ggplot2-将geom_segment扩展到绘图的可见范围之外 - 腾讯云开发者社区

数据可视化本期推文数据可视化的难点在于连接“气球”的连接线的绘制，ggplot2 中geom_segment()可以灵活实现这一过程，而Matplotlib 则相对麻烦点，但也是有绘制连接线的方法的...ax.axvline()和ax.axhline()用于绘制固定位置的线十分方便，但其范围(长短)位置较为固定，无法随着具体数值进行更改，即transform属性固定。...其他为具体如刻度范围之类的设置。最终效果如下： ? 04....本期推文的目的还是熟悉绘图技巧，将数据可视化设计当作“艺术“，多看，多练，优秀的可视化绘制技巧终究可以获得的。能力有限，如有出错，请联系我啊(不能留言，直接添加本人微信进行交流吧)。...往后的推文除了保密的科研数据之外(当然，会有其他数据代替的)，我都会给大家的 ? ? ，链接失效的话，直接联系我直接发代码给你 ? ?

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绘制圆环图雷达图星形图极坐标图径向图POLAR CHART可视化分析汽车性能数据

映射您的数据和绘图需求，使其最终成为圆环。作为一个额外的好处，我还发现它的构建/加载速度更快。对我来说很重要，因为我让它们在 Shiny Apps 中交互。我在示例中使用了 mtcars 数据。...该图显示了集合中的 12 辆汽车：背景中的气缸。4、6 和 8 缸的浅色、中色和深色。用蓝色标出每辆车每加仑的里数。这篇文章是逐步展示如何将所需的元素添加到圆形图中。...# 数据点 rotate_data 我想展示绘图范围数据，所以我伪造了一系列 qsec 数据。基本上，您为每辆车（标签）上的 qsec 生成一个具有多个值（行）的数据框。...#编造一些范围数据 bind_rows rotate_data 使用polygon 绘制范围，使用 path 和 point 绘制 mpg 值。...但是为了简单地将所有轴文本和轴标签设置为blank，我构建了一个可以使用 text 绘制的数据框。

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116-R可视化36-把你长长的坐标轴弄短

正好来复习一下前面[[111-R可视化35-结合grid与ggplot输出]] 的用法。这里可以用任意的umap 结果作为绘图输入。...ggplot 自带的geom_segment 方法。...这时候直接把这个geom_segment结果添加到原本的ggplot 图层上： p1 + geom_segment(data = segment.df, mapping...我们来看看umap 坐标的范围： > range(cell_reduction_df$UMAP_1) [1] -7.486754 11.550125 > range(cell_reduction_df$...The magick package: Advanced Image-Processing in R • magick (ropensci.org)[2] 直接从图片而非绘图对象的层面把内容添加上去：

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基于 R 语言的科研论文绘图技巧详解（1）

简介在查阅文献的过程中，看到了几幅非常不错的出版图，今天就跟着小编一起学习下，他们是怎么使用 R 绘制出来的。...后面几幅图会一一介绍，读者在学习过程中，可以将内部学到的知识点应用到自己的图形绘制中。...绘图加载包首先加载一些需要使用到的包。.../image2.png")) 接下来，将两幅图并行合并，放置到一幅图中。这里的代码，小编也是第一次见。...color="yellow", size=1) + scale_x_continuous(limits = c(0,1))+ # 设置 x 轴坐标范围

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COVID-19 in africa

ggplot2-绘制非洲地区新冠肺炎（COVID19）最近接触COVID的项目，目前COVID已经在世界上普遍大流行，而且WHO官网及霍普金斯大学等都有相对应的全球COVID19监测平台。...然后通过 covid中的country与africa中的country进行数据关联。 cd=left_join(africa,COVID)，将covid数据关联到africa sf数据库中。...这里需要注意的是，我们用geom_segment来表示点之间的细线。...(reverse=TRUE)) + geom_point(data=label,aes(x=x,y=y),col="#D6604D",size=2,alpha=0.9) + # line geom_segment...(reverse=TRUE)) + geom_point(data=label,aes(x=x,y=y),col="#D6604D",size=2,alpha=0.9) + # line geom_segment

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跟着Nature Genetics 学画图：R语言ggplot2画箱线图(boxplot)展示D statistic

