法。核密度图是用来观察连续型变量分布有效方法。...绘制密度方法: plot(density(x)) 其中x是一个数量型向量,由于plot()函数会创建一副新图形,要向一幅已经存在图形上叠加密度曲线,可使用lines()函数: >par(mfrow...小提琴图基本上是核密度图以镜像方式在箱线图上添加。在图中,白点是中位数,黑色盒型范围是下四分位点到上四分位点,细黑线表示须,外部形状即核密度估计。...可以通过添加参数groups来选定一个因子,用以指定x中元素分组方式。如果这样做,参数gcolor可以控制不同组标签颜色,cex可控制标签大小。...点和标签颜色来自color,点以填充形式表示。

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(数据科学学习手札37)ggplot2基本绘图语法介绍

,末尾2是因为Hadley写包一个习惯——对先前版本不满意便写一个新版本名称不变仅在末尾加上2,reshape2等;   按照《图形语法》一书中观点,一张统计图形就是从数据到点、线或方块等几何对象颜色...qplot非常相似,只需要将图形属性和变量名放到函数aes()内即可,但要注意,这里不像qplot默认图层为散点图,使用ggplot时如果+geom_部分,则没有图层会被创建,例如: library...中创建了基础数据映射之后,又接连添加了两个图层,第一个图层绘制出以因子转化后cyl为shape散点图,第二个图层绘制出以因子转化后cyl为colour光滑拟合曲线,这时summary我们p也可以观察到分图层各图层信息...只接受数据框输入,而且,对于一个已经创建基于数据框1绘图对象p,可以用p %+% 数据框2 形式直接替代原来数据集: library(ggplot2) data <- mtcars p <...,转换后数据集中若涉及连续型与离散型间转换,就需要注意一下,因为有些图在这种情况会因为兼容原因而绘图失败。

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ggplot2绘制散点图配合拟合曲线和边际分布直方图

图形展示 图形解读 ❝此图使用经典企鹅数据集进行展示,在散点图基础上按照分组添加拟合曲线及回归方程与R,P值,后使用ggExtra添加密度曲线与数据分布直方图,使用已有R包进行绘制非常方便,此图大概有以下几点注意事项...它们有一些相似之处,但也有一些关键区别。 ❞ stat_poly_line 是一个在 ggplot2 图形中添加多项式回归线函数。这个函数直接计算多项式回归模型,并将拟合线添加到图形上。...它允许指定多项式阶数,即回归方程中最高次项次数。可直接在图形上添加拟合线,而不是基于数据点平滑。 geom_smooth是一个更通用函数,用于在 ggplot2 图形中添加平滑曲线或拟合线。...它支持多种平滑方法,包括局部回归(loess)、光滑样条(smooth spline)和线性模型。它可以自动选择平滑参数,还可以显示拟合线周围置信区间。...回归方程添加 ❝stat_poly_eq:用于添加多项式回归方程和相关统计量( R2、p 值等)标签。这个函数不仅仅限于线 性回归,还可以用于更高阶多项式回归。

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一小时掌握R语言数据可视化

,右边是按照指定一个维度展示不同颜色 > ggplot(data, aes(x, y)) + geom_point(colour="red") > ggplot(data, aes(x, y)) +...请尊重原创,转载请注明来源网站www.shareditor.com以及原始链接地址 使用geom_bar来画直方图 直观上看,直方图是表达一种累积量,因此默认直方图高度是counts或sum,也就是像下面这样子...(aes(weight=y)) > ggplot(data, aes(x,y)) + geom_bar(stat = "identity") 如果我们想要把多种取值统计数目累加显示在柱状图上,可以这样...(y)), position="fill") 利用geom_density画概率密度曲线 概率密度就是某些值出现频次多少一个曲线,并做平滑,如下: > x <- rep(c(1,3,7,11,23,50,60...y值来分开画密度图,并且用不同颜色来表示不同y值,那么我们可以用描边方式(左),也可以用填充方式(中),当然也可以两者结合 > ggplot(data, aes(x, colour = factor

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(数据科学学习手札38)ggplot2基本图形简述

abline()、hline()与vline()   在R基础绘图系统中我们可以在已绘制图床上通过abline来添加线条,在ggplot2中当然也有类似的方法: geom_abline():   ...():   如果你想添加直线垂直于x轴,则可以使用geom_vline()来快捷地添加垂直线条,xintercept传入参数即为线条在x轴上位置,若传入向量则可同时添加多条线条: library...contour为F: # 密度图函数,通过fill设置填充颜色数据为密度,geom设置绘制栅格图 p <- ggplot(data, aes(x = X1, y = X2)) + stat_density2d...() 为我们填充设置透明度,并将边框也赋以对应颜色: p <- ggplot(mpg, aes(class, hwy, fill=factor(class), colour=factor(class...,因为前面也说过,这里就举几个由朴素直方图扩展开示例: library(ggplot2) p <- ggplot(diamonds, aes(carat)) + geom_histogram

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看看程序员大佬都推荐几大Python库…

大家好,又见面了,我是你们朋友全栈君。 数据可视化是数据分析中极为重要部分,而数据可视化图表(条形图,散点图,折线图,地理图等)也是非常关键一环。...Plotly提供了40多种独特图表类型,例如散点图,直方图,折线图,条形图,饼图,误差线,箱形图,多轴,迷你图,树状图,3-D图表等。Plotly还提供了等高线图,其中在其他数据可视化库中并不常见。...Seaborn还具有各种工具来选择可以显示数据中图案调色板。 GGplot Ggplot是一个Python数据可视化库,它基于为编程语言R创建ggplot2实现为基础。...Ggplot可以使用高级功能创建数据可视化,例如条形图,饼图,直方图,散点图,错误图等。 API。可在单个可视化中添加不同类型数据可视化组件或层。...Geoplotlib Geoplotlib为创建地图或使用地理数据提供支持,安装之前需要NumPy和pyglet,它可以使用许多不同类型地图,例如点密度图,区域索引,符号图等。

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