首先推荐一个分享R语言干货的优质公众号 R语言统计与绘图简介：R语言统计与绘图公众号目前致力于分享医学统计与R绘图知识，手把手教你使用R语言绘制基线特征表、KM生存曲线、森林图、ROC曲线等。...每天一篇精彩R语言推文教程，手把手带你入门R语言绘图。...(x=1,xend=5,y=-0.04,yend=-0.04)+ annotate("text",x=3,y=-0.02,label="CAU",vjust=10)+ geom_segment(...x=6,xend=9,y=-0.04,yend=-0.04)+ annotate("text",x=7.5,y=-0.02,label="SEU",vjust=10)+ geom_segment...image.png 箭头指的地方如何用代码缩短暂时不知道了，出图后手动调整吧最终结果 ? image.png 这里遇到的问题是如何将箱线图的垂直线改成虚线呢？

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Day06 生信马拉松-R语言作图

基础包绘图函数内容-仅作了解，不常用# 低级绘图函数line() #添加线curve() #添加曲线abline() #添加给定斜率的线points() #添加点segments() #折线arrows...() #箭头axis() #坐标轴box() #外框title() #标题text() #文字# 高级绘图函数plot() #多种图形hist() #频率直方图boxplot() #箱线图stripchart...() #点图barplot() #柱状图dotchart() #点图piechart() #饼图matplot() #数学图形关闭画板 dev.off()1.1.2 ggplot2-列名不带引号，行末写...freggplot(data = fre) + geom_bar(mapping = aes(x = Var1, y = Freq), stat = "identity") #手动添加y轴/y值5.2 将count...iris_box_ggpubr.png")2.3 eoffice包导出为ppt,全部元素都是可编辑模式library(eoffice)topptx(p,"iris_box_ggpubr.pptx")3.拼图详细内容可见小洁老师的前期推文

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🤩 Circular lollipop | 哇咔咔！！！环形棒棒糖图好吃又好玩！~

time_unit == "years" ~ value * 60 * 24 * 365, TRUE ~ NA_real_ ) ) ---- 4.2 增加画图空间接下来，将固定值...1000添加到所有时间，为圆圈内的标签留下所需的额外空间。...5.1 基础绘图 p <- ggplot(df_pw_plot, aes(rank, time, color = category)) + # 垂直线 geom_segment( aes...# Prism color rcartocolor::scale_color_carto_d(palette = "Prism", guide = "none") + # dots大小范围...is.na(category)) ---- 6.2 开始绘图 facet <- ggplot(facet_data, aes(rank, time, color = category)) + geom_segment

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R 语言柱状图示例笔记

由于微信不允许外部链接，你需要点击文章尾部左下角的 "阅读原文"，才能访问文章中链接。一、基础柱状图 1. barplot 命令基于barplot基础柱状图颜色、方向及分组的绘图示例。...、方向及分组的绘图示例。..."mean", "sd", "n", "se") myData$names <- c(paste(myData$cyl, "cyl /", myData$gears, " gear")) 定义作图范围...，其他可替代柱状图的图形包含棒棒糖图（Lollipop）、环形柱状图等未在本文中展开介绍，有兴趣的小伙伴可参考文章最后的参考资料。...- barplot1》》，STHDA Winston Chang，《ggplot2- barplot2》，Cookbook for R Chris Wetherill，《Building Barplots

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86-R可视化18-自定义分类或连续数据坐标轴文本

Date : [[2022-01-04_Tue]] Tags : #R/index/02 #R/R可视化 #R/R数据科学参考：ggplot2-设置坐标轴 - yutingliuyl - 博客园 (cnblogs.com...)[1] 前言最近遇到一个问题，如何将ggplot 连续性数据的坐标轴文本，自定义成想要的分类数据，比如1:10 的数值替换成 id1, id2...id10，实现以假乱真的效果。...这里主要谈的还是标签，关于坐标的范围限定，可以参考：[[57-R可视化6-ggplot2三部曲最终之进阶为菜鸟]] 连续与分类数据的处理无论是y 还是x 轴，都对应scale_**_discrete/...分类数据主要是两个参数，比如： bp <- ggplot(PlantGrowth, aes(x=group, y=weight)) + geom_boxplot() # 将原有的 "ctrl", "trt1...(x = NULL) + scale_y_continuous( label = function(x) {return(paste("TEST", x))}) 参考资料 [1]ggplot2

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R-ggplot2 基础图表绘制-散点图示例

前两期分别介绍了R-ggplot2 基础散点图R-ggplot2 基础图表绘制-散点图和 Python-seaborn基础散点图Python-seaborn 基础图表绘制-散点图的绘制方法，较为系统的介绍了绘图的基础语法...，也为一些绘图基础不是很好的小伙伴提供了参考方法，基础的讲过了，接下里我们将示例应用了啊(也是这个系列推文的流程啊:基础+示例演示)，只为让你更好的掌握绘图知识点。...主要涉及的知识点如下： geom_smooth()绘制拟合线 ggrepel::geom_text_repel()绘制不重叠文本 ggplot2 + ggrepel 图表再现这期的推文绘图示例我们使用的是经济学人经典的一张图表...geom_text_repel()添加文本由于原图文字与散点之间的链接线设置较为合理，这里我们可以使用geom_segment()单独进行位置设置并连线，这里我们就不使用此方法，直接使用geom_text_repel...，但还是存在部分细节之处没有很好的仿制，这里我么只学习绘图技巧啊) 总结本期推文我们进行了散点示例图的绘制，主要目的还是进行图表技巧的练习，希望可以给大家提供些绘图灵感。

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Matlab中axis函数使用

目录语法二.说明示例设置坐标轴范围使用半自动坐标轴范围设置多个坐标轴的坐标轴范围显示绘图而不显示坐标区背景使用紧凑的坐标轴范围并返回值更改坐标系的方向添加新绘图时保留当前的坐标轴范围...visibility – 坐标区线条和背景的可见性坐标区线条和背景的可见性，指定为on或off。...使用 hold on 避免绘图函数覆盖预设的坐标轴范围。二.说明 axis(limits) 指定当前坐标区的范围。以包含 4 个、6 个或 8 个元素的向量形式指定范围。...[m,v,d] = axis('state') 返回坐标轴范围选择、坐标区可见性和 y 轴方向的当前设置。在以后的版本中将会删除该语法。...surf(peaks) axis off 使用紧凑的坐标轴范围并返回值绘制一个曲面。将坐标轴范围设置为等于数据范围，这样绘图可以扩展到坐标区边缘。

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跟着Nature microbiology学画图~R语言ggplot2以原点为中心画坐标轴

参考的链接是 https://stackoverflow.com/questions/17753101/center-x-and-y-axis-with-ggplot2 第一步需要确定数据的范围，比如用鸢尾花的数据集花瓣长宽分别做...x和y 用summary()函数看一下数据的范围 summary(iris) ?...最大值是6.9，那我们将坐标轴的范围设置为-7~7. axis_begin<- -7 axis_end<-7 刻度设置为15个 total_ticks<-15 最终是通过geom_segment()...image.png 接下来简单修饰包括去灰色背景更改坐标轴范围添加最外圈的方框去掉最外圈的文字和小短线 ggplot(iris,aes(x=Petal.Length,y=Petal.Width...draw_axis_line(20, 4) 20是x轴的范围，4是y轴的范围最终的出图效果 ?

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R语言ggplot2：单元格为方块的热图简单小例子-2

昨天公众号后台有人留言作图，示例图如下 image.png 我选择使用R语言的ggplot2来实现，这个是箱线图和热图的拼接，右侧的热图可以借助geom_point()函数实现，将点的形状改为正方块，数值按照正负来映射颜色...基本的思路有了。...继续昨天推文的内容 R语言ggplot2绘图单元格为方块的热图—1—调整图例的位置（点击蓝色字体直达昨天的推文）今天的推文记录一下如何实现这个热图首先构造一份数据集 set.seed("20200407...element_blank(), panel.border = element_rect(color="grey"), axis.ticks = element_blank())+ geom_segment...(data=df3,aes(x=x,xend=xend,y=y,yend=yend), color="grey")+ geom_segment(data=df4,aes

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R 可视乎 | 绘制卡通圣诞树

theme_bw()将背景颜色更改为白色。scale_x_continuous(breaks = NULL)(和 y 轴对应) 去掉标记和网格线。...这些散点的坐标是基于均匀分布随机产生的。给灯设置的数量是 50 ，底部分布的数量为 35% ，顶部为 5% ，参数值可以根据自己喜好更改。最后一个变量的值从1到4，使用这个来控制每个点的透明度。...Desired.Lights * 0.05), 15, 17), 0)) Lights$Lights.Colour <- c(round(runif(Total.Lights, 1, 4), 0)) ##将灯添加到树上...，可以用缎带来装饰一下，使用 geom_segment() 函数来实现这一点。...", size = 2) tree 可以看到，对于水平色带，设置了一个 x坐标范围，但为了得到一条直线，设置了两个y坐标的相同值，而对于垂直线，则设置了相反的值。

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R语言绘图之ggplot2

当我们看到很多优美的绘图时，你是否会有据为己有的冲动？我反正是有的。那么今天我们就为大家介绍一下目前在R语言中流行的绘图包ggplot2。...2. ggplot2的绘图原理: ggplot2的核心理念是将绘图与数据分离，数据相关的绘图与数据无关的绘图分离，并按图层作图。...（与Crossbar图和箱线图相关，可以用来表示线的范围） geom_polygon 多边形 geom_quantile 一组分位数线（来自分位数回归） geom_rect 二维的长方形 geom_ribbon...彩虹图（在连续的x值上表示y的范围，例如Tufte著名的拿破仑远征图） geom_rug 触须 geom_segment 线段 geom_smooth 平滑的条件均值 geom_step 阶梯图 geom_text...coord_map 地图投影 coord_polar 极坐标投影 coord_trans 变换笛卡儿坐标分面函数描述 facet_grid 将分面放置在二维网格中 facet_wrap 将一维的分面按二维排列

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科研作图之光谱图绘制

本视频使用的绘图软件是Origin2019学习版 (关于如何获取Origin学习版软件，请查阅本公众号文章：开启OriginLab 2019的正确姿势)；所用数据来源网络，这里要求使用的数据横坐标要在光谱波长区间内...除此之外还需要知道不同波段的波长值与RGB颜色值的对应关系，下图给出可见光波长与颜色的对应关系(来源：百度百科)： ?...得到各波段的RGB值后，将直方图的边框通过colormap填充，而填充的颜色由直方图所处x轴位置决定，详见视频。...视频中所用网站：可见光波长范围：https://www.baidu.com/s?...wd=可见光波长范围&ie=UTF-8 波长与RGB：https://academo.org/demos/wavelength-to-colour-relationship/ 本文作者：艾木樨

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R语言可视化——中心放射状路径图

最近一直在研究ggplot剩余还没有涉略过的图表类型，试图挖掘出一些新的图表形式，就像是该包的作者所暗示的那样，ggplot2只是给你搭建了一个图层语法环境，至于具体能创造出何种图形，全凭自己的想象力。...慢慢的我发现还有一类geom_segment对象自己一直没有尝试过，于是满心欢喜的尝试了一下，果然还是有收获的，我发现通过这个segment图层，可以批量的创建放射状线条图，也就是路径图，这解决了我一直以来的难题...(data=dataC,aes(x=sourcex,y=sourcey,xend=tagetx,yend=tagety,colour="red"),curvature = 0.8)+ #用于调整曲率，范围在...(data=dataC,aes(x=sourcex,y=sourcey,xend=tagetx,yend=tagety,colour="red"))+ geom_segment(data=dataF,aes...当然，根据实际需要，你也可以将图层叠加N次，从而制作出与业务需求一致的多中心放射状路径图，这里只给出思路和大致步骤，感兴趣的小伙伴可以自己尝试。

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了解绘制条形图和折线图的细节

考虑到公众号后台数不胜数的提问其实并不是生物学知识或者数据处理知识的困惑，仅仅是绘图小技巧以及数据转换的困难。...： #时间是连续性变量，此时会在x轴上介于最小值和最大值之间所有可能的取值范围处绘制条形 ggplot(BOD,aes(x=Time,y=demand))+geom_col() #使用factor函数将连续型变量转化为离散型变量...，需要scale_fill_brewer()或者scale_fill_manual()重新设定颜色 #注意颜色的映射实在aes()中完成的，而颜色的设定实在aes()之外完成的 ggplot(ups,aes...调整vjust，但是有可能使数据标签位于绘图区范围之外 #(2)增加ylim调整y轴范围，只是数值竖直调整的幅度取决于y轴范围 #增加y轴上限 ggplot(ce,aes(x=interaction(...A：运行geom_area(position='fill') #基础绘图，运行geom_area(position='fill')可以将y轴范围按比例调整0~1 ggplot(uspopage,aes(

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ggplot2都有哪些使用不多但是却异常强大的图层函数

要说ggplot2中那些使用不多但是却功能强大的图层函数，我首先想到的就是geom_rect、geom_linerange、geom_segment、geom_ploygon。...这四个函数分别定义了ggplot2中的矩形图、垂直线图（线范围图）、线段图、几何多边形图。...这四种图表类型独立使用的机会很少，一般都是作为图表的辅助信息，但是如果能恰到好处的使用，你会挖掘出很多新意。...geom_segment() geom_segment通常用于制作直线段图，路径图、放射线图等，思路也很简单，只需要指定每一条线段的起点坐标、终点坐标即可。即分别制定x,y,xend,yend。...但是其实不然，这个grom_linerange函数可以实现批量美学映射，包含线条颜色自定义、粗细自定义、线型自定义以及线条上下边界的自定义，通过coord_flip函数还可以将垂直线的所有应用转化为水平线应用

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